Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

CHD4 англ Chromodomain helicase DNA binding protein 4 білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на кор

CHD4

CHD4

CHD4 (англ. Chromodomain helicase DNA binding protein 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 912 амінокислот, а молекулярна маса — 218 005.

CHD4
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи CHD4, CHD-4, Mi-2b, Mi2-BETA, chromodomain helicase DNA binding protein 4, SIHIWES
Зовнішні ІД OMIM: 603277 MGI: 1344380 HomoloGene: 68175 GeneCards: CHD4
Пов'язані генетичні захворювання
Sifrim-Hitz-Weiss syndrome
Шаблон експресії
image

image

image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1108
107932
Ensembl
ENSG00000111642
ENSMUSG00000063870
UniProt
Q14839
Q6PDQ2
RefSeq (мРНК)
NM_001273
NM_001297553
NM_001363606
NM_145979
NM_001346610
RefSeq (білок)
NP_001264
NP_001284482
NP_001350535
Локус (UCSC) Хр. 12: 6.57 – 6.61 Mb Хр. 6: 125.07 – 125.11 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MASGLGSPSPCSAGSEEEDMDALLNNSLPPPHPENEEDPEEDLSETETPK
LKKKKKPKKPRDPKIPKSKRQKKERMLLCRQLGDSSGEGPEFVEEEEEVA
LRSDSEGSDYTPGKKKKKKLGPKKEKKSKSKRKEEEEEEDDDDDSKEPKS
SAQLLEDWGMEDIDHVFSEEDYRTLTNYKAFSQFVRPLIAAKNPKIAVSK
MMMVLGAKWREFSTNNPFKGSSGASVAAAAAAAVAVVESMVTATEVAPPP
PPVEVPIRKAKTKEGKGPNARRKPKGSPRVPDAKKPKPKKVAPLKIKLGG
FGSKRKRSSSEDDDLDVESDFDDASINSYSVSDGSTSRSSRSRKKLRTTK
KKKKGEEEVTAVDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHMVCLDPD
MEKAPEGKWSCPHCEKEGIQWEAKEDNSEGEEILEEVGGDLEEEDDHHME
FCRVCKDGGELLCCDTCPSSYHIHCLNPPLPEIPNGEWLCPRCTCPALKG
KVQKILIWKWGQPPSPTPVPRPPDADPNTPSPKPLEGRPERQFFVKWQGM
SYWHCSWVSELQLELHCQVMFRNYQRKNDMDEPPSGDFGGDEEKSRKRKN
KDPKFAEMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSVDKKGHVHYLIKWRDLPYD
QASWESEDVEIQDYDLFKQSYWNHRELMRGEEGRPGKKLKKVKLRKLERP
PETPTVDPTVKYERQPEYLDATGGTLHPYQMEGLNWLRFSWAQGTDTILA
DEMGLGKTVQTAVFLYSLYKEGHSKGPFLVSAPLSTIINWEREFEMWAPD
MYVVTYVGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIRGGKKASRMKKEASVKFHVLLT
SYELITIDMAILGSIDWACLIVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYSLQHKLLL
TGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFHNLEGFLEEFADIAKEDQIKKLHDML
GPHMLRRLKADVFKNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNAR
GGGNQVSLLNVVMDLKKCCNHPYLFPVAAMEAPKMPNGMYDGSALIRASG
KLLLLQKMLKNLKEGGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLEHEGYKYERIDGGI
TGNMRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNP
HNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKKKMMLTHLVVR
PGLGSKTGSMSKQELDDILKFGTEELFKDEATDGGGDNKEGEDSSVIHYD
DKAIERLLDRNQDETEDTELQGMNEYLSSFKVAQYVVREEEMGEEEEVER
EIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNYNDGSQ
EDRDWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAPRRPSRKGLRNDKDKPL
PPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRG
KSEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMS
LIRKKVQEFEHVNGRWSMPELAEVEENKKMSQPGSPSPKTPTPSTPGDTQ
PNTPAPVPPAEDGIKIEENSLKEEESIEGEKEVKSTAPETAIECTQAPAP
ASEDEKVVVEPPEGEEKVEKAEVKERTEEPMETEPKGAADVEKVEEKSAI
DLTPIVVEDKEEKKEEEEKKEVMLQNGETPKDLNDEKQKKNIKQRFMFNI
ADGGFTELHSLWQNEERAATVTKKTYEIWHRRHDYWLLAGIINHGYARWQ
DIQNDPRYAILNEPFKGEMNRGNFLEIKNKFLARRFKLLEQALVIEEQLR
RAAYLNMSEDPSHPSMALNTRFAEVECLAESHQHLSKESMAGNKPANAVL
HKVLKQLEELLSDMKADVTRLPATIARIPPVAVRLQMSERNILSRLANRA
PEPTPQQVAQQQ

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, , фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Tong J.K., Hassig C.A., Schnitzler G.R., Kingston R.E., Schreiber S.L. (1998). Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex. Nature. 395: 917—921. PMID 9804427 DOI:10.1038/27699
  • Schmidt D.R., Schreiber S.L. (1999). Molecular association between ATR and two components of the nucleosome remodeling and deacetylating complex, HDAC2 and CHD4. Biochemistry. 38: 14711—14717. PMID 10545197 DOI:10.1021/bi991614n
  • Sillibourne J.E., Delaval B., Redick S., Sinha M., Doxsey S.J. (2007). Chromatin remodeling proteins interact with pericentrin to regulate centrosome integrity. Mol. Biol. Cell. 18: 3667—3680. PMID 17626165 DOI:10.1091/mbc.E06-07-0604
  • Yuce O., West S.C. (2013). Senataxin, defective in the neurodegenerative disorder ataxia with oculomotor apraxia 2, lies at the interface of transcription and the DNA damage response. Mol. Cell. Biol. 33: 406—417. PMID 23149945 DOI:10.1128/MCB.01195-12
  • Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з CHD4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1919 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  5. (англ.) . Архів оригіналу за 16 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до .

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

CHD4 angl Chromodomain helicase DNA binding protein 4 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 12 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 912 aminokislot a molekulyarna masa 218 005 CHD4Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1MM2 1MM3 2EE1 2L5U 2L75 4O9I 2N5NIdentifikatoriSimvoliCHD4 CHD 4 Mi 2b Mi2 BETA chromodomain helicase DNA binding protein 4 SIHIWESZovnishni ID OMIM 603277 MGI 1344380 HomoloGene 68175 GeneCards CHD4Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaSifrim Hitz Weiss syndrome Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0000980 RNA polymerase II cis regulatory region sequence specific DNA binding DNA binding nucleotide binding GO 0008026 helicase activity GO 0004003 DNA helicase activity transcription factor binding zv yazuvannya z ionom metalu GO 0001948 GO 0016582 protein binding nucleosomal DNA binding hydrolase activity ATP binding histone deacetylase activity histone deacetylase binding zinc ion bindingKlitinna komponenta citoplazma NuRD complex centrosoma membrana nukleoplazma centr organizaciyi mikrotrubochok protein DNA complex citoskelet klitinne yadro GO 0009327 protein containing complexBiologichnij proces GO 0009373 regulation of transcription DNA templated GO 0044324 GO 0003256 GO 1901213 GO 0046019 GO 0046020 GO 1900094 GO 0061216 GO 0060994 GO 1902064 GO 0003258 GO 0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II transcription DNA templated terminal button organization histone deacetylation DNA duplex unwinding regulation of signal transduction by p53 class mediator GO 0031497 GO 0006336 GO 0034724 GO 0001301 GO 0007580 GO 0034652 GO 0010847 chromatin organizationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez1108 107932Ensembl ENSG00000111642 ENSMUSG00000063870UniProt Q14839 Q6PDQ2RefSeq mRNK NM 001273 NM 001297553 NM 001363606NM 145979 NM 001346610RefSeq bilok NP 001264 NP 001284482 NP 001350535NP 001333539 NP 666091 NP 001390521 NP 001390522 NP 001390523NP 001390524 NP 001390525 NP 001390526 NP 001390527Lokus UCSC Hr 12 6 57 6 61 MbHr 6 125 07 125 11 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MASGLGSPSPCSAGSEEEDMDALLNNSLPPPHPENEEDPEEDLSETETPK LKKKKKPKKPRDPKIPKSKRQKKERMLLCRQLGDSSGEGPEFVEEEEEVA LRSDSEGSDYTPGKKKKKKLGPKKEKKSKSKRKEEEEEEDDDDDSKEPKS SAQLLEDWGMEDIDHVFSEEDYRTLTNYKAFSQFVRPLIAAKNPKIAVSK MMMVLGAKWREFSTNNPFKGSSGASVAAAAAAAVAVVESMVTATEVAPPP PPVEVPIRKAKTKEGKGPNARRKPKGSPRVPDAKKPKPKKVAPLKIKLGG FGSKRKRSSSEDDDLDVESDFDDASINSYSVSDGSTSRSSRSRKKLRTTK KKKKGEEEVTAVDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHMVCLDPD MEKAPEGKWSCPHCEKEGIQWEAKEDNSEGEEILEEVGGDLEEEDDHHME FCRVCKDGGELLCCDTCPSSYHIHCLNPPLPEIPNGEWLCPRCTCPALKG KVQKILIWKWGQPPSPTPVPRPPDADPNTPSPKPLEGRPERQFFVKWQGM SYWHCSWVSELQLELHCQVMFRNYQRKNDMDEPPSGDFGGDEEKSRKRKN KDPKFAEMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSVDKKGHVHYLIKWRDLPYD QASWESEDVEIQDYDLFKQSYWNHRELMRGEEGRPGKKLKKVKLRKLERP PETPTVDPTVKYERQPEYLDATGGTLHPYQMEGLNWLRFSWAQGTDTILA DEMGLGKTVQTAVFLYSLYKEGHSKGPFLVSAPLSTIINWEREFEMWAPD MYVVTYVGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIRGGKKASRMKKEASVKFHVLLT SYELITIDMAILGSIDWACLIVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYSLQHKLLL TGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFHNLEGFLEEFADIAKEDQIKKLHDML GPHMLRRLKADVFKNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNAR GGGNQVSLLNVVMDLKKCCNHPYLFPVAAMEAPKMPNGMYDGSALIRASG KLLLLQKMLKNLKEGGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLEHEGYKYERIDGGI TGNMRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNP HNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKKKMMLTHLVVR PGLGSKTGSMSKQELDDILKFGTEELFKDEATDGGGDNKEGEDSSVIHYD DKAIERLLDRNQDETEDTELQGMNEYLSSFKVAQYVVREEEMGEEEEVER EIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNYNDGSQ EDRDWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAPRRPSRKGLRNDKDKPL PPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRG KSEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMS LIRKKVQEFEHVNGRWSMPELAEVEENKKMSQPGSPSPKTPTPSTPGDTQ PNTPAPVPPAEDGIKIEENSLKEEESIEGEKEVKSTAPETAIECTQAPAP ASEDEKVVVEPPEGEEKVEKAEVKERTEEPMETEPKGAADVEKVEEKSAI DLTPIVVEDKEEKKEEEEKKEVMLQNGETPKDLNDEKQKKNIKQRFMFNI ADGGFTELHSLWQNEERAATVTKKTYEIWHRRHDYWLLAGIINHGYARWQ DIQNDPRYAILNEPFKGEMNRGNFLEIKNKFLARRFKLLEQALVIEEQLR RAAYLNMSEDPSHPSMALNTRFAEVECLAESHQHLSKESMAGNKPANAVL HKVLKQLEELLSDMKADVTRLPATIARIPPVAVRLQMSERNILSRLANRA PEPTPQQVAQQQ A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do gidrolaz gelikaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi acetilyuvannya alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ATF nukleotidami ionami metaliv ionom cinku DNK Lokalizovanij u citoplazmi citoskeleti yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Tong J K Hassig C A Schnitzler G R Kingston R E Schreiber S L 1998 Chromatin deacetylation by an ATP dependent nucleosome remodelling complex Nature 395 917 921 PMID 9804427 DOI 10 1038 27699 Schmidt D R Schreiber S L 1999 Molecular association between ATR and two components of the nucleosome remodeling and deacetylating complex HDAC2 and CHD4 Biochemistry 38 14711 14717 PMID 10545197 DOI 10 1021 bi991614n Sillibourne J E Delaval B Redick S Sinha M Doxsey S J 2007 Chromatin remodeling proteins interact with pericentrin to regulate centrosome integrity Mol Biol Cell 18 3667 3680 PMID 17626165 DOI 10 1091 mbc E06 07 0604 Yuce O West S C 2013 Senataxin defective in the neurodegenerative disorder ataxia with oculomotor apraxia 2 lies at the interface of transcription and the DNA damage response Mol Cell Biol 33 406 417 PMID 23149945 DOI 10 1128 MCB 01195 12 Impens F Radoshevich L Cossart P Ribet D 2014 Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli Proc Natl Acad Sci U S A 111 12432 12437 PMID 25114211 DOI 10 1073 pnas 1413825111PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z CHD4 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 1919 angl Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 16 zhovtnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 12 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Na cyu stattyu ne posilayutsya inshi statti Vikipediyi Bud laska rozstavte posilannya vidpovidno do prijnyatih rekomendacij

Дата публікації:
Топ