SND1

SND1 (англ. Staphylococcal nuclease and tudor domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 910 амінокислот, а молекулярна маса — 101 997.

SND1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2E6N, 2HQE, 2HQX, 2O4X, 3BDL, 3OMC, 3OMG, 4QMG
Ідентифікатори
Символи	SND1, TDRD11, p100, staphylococcal nuclease and tudor domain containing 1, Tudor-SN
Зовнішні ІД	OMIM: 602181 MGI: 1929266 HomoloGene: 8665 GeneCards: SND1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001104 transcription coregulator activity • nucleic acid binding • nuclease activity • RNA binding • cadherin binding • endonuclease activity • endoribonuclease activity • hydrolase activity • RISC complex binding Клітинна компонента • Меланосома • RISC • екзосома • мітохондрія • мембрана • dense body • цитоплазма • гіалоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • Сайленсинг генів • GO:0022415 viral process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • osteoblast differentiation • transcription, DNA-templated • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • Деградація РНК • regulation of cell cycle process • miRNA catabolic process • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	27044	56463
Ensembl	ENSG00000197157	ENSMUSG00000001424
UniProt	Q7KZF4	Q78PY7
RefSeq (мРНК)	NM_014390	NM_019776
RefSeq (білок)	NP_055205	NP_062750
Локус (UCSC)	Хр. 7: 127.65 – 128.09 Mb	Хр. 6: 28.48 – 28.94 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASSAQSGGS		SGGPAVPTVQ		RGIIKMVLSG		CAIIVRGQPR		GGPPPERQIN
LSNIRAGNLA		RRAAATQPDA		KDTPDEPWAF		PAREFLRKKL		IGKEVCFTIE
NKTPQGREYG		MIYLGKDTNG		ENIAESLVAE		GLATRREGMR		ANNPEQNRLS
ECEEQAKAAK		KGMWSEGNGS		HTIRDLKYTI		ENPRHFVDSH		HQKPVNAIIE
HVRDGSVVRA		LLLPDYYLVT		VMLSGIKCPT		FRREADGSET		PEPFAAEAKF
FTESRLLQRD		VQIILESCHN		QNILGTILHP		NGNITELLLK		EGFARCVDWS
IAVYTRGAEK		LRAAERFAKE		RRLRIWRDYV		APTANLDQKD		KQFVAKVMQV
LNADAIVVKL		NSGDYKTIHL		SSIRPPRLEG		ENTQDKNKKL		RPLYDIPYMF
EAREFLRKKL		IGKKVNVTVD		YIRPASPATE		TVPAFSERTC		ATVTIGGINI
AEALVSKGLA		TVIRYRQDDD		QRSSHYDELL		AAEARAIKNG		KGLHSKKEVP
IHRVADISGD		TQKAKQFLPF		LQRAGRSEAV		VEYVFSGSRL		KLYLPKETCL
ITFLLAGIEC		PRGARNLPGL		VQEGEPFSEE		ATLFTKELVL		QREVEVEVES
MDKAGNFIGW		LHIDGANLSV		LLVEHALSKV		HFTAERSSYY		KSLLSAEEAA
KQKKEKVWAH		YEEQPVEEVM		PVLEEKERSA		SYKPVFVTEI		TDDLHFYVQD
VETGTQLEKL		MENMRNDIAS		HPPVEGSYAP		RRGEFCIAKF		VDGEWYRARV
EKVESPAKIH		VFYIDYGNRE		VLPSTRLGTL		SPAFSTRVLP		AQATEYAFAF
IQVPQDDDAR		TDAVDSVVRD		IQNTQCLLNV		EHLSAGCPHV		TLQFADSKGD
VGLGLVKEGL		VMVEVRKEKQ		FQKVITEYLN		AQESAKSARL		NLWRYGDFRA
DDADEFGYSR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Tong X., Drapkin R., Yalamanchili R., Mosialos G., Kieff E. (1995). The Epstein-Barr virus nuclear protein 2 acidic domain forms a complex with a novel cellular coactivator that can interact with TFIIE. Mol. Cell. Biol. 15: 4735—4744. PMID 7651391 DOI:10.1128/MCB.15.9.4735
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tijms M.A., Snijder E.J. (2003). Equine arteritis virus non-structural protein 1, an essential factor for viral subgenomic mRNA synthesis, interacts with the cellular transcription co-factor p100. J. Gen. Virol. 84: 2317—2322. PMID 12917451 DOI:10.1099/vir.0.19297-0

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30646 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.{{}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url ()
4. UniProt, Q7KZF4 (англ.) . Архів оригіналу за 24 жовтня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

• Хромосома 7