Альтернативний сплайсинг — механізм виникнення варіацій при сплайсингу РНК за рахунок відокремлення екзонів попередника мРНК (пре-мРНК) і їх повторного з'єднання. В результаті отримуються альтернативні варіанти нуклеотидної послідовності мРНК. Ці варіанти мРНК, мРНК-ізоформи. або сплайс-варіанти, потім зазвичай використовуються у процесі трансляції та переводяться в амінокислотну послідовність, формуючи ізоформи білків. Таким чином, альтернативний сплайсинг збільшує різноманітність білків, що синтезуються клітиною.
Альтернативний сплайсинг вважається основним процесом, що призводить до різноманіття білків (поряд з , редагуванням мРНК тощо), яке значно перевищує кількість генів у геномах організмах. Так, наприклад, у геномі людини знаходиться менше 19 тисяч функціональних генів. Водночас кількість відомих білків людини, за базою даних UniProt, перевищує 154 тисячі станом на липень 2016 року.
Історія дослідження
Альтернативний сплайсинг було вперше описано 1977 року в аденовірусів. У 1981 році подібний механізм було виявлено при синтезі гормону ссавців кальцитоніну. Цього ж року було доведено, що мРНК антитіл також підлягають альтернативному сплайсингу. Надалі таких білків було виявлено тисячі.
Найбільше сплайс-ізоформ, які утворюються з однієї пре-мРНК, відомо для гена DSCAM з нервової системи дрозофіли: 2000 року в нього було описано більше 38 тисяч варіантів.
Примітки
- Xiang-Dong Fu & Manuel Jr Ares (August 2014). Context-dependent control of alternative splicing by RNA-binding proteins. Nature reviews. Genetics. doi:10.1038/nrg3778. PMID 25112293.
- Ezkurdia, I.; Juan, D.; Rodriguez, J. M.; Frankish, A.; Diekhans, M.; Harrow, J.; Vazquez, J.; Valencia, A.; Tress, M. L. (2014). Multiple evidence strands suggest that there may be as few as 19 000 human protein-coding genes. Human Molecular Genetics. 23 (22): 5866—5878. doi:10.1093/hmg/ddu309. ISSN 0964-6906.
- UniProtKB results: Homo sapiens [ 18 серпня 2016 у Wayback Machine.](англ.)
- Schmucker, Dietmar; Clemens, James C; Shu, Huidy; Worby, Carolyn A; Xiao, Jian; Muda, Marco; Dixon, Jack E; Zipursky, S.Lawrence (2000). Drosophila Dscam Is an Axon Guidance Receptor Exhibiting Extraordinary Molecular Diversity. Cell. 101 (6): 671—684. doi:10.1016/S0092-8674(00)80878-8. ISSN 0092-8674.
Це незавершена стаття з молекулярної біології. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
Alternativnij splajsing mehanizm viniknennya variacij pri splajsingu RNK za rahunok vidokremlennya ekzoniv poperednika mRNK pre mRNK i yih povtornogo z yednannya V rezultati otrimuyutsya alternativni varianti nukleotidnoyi poslidovnosti mRNK Ci varianti mRNK mRNK izoformi abo splajs varianti potim zazvichaj vikoristovuyutsya u procesi translyaciyi ta perevodyatsya v aminokislotnu poslidovnist formuyuchi izoformi bilkiv Takim chinom alternativnij splajsing zbilshuye riznomanitnist bilkiv sho sintezuyutsya klitinoyu Metodi alternativnogo splajsingu Alternativnij splajsing vvazhayetsya osnovnim procesom sho prizvodit do riznomanittya bilkiv poryad z redaguvannyam mRNK tosho yake znachno perevishuye kilkist geniv u genomah organizmah Tak napriklad u genomi lyudini znahoditsya menshe 19 tisyach funkcionalnih geniv Vodnochas kilkist vidomih bilkiv lyudini za bazoyu danih UniProt perevishuye 154 tisyachi stanom na lipen 2016 roku Istoriya doslidzhennyaAlternativnij splajsing bulo vpershe opisano 1977 roku v adenovirusiv U 1981 roci podibnij mehanizm bulo viyavleno pri sintezi gormonu ssavciv kalcitoninu Cogo zh roku bulo dovedeno sho mRNK antitil takozh pidlyagayut alternativnomu splajsingu Nadali takih bilkiv bulo viyavleno tisyachi Najbilshe splajs izoform yaki utvoryuyutsya z odniyeyi pre mRNK vidomo dlya gena DSCAM z nervovoyi sistemi drozofili 2000 roku v nogo bulo opisano bilshe 38 tisyach variantiv PrimitkiXiang Dong Fu amp Manuel Jr Ares August 2014 Context dependent control of alternative splicing by RNA binding proteins Nature reviews Genetics doi 10 1038 nrg3778 PMID 25112293 Ezkurdia I Juan D Rodriguez J M Frankish A Diekhans M Harrow J Vazquez J Valencia A Tress M L 2014 Multiple evidence strands suggest that there may be as few as 19 000 human protein coding genes Human Molecular Genetics 23 22 5866 5878 doi 10 1093 hmg ddu309 ISSN 0964 6906 UniProtKB results Homo sapiens 18 serpnya 2016 u Wayback Machine angl Schmucker Dietmar Clemens James C Shu Huidy Worby Carolyn A Xiao Jian Muda Marco Dixon Jack E Zipursky S Lawrence 2000 Drosophila Dscam Is an Axon Guidance Receptor Exhibiting Extraordinary Molecular Diversity Cell 101 6 671 684 doi 10 1016 S0092 8674 00 80878 8 ISSN 0092 8674 Ce nezavershena stattya z molekulyarnoyi biologiyi Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi