Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

DGCR8 англ DGCR8 microprocessor complex subunit білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому

DGCR8

DGCR8

DGCR8 (англ. DGCR8, microprocessor complex subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 773 амінокислот, а молекулярна маса — 86 045.

DGCR8
image
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи DGCR8, C22orf12, DGCRK6, Gy1, pasha, Pasha, DGCR8 microprocessor complex subunit, microprocessor complex subunit
Зовнішні ІД OMIM: 609030 MGI: 2151114 HomoloGene: 11223 GeneCards: DGCR8
Шаблон експресії
image

image

image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
54487
94223
Ensembl
ENSG00000128191
ENSMUSG00000022718
UniProt
Q8WYQ5
Q9EQM6
RefSeq (мРНК)
NM_001190326
NM_022720
NM_033324
RefSeq (білок)
NP_001177255
NP_073557
NP_201581
Локус (UCSC) Хр. 22: 20.08 – 20.11 Mb н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
METDESPSPLPCGPAGEAVMESRARPFQALPREQSPPPPLQTSSGAEVMD
VGSGGDGQSELPAEDPFNFYGASLLSKGSFSKGRLLIDPNCSGHSPRTAR
HAPAVRKFSPDLKLLKDVKISVSFTESCRSKDRKVLYTGAERDVRAECGL
LLSPVSGDVHACPFGGSVGDGVGIGGESADKKDEENELDQEKRVEYAVLD
ELEDFTDNLELDEEGAGGFTAKAIVQRDRVDEEALNFPYEDDFDNDVDAL
LEEGLCAPKKRRTEEKYGGDSDHPSDGETSVQPMMTKIKTVLKSRGRPPT
EPLPDGWIMTFHNSGVPVYLHRESRVVTWSRPYFLGTGSIRKHDPPLSSI
PCLHYKKMKDNEEREQSSDLTPSGDVSPVKPLSRSAELEFPLDEPDSMGA
DPGPPDEKDPLGAEAAPGALGQVKAKVEVCKDESVDLEEFRSYLEKRFDF
EQVTVKKFRTWAERRQFNREMKRKQAESERPILPANQKLITLSVQDAPTK
KEFVINPNGKSEVCILHEYMQRVLKVRPVYNFFECENPSEPFGASVTIDG
VTYGSGTASSKKLAKNKAARATLEILIPDFVKQTSEEKPKDSEELEYFNH
ISIEDSRVYELTSKAGLLSPYQILHECLKRNHGMGDTSIKFEVVPGKNQK
SEYVMACGKHTVRGWCKNKRVGKQLASQKILQLLHPHVKNWGSLLRMYGR
ESSKMVKQETSDKSVIELQQYAKKNKPNLHILSKLQEEMKRLAEEREETR
KKPKMSIVASAQPGGEPLCTVDV

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза, гемом, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Shiohama A., Sasaki T., Noda S., Minoshima S., Shimizu N. (2003). Molecular cloning and expression analysis of a novel gene DGCR8 located in the DiGeorge syndrome chromosomal region. Biochem. Biophys. Res. Commun. 304: 184—190. PMID 12705904 DOI:10.1016/S0006-291X(03)00554-0
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Landthaler M., Yalcin A., Tuschl T. (2004). The human DiGeorge syndrome critical region gene 8 and its D. melanogaster homolog are required for miRNA biogenesis. Curr. Biol. 14: 2162—2167. PMID 15589161 DOI:10.1016/j.cub.2004.11.001
  • Yeom K.-H., Lee Y., Han J., Suh M.R., Kim V.N. (2006). Characterization of DGCR8/Pasha, the essential cofactor for Drosha in primary miRNA processing. Nucleic Acids Res. 34: 4622—4629. PMID 16963499 DOI:10.1093/nar/gkl458
  • Shiohama A., Sasaki T., Noda S., Minoshima S., Shimizu N. (2007). Nucleolar localization of DGCR8 and identification of eleven DGCR8-associated proteins. Exp. Cell Res. 313: 4196—4207. PMID 17765891 DOI:10.1016/j.yexcr.2007.07.020
  • Faller M., Matsunaga M., Yin S., Loo J.A., Guo F. (2007). Heme is involved in microRNA processing. Nat. Struct. Mol. Biol. 14: 23—29. PMID 17159994 DOI:10.1038/nsmb1182

