PTPRM (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type M) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 452 амінокислот, а молекулярна маса — 163 682.
PTPRM | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | PTPRM, PTPRL1, R-PTP-MU, RPTPM, RPTPU, hR-PTPu, protein tyrosine phosphatase, receptor type M, protein tyrosine phosphatase receptor type M | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 176888 MGI: 102694 HomoloGene: 37694 GeneCards: PTPRM | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 18: 7.57 – 8.41 Mb | Хр. 17: 66.97 – 67.66 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MRGLGTCLAT | LAGLLLTAAG | ETFSGGCLFD | EPYSTCGYSQ | SEGDDFNWEQ | ||||
VNTLTKPTSD | PWMPSGSFML | VNASGRPEGQ | RAHLLLPQLK | ENDTHCIDFH | ||||
YFVSSKSNSP | PGLLNVYVKV | NNGPLGNPIW | NISGDPTRTW | NRAELAISTF | ||||
WPNFYQVIFE | VITSGHQGYL | AIDEVKVLGH | PCTRTPHFLR | IQNVEVNAGQ | ||||
FATFQCSAIG | RTVAGDRLWL | QGIDVRDAPL | KEIKVTSSRR | FIASFNVVNT | ||||
TKRDAGKYRC | MIRTEGGVGI | SNYAELVVKE | PPVPIAPPQL | ASVGATYLWI | ||||
QLNANSINGD | GPIVAREVEY | CTASGSWNDR | QPVDSTSYKI | GHLDPDTEYE | ||||
ISVLLTRPGE | GGTGSPGPAL | RTRTKCADPM | RGPRKLEVVE | VKSRQITIRW | ||||
EPFGYNVTRC | HSYNLTVHYC | YQVGGQEQVR | EEVSWDTENS | HPQHTITNLS | ||||
PYTNVSVKLI | LMNPEGRKES | QELIVQTDED | LPGAVPTESI | QGSTFEEKIF | ||||
LQWREPTQTY | GVITLYEITY | KAVSSFDPEI | DLSNQSGRVS | KLGNETHFLF | ||||
FGLYPGTTYS | FTIRASTAKG | FGPPATNQFT | TKISAPSMPA | YELETPLNQT | ||||
DNTVTVMLKP | AHSRGAPVSV | YQIVVEEERP | RRTKKTTEIL | KCYPVPIHFQ | ||||
NASLLNSQYY | FAAEFPADSL | QAAQPFTIGD | NKTYNGYWNT | PLLPYKSYRI | ||||
YFQAASRANG | ETKIDCVQVA | TKGAATPKPV | PEPEKQTDHT | VKIAGVIAGI | ||||
LLFVIIFLGV | VLVMKKRKLA | KKRKETMSST | RQEMTVMVNS | MDKSYAEQGT | ||||
NCDEAFSFMD | THNLNGRSVS | SPSSFTMKTN | TLSTSVPNSY | YPDETHTMAS | ||||
DTSSLVQSHT | YKKREPADVP | YQTGQLHPAI | RVADLLQHIT | QMKCAEGYGF | ||||
KEEYESFFEG | QSAPWDSAKK | DENRMKNRYG | NIIAYDHSRV | RLQTIEGDTN | ||||
SDYINGNYID | GYHRPNHYIA | TQGPMQETIY | DFWRMVWHEN | TASIIMVTNL | ||||
VEVGRVKCCK | YWPDDTEIYK | DIKVTLIETE | LLAEYVIRTF | AVEKRGVHEI | ||||
REIRQFHFTG | WPDHGVPYHA | TGLLGFVRQV | KSKSPPSAGP | LVVHCSAGAG | ||||
RTGCFIVIDI | MLDMAEREGV | VDIYNCVREL | RSRRVNMVQT | EEQYVFIHDA | ||||
ILEACLCGDT | SVPASQVRSL | YYDMNKLDPQ | TNSSQIKEEF | RTLNMVTPTL | ||||
RVEDCSIALL | PRNHEKNRCM | DILPPDRCLP | FLITIDGESS | NYINAALMDS | ||||
YKQPSAFIVT | QHPLPNTVKD | FWRLVLDYHC | TSVVMLNDVD | PAQLCPQYWP | ||||
ENGVHRHGPI | QVEFVSADLE | EDIISRIFRI | YNAARPQDGY | RMVQQFQFLG | ||||
WPMYRDTPVS | KRSFLKLIRQ | VDKWQEEYNG | GEGRTVVHCL | NGGGRSGTFC | ||||
AISIVCEMLR | HQRTVDVFHA | VKTLRNNKPN | MVDLLDQYKF | CYEVALEYLN | ||||
SG |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hoffmann K.M., Tonks N.K., Barford D. (1997). The crystal structure of domain 1 of receptor protein-tyrosine phosphatase mu. J. Biol. Chem. 272: 27505—27508. PMID 9346878 DOI:10.1074/jbc.272.44.27505
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9675 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
PTPRM angl Protein tyrosine phosphatase receptor type M bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 18 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 452 aminokislot a molekulyarna masa 163 682 PTPRMNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1RPM 2C9A 2V5YIdentifikatoriSimvoliPTPRM PTPRL1 R PTP MU RPTPM RPTPU hR PTPu protein tyrosine phosphatase receptor type M protein tyrosine phosphatase receptor type MZovnishni ID OMIM 176888 MGI 102694 HomoloGene 37694 GeneCards PTPRMOntologiya genaMolekulyarna funkciya phosphoprotein phosphatase activity GO 0098519 GO 0098518 phosphatase activity cadherin binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding identical protein binding protein tyrosine phosphatase activity transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity hydrolase activityKlitinna komponenta citoplazma integral component of membrane membrana cell cell junction integral component of plasma membrane perinuclear region of cytoplasm lamellipodium klitinna membranaBiologichnij proces GO 0098501 GO 0098502 GO 0006286 defosforilyuvannya retina layer formation GO 0016576 protein dephosphorylation negative regulation of endothelial cell migration negative regulation of endothelial cell proliferation adgeziya klitin negative regulation of angiogenesis neuron projection development GO 0072468 signalna transdukciya homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules retinal ganglion cell axon guidance peptidyl tyrosine dephosphorylationDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez5797 19274Ensembl ENSG00000173482 ENSMUSG00000033278UniProt P28827 P28828RefSeq mRNK NM 001105244 NM 002845 NM 001378142 NM 001378143 NM 001378144NM 001378145 NM 001378146 NM 001378147NM 008984 NM 001357625RefSeq bilok NP 001098714 NP 002836 NP 001365071 NP 001365072 NP 001365073NP 001365074 NP 001365075 NP 001365076NP 033010 NP 001344554Lokus UCSC Hr 18 7 57 8 41 MbHr 17 66 97 67 66 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MRGLGTCLATLAGLLLTAAGETFSGGCLFDEPYSTCGYSQSEGDDFNWEQ VNTLTKPTSDPWMPSGSFMLVNASGRPEGQRAHLLLPQLKENDTHCIDFH YFVSSKSNSPPGLLNVYVKVNNGPLGNPIWNISGDPTRTWNRAELAISTF WPNFYQVIFEVITSGHQGYLAIDEVKVLGHPCTRTPHFLRIQNVEVNAGQ FATFQCSAIGRTVAGDRLWLQGIDVRDAPLKEIKVTSSRRFIASFNVVNT TKRDAGKYRCMIRTEGGVGISNYAELVVKEPPVPIAPPQLASVGATYLWI QLNANSINGDGPIVAREVEYCTASGSWNDRQPVDSTSYKIGHLDPDTEYE ISVLLTRPGEGGTGSPGPALRTRTKCADPMRGPRKLEVVEVKSRQITIRW EPFGYNVTRCHSYNLTVHYCYQVGGQEQVREEVSWDTENSHPQHTITNLS PYTNVSVKLILMNPEGRKESQELIVQTDEDLPGAVPTESIQGSTFEEKIF LQWREPTQTYGVITLYEITYKAVSSFDPEIDLSNQSGRVSKLGNETHFLF FGLYPGTTYSFTIRASTAKGFGPPATNQFTTKISAPSMPAYELETPLNQT DNTVTVMLKPAHSRGAPVSVYQIVVEEERPRRTKKTTEILKCYPVPIHFQ NASLLNSQYYFAAEFPADSLQAAQPFTIGDNKTYNGYWNTPLLPYKSYRI YFQAASRANGETKIDCVQVATKGAATPKPVPEPEKQTDHTVKIAGVIAGI LLFVIIFLGVVLVMKKRKLAKKRKETMSSTRQEMTVMVNSMDKSYAEQGT NCDEAFSFMDTHNLNGRSVSSPSSFTMKTNTLSTSVPNSYYPDETHTMAS DTSSLVQSHTYKKREPADVPYQTGQLHPAIRVADLLQHITQMKCAEGYGF KEEYESFFEGQSAPWDSAKKDENRMKNRYGNIIAYDHSRVRLQTIEGDTN SDYINGNYIDGYHRPNHYIATQGPMQETIYDFWRMVWHENTASIIMVTNL VEVGRVKCCKYWPDDTEIYKDIKVTLIETELLAEYVIRTFAVEKRGVHEI REIRQFHFTGWPDHGVPYHATGLLGFVRQVKSKSPPSAGPLVVHCSAGAG RTGCFIVIDIMLDMAEREGVVDIYNCVRELRSRRVNMVQTEEQYVFIHDA ILEACLCGDTSVPASQVRSLYYDMNKLDPQTNSSQIKEEFRTLNMVTPTL RVEDCSIALLPRNHEKNRCMDILPPDRCLPFLITIDGESSNYINAALMDS YKQPSAFIVTQHPLPNTVKDFWRLVLDYHCTSVVMLNDVDPAQLCPQYWP ENGVHRHGPIQVEFVSADLEEDIISRIFRIYNAARPQDGYRMVQQFQFLG WPMYRDTPVSKRSFLKLIRQVDKWQEEYNGGEGRTVVHCLNGGGRSGTFC AISIVCEMLRHQRTVDVFHAVKTLRNNKPNMVDLLDQYKFCYEVALEYLN SG A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do gidrolaz receptoriv proteyin fosfataz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak klitinna adgeziya alternativnij splajsing Lokalizovanij u membrani LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Hoffmann K M Tonks N K Barford D 1997 The crystal structure of domain 1 of receptor protein tyrosine phosphatase mu J Biol Chem 272 27505 27508 PMID 9346878 DOI 10 1074 jbc 272 44 27505PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 9675 angl Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 8 serpnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 18 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi