TET2 (англ. Tet methylcytosine dioxygenase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 002 амінокислот, а молекулярна маса — 223 811.
TET2 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | TET2, KIAA1546, MDS, tet methylcytosine dioxygenase 2, Tet methylcytosine dioxygenase 2, IMD75 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 612839 MGI: 2443298 HomoloGene: 49498 GeneCards: TET2 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
рак молочної залози, меланома, справжня поліцитемія, мієлодиспластичний синдром, гострий мієлоїдний лейкоз, blood platelet count | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 4: 105.15 – 105.28 Mb | Хр. 3: 133.17 – 133.25 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MEQDRTNHVE | GNRLSPFLIP | SPPICQTEPL | ATKLQNGSPL | PERAHPEVNG | ||||
DTKWHSFKSY | YGIPCMKGSQ | NSRVSPDFTQ | ESRGYSKCLQ | NGGIKRTVSE | ||||
PSLSGLLQIK | KLKQDQKANG | ERRNFGVSQE | RNPGESSQPN | VSDLSDKKES | ||||
VSSVAQENAV | KDFTSFSTHN | CSGPENPELQ | ILNEQEGKSA | NYHDKNIVLL | ||||
KNKAVLMPNG | ATVSASSVEH | THGELLEKTL | SQYYPDCVSI | AVQKTTSHIN | ||||
AINSQATNEL | SCEITHPSHT | SGQINSAQTS | NSELPPKPAA | VVSEACDADD | ||||
ADNASKLAAM | LNTCSFQKPE | QLQQQKSVFE | ICPSPAENNI | QGTTKLASGE | ||||
EFCSGSSSNL | QAPGGSSERY | LKQNEMNGAY | FKQSSVFTKD | SFSATTTPPP | ||||
PSQLLLSPPP | PLPQVPQLPS | EGKSTLNGGV | LEEHHHYPNQ | SNTTLLREVK | ||||
IEGKPEAPPS | QSPNPSTHVC | SPSPMLSERP | QNNCVNRNDI | QTAGTMTVPL | ||||
CSEKTRPMSE | HLKHNPPIFG | SSGELQDNCQ | QLMRNKEQEI | LKGRDKEQTR | ||||
DLVPPTQHYL | KPGWIELKAP | RFHQAESHLK | RNEASLPSIL | QYQPNLSNQM | ||||
TSKQYTGNSN | MPGGLPRQAY | TQKTTQLEHK | SQMYQVEMNQ | GQSQGTVDQH | ||||
LQFQKPSHQV | HFSKTDHLPK | AHVQSLCGTR | FHFQQRADSQ | TEKLMSPVLK | ||||
QHLNQQASET | EPFSNSHLLQ | HKPHKQAAQT | QPSQSSHLPQ | NQQQQQKLQI | ||||
KNKEEILQTF | PHPQSNNDQQ | REGSFFGQTK | VEECFHGENQ | YSKSSEFETH | ||||
NVQMGLEEVQ | NINRRNSPYS | QTMKSSACKI | QVSCSNNTHL | VSENKEQTTH | ||||
PELFAGNKTQ | NLHHMQYFPN | NVIPKQDLLH | RCFQEQEQKS | QQASVLQGYK | ||||
NRNQDMSGQQ | AAQLAQQRYL | IHNHANVFPV | PDQGGSHTQT | PPQKDTQKHA | ||||
ALRWHLLQKQ | EQQQTQQPQT | ESCHSQMHRP | IKVEPGCKPH | ACMHTAPPEN | ||||
KTWKKVTKQE | NPPASCDNVQ | QKSIIETMEQ | HLKQFHAKSL | FDHKALTLKS | ||||
QKQVKVEMSG | PVTVLTRQTT | AAELDSHTPA | LEQQTTSSEK | TPTKRTAASV | ||||
LNNFIESPSK | LLDTPIKNLL | DTPVKTQYDF | PSCRCVEQII | EKDEGPFYTH | ||||
LGAGPNVAAI | REIMEERFGQ | KGKAIRIERV | IYTGKEGKSS | QGCPIAKWVV | ||||
RRSSSEEKLL | CLVRERAGHT | CEAAVIVILI | LVWEGIPLSL | ADKLYSELTE | ||||
TLRKYGTLTN | RRCALNEERT | CACQGLDPET | CGASFSFGCS | WSMYYNGCKF | ||||
ARSKIPRKFK | LLGDDPKEEE | KLESHLQNLS | TLMAPTYKKL | APDAYNNQIE | ||||
YEHRAPECRL | GLKEGRPFSG | VTACLDFCAH | AHRDLHNMQN | GSTLVCTLTR | ||||
EDNREFGGKP | EDEQLHVLPL | YKVSDVDEFG | SVEAQEEKKR | SGAIQVLSSF | ||||
RRKVRMLAEP | VKTCRQRKLE | AKKAAAEKLS | SLENSSNKNE | KEKSAPSRTK | ||||
QTENASQAKQ | LAELLRLSGP | VMQQSQQPQP | LQKQPPQPQQ | QQRPQQQQPH | ||||
HPQTESVNSY | SASGSTNPYM | RRPNPVSPYP | NSSHTSDIYG | STSPMNFYST | ||||
SSQAAGSYLN | SSNPMNPYPG | LLNQNTQYPS | YQCNGNLSVD | NCSPYLGSYS | ||||
PQSQPMDLYR | YPSQDPLSKL | SLPPIHTLYQ | PRFGNSQSFT | SKYLGYGNQN | ||||
