PIWIL2 (англ. Piwi like RNA-mediated gene silencing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 8-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 973 амінокислот, а молекулярна маса — 109 849.
PIWIL2 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | PIWIL2, CT80, HILI, PIWIL1L, mili, piwi like RNA-mediated gene silencing 2 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 610312 MGI: 1930036 HomoloGene: 23071 GeneCards: PIWIL2 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 8: 22.28 – 22.36 Mb | Хр. 14: 70.61 – 70.67 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MDPFRPSFRG | QSPIHPSQCQ | AVRMPGCWPQ | ASKPLDPALG | RGAPAGRGHV | ||||
FGKPEEPSTQ | RGPAQRESVG | LVSMFRGLGI | ETVSKTPLKR | EMLPSGRGIL | ||||
GRGLSANLVR | KDREELSPTF | WDPKVLAAGD | SKMAETSVGW | SRTLGRGSSD | ||||
ASLLPLGRAA | GGISREVDKP | PCTFSTPSRG | PPQLSSPPAL | PQSPLHSPDR | ||||
PLVLTVEHKE | KELIVKQGSK | GTPQSLGLNL | VKIQCHNEAV | YQYHVTFSPN | ||||
VECKSMRFGM | LKDHQAVTGN | VTAFDGSILY | LPVKLQQVLE | LKSQRKTDSA | ||||
EISIKIQMTK | ILEPCSDLCI | PFYNVVFRRV | MKLLDMKLVG | RNFYDPTSAM | ||||
VLQQHRLQIW | PGYAASIRRT | DGGLFLLADV | SHKVIRNDCV | LDVMHAIYQQ | ||||
NKEHFQDECT | KLLVGNIVIT | RYNNRTYRID | DVDWNKTPKD | SFTMSDGKEI | ||||
TFLEYYSKNY | GITVKEEDQP | LLIHRPSERQ | DNHGMLLKGE | ILLLPELSFM | ||||
TGIPEKMKKD | FRAMKDLAQQ | INLSPKQHHS | ALECLLQRIA | KNEAATNELM | ||||
RWGLRLQKDV | HKIEGRVLPM | ERINLKNTSF | ITSQELNWVK | EVTRDPSILT | ||||
IPMHFWALFY | PKRAMDQARE | LVNMLEKIAG | PIGMRMSPPA | WVELKDDRIE | ||||
TYVRTIQSTL | GAEGKIQMVV | CIIMGPRDDL | YGAIKKLCCV | QSPVPSQVVN | ||||
VRTIGQPTRL | RSVAQKILLQ | INCKLGGELW | GVDIPLKQLM | VIGMDVYHDP | ||||
SRGMRSVVGF | VASINLTLTK | WYSRVVFQMP | HQEIVDSLKL | CLVGSLKKFY | ||||
EVNHCLPEKI | VVYRDGVSDG | QLKTVANYEI | PQLQKCFEAF | ENYQPKMVVF | ||||
VVQKKISTNL | YLAAPQNFVT | PTPGTVVDHT | ITSCEWVDFY | LLAHHVRQGC | ||||
GIPTHYVCVL | NTANLSPDHM | QRLTFKLCHM | YWNWPGTIRV | PAPCKYAHKL | ||||
AFLSGHILHH | EPAIQLCENL | FFL |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, , ендонуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, диференціація клітин, сперматогенез, РНК-залежне заглушення генів, мейоз, альтернативний сплайсинг, метилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, РНК. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- Sasaki T., Shiohama A., Minoshima S., Shimizu N. (2003). Identification of eight members of the Argonaute family in the human genome. Genomics. 82: 323—330. PMID 12906857 DOI:10.1016/S0888-7543(03)00129-0
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Tian Y., Simanshu D.K., Ma J.B., Patel D.J. (2011). Structural basis for piRNA 2'-O-methylated 3'-end recognition by Piwi PAZ (Piwi/Argonaute/Zwille) domains. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 903—910. PMID 21193640 DOI:10.1073/pnas.1017762108
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 19 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 23 жовтня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
