Azərbaycanca
Беларускі
Dansk
Deutsch
Española
Français
Indonesia
Italiana
日本語
Қазақ
Lietuvos
Nederlands
Português
Русский
සිංහල
แบบไทย
Türkçe
Українська
中國人
United State
Afrikaans
UPF1 (англ. UPF1, RNA helicase and ATPase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 129 амінокислот, а молекулярна маса — 124 345.
| UPF1 | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
| Ідентифікатори | |||||||||||||||||
| Символи | UPF1, HNORF1, RENT1, pNORF1, smg-2, RNA helicase and ATPase, UPF1 RNA helicase and ATPase, UTF | ||||||||||||||||
| Зовнішні ІД | OMIM: 601430 MGI: 107995 HomoloGene: 2185 GeneCards: UPF1 | ||||||||||||||||
| Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
| Viroporin 3a | |||||||||||||||||
| Viroporin 3a | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
| Шаблон експресії | |||||||||||||||||
  | |||||||||||||||||
| Більше даних | |||||||||||||||||
| Ортологи | |||||||||||||||||
| Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
| Entrez |
|
| |||||||||||||||
| Ensembl |
|
| |||||||||||||||
| UniProt |
|
| |||||||||||||||
| RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
| RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
| Локус (UCSC) | Хр. 19: 18.83 – 18.87 Mb | Хр. 8: 70.78 – 70.81 Mb | |||||||||||||||
| PubMed search | |||||||||||||||||
| Вікідані | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MSVEAYGPSS | QTLTFLDTEE | AELLGADTQG | SEFEFTDFTL | PSQTQTPPGG | ||||
| PGGPGGGGAG | GPGGAGAGAA | AGQLDAQVGP | EGILQNGAVD | DSVAKTSQLL | ||||
| AELNFEEDEE | DTYYTKDLPI | HACSYCGIHD | PACVVYCNTS | KKWFCNGRGN | ||||
| TSGSHIVNHL | VRAKCKEVTL | HKDGPLGETV | LECYNCGCRN | VFLLGFIPAK | ||||
| ADSVVVLLCR | QPCASQSSLK | DINWDSSQWQ | PLIQDRCFLS | WLVKIPSEQE | ||||
| QLRARQITAQ | QINKLEELWK | ENPSATLEDL | EKPGVDEEPQ | HVLLRYEDAY | ||||
| QYQNIFGPLV | KLEADYDKKL | KESQTQDNIT | VRWDLGLNKK | RIAYFTLPKT | ||||
| DSGNEDLVII | WLRDMRLMQG | DEICLRYKGD | LAPLWKGIGH | VIKVPDNYGD | ||||
| EIAIELRSSV | GAPVEVTHNF | QVDFVWKSTS | FDRMQSALKT | FAVDETSVSG | ||||
| YIYHKLLGHE | VEDVIIKCQL | PKRFTAQGLP | DLNHSQVYAV | KTVLQRPLSL | ||||
| IQGPPGTGKT | VTSATIVYHL | ARQGNGPVLV | CAPSNIAVDQ | LTEKIHQTGL | ||||
| KVVRLCAKSR | EAIDSPVSFL | ALHNQIRNMD | SMPELQKLQQ | LKDETGELSS | ||||
| ADEKRYRALK | RTAERELLMN | ADVICCTCVG | AGDPRLAKMQ | FRSILIDEST | ||||
| QATEPECMVP | VVLGAKQLIL | VGDHCQLGPV | VMCKKAAKAG | LSQSLFERLV | ||||
| VLGIRPIRLQ | VQYRMHPALS | AFPSNIFYEG | SLQNGVTAAD | RVKKGFDFQW | ||||
| PQPDKPMFFY | VTQGQEEIAS | SGTSYLNRTE | AANVEKITTK | LLKAGAKPDQ | ||||
| IGIITPYEGQ | RSYLVQYMQF | SGSLHTKLYQ | EVEIASVDAF | QGREKDFIIL | ||||
| SCVRANEHQG | IGFLNDPRRL | NVALTRARYG | VIIVGNPKAL | SKQPLWNHLL | ||||
| NYYKEQKVLV | EGPLNNLRES | LMQFSKPRKL | VNTINPGARF | MTTAMYDARE | ||||
| AIIPGSVYDR | SSQGRPSSMY | FQTHDQIGMI | SAGPSHVAAM | NIPIPFNLVM | ||||
| PPMPPPGYFG | QANGPAAGRG | TPKGKTGRGG | RQKNRFGLPG | PSQTNLPNSQ | ||||
| ASQDVASQPF | SQGALTQGYI | SMSQPSQMSQ | PGLSQPELSQ | DSYLGDEFKS | ||||
| QIDVALSQDS | TYQGERAYQH | GGVTGLSQY |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Perlick H.A., Medghalchi S.M., Spencer F.A., Kendzior R.J. Jr., Dietz H.C. (1996). Mammalian orthologues of a yeast regulator of nonsense transcript stability. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 10928—10932. PMID 8855285 DOI:10.1073/pnas.93.20.10928
- Applequist S.E., Selg M., Raman C., Jaeck H.-M. (1997). Cloning and characterization of HUPF1, a human homolog of the Saccharomyces cerevisiae nonsense mRNA-reducing UPF1 protein. Nucleic Acids Res. 25: 814—821. PMID 9064659 DOI:10.1093/nar/25.4.814
- Page M.F., Carr B., Anders K.R., Grimson A., Anderson P. (1999). SMG-2 is a phosphorylated protein required for mRNA surveillance in Caenorhabditis elegans and related to Upf1p of yeast. Mol. Cell. Biol. 19: 5943—5951. PMID 10454541 DOI:10.1128/MCB.19.9.5943
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Lykke-Andersen J., Shu M.-D., Steitz J.A. (2000). Human Upf proteins target an mRNA for nonsense-mediated decay when bound downstream of a termination codon. Cell. 103: 1121—1131. PMID 11163187 DOI:10.1016/S0092-8674(00)00214-2
- Mendell J.T., Medghalchi S.M., Lake R.G., Noensie E.N., Dietz H.C. (2000). Novel Upf2p orthologues suggest a functional link between translation initiation and nonsense surveillance complexes. Mol. Cell. Biol. 20: 8944—8957. PMID 11073994 DOI:10.1128/MCB.20.23.8944-8957.2000
Примітки
- Сполуки, які фізично взаємодіють з UPF1 regulator of nonsense transcripts homolog (Yeast), isoform CRA_a переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Сполуки, які фізично взаємодіють з UPF1 RNA helicase and ATPase переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9962 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- UniProt, Q92900 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до . |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
UPF1 angl UPF1 RNA helicase and ATPase bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 19 yi hromosomi 5 Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 129 aminokislot a molekulyarna masa 124 345 6 UPF1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2GJK 2GK6 2GK7 2IYK 2WJV 2WJY 2XZO 2XZPIdentifikatoriSimvoliUPF1 HNORF1 RENT1 pNORF1 smg 2 RNA helicase and ATPase UPF1 RNA helicase and ATPase UTFZovnishni ID OMIM 601430 MGI 107995 HomoloGene 2185 GeneCards UPF1Reaguye na spolukuViroporin 3a 1 Viroporin 3a 2 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya nucleotide binding DNA binding telomeric DNA binding zinc ion binding chromatin binding zv yazuvannya z ionom metalu GO 0001948 GO 0016582 protein binding hydrolase activity ATP binding GO 0008026 helicase activity RNA bindingKlitinna komponenta gialoplazma P body exon exon junction complex supraspliceosomal complex nukleoplazma Hromatin citoplazma klitinne yadroBiologichnij proces regulation of translational termination telomere maintenance via semi conservative replication positive regulation of mRNA catabolic process mRNA export from nucleus replikaciya DNK nuclear transcribed mRNA catabolic process cellular response to interleukin 1 nuclear transcribed mRNA catabolic process endonucleolytic cleavage dependent decay histone mRNA catabolic process dosage compensation by inactivation of X chromosome cellular response to lipopolysaccharide 3 UTR mediated mRNA destabilization GO 0100026 Reparaciya DNK nuclear transcribed mRNA catabolic process nonsense mediated decay regulation of telomere maintenance cell cycle phase transition GO 0022415 viral processDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez5976 19704Ensembl ENSG00000005007 ENSMUSG00000058301UniProt Q92900 Q9EPU0RefSeq mRNK NM 002911 NM 001297549NM 001122829 NM 030680RefSeq bilok NP 001284478 NP 002902 NP 001284478 1NP 001116301 NP 109605Lokus UCSC Hr 19 18 83 18 87 MbHr 8 70 78 70 81 MbPubMed