Термін «варіант, який викликає занепокоєння» (англ. Variant of concern; VOC) для SARS-CoV-2, який викликає COVID-19 – це категорія, яка використовується для варіантів вірусу, де присутня мутації в їхньому домені, що зв’язує рецептор білка (RBD), суттєво підвищення спорідненості зв’язування (наприклад, N501Y) у комплексі RBD-hACE2 (генетичні дані), а також пов’язане зі швидким поширенням у популяціях людей (епідеміологічні дані) та високою смертністю.
До цього новий варіант міг бути позначений як "цікавий варіант". Під час або після більш повної оцінки як «варіант, що викликає занепокоєння», варіант зазвичай приписують лінії в системі номенклатури PANGOLIN і кладам у системах Nextstrain і GISAID.
Під час пандемії COVID-19 було помічено, що вірус SARS-CoV-2 мутував, причому певні комбінації конкретних точкових мутацій виявилися більш тривожними, ніж інші. Це було в основному з причин передачі та вірулентності, а також щодо можливої появи мутацій escape.
Критерії
Кілька національних та міжнародних організацій охорони здоров’я (напр Центри контролю та профілактики захворювань (CDC) (США), громадського здоров’я Англії (PHE) і консорціум COVID-19 Genomics UK для Великої Британії, а також Канадська мережа геноміки COVID (CanCOGeN) використовують деякі або всі наведені нижче критерії для оцінити варіанти:
- Підвищена передача
- Підвищена захворюваність
- Підвищена смертність
- Підвищений ризик «довгого COVID»
- Можливість ухилятися від виявлення за допомогою діагностичних тестів
- Знижена чутливість до противірусних препаратів (якщо і коли такі препарати доступні)
- Знижена сприйнятливість до нейтралізуючих антитіл, як терапевтичних (наприклад, реконвалесцентна плазма або моноклональні антитіла), так і в лабораторних експериментах
- Здатність уникати природного імунітету (наприклад, викликати повторні інфекції)
- Здатність заражати вакцинованих осіб
- Підвищений ризик певних станів, таких як мультисистемний запальний синдром або довготривала COVID-19.
- Підвищена спорідненість з певними демографічними або клінічними групами, такими як діти або люди з ослабленим імунітетом .
Варіанти, які відповідають одному або кільком із цих критеріїв, можуть бути позначені як "варіанти, що цікавлять" або "варіанти, що розслідуються" ("VUI") до перевірки та підтвердження цих властивостей. Після підтвердження варіанти, що представляють інтерес /VUI, можуть бути перейменовані в «варіанти, що викликають занепокоєння» моніторинговими організаціями, такими як CDC. Пов’язаною категорією є «варіант із високим рівнем наслідків», який використовується CDC, якщо є чіткі докази того, що ефективність заходів профілактики або втручання для конкретного варіанта істотно знижена.
Класифікації за країнами
Всесвітня організація охорони здоров'я
ВООЗ веде список варіантів, що викликають глобальне занепокоєння. 26 листопада 2021 року ВООЗ додала п’ятий варіант, що викликає занепокоєння, омікрон-варіант, раніше відомий як B.1.1.529. Омікрон-варіант приєднується до варіантів альфа, бета, гамма та дельта.
Африка
NICD у Південній Африці підтримує список варіантів та засобів для тестування на місцевому рівні у співпраці з KRISP.
Європа
Станом на кінець листопада 2021 року Європейський центр профілактики та контролю захворювань оголосив чотири варіанти «варіантами, що викликають занепокоєння»: бета, гамма, дельта та B.1.1.529 (названий «омікрон» після оновлення посилання); мю, лямбда і AY.4.2 були названі варіантами, що представляють інтерес (VOI), тоді як було 9 "Варіантів, що контролюються". 25 варіантів були описані як «деескалаційні».
Сполучене Королівство
Станом на кінець листопада 2021 року Сполучене Королівство має п’ятнадцять варіантів у своєму «списку спостереження», 4 зі статусом «VOC» і 11 з рейтингом «VUI». Позначені «VOC» були альфа, бета, гамма та дельта. На початку грудня 2021 року омікрон було додано до «VOC». Серед досліджуваних варіантів — «VUI-21OCT-01/ AY 4.2».
Північна Америка
Канада (через 'health-infobase.canada.ca') та Сполучені Штати (через CDC) також ведуть списки варіантів, що викликають занепокоєння. Станом на початок грудня Канада відстежувала п’ять варіантів занепокоєння: Альфа, Бета, Гама, Дельта та Омікрон, а США — два: Дельта та Омікрон.
