Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

IFIH1 англ Interferon induced with helicase C domain 1 білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на ко

MDA5

MDA5

IFIH1 (англ. Interferon induced with helicase C domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 025 амінокислот, а молекулярна маса — 116 689.

IFIH1
image
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи IFIH1, AGS7, Hlcd, IDDM19, MDA-5, MDA5, RLR-2, SGMRT1, interferon induced with helicase C domain 1, IMD95
Зовнішні ІД OMIM: 606951 MGI: 1918836 HomoloGene: 32535 GeneCards: IFIH1
Пов'язані генетичні захворювання
цукровий діабет тип 1, type 1 diabetes mellitus 19, Singleton-Merten syndrome 1, Singleton Merten syndrome, Aicardi-Goutieres syndrome
Шаблон експресії
image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
64135
71586
Ensembl
ENSG00000115267
ENSMUSG00000026896
UniProt
Q9BYX4
Q8R5F7
RefSeq (мРНК)
NM_022168
NM_001164477
NM_027835
RefSeq (білок)
NP_071451
NP_001157949
NP_082111
Локус (UCSC) Хр. 2: 162.27 – 162.32 Mb Хр. 2: 62.43 – 62.48 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MSNGYSTDENFRYLISCFRARVKMYIQVEPVLDYLTFLPAEVKEQIQRTV
ATSGNMQAVELLLSTLEKGVWHLGWTREFVEALRRTGSPLAARYMNPELT
DLPSPSFENAHDEYLQLLNLLQPTLVDKLLVRDVLDKCMEEELLTIEDRN
RIAAAENNGNESGVRELLKRIVQKENWFSAFLNVLRQTGNNELVQELTGS
DCSESNAEIENLSQVDGPQVEEQLLSTTVQPNLEKEVWGMENNSSESSFA
DSSVVSESDTSLAEGSVSCLDESLGHNSNMGSDSGTMGSDSDEENVAARA
SPEPELQLRPYQMEVAQPALEGKNIIICLPTGSGKTRVAVYIAKDHLDKK
KKASEPGKVIVLVNKVLLVEQLFRKEFQPFLKKWYRVIGLSGDTQLKISF
PEVVKSCDIIISTAQILENSLLNLENGEDAGVQLSDFSLIIIDECHHTNK
EAVYNNIMRHYLMQKLKNNRLKKENKPVIPLPQILGLTASPGVGGATKQA
KAEEHILKLCANLDAFTIKTVKENLDQLKNQIQEPCKKFAIADATREDPF
KEKLLEIMTRIQTYCQMSPMSDFGTQPYEQWAIQMEKKAAKEGNRKERVC
AEHLRKYNEALQINDTIRMIDAYTHLETFYNEEKDKKFAVIEDDSDEGGD
DEYCDGDEDEDDLKKPLKLDETDRFLMTLFFENNKMLKRLAENPEYENEK
LTKLRNTIMEQYTRTEESARGIIFTKTRQSAYALSQWITENEKFAEVGVK
AHHLIGAGHSSEFKPMTQNEQKEVISKFRTGKINLLIATTVAEEGLDIKE
CNIVIRYGLVTNEIAMVQARGRARADESTYVLVAHSGSGVIEHETVNDFR
EKMMYKAIHCVQNMKPEEYAHKILELQMQSIMEKKMKTKRNIAKHYKNNP
SLITFLCKNCSVLACSGEDIHVIEKMHHVNMTPEFKELYIVRENKALQKK
CADYQINGEIICKCGQAWGTMMVHKGLDLPCLKIRNFVVVFKNNSTKKQY
KKWVELPITFPNLDYSECCLFSDED

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, антивірусний захист, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Bamming D., Horvath C.M. (2009). Regulation of signal transduction by enzymatically inactive antiviral RNA helicase proteins MDA5, RIG-I, and LGP2. J. Biol. Chem. 284: 9700—9712. PMID 19211564 DOI:10.1074/jbc.M807365200
  • Loo Y.M., Gale M. Jr. (2011). Immune signaling by RIG-I-like receptors. Immunity. 34: 680—692. PMID 21616437 DOI:10.1016/j.immuni.2011.05.003
  • Kato H., Takahasi K., Fujita T. (2011). RIG-I-like receptors: cytoplasmic sensors for non-self RNA. Immunol. Rev. 243: 91—98. PMID 21884169 DOI:10.1111/j.1600-065X.2011.01052.x
  • Onoguchi K., Yoneyama M., Fujita T. (2011). Retinoic acid-inducible gene-I-like receptors. J. Interferon Cytokine Res. 31: 27—31. PMID 20950133 DOI:10.1089/jir.2010.0057
  • Miyashita M., Oshiumi H., Matsumoto M., Seya T. (2011). DDX60, a DEXD/H box helicase, is a novel antiviral factor promoting RIG-I-like receptor-mediated signaling. Mol. Cell. Biol. 31: 3802—3819. PMID 21791617 DOI:10.1128/MCB.01368-10

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з IFIH1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 4 квітня 2015. Процитовано 29 серпня 2017.
  5. (англ.) . Архів оригіналу за 26 серпня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

