Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

MID1 англ Midline 1 білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на X хромосомі Довжина поліпептидного ла

MID1

MID1

MID1 (англ. Midline 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 667 амінокислот, а молекулярна маса — 75 251.

MID1
image
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи MID1, BBBG1, FXY, GBBB1, MIDIN, OGS1, OS, OSX, RNF59, TRIM18, XPRF, ZNFXY, midline 1, GBBB
Зовнішні ІД OMIM: 300552 MGI: 1100537 HomoloGene: 7837 GeneCards: MID1
Шаблон експресії
image

image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4281
17318
Ensembl
ENSG00000101871
ENSMUSG00000035299
UniProt
O15344
O70583
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
NP_001277433
NP_001277434
NP_001277435
NP_001277441
NP_034927
Локус (UCSC) Хр. X: 10.45 – 10.83 Mb Хр. X: 168.47 – 168.79 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVSHCATNESVES
ITAFQCPTCRHVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSET
RRERAFDANTMTSAEKVLCQFCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATH
PNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHEDEKVNMYCVTDDQLICALCKL
VGRHRDHQVAALSERYDKLKQNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQTCQH
VEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIA
NCKQCIERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLI
PEINLNDTFDTFALDFSREKKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTIT
VHWTSDDEFSVVSYELQYTIFTGQANVVSLCNSADSWMIVPNIKQNHYTV
HGLQSGTKYIFMVKAINQAGSRSSEPGKLKTNSQPFKLDPKSAHRKLKVS
HDNLTVERDESSSKKSHTPERFTSQGSYGVAGNVFIDSGRHYWEVVISGS
TWYAIGLAYKSAPKHEWIGKNSASWALCRCNNNWVVRHNSKEIPIEPAPH
LRRVGILLDYDNGSIAFYDALNSIHLYTFDVAFAQPVCPTFTVWNKCLTI
ITGLPIPDHLDCTEQLP

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Еволюція

Послідовність гену консервативна в ссавців, за виключенням Mus musculus. У цього виду миші відбулася транслокація гену до псевдоавтосомної ділянки X-хромосоми, що призвело до підвищеної частоти рекомбінації у мейозі, збільшенні помилок та їхньої репарації за принципом спрямованої конверсії генів (англ. biased gene conversion).

Література

  • Perry J., Feather S., Smith A., Palmer S., Ashworth A. (1998). The human FXY gene is located within Xp22.3: implications for evolution of the mammalian X chromosome. Hum. Mol. Genet. 7: 299—305. PMID 9425238 DOI:10.1093/hmg/7.2.299
  • Van den Veyver I.B., Cormier T.A., Jurecic V., Baldini A., Zoghbi H.Y. (1998). Characterization and physical mapping in human and mouse of a novel RING finger gene in Xp22. Genomics. 51: 251—261. PMID 9722948 DOI:10.1006/geno.1998.5350
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Cainarca S., Messali S., Ballabio A., Meroni G. (1999). Functional characterization of the Opitz syndrome gene product (midin): evidence for homodimerization and association with microtubules throughout the cell cycle. Hum. Mol. Genet. 8: 1387—1396. PMID 10400985 DOI:10.1093/hmg/8.8.1387
  • Short K.M., Hopwood B., Yi Z., Cox T.C. (2002). MID1 and MID2 homo- and heterodimerise to tether the rapamycin-sensitive PP2A regulatory subunit, Alpha 4, to microtubules: implications for the clinical variability of X-linked Opitz GBBB syndrome and other developmental disorders. BMC Cell Biol. 3: 1—1. PMID 11806752 DOI:10.1186/1471-2121-3-1
  • Massiah M.A., Simmons B.N., Short K.M., Cox T.C. (2006). Solution structure of the RBCC/TRIM B-box1 domain of human MID1: B-box with a RING. J. Mol. Biol. 358: 532—545. PMID 16529770 DOI:10.1016/j.jmb.2006.02.009

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7095 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
  5. Galtier, Nicolas; Duret, Laurent (2007). Adaptation or biased gene conversion? Extending the null hypothesis of molecular evolution. Trends in Genetics. 23 (6): 273—277. doi:10.1016/j.tig.2007.03.011. ISSN 0168-9525.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

MID1 angl Midline 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na X hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 667 aminokislot a molekulyarna masa 75 251 MID1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2DQ5 2FFW 2JUN 5IM8IdentifikatoriSimvoliMID1 BBBG1 FXY GBBB1 MIDIN OGS1 OS OSX RNF59 TRIM18 XPRF ZNFXY midline 1 GBBBZovnishni ID OMIM 300552 MGI 1100537 HomoloGene 7837 GeneCards MID1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya protein homodimerization activity microtubule binding zinc ion binding zv yazuvannya z ionom metalu phosphoprotein binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding identical protein binding protein heterodimerization activity ubiquitin protein ligase binding transferase activityKlitinna komponenta citoplazma gialoplazma microtubule cytoskeleton vereteno podilu vnutrishnoklitinnij microtubule associated complex cytoplasmic microtubule mikrotrubochka citoskeletBiologichnij proces pattern specification process interferon gamma mediated signaling pathway negative regulation of microtubule depolymerization protein localization to microtubule microtubule cytoskeleton organization positive regulation of stress activated MAPK cascadeDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez4281 17318Ensembl ENSG00000101871 ENSMUSG00000035299UniProt O15344 O70583RefSeq mRNK NM 000381 NM 001098624 NM 001193277 NM 001193278 NM 001193279NM 001193280 NM 001193281 NM 033289 NM 033290 NM 033291 NM 001347733NM 001290504 NM 001290505 NM 001290506 NM 001290512 NM 010797NM 183151RefSeq bilok NP 000372 NP 001092094 NP 001180206 NP 001180207 NP 001180208NP 001180209 NP 001334662 NP 150631 NP 150632NP 001277433 NP 001277434 NP 001277435 NP 001277441 NP 034927Lokus UCSC Hr X 10 45 10 83 MbHr X 168 47 168 79 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 METLESELTCPICLELFEDPLLLPCAHSLCFNCAHRILVSHCATNESVES ITAFQCPTCRHVITLSQRGLDGLKRNVTLQNIIDRFQKASVSGPNSPSET RRERAFDANTMTSAEKVLCQFCDQDPAQDAVKTCVTCEVSYCDECLKATH PNKKPFTGHRLIEPIPDSHIRGLMCLEHEDEKVNMYCVTDDQLICALCKL VGRHRDHQVAALSERYDKLKQNLESNLTNLIKRNTELETLLAKLIQTCQH VEVNASRQEAKLTEECDLLIEIIQQRRQIIGTKIKEGKVMRLRKLAQQIA NCKQCIERSASLISQAEHSLKENDHARFLQTAKNITERVSMATASSQVLI PEINLNDTFDTFALDFSREKKLLECLDYLTAPNPPTIREELCTASYDTIT VHWTSDDEFSVVSYELQYTIFTGQANVVSLCNSADSWMIVPNIKQNHYTV HGLQSGTKYIFMVKAINQAGSRSSEPGKLKTNSQPFKLDPKSAHRKLKVS HDNLTVERDESSSKKSHTPERFTSQGSYGVAGNVFIDSGRHYWEVVISGS TWYAIGLAYKSAPKHEWIGKNSASWALCRCNNNWVVRHNSKEIPIEPAPH LRRVGILLDYDNGSIAFYDALNSIHLYTFDVAFAQPVCPTFTVWNKCLTI ITGLPIPDHLDCTEQLP A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do transferaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak ubikvitinuvannya bilkiv alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku Lokalizovanij u citoplazmi citoskeleti EvolyuciyaPoslidovnist genu konservativna v ssavciv za viklyuchennyam Mus musculus U cogo vidu mishi vidbulasya translokaciya genu do psevdoavtosomnoyi dilyanki X hromosomi sho prizvelo do pidvishenoyi chastoti rekombinaciyi u mejozi zbilshenni pomilok ta yihnoyi reparaciyi za principom spryamovanoyi konversiyi geniv angl biased gene conversion LiteraturaPerry J Feather S Smith A Palmer S Ashworth A 1998 The human FXY gene is located within Xp22 3 implications for evolution of the mammalian X chromosome Hum Mol Genet 7 299 305 PMID 9425238 DOI 10 1093 hmg 7 2 299 Van den Veyver I B Cormier T A Jurecic V Baldini A Zoghbi H Y 1998 Characterization and physical mapping in human and mouse of a novel RING finger gene in Xp22 Genomics 51 251 261 PMID 9722948 DOI 10 1006 geno 1998 5350 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Cainarca S Messali S Ballabio A Meroni G 1999 Functional characterization of the Opitz syndrome gene product midin evidence for homodimerization and association with microtubules throughout the cell cycle Hum Mol Genet 8 1387 1396 PMID 10400985 DOI 10 1093 hmg 8 8 1387 Short K M Hopwood B Yi Z Cox T C 2002 MID1 and MID2 homo and heterodimerise to tether the rapamycin sensitive PP2A regulatory subunit Alpha 4 to microtubules implications for the clinical variability of X linked Opitz GBBB syndrome and other developmental disorders BMC Cell Biol 3 1 1 PMID 11806752 DOI 10 1186 1471 2121 3 1 Massiah M A Simmons B N Short K M Cox T C 2006 Solution structure of the RBCC TRIM B box1 domain of human MID1 B box with a RING J Mol Biol 358 532 545 PMID 16529770 DOI 10 1016 j jmb 2006 02 009PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 7095 angl Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 17 veresnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Galtier Nicolas Duret Laurent 2007 Adaptation or biased gene conversion Extending the null hypothesis of molecular evolution Trends in Genetics 23 6 273 277 doi 10 1016 j tig 2007 03 011 ISSN 0168 9525 Div takozhHromosoma X Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