Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

DDX58 англ DExD H box helicase 58 білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плечі 9 ї хро

RIG-I

RIG-I

DDX58 (англ. DExD/H-box helicase 58) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 925 амінокислот, а молекулярна маса — 106 600.

DDX58
image
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи DDX58, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 58, RIGI, RLR-1, SGMRT2, RIG-I, DEXD/H-box helicase 58, RIG1
Зовнішні ІД OMIM: 609631 MGI: 2442858 HomoloGene: 32215 GeneCards: DDX58
Шаблон експресії
image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
23586
230073
Ensembl
ENSG00000107201
ENSMUSG00000040296
UniProt
O95786
Q6Q899
RefSeq (мРНК)
NM_014314
NM_172689
RefSeq (білок)
NP_055129
NP_766277
Локус (UCSC) Хр. 9: 32.46 – 32.53 Mb Хр. 4: 40.2 – 40.24 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MTTEQRRSLQAFQDYIRKTLDPTYILSYMAPWFREEEVQYIQAEKNNKGP
MEAATLFLKFLLELQEEGWFRGFLDALDHAGYSGLYEAIESWDFKKIEKL
EEYRLLLKRLQPEFKTRIIPTDIISDLSECLINQECEEILQICSTKGMMA
GAEKLVECLLRSDKENWPKTLKLALEKERNKFSELWIVEKGIKDVETEDL
EDKMETSDIQIFYQEDPECQNLSENSCPPSEVSDTNLYSPFKPRNYQLEL
ALPAMKGKNTIICAPTGCGKTFVSLLICEHHLKKFPQGQKGKVVFFANQI
PVYEQQKSVFSKYFERHGYRVTGISGATAENVPVEQIVENNDIIILTPQI
LVNNLKKGTIPSLSIFTLMIFDECHNTSKQHPYNMIMFNYLDQKLGGSSG
PLPQVIGLTASVGVGDAKNTDEALDYICKLCASLDASVIATVKHNLEELE
QVVYKPQKFFRKVESRISDKFKYIIAQLMRDTESLAKRICKDLENLSQIQ
NREFGTQKYEQWIVTVQKACMVFQMPDKDEESRICKALFLYTSHLRKYND
ALIISEHARMKDALDYLKDFFSNVRAAGFDEIEQDLTQRFEEKLQELESV
SRDPSNENPKLEDLCFILQEEYHLNPETITILFVKTRALVDALKNWIEGN
PKLSFLKPGILTGRGKTNQNTGMTLPAQKCILDAFKASGDHNILIATSVA
DEGIDIAQCNLVILYEYVGNVIKMIQTRGRGRARGSKCFLLTSNAGVIEK
EQINMYKEKMMNDSILRLQTWDEAVFREKILHIQTHEKFIRDSQEKPKPV
PDKENKKLLCRKCKALACYTADVRVIEECHYTVLGDAFKECFVSRPHPKP
KQFSSFEKRAKIFCARQNCSHDWGIHVKYKTFEIPVIKIESFVVEDIATG
VQTLYSKWKDFHFEKIPFDPAEMSK

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, противірусний захист, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, щільних контактах.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Cui X.-F., Imaizumi T., Yoshida H., Borden E.C., Satoh K. (2004). Retinoic acid-inducible gene-I is induced by interferon-gamma and regulates the expression of interferon-gamma stimulated gene 15 in MCF-7 cells. Biochem. Cell Biol. 82: 401—405. PMID 15181474 DOI:10.1139/o04-041
  • Seth R.B., Sun L., Ea C.-K., Chen Z.J. (2005). Identification and characterization of MAVS, a mitochondrial antiviral signaling protein that activates NF-kappaB and IRF 3. Cell. 122: 669—682. PMID 16125763 DOI:10.1016/j.cell.2005.08.012
  • Zhao C., Denison C., Huibregtse J.M., Gygi S.P., Krug R.M. (2005). Human ISG15 conjugation targets both IFN-induced and constitutively expressed proteins functioning in diverse cellular pathways. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 10200—10205. PMID 16009940 DOI:10.1073/pnas.0504754102
  • Kim M.J., Hwang S.Y., Imaizumi T., Yoo J.Y. (2008). Negative feedback regulation of RIG-I-mediated antiviral signaling by interferon-induced ISG15 conjugation. J. Virol. 82: 1474—1483. PMID 18057259 DOI:10.1128/JVI.01650-07
  • Ishikawa H., Barber G.N. (2008). STING is an endoplasmic reticulum adaptor that facilitates innate immune signalling. Nature. 455: 674—678. PMID 18724357 DOI:10.1038/nature07317