MQGDGFSSCT | IRPNVHHVGK | LPPYPTHEMD | GHFMGATSRL | PPNLSNPNMD | ||||
YKNGEHHSPS | HIIHNYSAAP | GMFNSSLHAL | HLQNKENDML | SHTANGLSKM | ||||
LPALNHDRTA | CVQGGLHKLS | DANGQEKQPL | ALVQGVASGA | EDNDEVWSDS | ||||
EQSFLDPDIG | GVAVAPTHGS | ILIECAKREL | HATTPLKNPN | RNHPTRISLV | ||||
FYQHKSMNEP | KHGLALWEAK | MAEKAREKEE | ECEKYGPDYV | PQKSHGKKVK | ||||
REPAEPHETS | EPTYLRFIKS | LAERTMSVTT | DSTVTTSPYA | FTRVTGPYNR | ||||
YI |
Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, , фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, альтернативний сплайсинг, метилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза, ДНК.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
- Chen Q., Chen Y., Bian C., Fujiki R., Yu X. (2013). TET2 promotes histone O-GlcNAcylation during gene transcription. Nature. 493: 561—564. PMID 23222540 DOI:10.1038/nature11742
- Katoh M., Katoh M. (2004). Identification and characterization of human CXXC10 gene in silico. Int. J. Oncol. 25: 1193—1199. PMID 15375572
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з TET2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25941 (англ.) . Процитовано 18 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до . |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
TET2 angl Tet methylcytosine dioxygenase 2 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na 4 j hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 2 002 aminokislot a molekulyarna masa 223 811 TET2Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB4NM6 5DEU 5D9YIdentifikatoriSimvoliTET2 KIAA1546 MDS tet methylcytosine dioxygenase 2 Tet methylcytosine dioxygenase 2 IMD75Zovnishni ID OMIM 612839 MGI 2443298 HomoloGene 49498 GeneCards TET2Pov yazani genetichni zahvoryuvannyarak molochnoyi zalozi melanoma spravzhnya policitemiya miyelodisplastichnij sindrom gostrij miyeloyidnij lejkoz blood platelet count Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0001948 GO 0016582 protein binding zv yazuvannya z ionom metalu oxidoreductase activity dioxygenase activity zinc ion binding DNA binding ferrous iron binding methylcytosine dioxygenase activity iron ion bindingKlitinna komponenta klitinne yadroBiologichnij proces 5 methylcytosine catabolic process klitinnij cikl GO 1904578 response to organic cyclic compound protein O linked glycosylation myeloid cell differentiation GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II DNA demethylation histone H3 K4 trimethylation GO 0031497 GO 0006336 GO 0034724 GO 0001301 GO 0007580 GO 0034652 GO 0010847 chromatin organization oxidative demethylationDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez54790 214133Ensembl ENSG00000168769 ENSMUSG00000040943UniProt Q6N021 Q4JK59RefSeq mRNK NM 001127208 NM 017628NM 001040400 NM 145989 NM 001346736RefSeq bilok NP 001120680 NP 060098NP 001035490 NP 001333665Lokus UCSC Hr 4 105 15 105 28 MbHr 3 133 17 133 25 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MEQDRTNHVEGNRLSPFLIPSPPICQTEPLATKLQNGSPLPERAHPEVNG DTKWHSFKSYYGIPCMKGSQNSRVSPDFTQESRGYSKCLQNGGIKRTVSE PSLSGLLQIKKLKQDQKANGERRNFGVSQERNPGESSQPNVSDLSDKKES VSSVAQENAVKDFTSFSTHNCSGPENPELQILNEQEGKSANYHDKNIVLL KNKAVLMPNGATVSASSVEHTHGELLEKTLSQYYPDCVSIAVQKTTSHIN AINSQATNELSCEITHPSHTSGQINSAQTSNSELPPKPAAVVSEACDADD ADNASKLAAMLNTCSFQKPEQLQQQKSVFEICPSPAENNIQGTTKLASGE EFCSGSSSNLQAPGGSSERYLKQNEMNGAYFKQSSVFTKDSFSATTTPPP PSQLLLSPPPPLPQVPQLPSEGKSTLNGGVLEEHHHYPNQSNTTLLREVK IEGKPEAPPSQSPNPSTHVCSPSPMLSERPQNNCVNRNDIQTAGTMTVPL CSEKTRPMSEHLKHNPPIFGSSGELQDNCQQLMRNKEQEILKGRDKEQTR DLVPPTQHYLKPGWIELKAPRFHQAESHLKRNEASLPSILQYQPNLSNQM TSKQYTGNSNMPGGLPRQAYTQKTTQLEHKSQMYQVEMNQGQSQGTVDQH LQFQKPSHQVHFSKTDHLPKAHVQSLCGTRFHFQQRADSQTEKLMSPVLK QHLNQQASETEPFSNSHLLQHKPHKQAAQTQPSQSSHLPQNQQQQQKLQI KNKEEILQTFPHPQSNNDQQREGSFFGQTKVEECFHGENQYSKSSEFETH NVQMGLEEVQNINRRNSPYSQTMKSSACKIQVSCSNNTHLVSENKEQTTH PELFAGNKTQNLHHMQYFPNNVIPKQDLLHRCFQEQEQKSQQASVLQGYK NRNQDMSGQQAAQLAQQRYLIHNHANVFPVPDQGGSHTQTPPQKDTQKHA ALRWHLLQKQEQQQTQQPQTESCHSQMHRPIKVEPGCKPHACMHTAPPEN KTWKKVTKQENPPASCDNVQQKSIIETMEQHLKQFHAKSLFDHKALTLKS QKQVKVEMSGPVTVLTRQTTAAELDSHTPALEQQTTSSEKTPTKRTAASV LNNFIESPSKLLDTPIKNLLDTPVKTQYDFPSCRCVEQIIEKDEGPFYTH LGAGPNVAAIREIMEERFGQKGKAIRIERVIYTGKEGKSSQGCPIAKWVV RRSSSEEKLLCLVRERAGHTCEAAVIVILILVWEGIPLSLADKLYSELTE TLRKYGTLTNRRCALNEERTCACQGLDPETCGASFSFGCSWSMYYNGCKF ARSKIPRKFKLLGDDPKEEEKLESHLQNLSTLMAPTYKKLAPDAYNNQIE YEHRAPECRLGLKEGRPFSGVTACLDFCAHAHRDLHNMQNGSTLVCTLTR EDNREFGGKPEDEQLHVLPLYKVSDVDEFGSVEAQEEKKRSGAIQVLSSF RRKVRMLAEPVKTCRQRKLEAKKAAAEKLSSLENSSNKNEKEKSAPSRTK QTENASQAKQLAELLRLSGPVMQQSQQPQPLQKQPPQPQQQQRPQQQQPH HPQTESVNSYSASGSTNPYMRRPNPVSPYPNSSHTSDIYGSTSPMNFYST SSQAAGSYLNSSNPMNPYPGLLNQNTQYPSYQCNGNLSVDNCSPYLGSYS PQSQPMDLYRYPSQDPLSKLSLPPIHTLYQPRFGNSQSFTSKYLGYGNQN MQGDGFSSCTIRPNVHHVGKLPPYPTHEMDGHFMGATSRLPPNLSNPNMD YKNGEHHSPSHIIHNYSAAPGMFNSSLHALHLQNKENDMLSHTANGLSKM LPALNHDRTACVQGGLHKLSDANGQEKQPLALVQGVASGAEDNDEVWSDS EQSFLDPDIGGVAVAPTHGSILIECAKRELHATTPLKNPNRNHPTRISLV FYQHKSMNEPKHGLALWEAKMAEKAREKEEECEKYGPDYVPQKSHGKKVK REPAEPHETSEPTYLRFIKSLAERTMSVTTDSTVTTSPYAFTRVTGPYNR YI A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do oksidoreduktaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak klitinnij cikl alternativnij splajsing metilyuvannya Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku ionom zaliza DNK LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Nagase T Kikuno R Nakayama M Hirosawa M Ohara O 2000 Prediction of the coding sequences of unidentified human genes XVIII The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro DNA Res 7 273 281 PMID 10997877 DOI 10 1093 dnares 7 4 271 Chen Q Chen Y Bian C Fujiki R Yu X 2013 TET2 promotes histone O GlcNAcylation during gene transcription Nature 493 561 564 PMID 23222540 DOI 10 1038 nature11742 Katoh M Katoh M 2004 Identification and characterization of human CXXC10 gene in silico Int J Oncol 25 1193 1199 PMID 15375572PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z TET2 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 25941 angl Procitovano 18 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 17 veresnya 2017 Procitovano 18 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 4 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Na cyu stattyu ne posilayutsya inshi statti Vikipediyi Bud laska rozstavte posilannya vidpovidno do prijnyatih rekomendacij