IFIH1 angl Interferon induced with helicase C domain 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 2 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 025 aminokislot a molekulyarna masa 116 689 IFIH1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2RQB 3B6E 3GA3 4GL2IdentifikatoriSimvoliIFIH1 AGS7 Hlcd IDDM19 MDA 5 MDA5 RLR 2 SGMRT1 interferon induced with helicase C domain 1 IMD95Zovnishni ID OMIM 606951 MGI 1918836 HomoloGene 32535 GeneCards IFIH1Pov yazani genetichni zahvoryuvannyacukrovij diabet tip 1 type 1 diabetes mellitus 19 Singleton Merten syndrome 1 Singleton Merten syndrome Aicardi Goutieres syndrome Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding nucleotide binding GO 0008026 helicase activity zinc ion binding zv yazuvannya z ionom metalu GO 0001948 GO 0016582 protein binding single stranded RNA binding RNA binding double stranded RNA binding ribonucleoprotein complex binding hydrolase activity ATP binding identical protein bindingKlitinna komponenta citoplazma gialoplazma klitinne yadroBiologichnij proces positive regulation of interferon alpha production MDA 5 signaling pathway proces imunnoyi sistemi response to virus protein sumoylation cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway in response to virus negative regulation of type I interferon production detection of virus GO 0022415 viral process vrodzhenij imunitet regulation of type III interferon production positive regulation of interferon beta production protein deubiquitination positive regulation of response to cytokine stimulus cellular response to exogenous dsRNA defense response to virusDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez64135 71586Ensembl ENSG00000115267 ENSMUSG00000026896UniProt Q9BYX4 Q8R5F7RefSeq mRNK NM 022168NM 001164477 NM 027835RefSeq bilok NP 071451NP 001157949 NP 082111Lokus UCSC Hr 2 162 27 162 32 MbHr 2 62 43 62 48 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MSNGYSTDENFRYLISCFRARVKMYIQVEPVLDYLTFLPAEVKEQIQRTV ATSGNMQAVELLLSTLEKGVWHLGWTREFVEALRRTGSPLAARYMNPELT DLPSPSFENAHDEYLQLLNLLQPTLVDKLLVRDVLDKCMEEELLTIEDRN RIAAAENNGNESGVRELLKRIVQKENWFSAFLNVLRQTGNNELVQELTGS DCSESNAEIENLSQVDGPQVEEQLLSTTVQPNLEKEVWGMENNSSESSFA DSSVVSESDTSLAEGSVSCLDESLGHNSNMGSDSGTMGSDSDEENVAARA SPEPELQLRPYQMEVAQPALEGKNIIICLPTGSGKTRVAVYIAKDHLDKK KKASEPGKVIVLVNKVLLVEQLFRKEFQPFLKKWYRVIGLSGDTQLKISF PEVVKSCDIIISTAQILENSLLNLENGEDAGVQLSDFSLIIIDECHHTNK EAVYNNIMRHYLMQKLKNNRLKKENKPVIPLPQILGLTASPGVGGATKQA KAEEHILKLCANLDAFTIKTVKENLDQLKNQIQEPCKKFAIADATREDPF KEKLLEIMTRIQTYCQMSPMSDFGTQPYEQWAIQMEKKAAKEGNRKERVC AEHLRKYNEALQINDTIRMIDAYTHLETFYNEEKDKKFAVIEDDSDEGGD DEYCDGDEDEDDLKKPLKLDETDRFLMTLFFENNKMLKRLAENPEYENEK LTKLRNTIMEQYTRTEESARGIIFTKTRQSAYALSQWITENEKFAEVGVK AHHLIGAGHSSEFKPMTQNEQKEVISKFRTGKINLLIATTVAEEGLDIKE CNIVIRYGLVTNEIAMVQARGRARADESTYVLVAHSGSGVIEHETVNDFR EKMMYKAIHCVQNMKPEEYAHKILELQMQSIMEKKMKTKRNIAKHYKNNP SLITFLCKNCSVLACSGEDIHVIEKMHHVNMTPEFKELYIVRENKALQKK CADYQINGEIICKCGQAWGTMMVHKGLDLPCLKIRNFVVVFKNNSTKKQY KKWVELPITFPNLDYSECCLFSDED A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do gidrolaz gelikaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak imunitet vrodzhenij imunitet vzayemodiya hazyayin virus antivirusnij zahist polimorfizm alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ATF nukleotidami ionami metaliv ionom cinku RNK Lokalizovanij u citoplazmi yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Bamming D Horvath C M 2009 Regulation of signal transduction by enzymatically inactive antiviral RNA helicase proteins MDA5 RIG I and LGP2 J Biol Chem 284 9700 9712 PMID 19211564 DOI 10 1074 jbc M807365200 Loo Y M Gale M Jr 2011 Immune signaling by RIG I like receptors Immunity 34 680 692 PMID 21616437 DOI 10 1016 j immuni 2011 05 003 Kato H Takahasi K Fujita T 2011 RIG I like receptors cytoplasmic sensors for non self RNA Immunol Rev 243 91 98 PMID 21884169 DOI 10 1111 j 1600 065X 2011 01052 x Onoguchi K Yoneyama M Fujita T 2011 Retinoic acid inducible gene I like receptors J Interferon Cytokine Res 31 27 31 PMID 20950133 DOI 10 1089 jir 2010 0057 Miyashita M Oshiumi H Matsumoto M Seya T 2011 DDX60 a DEXD H box helicase is a novel antiviral factor promoting RIG I like receptor mediated signaling Mol Cell Biol 31 3802 3819 PMID 21791617 DOI 10 1128 MCB 01368 10PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z IFIH1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 4 kvitnya 2015 Procitovano 29 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 26 serpnya 2017 Procitovano 29 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 2 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