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

DGCR8 angl DGCR8 microprocessor complex subunit bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 22 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 773 aminokislot a molekulyarna masa 86 045 DGCR8Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1X47 2YT4 3LE4 5B16IdentifikatoriSimvoliDGCR8 C22orf12 DGCRK6 Gy1 pasha Pasha DGCR8 microprocessor complex subunit microprocessor complex subunitZovnishni ID OMIM 609030 MGI 2151114 HomoloGene 11223 GeneCards DGCR8Ontologiya genaMolekulyarna funkciya primary miRNA binding ribonuclease III activity double stranded RNA binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding heme binding protein homodimerization activity zv yazuvannya z ionom metalu RNA binding identical protein bindingKlitinna komponenta citoplazma microprocessor complex yaderce klitinne yadro nukleoplazma GO 0097483 GO 0097481 postsinaptichne ushilnennyaBiologichnij proces regulation of stem cell proliferation GO 1990744 GO 1990729 primary miRNA processing RNA phosphodiester bond hydrolysis endonucleolytic RNA phosphodiester bond hydrolysis GO 0061715 miRNA metabolic processDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez54487 94223Ensembl ENSG00000128191 ENSMUSG00000022718UniProt Q8WYQ5 Q9EQM6RefSeq mRNK NM 001190326 NM 022720NM 033324RefSeq bilok NP 001177255 NP 073557NP 201581Lokus UCSC Hr 22 20 08 20 11 Mbn dPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 METDESPSPLPCGPAGEAVMESRARPFQALPREQSPPPPLQTSSGAEVMD VGSGGDGQSELPAEDPFNFYGASLLSKGSFSKGRLLIDPNCSGHSPRTAR HAPAVRKFSPDLKLLKDVKISVSFTESCRSKDRKVLYTGAERDVRAECGL LLSPVSGDVHACPFGGSVGDGVGIGGESADKKDEENELDQEKRVEYAVLD ELEDFTDNLELDEEGAGGFTAKAIVQRDRVDEEALNFPYEDDFDNDVDAL LEEGLCAPKKRRTEEKYGGDSDHPSDGETSVQPMMTKIKTVLKSRGRPPT EPLPDGWIMTFHNSGVPVYLHRESRVVTWSRPYFLGTGSIRKHDPPLSSI PCLHYKKMKDNEEREQSSDLTPSGDVSPVKPLSRSAELEFPLDEPDSMGA DPGPPDEKDPLGAEAAPGALGQVKAKVEVCKDESVDLEEFRSYLEKRFDF EQVTVKKFRTWAERRQFNREMKRKQAESERPILPANQKLITLSVQDAPTK KEFVINPNGKSEVCILHEYMQRVLKVRPVYNFFECENPSEPFGASVTIDG VTYGSGTASSKKLAKNKAARATLEILIPDFVKQTSEEKPKDSEELEYFNH ISIEDSRVYELTSKAGLLSPYQILHECLKRNHGMGDTSIKFEVVPGKNQK SEYVMACGKHTVRGWCKNKRVGKQLASQKILQLLHPHVKNWGSLLRMYGR ESSKMVKQETSDKSVIELQQYAKKNKPNLHILSKLQEEMKRLAEEREETR KKPKMSIVASAQPGGEPLCTVDV A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom zaliza gemom RNK Lokalizovanij u yadri LiteraturaShiohama A Sasaki T Noda S Minoshima S Shimizu N 2003 Molecular cloning and expression analysis of a novel gene DGCR8 located in the DiGeorge syndrome chromosomal region Biochem Biophys Res Commun 304 184 190 PMID 12705904 DOI 10 1016 S0006 291X 03 00554 0 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Landthaler M Yalcin A Tuschl T 2004 The human DiGeorge syndrome critical region gene 8 and its D melanogaster homolog are required for miRNA biogenesis Curr Biol 14 2162 2167 PMID 15589161 DOI 10 1016 j cub 2004 11 001 Yeom K H Lee Y Han J Suh M R Kim V N 2006 Characterization of DGCR8 Pasha the essential cofactor for Drosha in primary miRNA processing Nucleic Acids Res 34 4622 4629 PMID 16963499 DOI 10 1093 nar gkl458 Shiohama A Sasaki T Noda S Minoshima S Shimizu N 2007 Nucleolar localization of DGCR8 and identification of eleven DGCR8 associated proteins Exp Cell Res 313 4196 4207 PMID 17765891 DOI 10 1016 j yexcr 2007 07 020 Faller M Matsunaga M Yin S Loo J A Guo F 2007 Heme is involved in microRNA processing Nat Struct Mol Biol 14 23 29 PMID 17159994 DOI 10 1038 nsmb1182PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 4 veresnya 2015 Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 14 lipnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 22 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