Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

ADARB1 англ Adenosine deaminase RNA specific B1 білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому

ADARB1

ADARB1

ADARB1 (англ. Adenosine deaminase, RNA specific B1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 741 амінокислот, а молекулярна маса — 80 763.

ADARB1
image
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи ADARB1, ADAR2, DRABA2, DRADA2, RED1, adenosine deaminase, RNA specific B1, adenosine deaminase RNA specific B1, NEDHYMS
Зовнішні ІД OMIM: 601218 MGI: 891999 HomoloGene: 8280 GeneCards: ADARB1
3.5.4.37
Шаблон експресії
image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
104
110532
Ensembl
ENSG00000197381
ENSMUSG00000020262
UniProt
P78563
Q91ZS8
RefSeq (мРНК)
NM_001024837
NM_001024838
NM_001024839
NM_001024840
NM_130895
RefSeq (білок)
NP_001020008
NP_570965
NP_001020009
Локус (UCSC) Хр. 21: 45.07 – 45.23 Mb Хр. 10: 77.13 – 77.25 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MDIEDEENMSSSSTDVKENRNLDNVSPKDGSTPGPGEGSQLSNGGGGGPG
RKRPLEEGSNGHSKYRLKKRRKTPGPVLPKNALMQLNEIKPGLQYTLLSQ
TGPVHAPLFVMSVEVNGQVFEGSGPTKKKAKLHAAEKALRSFVQFPNASE
AHLAMGRTLSVNTDFTSDQADFPDTLFNGFETPDKAEPPFYVGSNGDDSF
SSSGDLSLSASPVPASLAQPPLPVLPPFPPPSGKNPVMILNELRPGLKYD
FLSESGESHAKSFVMSVVVDGQFFEGSGRNKKLAKARAAQSALAAIFNLH
LDQTPSRQPIPSEGLQLHLPQVLADAVSRLVLGKFGDLTDNFSSPHARRK
VLAGVVMTTGTDVKDAKVISVSTGTKCINGEYMSDRGLALNDCHAEIISR
RSLLRFLYTQLELYLNNKDDQKRSIFQKSERGGFRLKENVQFHLYISTSP
CGDARIFSPHEPILEGSRSYTQAGVQWCNHGSLQPRPPGLLSDPSTSTFQ
GAGTTEPADRHPNRKARGQLRTKIESGEGTIPVRSNASIQTWDGVLQGER
LLTMSCSDKIARWNVVGIQGSLLSIFVEPIYFSSIILGSLYHGDHLSRAM
YQRISNIEDLPPLYTLNKPLLSGISNAEARQPGKAPNFSVNWTVGDSAIE
VINATTGKDELGRASRLCKHALYCRWMRVHGKVPSHLLRSKITKPNVYHE
SKLAAKEYQAAKARLFTAFIKAGLGAWVEKPTEQDQFSLTP

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, процесінг мРНК, антивірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у ядрі.


У мозку миші в ході ембріонального розвитку активність білку зростає. Особливо висока його кількість у таламусі. Активність білка посилюють імпортин KPNA3, який транспортує його в ядро з цитоплазми, та ізомераза PIN1, що стабілізує фермент у ядрі.