PIWIL2 angl Piwi like RNA mediated gene silencing 2 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na 8 j hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 973 aminokislot a molekulyarna masa 109 849 PIWIL2Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB3O7X 3QIRIdentifikatoriSimvoliPIWIL2 CT80 HILI PIWIL1L mili piwi like RNA mediated gene silencing 2Zovnishni ID OMIM 610312 MGI 1930036 HomoloGene 23071 GeneCards PIWIL2Ontologiya genaMolekulyarna funkciya RNA binding nucleic acid binding piRNA binding mRNA binding nuclease activity endonuclease activity endoribonuclease activity hydrolase activity zv yazuvannya z ionom metalu polysome binding GO 0001948 GO 0016582 protein bindingKlitinna komponenta citoplazma chromatoid body Polisoma perinucleolar chromocenter pi body P granule dense body PET complex klitinne yadroBiologichnij proces germ line stem cell population maintenance diferenciaciya klitin positive regulation of histone H3 K9 acetylation RNA 5 end processing positive regulation of meiosis I positive regulation of translation DNA methylation involved in gamete generation Oogenez multicellular organism development GO 0007126 mejoz positive regulation of histone H3 K14 acetylation regulation of translation piRNA metabolic process Sajlensing geniv Spermatogenez negative regulation of transposition nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis RNA phosphodiester bond hydrolysis endonucleolytic piRNA biosynthetic process negative regulation of circadian rhythm ritmichnij procesDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez55124 57746Ensembl ENSG00000197181 ENSMUSG00000033644UniProt Q8TC59 Q8CDG1RefSeq mRNK NM 001135721 NM 018068 NM 001330480NM 021308 NM 001364321RefSeq bilok NP 001129193 NP 001317409 NP 060538NP 067283 NP 001351250Lokus UCSC Hr 8 22 28 22 36 MbHr 14 70 61 70 67 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MDPFRPSFRGQSPIHPSQCQAVRMPGCWPQASKPLDPALGRGAPAGRGHV FGKPEEPSTQRGPAQRESVGLVSMFRGLGIETVSKTPLKREMLPSGRGIL GRGLSANLVRKDREELSPTFWDPKVLAAGDSKMAETSVGWSRTLGRGSSD ASLLPLGRAAGGISREVDKPPCTFSTPSRGPPQLSSPPALPQSPLHSPDR PLVLTVEHKEKELIVKQGSKGTPQSLGLNLVKIQCHNEAVYQYHVTFSPN VECKSMRFGMLKDHQAVTGNVTAFDGSILYLPVKLQQVLELKSQRKTDSA EISIKIQMTKILEPCSDLCIPFYNVVFRRVMKLLDMKLVGRNFYDPTSAM VLQQHRLQIWPGYAASIRRTDGGLFLLADVSHKVIRNDCVLDVMHAIYQQ NKEHFQDECTKLLVGNIVITRYNNRTYRIDDVDWNKTPKDSFTMSDGKEI TFLEYYSKNYGITVKEEDQPLLIHRPSERQDNHGMLLKGEILLLPELSFM TGIPEKMKKDFRAMKDLAQQINLSPKQHHSALECLLQRIAKNEAATNELM RWGLRLQKDVHKIEGRVLPMERINLKNTSFITSQELNWVKEVTRDPSILT IPMHFWALFYPKRAMDQARELVNMLEKIAGPIGMRMSPPAWVELKDDRIE TYVRTIQSTLGAEGKIQMVVCIIMGPRDDLYGAIKKLCCVQSPVPSQVVN VRTIGQPTRLRSVAQKILLQINCKLGGELWGVDIPLKQLMVIGMDVYHDP SRGMRSVVGFVASINLTLTKWYSRVVFQMPHQEIVDSLKLCLVGSLKKFY EVNHCLPEKIVVYRDGVSDGQLKTVANYEIPQLQKCFEAFENYQPKMVVF VVQKKISTNLYLAAPQNFVTPTPGTVVDHTITSCEWVDFYLLAHHVRQGC GIPTHYVCVLNTANLSPDHMQRLTFKLCHMYWNWPGTIRVPAPCKYAHKL AFLSGHILHHEPAIQLCENLFFL A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do gidrolaz nukleaz endonukleaz Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak regulyaciya translyaciyi diferenciaciya klitin spermatogenez RNK zalezhne zaglushennya geniv mejoz alternativnij splajsing metilyuvannya Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv RNK Lokalizovanij u citoplazmi LiteraturaSasaki T Shiohama A Minoshima S Shimizu N 2003 Identification of eight members of the Argonaute family in the human genome Genomics 82 323 330 PMID 12906857 DOI 10 1016 S0888 7543 03 00129 0 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Tian Y Simanshu D K Ma J B Patel D J 2011 Structural basis for piRNA 2 O methylated 3 end recognition by Piwi PAZ Piwi Argonaute Zwille domains Proc Natl Acad Sci U S A 108 903 910 PMID 21193640 DOI 10 1073 pnas 1017762108PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 8 veresnya 2015 Procitovano 19 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 23 zhovtnya 2017 Procitovano 19 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 8 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi