GRIA2 (англ. Glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 883 амінокислот, а молекулярна маса — 98 821.
GRIA2 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | GRIA2, GLUR2, GLURB, GluA2, GluR-K2, HBGR2, glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 2, gluR-B, gluR-2, NEDLIB | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 138247 MGI: 95809 HomoloGene: 20225 GeneCards: GRIA2 | ||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
AMPA, Анірацетам, cx516, CX546, Циклотіазид, IDRA-21, пірацетам, S-18986, GYKI 53655, GYKI-52,466, NBQX, Тезампанел, Аргіотоксин 636 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 4: 157.2 – 157.37 Mb | Хр. 3: 80.59 – 80.71 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MQKIMHISVL | LSPVLWGLIF | GVSSNSIQIG | GLFPRGADQE | YSAFRVGMVQ | ||||
FSTSEFRLTP | HIDNLEVANS | FAVTNAFCSQ | FSRGVYAIFG | FYDKKSVNTI | ||||
TSFCGTLHVS | FITPSFPTDG | THPFVIQMRP | DLKGALLSLI | EYYQWDKFAY | ||||
LYDSDRGLST | LQAVLDSAAE | KKWQVTAINV | GNINNDKKDE | MYRSLFQDLE | ||||
LKKERRVILD | CERDKVNDIV | DQVITIGKHV | KGYHYIIANL | GFTDGDLLKI | ||||
QFGGANVSGF | QIVDYDDSLV | SKFIERWSTL | EEKEYPGAHT | TTIKYTSALT | ||||
YDAVQVMTEA | FRNLRKQRIE | ISRRGNAGDC | LANPAVPWGQ | GVEIERALKQ | ||||
VQVEGLSGNI | KFDQNGKRIN | YTINIMELKT | NGPRKIGYWS | EVDKMVVTLT | ||||
ELPSGNDTSG | LENKTVVVTT | ILESPYVMMK | KNHEMLEGNE | RYEGYCVDLA | ||||
AEIAKHCGFK | YKLTIVGDGK | YGARDADTKI | WNGMVGELVY | GKADIAIAPL | ||||
TITLVREEVI | DFSKPFMSLG | ISIMIKKPQK | SKPGVFSFLD | PLAYEIWMCI | ||||
VFAYIGVSVV | LFLVSRFSPY | EWHTEEFEDG | RETQSSESTN | EFGIFNSLWF | ||||
SLGAFMQQGC | DISPRSLSGR | IVGGVWWFFT | LIIISSYTAN | LAAFLTVERM | ||||
VSPIESAEDL | SKQTEIAYGT | LDSGSTKEFF | RRSKIAVFDK | MWTYMRSAEP | ||||
SVFVRTTAEG | VARVRKSKGK | YAYLLESTMN | EYIEQRKPCD | TMKVGGNLDS | ||||
KGYGIATPKG | SSLRNAVNLA | VLKLNEQGLL | DKLKNKWWYD | KGECGSGGGD | ||||
SKEKTSALSL | SNVAGVFYIL | VGGLGLAMLV | ALIEFCYKSR | AEAKRMKVAK | ||||
NAQNINPSSS | QNSQNFATYK | EGYNVYGIES | VKI |
Кодований геном білок за функціями належить до глутаматних рецепторів підродини АМРА-рецепторів. Це іонний канал, який відчиняється у відповідь на зв'язування з молекулою глутамінової кислоти та пропускає іони натрію всередину клітини.
На відміну від NMDA-рецепторів та інших АМРА-рецепторів у порі цього каналу в 607-му амінокислотному положенні знаходиться не залишок глутаміну, а залишок аргініну. Це робить іонний канал селективним для іонів натрію, а іони кальцію пройти крізь нього не можуть. Заміна стається завдяки редагуванню матричної РНК цього каналу, і є консервативною для більшості хребетних.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Dev K.K., Nakanishi S., Henley J.M. (2004). The PDZ domain of PICK1 differentially accepts protein kinase C-alpha and GluR2 as interacting ligands. J. Biol. Chem. 279: 41393—41397. PMID 15247289 DOI:10.1074/jbc.M404499200
- Sun W., Ferrer-Montiel A.V., Montal M. (1994). Primary structure and functional expression of the AMPA/kainate receptor subunit 2 from human brain. NeuroReport. 5: 441—444. PMID 8003671
- Paschen W., Hedreen J.C., Ross C.A. (1994). RNA editing of the glutamate receptor subunits GluR2 and GluR6 in human brain tissue. J. Neurochem. 63: 1596—1602. PMID 7523595
Примітки
- Сполуки, які фізично взаємодіють з GRIA2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 29 грудня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 21 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
- Konen, Lyndsey M.; Wright, Amanda L.; Royle, Gordon A.; Morris, Gary P.; Lau, Benjamin K.; Seow, Patrick W.; Zinn, Raphael; Milham, Luke T.; Vaughan, Christopher W.; Vissel, Bryce (2020). A new mouse line with reduced GluA2 Q/R site RNA editing exhibits loss of dendritic spines, hippocampal CA1-neuron loss, learning and memory impairments and NMDA receptor-independent seizure vulnerability. Molecular Brain. 13 (1). doi:10.1186/s13041-020-0545-1. ISSN 1756-6606.
{{}}
: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом ()(англ.)
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
GRIA2 angl Glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 2 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 4 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 883 aminokislot a molekulyarna masa 98 821 GRIA2Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2WJW 2WJX 2XHD 3R7X 3RN8 3RNN 3UA8 5H8SIdentifikatoriSimvoliGRIA2 GLUR2 GLURB GluA2 GluR K2 HBGR2 glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 2 gluR B gluR 2 NEDLIBZovnishni ID OMIM 138247 MGI 95809 HomoloGene 20225 GeneCards GRIA2Reaguye na spolukuAMPA Aniracetam cx516 CX546 Ciklotiazid IDRA 21 piracetam S 18986 GYKI 53655 GYKI 52 466 NBQX Tezampanel Argiotoksin 636 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya ion channel activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding ionotropic glutamate receptor activity extracellularly glutamate gated ion channel activity excitatory extracellular ligand gated ion channel activity AMPA glutamate receptor activity amyloid beta binding signaling receptor activityKlitinna komponenta integral component of membrane endocytic vesicle membrane postsynaptic membrane endoplasmic reticulum membrane membrana klitinna membrana sinaps integral component of plasma membrane mizhklitinni kontakti endoplazmatichnij retikulum AMPA glutamate receptor complex external side of plasma membrane dendrit nejrobiologiya dendritic spine excitatory synapse postsynapse postsynaptic endocytic zone GO 0097483 GO 0097481 postsinaptichne ushilnennyaBiologichnij proces ion transport ion transmembrane transport ionotropic glutamate receptor signaling pathway GO 0015915 transport GO 0072468 signalna transdukciya chemical synaptic transmission excitatory postsynaptic potential synaptic transmission glutamatergic regulation of NMDA receptor activityDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez2891 14800Ensembl ENSG00000120251 ENSMUSG00000033981UniProt P42262 P23819RefSeq mRNK NM 000826 NM 001083619 NM 001083620 NM 001379000 NM 001379001NM 001039195 NM 001083806 NM 013540 NM 001357924 NM 001357927RefSeq bilok NP 000817 NP 001077088 NP 001077089 NP 001365929 NP 001365930NP 001034284 NP 001077275 NP 038568 NP 001344853 NP 001344856Lokus UCSC Hr 4 157 2 157 37 MbHr 3 80 59 80 71 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MQKIMHISVLLSPVLWGLIFGVSSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQ FSTSEFRLTPHIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTI TSFCGTLHVSFITPSFPTDGTHPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAY LYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQVTAINVGNINNDKKDEMYRSLFQDLE LKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYHYIIANLGFTDGDLLKI QFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIKYTSALT YDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQ VQVEGLSGNIKFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLT ELPSGNDTSGLENKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLA AEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPL TITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCI VFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEFEDGRETQSSESTNEFGIFNSLWF SLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERM VSPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEP SVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDS KGYGIATPKGSSLRNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSGGGD SKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALIEFCYKSRAEAKRMKVAK NAQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do glutamatnih receptoriv pidrodini AMRA receptoriv Ce ionnij kanal yakij vidchinyayetsya u vidpovid na zv yazuvannya z molekuloyu glutaminovoyi kisloti ta propuskaye ioni natriyu vseredinu klitini Na vidminu vid NMDA receptoriv ta inshih AMRA receptoriv u pori cogo kanalu v 607 mu aminokislotnomu polozhenni znahoditsya ne zalishok glutaminu a zalishok argininu Ce robit ionnij kanal selektivnim dlya ioniv natriyu a ioni kalciyu projti kriz nogo ne mozhut Zamina stayetsya zavdyaki redaguvannyu matrichnoyi RNK cogo kanalu i ye konservativnoyu dlya bilshosti hrebetnih LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Dev K K Nakanishi S Henley J M 2004 The PDZ domain of PICK1 differentially accepts protein kinase C alpha and GluR2 as interacting ligands J Biol Chem 279 41393 41397 PMID 15247289 DOI 10 1074 jbc M404499200 Sun W Ferrer Montiel A V Montal M 1994 Primary structure and functional expression of the AMPA kainate receptor subunit 2 from human brain NeuroReport 5 441 444 PMID 8003671 Paschen W Hedreen J C Ross C A 1994 RNA editing of the glutamate receptor subunits GluR2 and GluR6 in human brain tissue J Neurochem 63 1596 1602 PMID 7523595PrimitkiSpoluki yaki fizichno vzayemodiyut z GRIA2 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 29 grudnya 2017 Procitovano 30 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 21 veresnya 2017 Procitovano 30 serpnya 2017 Konen Lyndsey M Wright Amanda L Royle Gordon A Morris Gary P Lau Benjamin K Seow Patrick W Zinn Raphael Milham Luke T Vaughan Christopher W Vissel Bryce 2020 A new mouse line with reduced GluA2 Q R site RNA editing exhibits loss of dendritic spines hippocampal CA1 neuron loss learning and memory impairments and NMDA receptor independent seizure vulnerability Molecular Brain 13 1 doi 10 1186 s13041 020 0545 1 ISSN 1756 6606 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite journal title Shablon Cite journal cite journal a Obslugovuvannya CS1 Storinki iz nepoznachenim DOI z bezkoshtovnim dostupom posilannya angl Div takozhHromosoma 4 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi