DIABLO

DIABLO (англ. Diablo IAP-binding mitochondrial protein) – білок, локалізований у мітохондрії. який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.

DIABLO
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1FEW, 1G3F, 1G73, 1OXQ, 1TW6, 1XB0, 1XB1, 3D9U, 3UIH, 3UIJ, 4TX5
Ідентифікатори
Символи	DIABLO, DFNA64, SMAC, Diablo, Diablo homolog, diablo IAP-binding mitochondrial protein
Зовнішні ІД	OMIM: 605219 MGI: 1913843 HomoloGene: 10532 GeneCards: DIABLO
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal dominant nonsyndromic deafness 64
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • гіалоплазма • мітохондріальний міжмембранний простір • мітохондрія • cytoplasmic side of plasma membrane • CD40 receptor complex Біологічний процес • intrinsic apoptotic signaling pathway • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors • GO:0097285 апоптоз • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process by cytochrome c • positive regulation of apoptotic process • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to oxidative stress • neuron apoptotic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56616	66593
Ensembl	ENSG00000184047	ENSMUSG00000029433
UniProt	Q9NR28	Q9JIQ3
RefSeq (мРНК)	NM_138930 NM_001278302 NM_001278303 NM_001278304 NM_001278342 NM_019887 NM_138929 NM_001371333	NM_023232
RefSeq (білок)	NP_001265231 NP_001265232 NP_001265233 NP_001265271 NP_063940 NP_620308 NP_001358262 NP_001265231.1	NP_075721
Локус (UCSC)	Хр. 12: 122.21 – 122.23 Mb	Хр. 5: 123.65 – 123.66 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, альтернативний сплайсинг.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAALKSWLSR		SVTSFFRYRQ		CLCVPVVANF		KKRCFSELIR		PWHKTVTIGF
GVTLCAVPIA		QKSEPHSLSS		EALMRRAVSL		VTDSTSTFLS		QTTYALIEAI
TEYTKAVYTL		TSLYRQYTSL		LGKMNSEEED		EVWQVIIGAR		AEMTSKHQEY
LKLETTWMTA		VGLSEMAAEA		AYQTGADQAS		ITARNHIQLV		KLQVEEVHQL
SRKAETKLAE		AQIEELRQKT		QEEGEERAES		EQEAYLRED

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Структура

Білок

Цей ген кодує дугоподібний білок, завдовжки 130 Å що складається з двох однакових молекул. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 239 амінокислот, 55 з яких складають мітохондріальну сигнальну послідовність на Ν-кінці. Як тільки весь поліпептидний ланцюг імпортувався в мітохондрію, сигнальна послідовність вирізається для отримання зрілого білка з 184 амінокислот. Це розщеплення також виявляє 4 залишки на Ν-кінці, Ala-Val-Pro-Ile (AVPI), які є ядром для ΙΑP- зв'язуючих доменів і є вирішальними для інгібування білка XIAP. Зокрема тетрапептидна послідовність зв'язує домен BIR3 білку ΧΙAP для формування стабільного комплексу між DIABLO та XIAP. Структура гомодимера також полегшує зв'язування DIABLO та XIAP через домен BIR2, хоча зв'язок не формується доки білок не вивільняється в цитоплазму у результаті зовнішньої зміни проникності мемрани мітохондрії. Таким чином мономерні мутанти білка все ще можуть зв'язуватись з доменом ΒΙR3, але не з доменом BIR2, який погіршує інгібіторну функцію білка.

Ген

Ген DIABLO у  ссавців містить 6 екзонів охоплює 19,86 кб геномної ДНК. Для цього гена було описано декілька алтернативних варіантів сплайсингових транскриптів., але період дії деяких транскриптів і передбачувані комбінації екзонів не визначено остаточно.

Мутації

Шляхом генетичних аналізів було визначено, що гетерозиготна мутація білка SMAC/DIABLO c.377C> T, що характеризується домінантною, прогресуючою втратою слуху, позначеною як DFNA64. DFNA64 індетифіковано як генетичне захворювання людини, пов'язане з порушенням функції SMAC / DIABLO. Мутант SMAC / DIABLOS71L може викликати мітохондріальну дисфункцію.

Фізіологічна роль

DIABLO - білок, який сприяє активації апоптозу шляхом пригнічення ефекту інгібітора білків апоптозу (ΙΑP) - протеїн, який негативно регулює апоптоз або запрограмовану смерть клітин. DIABLO - мітохондріальний білок, локалізований в мітохондріальному межмамбранному просторі, але він входить в цитозоль, коли клітини піддаються апоптозу.

Упродовж внутрішнього шляху апоптозу білки ΒCL-2, такі як BAK і BAX утворюють пори у зовнішній мітохондріальній мембрані, що призводить до проникності мітохлндріальної мембрани і вивільненню цитохрома С та DIABLO. В той час як цитохром С безпосередньо активує APAF1 і каспазу 9. DIABLO зв'язує такі білки як XIAP та cIAP для пригнічення їх каспазно-зв'язуючої активності і дозволяє каспазі активувати апоптоз. DIABLO експресується в багатьох типах клітин, бере участь в багатьох біологічних процесах, включаючи апоптоз. На даний час неапоптичні функції DIABLO залишаються незрозумілими.

Основні функції

• стимулювання апоптозу шляхом зв'язування каспаз з інгібіторами сімейства IAP;
• активування каспаз в шляху цитохром С/APAF1/CASP9;
• бере участь у TNF-опосередкованій активації CASP8 і апоптозі;
• грає важливу роль в апоптозі, який викликаний нестероїдними протизапальними препаратами під час раку товстої кишки;
• один із проапоптичних білків, який вивільняється з мітохондрій які інактивують ΙΑP і відіграють надлишкову роль під час розвитку і загибелі клітин;
• відіграє обов'язкову роль в клітинах пухлини під час декількох шляхів індукції апоптоза;
• може ставити мішень на BIRC2, щоб індукувати TNFalpha-залежний апоптоз і тому може брати участь у лікуванні раку;
• Функція DIABLO, а не активність каспази-9, була вирішальною для повної активації ефекторних каспаз;

Взаємодія з іншими білками

• PRPS1 ініціює активацію каспази перед цитохромом С і DIABLO;
• взаэмодіє з UBE2K (сприяє деградації зрілого білка DIABLO через протеасомний шлях убіквітіна);
• перешкоджає апоптозу клітин раку молочної залози шляхом пригнічення BIRC5;
• при апоптозі BIRC5 роспізнає білок DIABLO;
• BIRC6 може грати потенційну онкогенну роль при нейробластомі шляхом інактивації цитоплазматичного DIABLO;
• внутрішньомембранне розщеплення DIABLO білком PARL генерує N-кінці ΙΑP-зв'язуючого моти́ву (ділянка послідовності ДНК або білка, що зустрічається в різних генах), який необхідний для апоптотичної активації білка.

Клінічне значення

DIABLO відіграє ключову роль у діагностиці та лікуванні раку. Надмірна експресія білка пов'язана з підвищеною чутливістю клітин пухлин до апоптозу. До цього часу спостерігали надмірну експресію білка для протидії прогресуваню раку. Після експериментального визначення структури білка, були розроблені низькомолекулярні меметики DIABLO, які розвивалися для імітації тетрапептиду AVPI у IAP-зв'язуючому домені білка, який відповідає за зв'язування доменів ΒΙR3 в таких білках як XIAP, cIAP1 для індукції апоптозу і некроптозу.

Декілька з багатьох меметиків білку розроблених упродовж останнього десятиліття, таких як SM-406 і два меметики компанії Genentech проходять клінічні випробування. Ці меметики також розроблені для безпосереднього знаходження мішені на пухлинних клітинах шляхом взаємодії з запальними білками, такими як IL-1β, які зазвичай продукуються твердими пухлинними ураженнями. Доклінічні дослідження вказують на те, що використання меметиків SMAC у поєднанні з хіміотерапією, лігандами і агоністами рецепторів смерті, а також лікарськими засобами, спрямованими на невеликі молекули, підвищують чутливість пухлинних клітин до цих способів лікування. Тим не менш, все ще існує потенціал для побічних ефектів, таких як підвищений рівень цитокінів і хемокінів у нормальних тканина.