Див. також
Примітки
- Shahhosseini, Nariman; Babuadze, George (Giorgi); Wong, Gary; Kobinger, Gary P. (May 2021). Mutation Signatures and In Silico Docking of Novel SARS-CoV-2 Variants of Concern. Microorganisms (англ.). 9 (5): 926. doi:10.3390/microorganisms9050926. PMC 8146828. PMID 33925854.
- . GOV.UK. 28 січня 2021. At "Differences between a Variant of Concern and Variant Under Investigation". Архів оригіналу за 7 червня 2021. Процитовано 19 лютого 2021.
SARS-CoV-2 variants, if considered to have concerning epidemiological, immunological, or pathogenic properties, are raised for formal investigation. At this point they are designated Variant Under Investigation (VUI) with a year, month, and number. Following a risk assessment with the relevant expert committee, they may be designated Variant of Concern (VOC)
- Rambaut, A.; Holmes, E.C.; O’Toole, Á. та ін. (2020). A dynamic nomenclature proposal for SARS-CoV-2 lineages to assist genomic epidemiology. Nature Microbiology. 5 (11): 1403—1407. doi:10.1038/s41564-020-0770-5. PMC 7610519. PMID 32669681.
- Bedford, Trevor; Hodcroft, Emma B; Neher, Richard A (6 січня 2021). . nextstrain.org/blog. Архів оригіналу за 18 січня 2021. Процитовано 19 січня 2021.
- . www.gisaid.org. 4 липня 2020. Архів оригіналу за 9 січня 2021. Процитовано 7 січня 2021.
- Griffiths, Emma; Tanner, Jennifer; Knox, Natalie; Hsiao, Will; Van Domselaar, Gary (15 січня 2021). (PDF). CanCOGeN (nccid.ca). Архів оригіналу (PDF) за 17 квітня 2021. Процитовано 25 лютого 2021.
- Contributor, IDSA (2 лютого 2021). . Science Speaks: Global ID News (амер.). Архів оригіналу за 21 квітня 2021. Процитовано 20 лютого 2021.
- CDC. (en-us) . Centers for Disease Control and Prevention. Архів оригіналу за 15 травня 2021. Процитовано 4 січня 2021. Ця стаття містить текст з джерела, що зараз в суспільному надбанні.
- Investigation of SARS-CoV-2 variants of concern in EnglandTechnical briefing 6 [ 29 квітня 2021 у Wayback Machine.] 13 February 2021 (See section: Nomenclature of variants in the UK, P.3) assets.publishing.service.gov.uk, accessed 27 February 2021
- CDC (11 лютого 2020). . Centers for Disease Control and Prevention (en-us) . Архів оригіналу за 16 червня 2021. Процитовано 16 березня 2021.
- . www.who.int (англ.). Архів оригіналу за 9 червня 2021. Процитовано 28 листопада 2021.
- . World Health Organization. Архів оригіналу за 26 листопада 2021. Процитовано 28 листопада 2021.
- . NICD (амер.). 25 листопада 2021. Архів оригіналу за 6 лютого 2022. Процитовано 29 листопада 2021.
- . www.krisp.org.za. Архів оригіналу за 28 січня 2022. Процитовано 29 листопада 2021.
- SARS-CoV-2 variants of concern [ 16 червня 2021 у Wayback Machine.] 26 November 2021 www.ecdc.europa.eu accessed 27 November 2021
- Variants of concern or under investigation: data up to 24 November 2021 [ 21 січня 2022 у Wayback Machine.] Updated 26 November 2021, www.gov.uk, accessed 27 November 2021
- COVID-19 daily epidemiology update [ 22 серпня 2020 у Wayback Machine.] 12 May 2021 health-infobase.canada.ca accessed 13 May 2021
- . Centers for Disease Control and Prevention (en-us) . 11 лютого 2020. Архів оригіналу за 16 червня 2021. Процитовано 30 квітня 2021.
- SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions [ 5 лютого 2022 у Wayback Machine.] Dec. 1, 2021 www.cdc.gov, accessed December 7, 2021
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
Termin variant yakij viklikaye zanepokoyennya angl Variant of concern VOC dlya SARS CoV 2 yakij viklikaye COVID 19 ce kategoriya yaka vikoristovuyetsya dlya variantiv virusu de prisutnya mutaciyi v yihnomu domeni sho zv yazuye receptor bilka RBD suttyevo pidvishennya sporidnenosti zv yazuvannya napriklad N501Y u kompleksi RBD hACE2 genetichni dani a takozh pov yazane zi shvidkim poshirennyam u populyaciyah lyudej epidemiologichni dani ta visokoyu smertnistyu SARS CoV 2 virus sho viklikaye COVID 19 Do cogo novij variant mig buti poznachenij yak cikavij variant Pid chas abo pislya bilsh povnoyi ocinki yak variant sho viklikaye zanepokoyennya variant zazvichaj pripisuyut liniyi v sistemi nomenklaturi PANGOLIN i kladam u sistemah Nextstrain i GISAID Pid chas pandemiyi COVID 19 bulo pomicheno sho virus SARS CoV 2 mutuvav prichomu pevni kombinaciyi konkretnih tochkovih mutacij viyavilisya bilsh trivozhnimi nizh inshi Ce bulo v osnovnomu z prichin peredachi ta virulentnosti a takozh shodo mozhlivoyi poyavi mutacij escape KriteriyiKilka nacionalnih ta mizhnarodnih organizacij ohoroni zdorov ya napr Centri kontrolyu ta profilaktiki zahvoryuvan CDC SShA gromadskogo zdorov ya Angliyi PHE i konsorcium COVID 19 Genomics UK dlya Velikoyi Britaniyi a takozh Kanadska merezha genomiki COVID CanCOGeN vikoristovuyut deyaki abo vsi navedeni nizhche kriteriyi dlya ociniti varianti Pidvishena peredacha Pidvishena zahvoryuvanist Pidvishena smertnist Pidvishenij rizik dovgogo COVID Mozhlivist uhilyatisya vid viyavlennya za dopomogoyu diagnostichnih testiv Znizhena chutlivist do protivirusnih preparativ yaksho i koli taki preparati dostupni Znizhena sprijnyatlivist do nejtralizuyuchih antitil yak terapevtichnih napriklad rekonvalescentna plazma abo monoklonalni antitila tak i v laboratornih eksperimentah Zdatnist unikati prirodnogo imunitetu napriklad viklikati povtorni infekciyi Zdatnist zarazhati vakcinovanih osib Pidvishenij rizik pevnih staniv takih yak multisistemnij zapalnij sindrom abo dovgotrivala COVID 19 Pidvishena sporidnenist z pevnimi demografichnimi abo klinichnimi grupami takimi yak diti abo lyudi z oslablenim imunitetom Varianti yaki vidpovidayut odnomu abo kilkom iz cih kriteriyiv mozhut buti poznacheni yak varianti sho cikavlyat abo varianti sho rozsliduyutsya VUI do perevirki ta pidtverdzhennya cih vlastivostej Pislya pidtverdzhennya varianti sho predstavlyayut interes VUI mozhut buti perejmenovani v varianti sho viklikayut zanepokoyennya monitoringovimi organizaciyami takimi yak CDC Pov yazanoyu kategoriyeyu ye variant iz visokim rivnem naslidkiv yakij vikoristovuyetsya CDC yaksho ye chitki dokazi togo sho efektivnist zahodiv profilaktiki abo vtruchannya dlya konkretnogo varianta istotno znizhena Klasifikaciyi za krayinamiVsesvitnya organizaciya ohoroni zdorov ya VOOZ vede spisok variantiv sho viklikayut globalne zanepokoyennya 26 listopada 2021 roku VOOZ dodala p yatij variant sho viklikaye zanepokoyennya omikron variant ranishe vidomij yak B 1 1 529 Omikron variant priyednuyetsya do variantiv alfa beta gamma ta delta Afrika NICD u Pivdennij Africi pidtrimuye spisok variantiv ta zasobiv dlya testuvannya na miscevomu rivni u spivpraci z KRISP Yevropa Stanom na kinec listopada 2021 roku Yevropejskij centr profilaktiki ta kontrolyu zahvoryuvan ogolosiv chotiri varianti variantami sho viklikayut zanepokoyennya beta gamma delta ta B 1 1 529 nazvanij omikron pislya onovlennya posilannya myu lyambda i AY 4 2 buli nazvani variantami sho predstavlyayut interes VOI todi yak bulo 9 Variantiv sho kontrolyuyutsya 25 variantiv buli opisani yak deeskalacijni Spoluchene Korolivstvo