KCNIP1 (англ. Potassium voltage-gated channel interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 227 амінокислот, а молекулярна маса — 26 817.
KCNIP1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | KCNIP1, KCHIP1, VABP, potassium voltage-gated channel interacting protein 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 604660 MGI: 1917607 HomoloGene: 22824 GeneCards: KCNIP1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 5: 170.35 – 170.74 Mb | Хр. 11: 33.58 – 33.94 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MGAVMGTFSS | LQTKQRRPSK | DIAWWYYQYQ | RDKIEDELEM | TMVCHRPEGL | ||||
EQLEAQTNFT | KRELQVLYRG | FKNECPSGVV | NEDTFKQIYA | QFFPHGDAST | ||||
YAHYLFNAFD | TTQTGSVKFE | DFVTALSILL | RGTVHEKLRW | TFNLYDINKD | ||||
GYINKEEMMD | IVKAIYDMMG | KYTYPVLKED | TPRQHVDVFF | QKMDKNKDGI | ||||
VTLDEFLESC | QEDDNIMRSL | QLFQNVM |
Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, калію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках.
Література
- Pruunsild P., Timmusk T. (2005). Structure, alternative splicing, and expression of the human and mouse KCNIP gene family. Genomics. 86: 581—593. PMID 16112838 DOI:10.1016/j.ygeno.2005.07.001
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Van Hoorick D., Raes A., Keysers W., Mayeur E., Snyders D.J. (2003). Differential modulation of Kv4 kinetics by KCHIP1 splice variants. Mol. Cell. Neurosci. 24: 357—366. PMID 14572458 DOI:10.1016/S1044-7431(03)00174-X
- Lin Y.-L., Lin S.-R., Wu T.T., Chang L.-S. (2004). Evidence showing an intermolecular interaction between KChIP proteins and Taiwan cobra cardiotoxins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 319: 720—724. PMID 15184042 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.05.064
- Lin Y.-L., Chen C.Y., Cheng C.P., Chang L.S. (2004). Protein-protein interactions of KChIP proteins and Kv4.2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 321: 606—610. PMID 15358149 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.07.006
- Pioletti M., Findeisen F., Hura G.L., Minor D.L. Jr. (2006). Three-dimensional structure of the KChIP1-Kv4.3 T1 complex reveals a cross-shaped octamer. Nat. Struct. Mol. Biol. 13: 987—995. PMID 17057713 DOI:10.1038/nsmb1164
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15521 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 1 травня 2018. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
KCNIP1 angl Potassium voltage gated channel interacting protein 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 5 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 227 aminokislot a molekulyarna masa 26 817 KCNIP1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1S1E 2I2R 2NZ0IdentifikatoriSimvoliKCNIP1 KCHIP1 VABP potassium voltage gated channel interacting protein 1Zovnishni ID OMIM 604660 MGI 1917607 HomoloGene 22824 GeneCards KCNIP1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya calcium ion binding potassium channel regulator activity potassium channel activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding zv yazuvannya z ionom metalu voltage gated ion channel activityKlitinna komponenta citoplazma extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane voltage gated potassium channel complex klitinna membrana cell projection dendrit nejrobiologiya membranaBiologichnij proces potassium ion transport regulation of ion transmembrane transport ion transport regulation of potassium ion transmembrane transport potassium ion transmembrane transport cardiac conductionDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez30820 70357Ensembl ENSG00000182132 ENSMUSG00000053519UniProt Q9NZI2 Q9JJ57RefSeq mRNK NM 001034837 NM 001034838 NM 001278339 NM 001278340 NM 014592NM 001190885 NM 001190886 NM 001290690 NM 027398 NM 001363115RefSeq bilok NP 001030009 NP 001030010 NP 001265268 NP 001265269 NP 055407NP 001177814 NP 001177815 NP 001277619 NP 081674 NP 001350044Lokus UCSC Hr 5 170 35 170 74 MbHr 11 33 58 33 94 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MGAVMGTFSSLQTKQRRPSKDIAWWYYQYQRDKIEDELEMTMVCHRPEGL EQLEAQTNFTKRELQVLYRGFKNECPSGVVNEDTFKQIYAQFFPHGDAST YAHYLFNAFDTTQTGSVKFEDFVTALSILLRGTVHEKLRWTFNLYDINKD GYINKEEMMDIVKAIYDMMGKYTYPVLKEDTPRQHVDVFFQKMDKNKDGI VTLDEFLESCQEDDNIMRSLQLFQNVM A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do ionnih kanaliv potencialzalezhnih kanaliv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transport ioniv transport transport kaliyu alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom kalciyu kaliyu Lokalizovanij u klitinnij membrani citoplazmi membrani klitinnih vidrostkah LiteraturaPruunsild P Timmusk T 2005 Structure alternative splicing and expression of the human and mouse KCNIP gene family Genomics 86 581 593 PMID 16112838 DOI 10 1016 j ygeno 2005 07 001 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Van Hoorick D Raes A Keysers W Mayeur E Snyders D J 2003 Differential modulation of Kv4 kinetics by KCHIP1 splice variants Mol Cell Neurosci 24 357 366 PMID 14572458 DOI 10 1016 S1044 7431 03 00174 X Lin Y L Lin S R Wu T T Chang L S 2004 Evidence showing an intermolecular interaction between KChIP proteins and Taiwan cobra cardiotoxins Biochem Biophys Res Commun 319 720 724 PMID 15184042 DOI 10 1016 j bbrc 2004 05 064 Lin Y L Chen C Y Cheng C P Chang L S 2004 Protein protein interactions of KChIP proteins and Kv4 2 Biochem Biophys Res Commun 321 606 610 PMID 15358149 DOI 10 1016 j bbrc 2004 07 006 Pioletti M Findeisen F Hura G L Minor D L Jr 2006 Three dimensional structure of the KChIP1 Kv4 3 T1 complex reveals a cross shaped octamer Nat Struct Mol Biol 13 987 995 PMID 17057713 DOI 10 1038 nsmb1164PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 15521 angl Procitovano 5 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 1 travnya 2018 Procitovano 5 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 5 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi