Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

HDAC3 англ Histone deacetylase 3 білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плечі 5 ї хром

HDAC3

HDAC3

HDAC3 (англ. Histone deacetylase 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 428 амінокислот, а молекулярна маса — 48 848.

HDAC3
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи HDAC3, HD3, RPD3, RPD3-2, histone deacetylase 3
Зовнішні ІД OMIM: 605166 MGI: 1343091 HomoloGene: 48250 GeneCards: HDAC3
Реагує на сполуку
abexinostat, apicidin, belinostat, Масляна кислота, entinostat, givinostat, mocetinostat, panobinostat, pracinostat, quisinostat, resminostat, romidepsin, trichostatin A, золінза, entinostat, cudc-101, cudc-907, tacedinaline
Шаблон експресії
image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
8841
15183
Ensembl
ENSG00000171720
ENSMUSG00000024454
UniProt
O15379
O88895
RefSeq (мРНК)
NM_003883
NM_010411
RefSeq (білок)
NP_003874
NP_001341968
NP_001341969
NP_001341970
NP_034541
Локус (UCSC) Хр. 5: 141.62 – 141.64 Mb Хр. 18: 38.07 – 38.09 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MAKTVAYFYDPDVGNFHYGAGHPMKPHRLALTHSLVLHYGLYKKMIVFKP
YQASQHDMCRFHSEDYIDFLQRVSPTNMQGFTKSLNAFNVGDDCPVFPGL
FEFCSRYTGASLQGATQLNNKICDIAINWAGGLHHAKKFEASGFCYVNDI
VIGILELLKYHPRVLYIDIDIHHGDGVQEAFYLTDRVMTVSFHKYGNYFF
PGTGDMYEVGAESGRYYCLNVPLRDGIDDQSYKHLFQPVINQVVDFYQPT
CIVLQCGADSLGCDRLGCFNLSIRGHGECVEYVKSFNIPLLVLGGGGYTV
RNVARCWTYETSLLVEEAISEELPYSEYFEYFAPDFTLHPDVSTRIENQN
SRQYLDQIRQTIFENLKMLNHAPSVQIHDVPADLLTYDRTDEADAEERGP
EENYSRPEAPNEFYDGDHDNDKESDVEI

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, , фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • Yang W.-M., Yao Y.-L., Sun J.-M., Davie J.R., Seto E. (1997). Isolation and characterization of cDNAs corresponding to an additional member of the human histone deacetylase gene family. J. Biol. Chem. 272: 28001—28007. PMID 9346952 DOI:10.1074/jbc.272.44.28001
  • Emiliani S., Fischle W., van Lint C., Al-Abed Y., Verdin E. (1998). Characterization of a human RPD3 ortholog, HDAC3. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 2795—2800. PMID 9501169 DOI:10.1073/pnas.95.6.2795
  • Mahlknecht U., Emiliani S., Najfeld V., Young S., Verdin E. (1999). Genomic organization and chromosomal localization of the human histone deacetylase 3 gene. Genomics. 56: 197—202. PMID 10051405 DOI:10.1006/geno.1998.5645
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Wei L.-N., Hu X., Chandra D., Seto E., Farooqui M. (2000). Receptor-interacting protein 140 directly recruits histone deacetylases for gene silencing. J. Biol. Chem. 275: 40782—40787. PMID 11006275 DOI:10.1074/jbc.M004821200
  • Zhou X., Richon V.M., Rifkind R.A., Marks P.A. (2000). Identification of a transcriptional repressor related to the noncatalytic domain of histone deacetylases 4 and 5. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 1056—1061. PMID 10655483 DOI:10.1073/pnas.97.3.1056

Примітки

  1. Сполуки, які фізично взаємодіють з Histone deacetylase 3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 3 квітня 2016. Процитовано 5 вересня 2017.
  5. (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