Stanom na kinec listopada 2021 roku Spoluchene Korolivstvo maye p yatnadcyat variantiv u svoyemu spisku sposterezhennya 4 zi statusom VOC i 11 z rejtingom VUI Poznacheni VOC buli alfa beta gamma ta delta Na pochatku grudnya 2021 roku omikron bulo dodano do VOC Sered doslidzhuvanih variantiv VUI 21OCT 01 AY 4 2 Pivnichna Amerika Kanada cherez health infobase canada ca ta Spolucheni Shtati cherez CDC takozh vedut spiski variantiv sho viklikayut zanepokoyennya Stanom na pochatok grudnya Kanada vidstezhuvala p yat variantiv zanepokoyennya Alfa Beta Gama Delta ta Omikron a SShA dva Delta ta Omikron Div takozhShtami SARS CoV 2 Cluster 5 Alfa Beta Gamma Delta Epsilon Zeta Teta Eta Jota Kappa Lyambda M yu OmikronPrimitkiShahhosseini Nariman Babuadze George Giorgi Wong Gary Kobinger Gary P May 2021 Mutation Signatures and In Silico Docking of Novel SARS CoV 2 Variants of Concern Microorganisms angl 9 5 926 doi 10 3390 microorganisms9050926 PMC 8146828 PMID 33925854 GOV UK 28 sichnya 2021 At Differences between a Variant of Concern and Variant Under Investigation Arhiv originalu za 7 chervnya 2021 Procitovano 19 lyutogo 2021 SARS CoV 2 variants if considered to have concerning epidemiological immunological or pathogenic properties are raised for formal investigation At this point they are designated Variant Under Investigation VUI with a year month and number Following a risk assessment with the relevant expert committee they may be designated Variant of Concern VOC Rambaut A Holmes E C O Toole A ta in 2020 A dynamic nomenclature proposal for SARS CoV 2 lineages to assist genomic epidemiology Nature Microbiology 5 11 1403 1407 doi 10 1038 s41564 020 0770 5 PMC 7610519 PMID 32669681 Bedford Trevor Hodcroft Emma B Neher Richard A 6 sichnya 2021 nextstrain org blog Arhiv originalu za 18 sichnya 2021 Procitovano 19 sichnya 2021 www gisaid org 4 lipnya 2020 Arhiv originalu za 9 sichnya 2021 Procitovano 7 sichnya 2021 Griffiths Emma Tanner Jennifer Knox Natalie Hsiao Will Van Domselaar Gary 15 sichnya 2021 PDF CanCOGeN nccid ca Arhiv originalu PDF za 17 kvitnya 2021 Procitovano 25 lyutogo 2021 Contributor IDSA 2 lyutogo 2021 Science Speaks Global ID News amer Arhiv originalu za 21 kvitnya 2021 Procitovano 20 lyutogo 2021 CDC en us Centers for Disease Control and Prevention Arhiv originalu za 15 travnya 2021 Procitovano 4 sichnya 2021 Cya stattya mistit tekst z dzherela sho zaraz v suspilnomu nadbanni Investigation of SARS CoV 2 variants of concern in EnglandTechnical briefing 6 29 kvitnya 2021 u Wayback Machine 13 February 2021 See section Nomenclature of variants in the UK P 3 assets publishing service gov uk accessed 27 February 2021 CDC 11 lyutogo 2020 Centers for Disease Control and Prevention en us Arhiv originalu za 16 chervnya 2021 Procitovano 16 bereznya 2021 www who int angl Arhiv originalu za 9 chervnya 2021 Procitovano 28 listopada 2021 World Health Organization Arhiv originalu za 26 listopada 2021 Procitovano 28 listopada 2021 NICD amer 25 listopada 2021 Arhiv originalu za 6 lyutogo 2022 Procitovano 29 listopada 2021 www krisp org za Arhiv originalu za 28 sichnya 2022 Procitovano 29 listopada 2021 SARS CoV 2 variants of concern 16 chervnya 2021 u Wayback Machine 26 November 2021 www ecdc europa eu accessed 27 November 2021 Variants of concern or under investigation data up to 24 November 2021 21 sichnya 2022 u Wayback Machine Updated 26 November 2021 www gov uk accessed 27 November 2021 COVID 19 daily epidemiology update 22 serpnya 2020 u Wayback Machine 12 May 2021 health infobase canada ca accessed 13 May 2021 Centers for Disease Control and Prevention en us 11 lyutogo 2020 Arhiv originalu za 16 chervnya 2021 Procitovano 30 kvitnya 2021 SARS CoV 2 Variant Classifications and Definitions 5 lyutogo 2022 u Wayback Machine Dec 1 2021 www cdc gov accessed December 7 2021