Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

Аденозин дезамінази РНК ADAR родина білків ферментів які відщеплюють аміногрупу від азотистої основи аденіну яка знаходи

Аденозин-дезамінази РНК

Аденозин-дезамінази РНК

Аденозин-дезамінази РНК, ADAR — родина білків-ферментів , які відщеплюють аміногрупу від азотистої основи аденіну, яка знаходиться у полінуклеотидному ланцюгу РНК. Аденозин-дезамінази розпізнають дволанцюгову ділянку РНК і є основними ферментами, які забезпечують процес редагування РНК у хребетних, зокрема у ссавців і людини.

Аденозин-дезаміназа РНК 1
image
ADAR1 людини
Ідентифікатори
СимволADAR
Інші символиADAR1; AGS6; DRADA; DSH; DSRAD; G1P1; IFI-4; IFI4; K88DSRBP; P136
Entrez103
OMIM146920
RefSeqNM_001025107
UniProtP55265
Інша інформація
3.5.4.37
ЛокусХр. 1 1q21.3
Аденозин-дезаміназа РНК 2
image
ADARB1 людини
Ідентифікатори
СимволADARB1
Інші символиRED2; ADAR3
Entrez104
OMIM601218
RefSeqNP_001020008&rn=1 NM_001024837, NP_001020008
UniProtP78563
Інша інформація
3.5.4.37
ЛокусХр. 21 21q22.3
Аденозин-дезаміназа РНК 3
Ідентифікатори
СимволADARB2
Entrez105
OMIM602065
RefSeqNP_061172.1&rn=1 NM_018702.3, NP_061172.1
Інша інформація
ЛокусХр. 10 10p15.3

За амінокислотною послідовністю й рентгенограмами білкових кристалів вони принципово відрізняються від інших аденозиндезаміназ (ADA), що відщеплюють аміногрупу від аденозинмонофосфату (АМФ). Деяку гомологію спостерігають між генами ADAR та цитозиндезаміназ, що може свідчити про їх походження від спільного гену-предка. Утворений внаслідок дезамінування нуклеотид інозин розпізнається системами трансляції, РНК-інтерференції, зворотної транскрипції та іншими молекулярними машинами, побудованими на принципі комплементарності, як гуанозин.

До родини аденозин-дезаміназ у ссавців належать 3 гени: ADAR1, ADAR2, ADAR3. Білок ADAR3 присутній лише в головному мозку, тоді як ADAR1 і ADAR2 наявні в усіх тканинах, хоча більше їх також у ЦНС.

Структура

На N-кінці білка знаходяться 2 РНК-зв'язувальних домени, а також 2 Z-ДНК-зв'язувальні сайти. C-кінець містить каталітичний дезаміназний домен, який у ADARB2 є неактивним.

Аденозин-дезамінази діють у формі димерів. Кожен із білків ADAR має у своєму складі РНК-зв'язувальний домен, який містить іон цинку. Також в активному центрі ферменту є молекула (IP6). Білок ADAR1 людини має в своєму складі додатковий сайт зв'язування з іоном цинку, який сприяє реакції дезамінування аденозину.

Білок ADAR1 існує у вигляді декількох ізоформ. Ізоформа ADAR1p110 коротша, не містить ДНК-зв'язувального домену, представлена в багатьох тканинах та не потребує додаткових сигналів для транскрипції і трансляції (конститутивна форма). Натомість ADAR1p150 є повнорозмірним білком, який експресується під дією інтерферонів. У мишей ADAR1p150 присутній у всіх тканинах окрім головного мозку. ADAR1p150 переважно локалізований у цитоплазмі клітин, тоді як ADAR1p110 — у ядрі.

image
Гомологія білків ADAR у тварин

Регуляція

Білки ADAR є мішенями фосфорилювання ферментами родини AKT-кіназ.

Функції

Редагування РНК

Докладніше: Редагування РНК

Аденозин-дезамінази взаємодіють із первинними транскриптами, найчастіше — до сплайсингу РНК. Мішенню є дволанцюгова РНК, зазвичай — спарені нуклеотиди у шпильках. Невідомо, чи існують послідовності, що є сприятливими до редагування, але є відомості щодо специфічної третинної й четвертинної укладки молекули РНК, яку використовують аденозин-дезамінази. Редагування відбувається в пре-мРНК, первинних транскриптах мікроРНК, у транскриптах повторів (наприклад, ). Редагування призводить до замін амінокислот у білку, що синтезується з мРНК, до створення або ліквідації сайтів для сплайсингу чи до зміни активності мікроРНК.

Вкорочений сплайс-варіант ферменту ADAR1 і білок ADAR2 містяться в ядрі та експресуються постійно. Білок ADAR1 із повною послідовністю (p150, масою 150 кілодальтон) рухається з ядра до цитоплазми й назад. Для білку ADAR3 людини не доведено дезаміназної активності.

Редагування А на І може відбуватися для всіх транскриптів (Q/R сайт глутаматних рецепторів — понад 99,9 % транскриптів редагуються) або лише для частини з них, тоді як інші транскрипти залишаються нередагованими. Регуляція редагування здійснюється багатьма факторами: інтерфероном, транскрипційними кофакторами, збиранням субодиниць білка в димери тощо. ADAR2 саморегулюється через негативний зворотний зв'язок: надлишок білка починає редагувати пре-мРНК самого ADAR2, викликаючи появу додаткового сайту сплайсингу й утворення вкороченого нефункціонального ферменту.

Досліди з аденозин-дезаміназ довели, що вони є життєво важливими для ссавців. Миші з вимкненим ADAR1 гинули ще в ембріональний період розвитку через масову втрату нейронів апоптозом і порушення системи кровотворення. Миші, позбавлені ADAR2, помирали одразу після народження через епілептичну активність мозку. Проте заміна лише одного нуклеотиду А на Г у сайті гену GluR2, що кодує глутамін, надавала змогу нокаутним мишам жити без таких порушень.

Частина сайтів редагування в мишей редагується переважно ADAR2, частина ADAR1, а інші редагуються обома ферментами.

У нематоди Caenorhabditis elegans білки ADAR задіяні в пригніченні активності ретротранспозонів та ендогенних вірусів.

РНК, що містить багато відредагованих інозинів, розпізнається білком SND1, який входить до складу РНК-індукованого комплексу заглушення біосинтезу білка. Це призводить до деградації такої РНК за допомогою ендонуклеази ENDOV.

У дрозофіли попри наявність лише одного гену ADAR, гомологу ADAR2, відбувається активне редагування РНК.

Інші функції

ADAR1 без зв'язування з РНК взаємодіє з білком UPF1, який входить до складу сплайсосоми, та є необхідним для руйнування інтронів після сплайсінгу. ADAR1 регулює транскрипцію в B-лімфоцитах через взаємодію з білком ELAVL1. Також ADAR1 зв'язується з протеїнкіназою PKR, пригнічуючи її противірусну дію. У зв'язуванні з PKR задіяні Z-ДНК–зв'язувальний домен та домен зв'язування для дволанцюгової РНК.

Походження та еволюція

Білки ADAR мають високий ступінь гомології з аденозин-дезаміназами тРНК (ADAT), а ті, у свою чергу, близькі до іншої родини ферментів — цитидиндезаміназ. При цьому не спостерігається жодної подібності у ADAR і аденозиндезаміназ пуринового обміну.

Гени ADAR наявні у більшості багатоклітинних тварин, хоча окремі групи втратили один чи обидва гени. Зокрема дрозофіли та інші комахи мають лише гомолог ADAR2.

Найбільшу кількість генів ADAR станом на 2018 рік мають реброплави, у геномі яких наявні 4 ізоформи аденозиндезаміназ. Ці ферменти є найбільш активними під час ембріогенезу. ADAR1 експресується на найвищому рівні під час раннього дроблення, тоді як ADAR2 і ADAR3 працюють під час формування війчастих гребінців.

Очисний добір у більшості видів тварин прибирає ідеально комплементарні дволанцюгові РНК, а ті, що залишаються, чи нові підлягають потужному редагуванню за допомогою ADAR1.

Захворювання

Мутації

Мутації гену ADAR призводять до виникнення рідкісного аутосомно-домінантного спадкового захворювання — [en], поширеного переважно серед японців, але відомого з європейської, індійської та карибської популяції.

Також мутації в цьому гені можуть призводити до рідкісного автоімунного [en].

Нейрологічні захворювання

У пацієнтів з хворобою Альцгеймера виявлено знижений рівень редагування аденозинів у РНК білків, пов'язаних з роботою головного мозку. Більша варіабельність редагування спостерігалася в гіпокампі, зокрема в Q/R сайті.

Редагування РНК серотонінового рецептора HTR2C посилюється під дією інтерферона, оскільки в 4 сайтах забезпечується білком ADAR1 Зміни рівнів редагування пре-мРНК цього рецептора спостерігаються при шизофренії, бічному аміотрофічному склерозі, під дією хронічного стресу, викликаного [en].

Інфекційні захворювання

Оскільки білки ADAR здатні зв'язуватися й редагувати довгі дволанцюгові РНК, притаманні багатьом вірусам на різних стадіях розвитку, то їхньою функцією вважалася противірусна дія шляхом редагування й пошкодження вірусного геному чи транскриптому. Перші свідчення такої дії були показані на клітинних лініях для вірусу кору. Однак упродовж 2010-х років накопичилося чимало досліджень, які виявили сприяння розмноженню вірусів з боку аденозиндезаміназ РНК. Зокрема це показано для вірусів кору, [en], ВІЛ, гепатиту D, Зіка.

Білки ADAR можуть відігравати роль у мутуванні РНК-вірусів. Також редагування РНК ВІЛ за допомогою ADAR1 не викликає суттєвих пошкоджень вірусних часточок та їхньої здатності інфікувати клітини.

Використання

Створено декілька штучних генетичних систем, елементом яких є аденозиндезамінази РНК, які здатні вибірково замінювати аденозин на інозин у РНК.

