PTPRT

PTPRT (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type T) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 441 амінокислот, а молекулярна маса — 162 134.

PTPRT
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2OOQ
Ідентифікатори
Символи	PTPRT, RPTPrho, protein tyrosine phosphatase, receptor type T, protein tyrosine phosphatase receptor type T, RPTP-rho, R-PTP-T
Зовнішні ІД	OMIM: 608712 MGI: 1321152 HomoloGene: 56924 GeneCards: PTPRT
Пов'язані генетичні захворювання
періодонтит
Онтологія гена Молекулярна функція • protein tyrosine phosphatase activity • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • beta-catenin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphoprotein phosphatase activity • hydrolase activity • alpha-catenin binding • cadherin binding • delta-catenin binding • gamma-catenin binding • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity • protein phosphatase binding • protein homodimerization activity • STAT family protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • cell surface • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane Біологічний процес • GO:0016576 protein dephosphorylation • адгезія клітин • GO:0072468 сигнальна трансдукція • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • peptidyl-tyrosine dephosphorylation • negative regulation of cell migration • cellular response to interleukin-6 • negative regulation of receptor signaling pathway via STAT • peptidyl-tyrosine dephosphorylation involved in inactivation of protein kinase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11122	19281
Ensembl	ENSG00000196090	ENSMUSG00000053141
UniProt	O14522	Q99M80
RefSeq (мРНК)	NM_007050 NM_133170 NM_001394024 NM_001394025 NM_001394026	NM_001291149 NM_001291150 NM_001291151 NM_021464
RefSeq (білок)	NP_008981 NP_573400	NP_001278078 NP_001278079 NP_001278080 NP_067439
Локус (UCSC)	Хр. 20: 42.07 – 43.19 Mb	Хр. 2: 161.36 – 162.5 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASLAALALS		LLLRLQLPPL		PGARAQSAAG		GCSFDEHYSN		CGYSVALGTN
GFTWEQINTW		EKPMLDQAVP		TGSFMMVNSS		GRASGQKAHL		LLPTLKENDT
HCIDFHYYFS		SRDRSSPGAL		NVYVKVNGGP		QGNPVWNVSG		VVTEGWVKAE
LAISTFWPHF		YQVIFESVSL		KGHPGYIAVD		EVRVLAHPCR		KAPHFLRLQN
VEVNVGQNAT		FQCIAGGKWS		QHDKLWLQQW		NGRDTALMVT		RVVNHRRFSA
TVSVADTAQR		SVSKYRCVIR		SDGGSGVSNY		AELIVKEPPT		PIAPPELLAV
GATYLWIKPN		ANSIIGDGPI		ILKEVEYRTT		TGTWAETHIV		DSPNYKLWHL
DPDVEYEIRV		LLTRPGEGGT		GPPGPPLTTR		TKCADPVHGP		QNVEIVDIRA
RQLTLQWEPF		GYAVTRCHSY		NLTVQYQYVF		NQQQYEAEEV		IQTSSHYTLR
GLRPFMTIRL		RLLLSNPEGR		MESEELVVQT		EEDVPGAVPL		ESIQGGPFEE
KIYIQWKPPN		ETNGVITLYE		INYKAVGSLD		PSADLSSQRG		KVFKLRNETH
HLFVGLYPGT		TYSFTIKAST		AKGFGPPVTT		RIATKISAPS		MPEYDTDTPL
NETDTTITVM		LKPAQSRGAP		VSVYQLVVKE		ERLQKSRRAA		DIIECFSVPV
SYRNASSLDS		LHYFAAELKP		ANLPVTQPFT		VGDNKTYNGY		WNPPLSPLKS
YSIYFQALSK		ANGETKINCV		RLATKGASTQ		NSNTVEPEKQ		VDNTVKMAGV
IAGLLMFIII		LLGVMLTIKR		RRNAYSYSYY		LKLAKKQKET		QSGAQREMGP
VASADKPTTK		LSASRNDEGF		SSSSQDVNGF		TDGSRGELSQ		PTLTIQTHPY
RTCDPVEMSY		PRDQFQPAIR		VADLLQHITQ		MKRGQGYGFK		EEYEALPEGQ
TASWDTAKED		ENRNKNRYGN		IISYDHSRVR		LLVLDGDPHS		DYINANYIDG
YHRPRHYIAT		QGPMQETVKD		FWRMIWQENS		ASIVMVTNLV		EVGRVKCVRY
WPDDTEVYGD		IKVTLIETEP		LAEYVIRTFT		VQKKGYHEIR		ELRLFHFTSW
PDHGVPCYAT		GLLGFVRQVK		FLNPPEAGPI		VVHCSAGAGR		TGCFIAIDTM
LDMAENEGVV		DIFNCVRELR		AQRVNLVQTE		EQYVFVHDAI		LEACLCGNTA
IPVCEFRSLY		YNISRLDPQT		NSSQIKDEFQ		TLNIVTPRVR		PEDCSIGLLP
RNHDKNRSMD		VLPLDRCLPF		LISVDGESSN		YINAALMDSH		KQPAAFVVTQ
HPLPNTVADF		WRLVFDYNCS		SVVMLNEMDT		AQFCMQYWPE		KTSGCYGPIQ
VEFVSADIDE		DIIHRIFRIC		NMARPQDGYR		IVQHLQYIGW		PAYRDTPPSK
RSLLKVVRRL		EKWQEQYDGR		EGRTVVHCLN		GGGRSGTFCA		ICSVCEMIQQ
QNIIDVFHIV		KTLRNNKSNM		VETLEQYKFV		YEVALEYLSS		F

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• McAndrew P.E., Frostholm A., White R.A., Rotter A., Burghes A.H.M. (1998). Identification and characterization of RPTP rho, a novel RPTP mu/kappa-like receptor protein tyrosine phosphatase whose expression is restricted to the central nervous system. Brain Res. Mol. Brain Res. 56: 9—21. PMID 9602027 DOI:10.1016/S0169-328X(98)00014-X
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Besco J.A., Frostholm A., Popesco M.C., Burghes A.H.M., Rotter A. (2001). Genomic organization and alternative splicing of the human and mouse RPTPrho genes. BMC Genomics. 2: 1—1. PMID 11423001 DOI:10.1186/1471-2164-2-1
• Besco J.A., Frostholm A., Popesco M.C., Burghes A.H.M., Rotter A. (2001). BMC Genomics. 2: 5—5. {{}}: Пропущений або порожній |title= () PMID 11814386 DOI:10.1186/1471-2164-2-5

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з PTPRT переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9682 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
5. (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 20