Література

  • Lai F., Chen C.-X., Carter K.C., Nishikura K. (1997). Editing of glutamate receptor B subunit ion channel RNAs by four alternatively spliced DRADA2 double-stranded RNA adenosine deaminases. Mol. Cell. Biol. 17: 2413—2424. PMID 9111310 DOI:10.1128/MCB.17.5.2413
  • Villard L., Tassone F., Haymowicz M., Welborn R., Gardiner K. (1997). Map location, genomic organization and expression patterns of the human RED1 RNA editase. Somat. Cell Mol. Genet. 23: 135—145. PMID 9330641 DOI:10.1007/BF02679972
  • Slavov D., Gardiner K. (2002). Phylogenetic comparison of the pre-mRNA adenosine deaminase ADAR2 genes and transcripts: conservation and diversity in editing site sequence and alternative splicing patterns. Gene. 299: 83—94. PMID 12459255 DOI:10.1016/S0378-1119(02)01016-8
  • Kawahara Y., Ito K., Ito M., Tsuji S., Kwak S. (2005). Novel splice variants of human ADAR2 mRNA: skipping of the exon encoding the dsRNA-binding domains, and multiple C-terminal splice sites. Gene. 363: 193—201. PMID 16297572 DOI:10.1016/j.gene.2005.07.028
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Maas S., Gommans W.M. (2009). Novel exon of mammalian ADAR2 extends open reading frame. PLoS ONE. 4: E4225—E4225. PMID 19156214 DOI:10.1371/journal.pone.0004225

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. (англ.) . Архів оригіналу за 23 травня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
  5. Lundin, Elin; Wu, Chenglin; Widmark, Albin; Behm, Mikaela; Hjerling-Leffler, Jens; Daniel, Chammiran; Öhman, Marie; Nilsson, Mats (2020). Spatiotemporal mapping of RNA editing in the developing mouse brain using in situ sequencing reveals regional and cell-type-specific regulation. BMC Biology. 18 (1). doi:10.1186/s12915-019-0736-3. ISSN 1741-7007.{{}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом ()(англ.)

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

ADARB1 angl Adenosine deaminase RNA specific B1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 21 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 741 aminokislot a molekulyarna masa 80 763 ADARB1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1ZY7 5ED1 5ED2 5HP3 5HP2IdentifikatoriSimvoliADARB1 ADAR2 DRABA2 DRADA2 RED1 adenosine deaminase RNA specific B1 adenosine deaminase RNA specific B1 NEDHYMSZovnishni ID OMIM 601218 MGI 891999 HomoloGene 8280 GeneCards ADARB13 5 4 37Ontologiya genaMolekulyarna funkciya zv yazuvannya z ionom metalu adenosine deaminase activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding RNA binding double stranded RNA binding mRNA binding hydrolase activity double stranded RNA adenosine deaminase activity tRNA specific adenosine deaminase activityKlitinna komponenta nukleoplazma yaderce klitinne yadro gialoplazma citoplazmaBiologichnij proces GO 0033168 GO 0036404 GO 1902360 RNA processing proces imunnoyi sistemi mRNA processing base conversion or substitution editing regulation of cell cycle negative regulation of cell migration defense response to virus negative regulation of protein kinase activity by regulation of protein phosphorylation positive regulation of viral genome replication vrodzhenij imunitet adenosine to inosine editing negative regulation of cell population proliferation neuromuscular synaptic transmission facial nerve morphogenesis hypoglossal nerve morphogenesis spinal cord ventral commissure morphogenesis multicellular organism growth neuromuscular process controlling posture innervaciya muscle tissue morphogenesis motor behavior motor neuron apoptotic processDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez104 110532Ensembl ENSG00000197381 ENSMUSG00000020262UniProt P78563 Q91ZS8RefSeq mRNK NM 001033049 NM 001112 NM 001160230 NM 015833 NM 015834NM 001346687 NM 001346688NM 001024837 NM 001024838 NM 001024839 NM 001024840 NM 130895RefSeq bilok NP 001103 NP 001153702 NP 001333616 NP 001333617 NP 056648NP 056649NP 001020008 NP 570965 NP 001020009Lokus UCSC Hr 21 45 07 45 23 MbHr 10 77 13 77 25 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MDIEDEENMSSSSTDVKENRNLDNVSPKDGSTPGPGEGSQLSNGGGGGPG RKRPLEEGSNGHSKYRLKKRRKTPGPVLPKNALMQLNEIKPGLQYTLLSQ TGPVHAPLFVMSVEVNGQVFEGSGPTKKKAKLHAAEKALRSFVQFPNASE AHLAMGRTLSVNTDFTSDQADFPDTLFNGFETPDKAEPPFYVGSNGDDSF SSSGDLSLSASPVPASLAQPPLPVLPPFPPPSGKNPVMILNELRPGLKYD FLSESGESHAKSFVMSVVVDGQFFEGSGRNKKLAKARAAQSALAAIFNLH LDQTPSRQPIPSEGLQLHLPQVLADAVSRLVLGKFGDLTDNFSSPHARRK VLAGVVMTTGTDVKDAKVISVSTGTKCINGEYMSDRGLALNDCHAEIISR RSLLRFLYTQLELYLNNKDDQKRSIFQKSERGGFRLKENVQFHLYISTSP CGDARIFSPHEPILEGSRSYTQAGVQWCNHGSLQPRPPGLLSDPSTSTFQ GAGTTEPADRHPNRKARGQLRTKIESGEGTIPVRSNASIQTWDGVLQGER LLTMSCSDKIARWNVVGIQGSLLSIFVEPIYFSSIILGSLYHGDHLSRAM YQRISNIEDLPPLYTLNKPLLSGISNAEARQPGKAPNFSVNWTVGDSAIE VINATTGKDELGRASRLCKHALYCRWMRVHGKVPSHLLRSKITKPNVYHE SKLAAKEYQAAKARLFTAFIKAGLGAWVEKPTEQDQFSLTP A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do gidrolaz Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak imunitet vrodzhenij imunitet procesing mRNK antivirusnij zahist Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku RNK Lokalizovanij u yadri U mozku mishi v hodi embrionalnogo rozvitku aktivnist bilku zrostaye Osoblivo visoka jogo kilkist u talamusi Aktivnist bilka posilyuyut importin KPNA3 yakij transportuye jogo v yadro z citoplazmi ta izomeraza PIN1 sho stabilizuye ferment u yadri LiteraturaLai F Chen C X Carter K C Nishikura K 1997 Editing of glutamate receptor B subunit ion channel RNAs by four alternatively spliced DRADA2 double stranded RNA adenosine deaminases Mol Cell Biol 17 2413 2424 PMID 9111310 DOI 10 1128 MCB 17 5 2413 Villard L Tassone F Haymowicz M Welborn R Gardiner K 1997 Map location genomic organization and expression patterns of the human RED1 RNA editase Somat Cell Mol Genet 23 135 145 PMID 9330641 DOI 10 1007 BF02679972 Slavov D Gardiner K 2002 Phylogenetic comparison of the pre mRNA adenosine deaminase ADAR2 genes and transcripts conservation and diversity in editing site sequence and alternative splicing patterns Gene 299 83 94 PMID 12459255 DOI 10 1016 S0378 1119 02 01016 8 Kawahara Y Ito K Ito M Tsuji S Kwak S 2005 Novel splice variants of human ADAR2 mRNA skipping of the exon encoding the dsRNA binding domains and multiple C terminal splice sites Gene 363 193 201 PMID 16297572 DOI 10 1016 j gene 2005 07 028 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Maas S Gommans W M 2009 Novel exon of mammalian ADAR2 extends open reading frame PLoS ONE 4 E4225 E4225 PMID 19156214 DOI 10 1371 journal pone 0004225PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 23 travnya 2017 Procitovano 22 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 25 serpnya 2017 Procitovano 22 serpnya 2017 Lundin Elin Wu Chenglin Widmark Albin Behm Mikaela Hjerling Leffler Jens Daniel Chammiran Ohman Marie Nilsson Mats 2020 Spatiotemporal mapping of RNA editing in the developing mouse brain using in situ sequencing reveals regional and cell type specific regulation BMC Biology 18 1 doi 10 1186 s12915 019 0736 3 ISSN 1741 7007 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite journal title Shablon Cite journal cite journal a Obslugovuvannya CS1 Storinki iz nepoznachenim DOI z bezkoshtovnim dostupom posilannya angl Div takozhHromosoma 21 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