Див. також

Примітки

  1. Willemijn M. Gommans, Dylan E. Dupuis, Jill E. McCane, Nicholas E. Tatalias, Stefan Maas (2008), Diversifying Exon Code through A-to-I RNA Editing, у Smith, H. (ред.), DNA RNA Editing, Wiley & Sons, Inc, с. 3—30
  2. Savva, Yiannis A; Rieder, Leila E; Reenan, Robert A (2012). The ADAR protein family. Genome Biology. 13 (12): 252. doi:10.1186/gb-2012-13-12-252. ISSN 1465-6906.{{}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом ()
  3. Park, SeHee; Doherty, Erin E.; Xie, Yixuan; Padyana, Anil K.; Fang, Fang; Zhang, Yue; Karki, Agya; Lebrilla, Carlito B.; Siegel, Justin B.; Beal, Peter A. (2020). High-throughput mutagenesis reveals unique structural features of human ADAR1. Nature Communications. 11 (1). doi:10.1038/s41467-020-18862-2. ISSN 2041-1723.
  4. Sinigaglia, Ketty; Wiatrek, Dagmara; Khan, Anzer; Michalik, David; Sambrani, Nagraj; Sedmík, Jiří; Vukić, Dragana; O'Connell, Mary A.; Keegan, Liam P. (2019). ADAR RNA editing in innate immune response phasing, in circadian clocks and in sleep. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Regulatory Mechanisms. 1862 (3): 356—369. doi:10.1016/j.bbagrm.2018.10.011. ISSN 1874-9399.
  5. Piazzi, Manuela; Bavelloni, Alberto; Gallo, Angela; Blalock, William L. (2020). AKT-Dependent Phosphorylation of ADAR1p110 and ADAR2 Represents a New and Important Link Between Cell Signaling and RNA Editing. DNA and Cell Biology. 39 (3): 343—348. doi:10.1089/dna.2020.5351. ISSN 1044-5498.(англ.)
  6. Farajollahi, Sanaz and Maas, Stefan (2010). Molecular diversity through RNA editing: a balancing act. Trends in Genetics. Elsevier. 26 (5): 221—230.
  7. Costa Cruz, Pedro Henrique; Kato, Yuki; Nakahama, Taisuke; Shibuya, Toshiharu; Kawahara, Yukio (2020). A comparative analysis of ADAR mutant mice reveals site-specific regulation of RNA editing. RNA. 26 (4): 454—469. doi:10.1261/rna.072728.119. ISSN 1355-8382.
  8. Fischer, Sylvia E. J.; Ruvkun, Gary (2020). Caenorhabditis elegans ADAR editing and the ERI-6/7/MOV10 RNAi pathway silence endogenous viral elements and LTR retrotransposons. Proceedings of the National Academy of Sciences. 117 (11): 5987—5996. doi:10.1073/pnas.1919028117. ISSN 0027-8424.(англ.)
  9. Zhang, Jianzhi; Duan, Yuange; Dou, Shengqian; Luo, Shiqi; Zhang, Hong; Lu, Jian (2017). Adaptation of A-to-I RNA editing in Drosophila. PLOS Genetics. 13 (3): e1006648. doi:10.1371/journal.pgen.1006648. ISSN 1553-7404.{{}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом ()
  10. Zhou, Shili; Yang, Chao; Zhao, Fanfan; Huang, Yanxia; Lin, Yuxia; Huang, Changbai; Ma, Xiaocao; Du, Jingjie; Wang, Yi; Long, Gang; He, Junfang; Liu, Chao; Zhang, Ping (2019). Double-stranded RNA deaminase ADAR1 promotes the Zika virus replication by inhibiting the activation of protein kinase PKR. Journal of Biological Chemistry. 294 (48): 18168—18180. doi:10.1074/jbc.RA119.009113. ISSN 0021-9258.{{}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом ()
  11. Moroz, Leonid L.; Kocot, Kevin M.; Citarella, Mathew R.; Dosung, Sohn; Norekian, Tigran P.; Povolotskaya, Inna S.; Grigorenko, Anastasia P.; Dailey, Christopher; Berezikov, Eugene; Buckley, Katherine M.; Ptitsyn, Andrey; Reshetov, Denis; Mukherjee, Krishanu; Moroz, Tatiana P.; Bobkova, Yelena; Yu, Fahong; Kapitonov, Vladimir V.; Jurka, Jerzy; Bobkov, Yuri V.; Swore, Joshua J.; Girardo, David O.; Fodor, Alexander; Gusev, Fedor; Sanford, Rachel; Bruders, Rebecca; Kittler, Ellen; Mills, Claudia E.; Rast, Jonathan P.; Derelle, Romain; Solovyev, Victor V.; Kondrashov, Fyodor A.; Swalla, Billie J.; Sweedler, Jonathan V.; Rogaev, Evgeny I.; Halanych, Kenneth M.; Kohn, Andrea B. (2014). The ctenophore genome and the evolutionary origins of neural systems. Nature. 510 (7503): 109—114. doi:10.1038/nature13400. ISSN 0028-0836.
