Перший Досліджуваний Варіант у грудні 2020 року (англ. The first Variant Under Investigation in December 2020 абревіатура VUI — 202012/01 затверджена як офіційна скорочена назва) а також відомий як гілка B.1.1.7, — варіант SARS-CoV-2, вірусу, який викликає COVID-19. Вперше варіант був виявлений у Великій Британії у жовтні 2020 року на вибірці, відібраній попереднього місяця і він швидко почав поширюватися до середини грудня. Це корелює зі значним збільшенням рівня зараження COVID-19 у Великій Британії; вважається, що це збільшення є принаймні частково обумовленим мутацією N501Y всередині рецептор-зв'язувального домену спайкового глікопротеїну, який необхідний для зв'язування з Ангіотензинперетворювальним ферментом 2 в клітинах людини.
Альфа-варіант SARS-CoV-2 | |
Офіційна назва | англ. Alpha[1] |
---|---|
Наукова назва таксона | Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus |
Таксономічний ранг | вид |
Вернакулярна назва | severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 і SARS-CoV-2 |
Названо на честь | альфа |
Дата відкриття (винаходу) | 20 вересня 2020[2] |
Місце відкриття | Велика Британія[3] |
Кількість випадків | 1[2], 1[2], 1[2], 1[2], 1[2], 1[2], 1[2], 1[2], 1[2], 1[2], 2[2], 2[2], 3[2], 3[2], 4[2], 4[2], 4[2], 4[2], 5[2], 7[2], 10[2], 13[2], 15[2], 17[2], 21[2], 21[2], 21[2], 21[2], 22[2], 22[2], 23[2], 30[2], 40[2], 42[2], 50[2], 56[2], 80[2], 89[2], 89[2], 95[2], 98[2], 99[2], 114[2], 213[2], 132[2], 370[2] і 24 364[2] |
Підтримується Вікіпроєктом | d і |
Альфа-варіант SARS-CoV-2 у Вікісховищі |
Генетика
Мутації SARS-CoV-2 є розповсюдженими: за даними консорціуму Геноміки Коронавірусної хвороби Великої Британії (COG-UK), лише у поверхневих глікопротеїнах («шипах» вірусу) виявлено понад 4000 мутацій. Зосередження уваги на мутаціях є загальним способом відстеження поширення вірусу. Окрім того, що, наприклад, показано, що SARS-CoV-2 прибув до Великої Британії з понад 1000 окремих випадків, він також показує, що варіант з мутацією G614 повністю замінив попередній D614.
Варіант VUI — 202012/01 визначається 17 мутаціями включаючи декілька в пепломері: мутація 69–70, мутація 144, N501Y, A570D, D614G, P681H, T716I, S982A, D1118H. Здається, однією з найважливіших мутацій є мутація N501Y — перехід від аспарагіну (N) до тирозину (Y) в амінокислотному положенні 501. Це пов'язано з його положенням всередині рецептор-зв'язувального домену (RBD) пепломера, який зв'язується з Ангіотензинперетворювальним ферментом 2. Мутації в RBD можуть призвести до того, що вірус стає більш заразним.
Виявлення
VUI-202012/01 був виявлений в жовтні 2020 року консорціумом Геноміки Коронавірусної хвороби Великої Британії (COG-UK) на вибірці, відібраній у вересні того ж року.
Характеристика
Заразність
На засіданні телеконференції 18 грудня 2020 року NERVTAG дійшов висновку, що вони більш-менш впевнені, що VUI-202012/01 є значно більш заразним, ніж інші варіанти, але що даних для досягнення будь-якого висновку щодо основного механізму підвищеної заразності (наприклад, збільшення вірусного навантаження) недостатньо, розподіл вірусів у тканинах, серійний інтервал тощо), віковий розподіл випадків або тяжкість захворювання.
Прем'єр-міністр Великої Британії Борис Джонсон заявив 19 грудня 2020 року, що новий варіант може бути на 70 % більш заразним, ніж попередні варіанти, хоча існує «значна невизначеність». Французький уряд заперечив думку Джонсона, заявивши, що «на цьому етапі це не було підтверджено». Вівек Мурті, який є колишнім головним лікарем США і нині є кандидатом на посаду головного лікаря та співголовою Консультативної ради COVID-19, погодився з Джонсоном, що варіант, здається, більш заразний.
Поширення
Перший випадок був, ймовірно, у середині вересня в Лондоні чи Кенті, Велика Британія. Станом на 13 грудня 2020 року у Великій Британії було виявлено 1108 випадків з цим варіантом у майже 60 різних місцевих органах влади. Ці випадки були переважно на південному сході Англії. Варіант також ідентифікований в Уельсі та Шотландії. 20 грудня 2020 року BBC повідомила, що Всесвітня організація охорони здоров'я (ВООЗ) заявила, що дев'ять випадків нового варіанту були зареєстровані в Данії та по одному в Нідерландах та Австралії. Пізніше того ж дня було повідомлено, що чотири були виявлені в Бельгії а один — в Італії. Сполучене Королівство та Данія проводять послідовність розслідувань своїх випадків коронавірусу значно вищими показниками, ніж більшість інших і вважалося ймовірним, що інші країни виявлять цей варіант пізніше. У Південній Африці також був виявлений штам з тією ж мутацією N501Y (що може призвести до вищої заразності), але він відрізняється від штаму Великої Британії. Мутація N501Y була виявлена і в інших місцях: в Австралії в червні — липні, США в липні та Бразилії в квітні, і поки не ясно, чи виникла вона спонтанно у Великій Британії, чи була імпортована.
Примітки
- Записується як VUI 202012/01 (англ. Variant Under Investigation, рік 2020, місяць 12, варіант 01). Джерело: і .
Джерела
- https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/
- https://cov-lineages.org/global_report_B.1.1.7.html
- Rambaut A., Loman N. J., Pybus O. G. та ін. Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations. — 2020.
- . Public Health England. 14 грудня 2020. Архів оригіналу за 15 грудня 2021. Процитовано 21 грудня 2020.
- . GISAID. Архів оригіналу за 20 грудня 2020. Процитовано 20 грудня 2020.
- (PDF). European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC). 20 грудня 2020. Архів оригіналу (PDF) за 17 грудня 2021. Процитовано 21 грудня 2020.
- Kupferschmidt, Kai; 2020 (20 грудня 2020). . Science | AAAS (англ.). Архів оригіналу за 21 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.
- . BBC News. 20 грудня 2020. Архів оригіналу за 21 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.
- Wise, Jacqui (16 грудня 2020). . BMJ (англ.). 371. doi:10.1136/bmj.m4857. ISSN 1756-1833. PMID 33328153. Архів оригіналу за 20 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.
- . Cell. 182 (4): 812—827.e19. 20 серпня 2020. doi:10.1016/j.cell.2020.06.043. Архів оригіналу за 20 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020 — через ScienceDirect.
- For a list of the symbols used for the α-amino acids incorporated into protein under mRNA direction, see:
- New and Emerging Respiratory Virus Threats Advisory Group (18 грудня 2020). . Архів оригіналу за 20 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.
- . BBC News. 20 грудня 2020. Архів оригіналу за 21 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.
- . BBC News. 19 грудня 2020. Архів оригіналу за 21 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.
- . Metro. 20 грудня 2020. Архів оригіналу за 20 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.
- GRIESHABER, KIRSTEN; HUI, SYLVIA (20 грудня 2020). . chicagotribune.com. Архів оригіналу за 20 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.
- Berger, Miriam (20 грудня 2020). . Washington Post (амер.). ISSN 0190-8286. Архів оригіналу за 20 грудня 2020. Процитовано 20 грудня 2020.
- Higgins-Dunn, N. (19 грудня 2020). . MSNBC. Архів оригіналу за 26 листопада 2021. Процитовано 21 грудня 2020.
- . www.sanger.ac.uk (амер.). Архів оригіналу за 13 вересня 2020. Процитовано 19 грудня 2020.
- Henley, Jon; Jones, Sam; Giuffrida, Angela; Holmes, Oliver (20 грудня 2020). . The Guardian. Архів оригіналу за 30 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.
- . The Brussel Times. 20 грудня 2020. Архів оригіналу за 20 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.
- [Coronavirus, one person tests positive in Italy for the English variant]. la Repubblica (італ.). 20 грудня 2020. Архів оригіналу за 2 січня 2021. Процитовано 21 грудня 2020.
- Knudsen, T.H. (20 грудня 2020). . Данське радіо (дан.). Архів оригіналу за 20 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.
- . New York Times. 20 грудня 2020. Архів оригіналу за 20 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.
- . Science Mag. 20 грудня 2020. Архів оригіналу за 21 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.
- . Архів оригіналу за 20 грудня 2020. Процитовано 21 грудня 2020.
{{}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з текстом «archived copy» як значення параметру title ()
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
Pershij Doslidzhuvanij Variant u grudni 2020 roku angl The first Variant Under Investigation in December 2020 abreviatura VUI 202012 01 zatverdzhena yak oficijna skorochena nazva a takozh vidomij yak gilka B 1 1 7 variant SARS CoV 2 virusu yakij viklikaye COVID 19 Vpershe variant buv viyavlenij u Velikij Britaniyi u zhovtni 2020 roku na vibirci vidibranij poperednogo misyacya i vin shvidko pochav poshiryuvatisya do seredini grudnya Ce korelyuye zi znachnim zbilshennyam rivnya zarazhennya COVID 19 u Velikij Britaniyi vvazhayetsya sho ce zbilshennya ye prinajmni chastkovo obumovlenim mutaciyeyu N501Y vseredini receptor zv yazuvalnogo domenu spajkovogo glikoproteyinu yakij neobhidnij dlya zv yazuvannya z Angiotenzinperetvoryuvalnim fermentom 2 v klitinah lyudini Alfa variant SARS CoV 2 source source source source source source source source track Oficijna nazvaangl Alpha 1 Naukova nazva taksonaSevere acute respiratory syndrome related coronavirus Taksonomichnij rangvid Vernakulyarna nazvasevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 i SARS CoV 2 Nazvano na chestalfa Data vidkrittya vinahodu 20 veresnya 2020 2 Misce vidkrittyaVelika Britaniya 3 Kilkist vipadkiv1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 2 2 2 2 3 2 3 2 4 2 4 2 4 2 4 2 5 2 7 2 10 2 13 2 15 2 17 2 21 2 21 2 21 2 21 2 22 2 22 2 23 2 30 2 40 2 42 2 50 2 56 2 80 2 89 2 89 2 95 2 98 2 99 2 114 2 213 2 132 2 370 2 i 24 364 2 Pidtrimuyetsya Vikiproyektomd i Proyekt Velika Britaniya Alfa variant SARS CoV 2 u VikishovishiGenetikaMutaciyi SARS CoV 2 ye rozpovsyudzhenimi za danimi konsorciumu Genomiki Koronavirusnoyi hvorobi Velikoyi Britaniyi COG UK lishe u poverhnevih glikoproteyinah shipah virusu viyavleno ponad 4000 mutacij Zoseredzhennya uvagi na mutaciyah ye zagalnim sposobom vidstezhennya poshirennya virusu Okrim togo sho napriklad pokazano sho SARS CoV 2 pribuv do Velikoyi Britaniyi z ponad 1000 okremih vipadkiv vin takozh pokazuye sho variant z mutaciyeyu G614 povnistyu zaminiv poperednij D614 Variant VUI 202012 01 viznachayetsya 17 mutaciyami vklyuchayuchi dekilka v peplomeri mutaciya 69 70 mutaciya 144 N501Y A570D D614G P681H T716I S982A D1118H Zdayetsya odniyeyu z najvazhlivishih mutacij ye mutaciya N501Y perehid vid asparaginu N do tirozinu Y v aminokislotnomu polozhenni 501 Ce pov yazano z jogo polozhennyam vseredini receptor zv yazuvalnogo domenu RBD peplomera yakij zv yazuyetsya z Angiotenzinperetvoryuvalnim fermentom 2 Mutaciyi v RBD mozhut prizvesti do togo sho virus staye bilsh zaraznim ViyavlennyaVUI 202012 01 buv viyavlenij v zhovtni 2020 roku konsorciumom Genomiki Koronavirusnoyi hvorobi Velikoyi Britaniyi COG UK na vibirci vidibranij u veresni togo zh roku HarakteristikaZaraznist Na zasidanni telekonferenciyi 18 grudnya 2020 roku NERVTAG dijshov visnovku sho voni bilsh mensh vpevneni sho VUI 202012 01 ye znachno bilsh zaraznim nizh inshi varianti ale sho danih dlya dosyagnennya bud yakogo visnovku shodo osnovnogo mehanizmu pidvishenoyi zaraznosti napriklad zbilshennya virusnogo navantazhennya nedostatno rozpodil virusiv u tkaninah serijnij interval tosho vikovij rozpodil vipadkiv abo tyazhkist zahvoryuvannya Prem yer ministr Velikoyi Britaniyi Boris Dzhonson zayaviv 19 grudnya 2020 roku sho novij variant mozhe buti na 70 bilsh zaraznim nizh poperedni varianti hocha isnuye znachna neviznachenist Francuzkij uryad zaperechiv dumku Dzhonsona zayavivshi sho na comu etapi ce ne bulo pidtverdzheno Vivek Murti yakij ye kolishnim golovnim likarem SShA i nini ye kandidatom na posadu golovnogo likarya ta spivgolovoyu Konsultativnoyi radi COVID 19 pogodivsya z Dzhonsonom sho variant zdayetsya bilsh zaraznij PoshirennyaPershij vipadok buv jmovirno u seredini veresnya v Londoni chi Kenti Velika Britaniya Stanom na 13 grudnya 2020 roku u Velikij Britaniyi bulo viyavleno 1108 vipadkiv z cim variantom u majzhe 60 riznih miscevih organah vladi Ci vipadki buli perevazhno na pivdennomu shodi Angliyi Variant takozh identifikovanij v Uelsi ta Shotlandiyi 20 grudnya 2020 roku BBC povidomila sho Vsesvitnya organizaciya ohoroni zdorov ya VOOZ zayavila sho dev yat vipadkiv novogo variantu buli zareyestrovani v Daniyi ta po odnomu v Niderlandah ta Avstraliyi Piznishe togo zh dnya bulo povidomleno sho chotiri buli viyavleni v Belgiyi a odin v Italiyi Spoluchene Korolivstvo ta Daniya provodyat poslidovnist rozsliduvan svoyih vipadkiv koronavirusu znachno vishimi pokaznikami nizh bilshist inshih i vvazhalosya jmovirnim sho inshi krayini viyavlyat cej variant piznishe U Pivdennij Africi takozh buv viyavlenij shtam z tiyeyu zh mutaciyeyu N501Y sho mozhe prizvesti do vishoyi zaraznosti ale vin vidriznyayetsya vid shtamu Velikoyi Britaniyi Mutaciya N501Y bula viyavlena i v inshih miscyah v Avstraliyi v chervni lipni SShA v lipni ta Braziliyi v kvitni i poki ne yasno chi vinikla vona spontanno u Velikij Britaniyi chi bula importovana PrimitkiZapisuyetsya yak VUI 202012 01 angl Variant Under Investigation rik 2020 misyac 12 variant 01 Dzherelo i Dzherelahttps www who int en activities tracking SARS CoV 2 variants https cov lineages org global report B 1 1 7 html Rambaut A Loman N J Pybus O G ta in Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS CoV 2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations 2020 d Track Q28320577d Track Q20005716d Track Q32632869d Track Q32643108d Track Q104668085 Public Health England 14 grudnya 2020 Arhiv originalu za 15 grudnya 2021 Procitovano 21 grudnya 2020 GISAID Arhiv originalu za 20 grudnya 2020 Procitovano 20 grudnya 2020 PDF European Centre for Disease Prevention and Control ECDC 20 grudnya 2020 Arhiv originalu PDF za 17 grudnya 2021 Procitovano 21 grudnya 2020 Kupferschmidt Kai 2020 20 grudnya 2020 Science AAAS angl Arhiv originalu za 21 grudnya 2020 Procitovano 21 grudnya 2020 BBC News 20 grudnya 2020 Arhiv originalu za 21 grudnya 2020 Procitovano 21 grudnya 2020 Wise Jacqui 16 grudnya 2020 BMJ angl 371 doi 10 1136 bmj m4857 ISSN 1756 1833 PMID 33328153 Arhiv originalu za 20 grudnya 2020 Procitovano 21 grudnya 2020 Cell 182 4 812 827 e19 20 serpnya 2020 doi 10 1016 j cell 2020 06 043 Arhiv originalu za 20 grudnya 2020 Procitovano 21 grudnya 2020 cherez ScienceDirect For a list of the symbols used for the a amino acids incorporated into protein under mRNA direction see New and Emerging Respiratory Virus Threats Advisory Group 18 grudnya 2020 Arhiv originalu za 20 grudnya 2020 Procitovano 21 grudnya 2020 BBC News 20 grudnya 2020 Arhiv originalu za 21 grudnya 2020 Procitovano 21 grudnya 2020 BBC News 19 grudnya 2020 Arhiv originalu za 21 grudnya 2020 Procitovano 21 grudnya 2020 Metro 20 grudnya 2020 Arhiv originalu za 20 grudnya 2020 Procitovano 21 grudnya 2020 GRIESHABER KIRSTEN HUI SYLVIA 20 grudnya 2020 chicagotribune com Arhiv originalu za 20 grudnya 2020 Procitovano 21 grudnya 2020 Berger Miriam 20 grudnya 2020 Washington Post amer ISSN 0190 8286 Arhiv originalu za 20 grudnya 2020 Procitovano 20 grudnya 2020 Higgins Dunn N 19 grudnya 2020 MSNBC Arhiv originalu za 26 listopada 2021 Procitovano 21 grudnya 2020 www sanger ac uk amer Arhiv originalu za 13 veresnya 2020 Procitovano 19 grudnya 2020 Henley Jon Jones Sam Giuffrida Angela Holmes Oliver 20 grudnya 2020 The Guardian Arhiv originalu za 30 grudnya 2020 Procitovano 21 grudnya 2020 The Brussel Times 20 grudnya 2020 Arhiv originalu za 20 grudnya 2020 Procitovano 21 grudnya 2020 Coronavirus one person tests positive in Italy for the English variant la Repubblica ital 20 grudnya 2020 Arhiv originalu za 2 sichnya 2021 Procitovano 21 grudnya 2020 Knudsen T H 20 grudnya 2020 Danske radio dan Arhiv originalu za 20 grudnya 2020 Procitovano 21 grudnya 2020 New York Times 20 grudnya 2020 Arhiv originalu za 20 grudnya 2020 Procitovano 21 grudnya 2020 Science Mag 20 grudnya 2020 Arhiv originalu za 21 grudnya 2020 Procitovano 21 grudnya 2020 Arhiv originalu za 20 grudnya 2020 Procitovano 21 grudnya 2020 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite web title Shablon Cite web cite web a Obslugovuvannya CS1 Storinki z tekstom archived copy yak znachennya parametru title posilannya