HDAC3 angl Histone deacetylase 3 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 5 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 428 aminokislot a molekulyarna masa 48 848 HDAC3Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB4A69IdentifikatoriSimvoliHDAC3 HD3 RPD3 RPD3 2 histone deacetylase 3Zovnishni ID OMIM 605166 MGI 1343091 HomoloGene 48250 GeneCards HDAC3Reaguye na spolukuabexinostat apicidin belinostat Maslyana kislota entinostat givinostat mocetinostat panobinostat pracinostat quisinostat resminostat romidepsin trichostatin A zolinza entinostat cudc 101 cudc 907 tacedinaline Ontologiya genaMolekulyarna funkciya NAD dependent histone deacetylase activity H3 K14 specific GO 0001106 transcription corepressor activity histone deacetylase activity protein deacetylase activity transcription factor binding histone deacetylase binding chromatin binding NF kappaB binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding enzyme binding hydrolase activity cyclin bindingKlitinna komponenta citoplazma histone deacetylase complex gialoplazma kompleks Goldzhi klitinna membrana transcription repressor complex nukleoplazma spindle microtubule klitinne yadro mitotic spindleBiologichnij proces histone H3 deacetylation positive regulation of protein phosphorylation GO 0009373 regulation of transcription DNA templated regulation of protein stability negative regulation of apoptotic process GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II cellular response to fluid shear stress transcription DNA templated spindle assembly protein deacetylation negative regulation of JNK cascade cirkadnij ritm negative regulation of myotube differentiation GO 0045996 negative regulation of transcription DNA templated histone deacetylation positive regulation of TOR signaling GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II negative regulation of nucleic acid templated transcription regulation of lipid metabolic process GO 0031497 GO 0006336 GO 0034724 GO 0001301 GO 0007580 GO 0034652 GO 0010847 chromatin organization positive regulation of protein import into nucleus histone H4 deacetylation positive regulation of cold induced thermogenesis positive regulation of protein ubiquitination circadian regulation of gene expression regulation of circadian rhythm ritmichnij procesDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez8841 15183Ensembl ENSG00000171720 ENSMUSG00000024454UniProt O15379 O88895RefSeq mRNK NM 003883NM 010411RefSeq bilok NP 003874 NP 001341968 NP 001341969 NP 001341970NP 034541Lokus UCSC Hr 5 141 62 141 64 MbHr 18 38 07 38 09 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MAKTVAYFYDPDVGNFHYGAGHPMKPHRLALTHSLVLHYGLYKKMIVFKP YQASQHDMCRFHSEDYIDFLQRVSPTNMQGFTKSLNAFNVGDDCPVFPGL FEFCSRYTGASLQGATQLNNKICDIAINWAGGLHHAKKFEASGFCYVNDI VIGILELLKYHPRVLYIDIDIHHGDGVQEAFYLTDRVMTVSFHKYGNYFF PGTGDMYEVGAESGRYYCLNVPLRDGIDDQSYKHLFQPVINQVVDFYQPT CIVLQCGADSLGCDRLGCFNLSIRGHGECVEYVKSFNIPLLVLGGGGYTV RNVARCWTYETSLLVEEAISEELPYSEYFEYFAPDFTLHPDVSTRIENQN SRQYLDQIRQTIFENLKMLNHAPSVQIHDVPADLLTYDRTDEADAEERGP EENYSRPEAPNEFYDGDHDNDKESDVEI A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do represoriv gidrolaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi alternativnij splajsing polimorfizm Lokalizovanij u citoplazmi yadri LiteraturaYang W M Yao Y L Sun J M Davie J R Seto E 1997 Isolation and characterization of cDNAs corresponding to an additional member of the human histone deacetylase gene family J Biol Chem 272 28001 28007 PMID 9346952 DOI 10 1074 jbc 272 44 28001 Emiliani S Fischle W van Lint C Al Abed Y Verdin E 1998 Characterization of a human RPD3 ortholog HDAC3 Proc Natl Acad Sci U S A 95 2795 2800 PMID 9501169 DOI 10 1073 pnas 95 6 2795 Mahlknecht U Emiliani S Najfeld V Young S Verdin E 1999 Genomic organization and chromosomal localization of the human histone deacetylase 3 gene Genomics 56 197 202 PMID 10051405 DOI 10 1006 geno 1998 5645 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Wei L N Hu X Chandra D Seto E Farooqui M 2000 Receptor interacting protein 140 directly recruits histone deacetylases for gene silencing J Biol Chem 275 40782 40787 PMID 11006275 DOI 10 1074 jbc M004821200 Zhou X Richon V M Rifkind R A Marks P A 2000 Identification of a transcriptional repressor related to the noncatalytic domain of histone deacetylases 4 and 5 Proc Natl Acad Sci U S A 97 1056 1061 PMID 10655483 DOI 10 1073 pnas 97 3 1056PrimitkiSpoluki yaki fizichno vzayemodiyut z Histone deacetylase 3 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 3 kvitnya 2016 Procitovano 5 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 5 veresnya 2017 Procitovano 5 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 5 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