  12. Barak, Michal; Porath, Hagit T.; Finkelstein, Gilad; Knisbacher, Binyamin A.; Buchumenski, Ilana; Roth, Shalom Hillel; Levanon, Erez Y.; Eisenberg, Eli (2020). Purifying selection of long dsRNA is the first line of defense against false activation of innate immunity. Genome Biology. 21 (1). doi:10.1186/s13059-020-1937-3. ISSN 1474-760X.{{}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом ()(англ.)
  13. Nakahama, Taisuke; Kawahara, Yukio (2020). Adenosine-to-inosine RNA editing in the immune system: friend or foe?. Cellular and Molecular Life Sciences. doi:10.1007/s00018-020-03466-2. ISSN 1420-682X.(англ.)
  14. Khermesh, Khen; D'Erchia, Anna Maria; Barak, Michal; Annese, Anita; Wachtel, Chaim; Levanon, Erez Y.; Picardi, Ernesto; Eisenberg, Eli (2016). Reduced levels of protein recoding by A-to-I RNA editing in Alzheimer's disease. RNA. 22 (2): 290—302. doi:10.1261/rna.054627.115. ISSN 1355-8382.
  15. Gaisler-Salomon, Inna; Kravitz, Efrat; Feiler, Yulia; Safran, Michal; Biegon, Anat; Amariglio, Ninette; Rechavi, Gideon (2014). Hippocampus-specific deficiency in RNA editing of GluA2 in Alzheimer's disease. Neurobiology of Aging. 35 (8): 1785—1791. doi:10.1016/j.neurobiolaging.2014.02.018. ISSN 0197-4580.
  16. Yang, Weidong; Wang, Qingde; Kanes, Stephen J; Murray, John M; Nishikura, Kazuko (2004). Altered RNA editing of serotonin 5-HT2C receptor induced by interferon: implications for depression associated with cytokine therapy. Molecular Brain Research. 124 (1): 70—78. doi:10.1016/j.molbrainres.2004.02.010. ISSN 0169-328X.
  17. Samuel, Charles E. (2011). Adenosine deaminases acting on RNA (ADARs) are both antiviral and proviral. Virology. 411 (2): 180—193. doi:10.1016/j.virol.2010.12.004. ISSN 0042-6822.
  18. Priyadharsini, Jayaseelan Vijayashree; Paramasivam, Arumugam (2021). RNA editors: key regulators of viral response in cancer patients. Epigenomics. doi:10.2217/epi-2021-0001. ISSN 1750-1911.
  19. Piontkivska, Helen; Matos, Luis F.; Paul, Sinu; Scharfenberg, Brian; Farmerie, William G.; Miyamoto, Michael M.; Wayne, Marta L. (2016). Role of Host-Driven Mutagenesis in Determining Genome Evolution of Sigma Virus (DMelSV; Rhabdoviridae) inDrosophila melanogaster. Genome Biology and Evolution. 8 (9): 2952—2963. doi:10.1093/gbe/evw212. ISSN 1759-6653.
  20. Doria, Margherita; Neri, Francesca; Gallo, Angela; Farace, Maria Giulia; Michienzi, Alessandro (2009). Editing of HIV-1 RNA by the double-stranded RNA deaminase ADAR1 stimulates viral infection. Nucleic Acids Research. 37 (17): 5848—5858. doi:10.1093/nar/gkp604. ISSN 1362-4962.
  21. Montiel-Gonzalez, Maria Fernanda; Diaz Quiroz, Juan Felipe; Rosenthal, Joshua J.C. (2019). Current strategies for Site-Directed RNA Editing using ADARs. Methods. 156: 16—24. doi:10.1016/j.ymeth.2018.11.016. ISSN 1046-2023.
  22. Qu, Liang; Yi, Zongyi; Zhu, Shiyou; Wang, Chunhui; Cao, Zhongzheng; Zhou, Zhuo; Yuan, Pengfei; Yu, Ying; Tian, Feng; Liu, Zhiheng; Bao, Ying; Zhao, Yanxia; Wei, Wensheng (2019). Programmable RNA editing by recruiting endogenous ADAR using engineered RNAs. Nature Biotechnology. 37 (9): 1059—1069. doi:10.1038/s41587-019-0178-z. ISSN 1087-0156.

Джерела

  • Farajollahi, Sanaz and Maas, Stefan (2010). Molecular diversity through RNA editing: a balancing act. Trends in Genetics. Elsevier. 26 (5): 221—230.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

Adenozin dezaminazi RNK ADAR rodina bilkiv fermentiv yaki vidsheplyuyut aminogrupu vid azotistoyi osnovi adeninu yaka znahoditsya u polinukleotidnomu lancyugu RNK Adenozin dezaminazi rozpiznayut dvolancyugovu dilyanku RNK i ye osnovnimi fermentami yaki zabezpechuyut proces redaguvannya RNK u hrebetnih zokrema u ssavciv i lyudini Adenozin dezaminaza RNK 1ADAR1 lyudiniIdentifikatoriSimvolADARInshi simvoliADAR1 AGS6 DRADA DSH DSRAD G1P1 IFI 4 IFI4 K88DSRBP P136Entrez103OMIM146920RefSeqNM 001025107UniProtP55265Insha informaciya3 5 4 37LokusHr 1 1q21 3Adenozin dezaminaza RNK 2ADARB1 lyudiniIdentifikatoriSimvolADARB1Inshi simvoliRED2 ADAR3Entrez104OMIM601218RefSeqNP 001020008 amp rn 1 NM 001024837 NP 001020008UniProtP78563Insha informaciya3 5 4 37LokusHr 21 21q22 3Adenozin dezaminaza RNK 3IdentifikatoriSimvolADARB2Entrez105OMIM602065RefSeqNP 061172 1 amp rn 1 NM 018702 3 NP 061172 1Insha informaciyaLokusHr 10 10p15 3 Za aminokislotnoyu poslidovnistyu j rentgenogramami bilkovih kristaliv voni principovo vidriznyayutsya vid inshih adenozindezaminaz ADA sho vidsheplyuyut aminogrupu vid adenozinmonofosfatu AMF Deyaku gomologiyu sposterigayut mizh genami ADAR ta citozindezaminaz sho mozhe svidchiti pro yih pohodzhennya vid spilnogo genu predka Utvorenij vnaslidok dezaminuvannya nukleotid inozin rozpiznayetsya sistemami translyaciyi RNK interferenciyi zvorotnoyi transkripciyi ta inshimi molekulyarnimi mashinami pobudovanimi na principi komplementarnosti yak guanozin Do rodini adenozin dezaminaz u ssavciv nalezhat 3 geni ADAR1 ADAR2 ADAR3 Bilok ADAR3 prisutnij lishe v golovnomu mozku todi yak ADAR1 i ADAR2 nayavni v usih tkaninah hocha bilshe yih takozh u CNS StrukturaNa N kinci bilka znahodyatsya 2 RNK zv yazuvalnih domeni a takozh 2 Z DNK zv yazuvalni sajti C kinec mistit katalitichnij dezaminaznij domen yakij u ADARB2 ye neaktivnim Adenozin dezaminazi diyut u formi dimeriv Kozhen iz bilkiv ADAR maye u svoyemu skladi RNK zv yazuvalnij domen yakij mistit ion cinku Takozh v aktivnomu centri fermentu ye molekula IP6 Bilok ADAR1 lyudini maye v svoyemu skladi dodatkovij sajt zv yazuvannya z ionom cinku yakij spriyaye reakciyi dezaminuvannya adenozinu Bilok ADAR1 isnuye u viglyadi dekilkoh izoform Izoforma ADAR1p110 korotsha ne mistit DNK zv yazuvalnogo domenu predstavlena v bagatoh tkaninah ta ne potrebuye dodatkovih signaliv dlya transkripciyi i translyaciyi konstitutivna forma Natomist ADAR1p150 ye povnorozmirnim bilkom yakij ekspresuyetsya pid diyeyu interferoniv U mishej ADAR1p150 prisutnij u vsih tkaninah okrim golovnogo mozku ADAR1p150 perevazhno lokalizovanij u citoplazmi klitin todi yak ADAR1p110 u yadri Gomologiya bilkiv ADAR u tvarinRegulyaciyaBilki ADAR ye mishenyami fosforilyuvannya fermentami rodini AKT kinaz FunkciyiRedaguvannya RNK Dokladnishe Redaguvannya RNK Adenozin dezaminazi vzayemodiyut iz pervinnimi transkriptami najchastishe do splajsingu RNK Mishennyu ye dvolancyugova RNK zazvichaj spareni nukleotidi u shpilkah Nevidomo chi isnuyut poslidovnosti sho ye spriyatlivimi do redaguvannya ale ye vidomosti shodo specifichnoyi tretinnoyi j chetvertinnoyi ukladki molekuli RNK yaku vikoristovuyut adenozin dezaminazi Redaguvannya vidbuvayetsya v pre mRNK pervinnih transkriptah mikroRNK u transkriptah povtoriv napriklad Redaguvannya prizvodit do zamin aminokislot u bilku sho sintezuyetsya z mRNK do stvorennya abo likvidaciyi sajtiv dlya splajsingu chi do zmini aktivnosti mikroRNK Vkorochenij splajs variant fermentu ADAR1 i bilok ADAR2 mistyatsya v yadri ta ekspresuyutsya postijno Bilok ADAR1 iz povnoyu poslidovnistyu p150 masoyu 150 kilodalton ruhayetsya z yadra do citoplazmi j nazad Dlya bilku ADAR3 lyudini ne dovedeno dezaminaznoyi