Література

• Du C., Fang M., Li Y., Li L., Wang X. (2000). Smac, a mitochondrial protein that promotes cytochrome c-dependent caspase activation by eliminating IAP inhibition. Cell. 102: 33—42. PMID 10929711 DOI:10.1016/S0092-8674(00)00008-8
• Fu J., Jin Y., Arend L.J. (2003). Smac3, a novel Smac/DIABLO splicing variant, attenuates the stability and apoptosis-inhibiting activity of X-linked inhibitor of apoptosis protein. J. Biol. Chem. 278: 52660—52672. PMID 14523016 DOI:10.1074/jbc.M308036200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bartke T., Pohl C., Pyrowolakis G., Jentsch S. (2004). Dual role of BRUCE as an antiapoptotic IAP and a chimeric E2/E3 ubiquitin ligase. Mol. Cell. 14: 801—811. PMID 15200957 DOI:10.1016/j.molcel.2004.05.018

Примітки

1. (англ.) . Архів оригіналу за 27 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
2. Захворювання, генетично пов'язані з DIABLO переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
3. Human PubMed Reference:.
4. Mouse PubMed Reference:.
5. Bai L, Smith DC, Wang S (October 2014). "Small-molecule SMAC mimetics as new cancer therapeutics". Pharmacology & Therapeutics. 144 (1): 82–95. doi:10.1016/j.pharmthera.2014.05.007. PMC 4247261. PMID 24841289.
6. Shi Y (May 2001). "A structural view of mitochondria-mediated apoptosis". Nature Structural Biology. 8 (5): 394–401. doi:10.1038/87548. PMID 11323712.
7. Martinez-Ruiz GU, Victoria-Acosta G, Vazquez-Santillan KI, Jimenez-Hernandez L, Muñoz-Galindo L, Ceballos-Cancino G, et al. (2014). "Ectopic expression of new alternative splice variant of Smac/DIABLO increases mammospheres formation". International Journal of Clinical and Experimental Pathology. 7 (9): 5515–26. PMC 4203164. PMID 25337193.
8. . genatlas.medecine.univ-paris5.fr. Архів оригіналу за 10 січня 2019. Процитовано 9 січня 2019.
9. . www.omim.org. Архів оригіналу за 8 вересня 2019. Процитовано 14 січня 2019.
10. Cheng, Jing; Zhu, Yuhua; He, Sudan; Lu, Yanping; Chen, Jing; Han, Bing; Petrillo, Marco; Wrzeszczynski, Kazimierz O.; Yang, Shiming (15 липня 2011). Functional Mutation of SMAC/DIABLO, Encoding a Mitochondrial Proapoptotic Protein, Causes Human Progressive Hearing Loss DFNA64. American Journal of Human Genetics. Т. 89, № 1. с. 56—66. doi:10.1016/j.ajhg.2011.05.027. ISSN 0002-9297. PMC 3135809. PMID 21722859. Процитовано 14 січня 2019.{{}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом ()
11. . www.ncbi.nlm.nih.gov. Архів оригіналу за 10 січня 2019. Процитовано 9 січня 2019.
12. Dobrzycka, Bozena; Terlikowski, Slawomir J; Bernaczyk, Piotr S; Garbowicz, Magdalena; Niklinski, Jacek; Chyczewski, Lech; Kulikowski, Marek (12 квітня 2011). Prognostic significance of smac/DIABLO in endometrioid endometrial cancer. Folia Histochemica et Cytobiologica. Т. 48, № 4. doi:10.2478/v10042-010-0091-2. ISSN 1897-5631. Процитовано 9 січня 2019.

Див. також

• Хромосома 12