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

DDX58 angl DExD H box helicase 58 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 9 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 925 aminokislot a molekulyarna masa 106 600 DDX58Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2LWD 2LWE 2QFB 2QFD 2RMJ 2YKG 3LRN 3LRR 3NCU 3OG8 3ZD6 3ZD7 4AY2 4BPB 4NQK 4ON9 4P4H 5E3H 5F98 5F9F 5F9HIdentifikatoriSimvoliDDX58 DEAD Asp Glu Ala Asp box polypeptide 58 RIGI RLR 1 SGMRT2 RIG I DEXD H box helicase 58 RIG1Zovnishni ID OMIM 609631 MGI 2442858 HomoloGene 32215 GeneCards DDX58Ontologiya genaMolekulyarna funkciya nucleotide binding GO 0008026 helicase activity zinc ion binding zv yazuvannya z ionom metalu GO 0001948 GO 0016582 protein binding single stranded RNA binding identical protein binding RNA binding double stranded RNA binding double stranded DNA binding hydrolase activity ATP binding nucleic acid binding ubiquitin protein ligase bindingKlitinna komponenta citoplazma cell projection membrana bicellular tight junction klitinna membrana ruffle membrane mizhklitinni kontakti actin cytoskeleton citoskelet gialoplazmaBiologichnij proces regulation of cell migration response to exogenous dsRNA positive regulation of interferon alpha production proces imunnoyi sistemi response to virus cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway in response to virus GO 1901313 positive regulation of gene expression positive regulation of granulocyte macrophage colony stimulating factor production positive regulation of interleukin 8 production positive regulation of interleukin 6 production negative regulation of type I interferon production detection of virus GO 0022415 viral process vrodzhenij imunitet GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II RIG I signaling pathway regulation of type III interferon production positive regulation of defense response to virus by host positive regulation of interferon beta production protein deubiquitination positive regulation of response to cytokine stimulus cellular response to exogenous dsRNA defense response to virus positive regulation of DNA binding transcription factor activity positive regulation of myeloid dendritic cell cytokine productionDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez23586 230073Ensembl ENSG00000107201 ENSMUSG00000040296UniProt O95786 Q6Q899RefSeq mRNK NM 014314NM 172689RefSeq bilok NP 055129NP 766277Lokus UCSC Hr 9 32 46 32 53 MbHr 4 40 2 40 24 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MTTEQRRSLQAFQDYIRKTLDPTYILSYMAPWFREEEVQYIQAEKNNKGP MEAATLFLKFLLELQEEGWFRGFLDALDHAGYSGLYEAIESWDFKKIEKL EEYRLLLKRLQPEFKTRIIPTDIISDLSECLINQECEEILQICSTKGMMA GAEKLVECLLRSDKENWPKTLKLALEKERNKFSELWIVEKGIKDVETEDL EDKMETSDIQIFYQEDPECQNLSENSCPPSEVSDTNLYSPFKPRNYQLEL ALPAMKGKNTIICAPTGCGKTFVSLLICEHHLKKFPQGQKGKVVFFANQI PVYEQQKSVFSKYFERHGYRVTGISGATAENVPVEQIVENNDIIILTPQI LVNNLKKGTIPSLSIFTLMIFDECHNTSKQHPYNMIMFNYLDQKLGGSSG PLPQVIGLTASVGVGDAKNTDEALDYICKLCASLDASVIATVKHNLEELE QVVYKPQKFFRKVESRISDKFKYIIAQLMRDTESLAKRICKDLENLSQIQ NREFGTQKYEQWIVTVQKACMVFQMPDKDEESRICKALFLYTSHLRKYND ALIISEHARMKDALDYLKDFFSNVRAAGFDEIEQDLTQRFEEKLQELESV SRDPSNENPKLEDLCFILQEEYHLNPETITILFVKTRALVDALKNWIEGN PKLSFLKPGILTGRGKTNQNTGMTLPAQKCILDAFKASGDHNILIATSVA DEGIDIAQCNLVILYEYVGNVIKMIQTRGRGRARGSKCFLLTSNAGVIEK EQINMYKEKMMNDSILRLQTWDEAVFREKILHIQTHEKFIRDSQEKPKPV PDKENKKLLCRKCKALACYTADVRVIEECHYTVLGDAFKECFVSRPHPKP KQFSSFEKRAKIFCARQNCSHDWGIHVKYKTFEIPVIKIESFVVEDIATG VQTLYSKWKDFHFEKIPFDPAEMSK A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do gidrolaz gelikaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak imunitet vrodzhenij imunitet vzayemodiya hazyayin virus protivirusnij zahist acetilyuvannya alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ATF nukleotidami ionami metaliv ionom cinku RNK Lokalizovanij u klitinnij membrani citoplazmi citoskeleti membrani klitinnih kontaktah klitinnih vidrostkah shilnih kontaktah LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Cui X F Imaizumi T Yoshida H Borden E C Satoh K 2004 Retinoic acid inducible gene I is induced by interferon gamma and regulates the expression of interferon gamma stimulated gene 15 in MCF 7 cells Biochem Cell Biol 82 401 405 PMID 15181474 DOI 10 1139 o04 041 Seth R B Sun L Ea C K Chen Z J 2005 Identification and characterization of MAVS a mitochondrial antiviral signaling protein that activates NF kappaB and IRF 3 Cell 122 669 682 PMID 16125763 DOI 10 1016 j cell 2005 08 012 Zhao C Denison C Huibregtse J M Gygi S P Krug R M 2005 Human ISG15 conjugation targets both IFN induced and constitutively expressed proteins functioning in diverse cellular pathways Proc Natl Acad Sci U S A 102 10200 10205 PMID 16009940 DOI 10 1073 pnas 0504754102 Kim M J Hwang S Y Imaizumi T Yoo J Y 2008 Negative feedback regulation of RIG I mediated antiviral signaling by interferon induced ISG15 conjugation J Virol 82 1474 1483 PMID 18057259 DOI 10 1128 JVI 01650 07 Ishikawa H Barber G N 2008 STING is an endoplasmic reticulum adaptor that facilitates innate immune signalling Nature 455 674 678 PMID 18724357 DOI 10 1038 nature07317PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 10 veresnya 2015 Procitovano 8 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 24 serpnya 2017 Procitovano 8 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 9 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