aktivnosti Redaguvannya A na I mozhe vidbuvatisya dlya vsih transkriptiv Q R sajt glutamatnih receptoriv ponad 99 9 transkriptiv redaguyutsya abo lishe dlya chastini z nih todi yak inshi transkripti zalishayutsya neredagovanimi Regulyaciya redaguvannya zdijsnyuyetsya bagatma faktorami interferonom transkripcijnimi kofaktorami zbirannyam subodinic bilka v dimeri tosho ADAR2 samoregulyuyetsya cherez negativnij zvorotnij zv yazok nadlishok bilka pochinaye redaguvati pre mRNK samogo ADAR2 viklikayuchi poyavu dodatkovogo sajtu splajsingu j utvorennya vkorochenogo nefunkcionalnogo fermentu Doslidi z adenozin dezaminaz doveli sho voni ye zhittyevo vazhlivimi dlya ssavciv Mishi z vimknenim ADAR1 ginuli she v embrionalnij period rozvitku cherez masovu vtratu nejroniv apoptozom i porushennya sistemi krovotvorennya Mishi pozbavleni ADAR2 pomirali odrazu pislya narodzhennya cherez epileptichnu aktivnist mozku Prote zamina lishe odnogo nukleotidu A na G u sajti genu GluR2 sho koduye glutamin nadavala zmogu nokautnim misham zhiti bez takih porushen Chastina sajtiv redaguvannya v mishej redaguyetsya perevazhno ADAR2 chastina ADAR1 a inshi redaguyutsya oboma fermentami U nematodi Caenorhabditis elegans bilki ADAR zadiyani v prignichenni aktivnosti retrotranspozoniv ta endogennih virusiv RNK sho mistit bagato vidredagovanih inoziniv rozpiznayetsya bilkom SND1 yakij vhodit do skladu RNK indukovanogo kompleksu zaglushennya biosintezu bilka Ce prizvodit do degradaciyi takoyi RNK za dopomogoyu endonukleazi ENDOV U drozofili popri nayavnist lishe odnogo genu ADAR gomologu ADAR2 vidbuvayetsya aktivne redaguvannya RNK Inshi funkciyi ADAR1 bez zv yazuvannya z RNK vzayemodiye z bilkom UPF1 yakij vhodit do skladu splajsosomi ta ye neobhidnim dlya rujnuvannya introniv pislya splajsingu ADAR1 regulyuye transkripciyu v B limfocitah cherez vzayemodiyu z bilkom ELAVL1 Takozh ADAR1 zv yazuyetsya z proteyinkinazoyu PKR prignichuyuchi yiyi protivirusnu diyu U zv yazuvanni z PKR zadiyani Z DNK zv yazuvalnij domen ta domen zv yazuvannya dlya dvolancyugovoyi RNK Pohodzhennya ta evolyuciyaBilki ADAR mayut visokij stupin gomologiyi z adenozin dezaminazami tRNK ADAT a ti u svoyu chergu blizki do inshoyi rodini fermentiv citidindezaminaz Pri comu ne sposterigayetsya zhodnoyi podibnosti u ADAR i adenozindezaminaz purinovogo obminu Geni ADAR nayavni u bilshosti bagatoklitinnih tvarin hocha okremi grupi vtratili odin chi obidva geni Zokrema drozofili ta inshi komahi mayut lishe gomolog ADAR2 Najbilshu kilkist geniv ADAR stanom na 2018 rik mayut rebroplavi u genomi yakih nayavni 4 izoformi adenozindezaminaz Ci fermenti ye najbilsh aktivnimi pid chas embriogenezu ADAR1 ekspresuyetsya na najvishomu rivni pid chas rannogo droblennya todi yak ADAR2 i ADAR3 pracyuyut pid chas formuvannya vijchastih grebinciv Ochisnij dobir u bilshosti vidiv tvarin pribiraye idealno komplementarni dvolancyugovi RNK a ti sho zalishayutsya chi novi pidlyagayut potuzhnomu redaguvannyu za dopomogoyu ADAR1 ZahvoryuvannyaMutaciyi Mutaciyi genu ADAR prizvodyat do viniknennya ridkisnogo autosomno dominantnogo spadkovogo zahvoryuvannya en poshirenogo perevazhno sered yaponciv ale vidomogo z yevropejskoyi indijskoyi ta karibskoyi populyaciyi Takozh mutaciyi v comu geni mozhut prizvoditi do ridkisnogo avtoimunnogo en Nejrologichni zahvoryuvannya U paciyentiv z hvoroboyu Alcgejmera viyavleno znizhenij riven redaguvannya adenoziniv u RNK bilkiv pov yazanih z robotoyu golovnogo mozku Bilsha variabelnist redaguvannya sposterigalasya v gipokampi zokrema v Q R sajti Redaguvannya RNK serotoninovogo receptora HTR2C posilyuyetsya pid diyeyu interferona oskilki v 4 sajtah zabezpechuyetsya bilkom ADAR1 Zmini rivniv redaguvannya pre mRNK cogo receptora sposterigayutsya pri shizofreniyi bichnomu amiotrofichnomu sklerozi pid diyeyu hronichnogo stresu viklikanogo en Infekcijni zahvoryuvannya Oskilki bilki ADAR zdatni zv yazuvatisya j redaguvati dovgi dvolancyugovi RNK pritamanni bagatom virusam na riznih stadiyah rozvitku to yihnoyu funkciyeyu vvazhalasya protivirusna diya shlyahom redaguvannya j poshkodzhennya virusnogo genomu chi transkriptomu Pershi svidchennya takoyi diyi buli pokazani na klitinnih liniyah dlya virusu koru Odnak uprodovzh 2010 h rokiv nakopichilosya chimalo doslidzhen yaki viyavili spriyannya rozmnozhennyu virusiv z boku adenozindezaminaz RNK Zokrema ce pokazano dlya virusiv koru en VIL gepatitu D Zika Bilki ADAR mozhut vidigravati rol u mutuvanni RNK virusiv Takozh redaguvannya RNK VIL za dopomogoyu ADAR1 ne viklikaye suttyevih poshkodzhen virusnih chastochok ta yihnoyi zdatnosti infikuvati klitini VikoristannyaStvoreno dekilka shtuchnih genetichnih sistem elementom yakih ye adenozindezaminazi RNK yaki zdatni vibirkovo zaminyuvati adenozin na inozin u RNK Div takozhCitidindezaminaziPrimitkiWillemijn M Gommans Dylan E Dupuis Jill E McCane Nicholas E Tatalias Stefan Maas 2008 Diversifying Exon Code through A to I RNA Editing u Smith H red DNA RNA Editing Wiley amp Sons Inc s 3 30 Savva Yiannis A Rieder Leila E Reenan Robert A 2012 The ADAR protein family Genome Biology 13 12 252 doi 10 1186 gb 2012 13 12 252 ISSN 1465 6906 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite journal title Shablon Cite journal cite journal a Obslugovuvannya CS1 Storinki iz nepoznachenim DOI z bezkoshtovnim dostupom posilannya Park SeHee Doherty Erin E Xie Yixuan Padyana Anil K Fang Fang Zhang Yue Karki Agya Lebrilla Carlito B Siegel Justin B Beal Peter A 2020 High throughput mutagenesis reveals unique structural features of human ADAR1 Nature Communications 11 1 doi 10 1038 s41467 020 18862 2 ISSN 2041 1723 Sinigaglia Ketty Wiatrek Dagmara Khan Anzer Michalik David Sambrani Nagraj Sedmik Jiri Vukic Dragana O Connell Mary A Keegan Liam P 2019 ADAR RNA editing in innate immune response phasing in circadian clocks and in sleep Biochimica et Biophysica Acta BBA Gene Regulatory Mechanisms 1862 3 356 369 doi 10 1016 j bbagrm 2018 10 011 ISSN 1874 9399 Piazzi Manuela Bavelloni Alberto Gallo Angela Blalock William L 2020 AKT Dependent Phosphorylation of ADAR1p110 and ADAR2 Represents a New and Important Link Between Cell Signaling and RNA Editing DNA and Cell Biology 39 3 343 348 doi 10 1089 dna 2020 5351 ISSN 1044 5498 angl Farajollahi Sanaz and Maas Stefan 2010 Molecular diversity through RNA editing a balancing act Trends in Genetics Elsevier 26 5 221 230 Costa Cruz Pedro Henrique Kato Yuki Nakahama Taisuke Shibuya Toshiharu Kawahara Yukio 2020 A comparative analysis of ADAR mutant mice reveals site specific regulation of RNA editing RNA 26 4 454 469 doi 10 1261 rna 072728 119 ISSN 1355 8382 Fischer Sylvia E J Ruvkun Gary 2020 Caenorhabditis elegans ADAR editing and the ERI 6 7 MOV10 RNAi pathway silence endogenous viral elements and LTR retrotransposons Proceedings of the National Academy of Sciences 117 11 5987 5996 doi 10 1073 pnas 1919028117 ISSN 0027 8424 angl Zhang Jianzhi Duan Yuange Dou Shengqian Luo Shiqi Zhang Hong Lu Jian 2017 Adaptation of A to I RNA editing in Drosophila PLOS Genetics 13 3 e1006648 doi 10 1371 journal pgen 1006648 ISSN 1553 7404 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite journal title Shablon Cite journal cite journal a Obslugovuvannya CS1 Storinki iz nepoznachenim DOI z bezkoshtovnim dostupom posilannya Zhou Shili Yang Chao Zhao Fanfan Huang Yanxia Lin Yuxia Huang Changbai Ma Xiaocao Du Jingjie Wang Yi Long Gang He Junfang Liu Chao Zhang Ping 2019 Double stranded RNA deaminase ADAR1 promotes the Zika virus replication by inhibiting the activation of protein kinase PKR Journal of Biological Chemistry 294 48 18168 18180 doi 10 1074 jbc RA119 009113 ISSN 0021 9258 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite journal title Shablon Cite journal cite journal a Obslugovuvannya CS1 Storinki iz nepoznachenim DOI z