search 3 4 VikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MSVEAYGPSSQTLTFLDTEEAELLGADTQGSEFEFTDFTLPSQTQTPPGG PGGPGGGGAGGPGGAGAGAAAGQLDAQVGPEGILQNGAVDDSVAKTSQLL AELNFEEDEEDTYYTKDLPIHACSYCGIHDPACVVYCNTSKKWFCNGRGN TSGSHIVNHLVRAKCKEVTLHKDGPLGETVLECYNCGCRNVFLLGFIPAK ADSVVVLLCRQPCASQSSLKDINWDSSQWQPLIQDRCFLSWLVKIPSEQE QLRARQITAQQINKLEELWKENPSATLEDLEKPGVDEEPQHVLLRYEDAY QYQNIFGPLVKLEADYDKKLKESQTQDNITVRWDLGLNKKRIAYFTLPKT DSGNEDLVIIWLRDMRLMQGDEICLRYKGDLAPLWKGIGHVIKVPDNYGD EIAIELRSSVGAPVEVTHNFQVDFVWKSTSFDRMQSALKTFAVDETSVSG YIYHKLLGHEVEDVIIKCQLPKRFTAQGLPDLNHSQVYAVKTVLQRPLSL IQGPPGTGKTVTSATIVYHLARQGNGPVLVCAPSNIAVDQLTEKIHQTGL KVVRLCAKSREAIDSPVSFLALHNQIRNMDSMPELQKLQQLKDETGELSS ADEKRYRALKRTAERELLMNADVICCTCVGAGDPRLAKMQFRSILIDEST QATEPECMVPVVLGAKQLILVGDHCQLGPVVMCKKAAKAGLSQSLFERLV VLGIRPIRLQVQYRMHPALSAFPSNIFYEGSLQNGVTAADRVKKGFDFQW PQPDKPMFFYVTQGQEEIASSGTSYLNRTEAANVEKITTKLLKAGAKPDQ IGIITPYEGQRSYLVQYMQFSGSLHTKLYQEVEIASVDAFQGREKDFIIL SCVRANEHQGIGFLNDPRRLNVALTRARYGVIIVGNPKALSKQPLWNHLL NYYKEQKVLVEGPLNNLRESLMQFSKPRKLVNTINPGARFMTTAMYDARE AIIPGSVYDRSSQGRPSSMYFQTHDQIGMISAGPSHVAAMNIPIPFNLVM PPMPPPGYFGQANGPAAGRGTPKGKTGRGGRQKNRFGLPGPSQTNLPNSQ ASQDVASQPFSQGALTQGYISMSQPSQMSQPGLSQPELSQDSYLGDEFKS QIDVALSQDSTYQGERAYQHGGVTGLSQY A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do gidrolaz gelikaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ATF nukleotidami ionami metaliv ionom cinku RNK Lokalizovanij u citoplazmi yadri Literaturared Perlick H A Medghalchi S M Spencer F A Kendzior R J Jr Dietz H C 1996 Mammalian orthologues of a yeast regulator of nonsense transcript stability Proc Natl Acad Sci U S A 93 10928 10932 PMID 8855285 DOI 10 1073 pnas 93 20 10928 Applequist S E Selg M Raman C Jaeck H M 1997 Cloning and characterization of HUPF1 a human homolog of the Saccharomyces cerevisiae nonsense mRNA reducing UPF1 protein Nucleic Acids Res 25 814 821 PMID 9064659 DOI 10 1093 nar 25 4 814 Page M F Carr B Anders K R Grimson A Anderson P 1999 SMG 2 is a phosphorylated protein required for mRNA surveillance in Caenorhabditis elegans and related to Upf1p of yeast Mol Cell Biol 19 5943 5951 PMID 10454541 DOI 10 1128 MCB 19 9 5943 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Lykke Andersen J Shu M D Steitz J A 2000 Human Upf proteins target an mRNA for nonsense mediated decay when bound downstream of a termination codon Cell 103 1121 1131 PMID 11163187 DOI 10 1016 S0092 8674 00 00214 2 Mendell J T Medghalchi S M Lake R G Noensie E N Dietz H C 2000 Novel Upf2p orthologues suggest a functional link between translation initiation and nonsense surveillance complexes Mol Cell Biol 20 8944 8957 PMID 11073994 DOI 10 1128 MCB 20 23 8944 8957 2000Primitkired Spoluki yaki fizichno vzayemodiyut z UPF1 regulator of nonsense transcripts homolog Yeast isoform CRA a pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Spoluki yaki fizichno vzayemodiyut z UPF1 RNA helicase and ATPase pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 9962 angl Arhiv originalu za 28 travnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 UniProt Q92900 angl Arhiv originalu za 8 serpnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhred Hromosoma 19 nbsp Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Na cyu stattyu ne posilayutsya inshi statti Vikipediyi Bud laska rozstavte posilannya vidpovidno do prijnyatih rekomendacij Otrimano z https uk wikipedia org w index php title UPF1 amp oldid 35757694