bezkoshtovnim dostupom posilannya Moroz Leonid L Kocot Kevin M Citarella Mathew R Dosung Sohn Norekian Tigran P Povolotskaya Inna S Grigorenko Anastasia P Dailey Christopher Berezikov Eugene Buckley Katherine M Ptitsyn Andrey Reshetov Denis Mukherjee Krishanu Moroz Tatiana P Bobkova Yelena Yu Fahong Kapitonov Vladimir V Jurka Jerzy Bobkov Yuri V Swore Joshua J Girardo David O Fodor Alexander Gusev Fedor Sanford Rachel Bruders Rebecca Kittler Ellen Mills Claudia E Rast Jonathan P Derelle Romain Solovyev Victor V Kondrashov Fyodor A Swalla Billie J Sweedler Jonathan V Rogaev Evgeny I Halanych Kenneth M Kohn Andrea B 2014 The ctenophore genome and the evolutionary origins of neural systems Nature 510 7503 109 114 doi 10 1038 nature13400 ISSN 0028 0836 Barak Michal Porath Hagit T Finkelstein Gilad Knisbacher Binyamin A Buchumenski Ilana Roth Shalom Hillel Levanon Erez Y Eisenberg Eli 2020 Purifying selection of long dsRNA is the first line of defense against false activation of innate immunity Genome Biology 21 1 doi 10 1186 s13059 020 1937 3 ISSN 1474 760X a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite journal title Shablon Cite journal cite journal a Obslugovuvannya CS1 Storinki iz nepoznachenim DOI z bezkoshtovnim dostupom posilannya angl Nakahama Taisuke Kawahara Yukio 2020 Adenosine to inosine RNA editing in the immune system friend or foe Cellular and Molecular Life Sciences doi 10 1007 s00018 020 03466 2 ISSN 1420 682X angl Khermesh Khen D Erchia Anna Maria Barak Michal Annese Anita Wachtel Chaim Levanon Erez Y Picardi Ernesto Eisenberg Eli 2016 Reduced levels of protein recoding by A to I RNA editing in Alzheimer s disease RNA 22 2 290 302 doi 10 1261 rna 054627 115 ISSN 1355 8382 Gaisler Salomon Inna Kravitz Efrat Feiler Yulia Safran Michal Biegon Anat Amariglio Ninette Rechavi Gideon 2014 Hippocampus specific deficiency in RNA editing of GluA2 in Alzheimer s disease Neurobiology of Aging 35 8 1785 1791 doi 10 1016 j neurobiolaging 2014 02 018 ISSN 0197 4580 Yang Weidong Wang Qingde Kanes Stephen J Murray John M Nishikura Kazuko 2004 Altered RNA editing of serotonin 5 HT2C receptor induced by interferon implications for depression associated with cytokine therapy Molecular Brain Research 124 1 70 78 doi 10 1016 j molbrainres 2004 02 010 ISSN 0169 328X Samuel Charles E 2011 Adenosine deaminases acting on RNA ADARs are both antiviral and proviral Virology 411 2 180 193 doi 10 1016 j virol 2010 12 004 ISSN 0042 6822 Priyadharsini Jayaseelan Vijayashree Paramasivam Arumugam 2021 RNA editors key regulators of viral response in cancer patients Epigenomics doi 10 2217 epi 2021 0001 ISSN 1750 1911 Piontkivska Helen Matos Luis F Paul Sinu Scharfenberg Brian Farmerie William G Miyamoto Michael M Wayne Marta L 2016 Role of Host Driven Mutagenesis in Determining Genome Evolution of Sigma Virus DMelSV Rhabdoviridae inDrosophila melanogaster Genome Biology and Evolution 8 9 2952 2963 doi 10 1093 gbe evw212 ISSN 1759 6653 Doria Margherita Neri Francesca Gallo Angela Farace Maria Giulia Michienzi Alessandro 2009 Editing of HIV 1 RNA by the double stranded RNA deaminase ADAR1 stimulates viral infection Nucleic Acids Research 37 17 5848 5858 doi 10 1093 nar gkp604 ISSN 1362 4962 Montiel Gonzalez Maria Fernanda Diaz Quiroz Juan Felipe Rosenthal Joshua J C 2019 Current strategies for Site Directed RNA Editing using ADARs Methods 156 16 24 doi 10 1016 j ymeth 2018 11 016 ISSN 1046 2023 Qu Liang Yi Zongyi Zhu Shiyou Wang Chunhui Cao Zhongzheng Zhou Zhuo Yuan Pengfei Yu Ying Tian Feng Liu Zhiheng Bao Ying Zhao Yanxia Wei Wensheng 2019 Programmable RNA editing by recruiting endogenous ADAR using engineered RNAs Nature Biotechnology 37 9 1059 1069 doi 10 1038 s41587 019 0178 z ISSN 1087 0156 DzherelaFarajollahi Sanaz and Maas Stefan 2010 Molecular diversity through RNA editing a balancing act Trends in Genetics Elsevier 26 5 221 230

Дата публікації:
Топ