HDAC10 (англ. Histone deacetylase 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 669 амінокислот, а молекулярна маса — 71 445.
HDAC10 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | HDAC10, HD10, histone deacetylase 10 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 608544 MGI: 2158340 HomoloGene: 23749 GeneCards: HDAC10 | ||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
bufexamac, pracinostat, quisinostat, золінза | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 22: 50.25 – 50.25 Mb | Хр. 15: 89.01 – 89.01 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MGTALVYHED | MTATRLLWDD | PECEIERPER | LTAALDRLRQ | RGLEQRCLRL | ||||
SAREASEEEL | GLVHSPEYVS | LVRETQVLGK | EELQALSGQF | DAIYFHPSTF | ||||
HCARLAAGAG | LQLVDAVLTG | AVQNGLALVR | PPGHHGQRAA | ANGFCVFNNV | ||||
AIAAAHAKQK | HGLHRILVVD | WDVHHGQGIQ | YLFEDDPSVL | YFSWHRYEHG | ||||
RFWPFLRESD | ADAVGRGQGL | GFTVNLPWNQ | VGMGNADYVA | AFLHLLLPLA | ||||
FEFDPELVLV | SAGFDSAIGD | PEGQMQATPE | CFAHLTQLLQ | VLAGGRVCAV | ||||
LEGGYHLESL | AESVCMTVQT | LLGDPAPPLS | GPMAPCQSAL | ESIQSARAAQ | ||||
APHWKSLQQQ | DVTAVPMSPS | SHSPEGRPPP | LLPGGPVCKA | AASAPSSLLD | ||||
QPCLCPAPSV | RTAVALTTPD | ITLVLPPDVI | QQEASALREE | TEAWARPHES | ||||
LAREEALTAL | GKLLYLLDGM | LDGQVNSGIA | ATPASAAAAT | LDVAVRRGLS | ||||
HGAQRLLCVA | LGQLDRPPDL | AHDGRSLWLN | IRGKEAAALS | MFHVSTPLPV | ||||
MTGGFLSCIL | GLVLPLAYGF | QPDLVLVALG | PGHGLQGPHA | ALLAAMLRGL | ||||
AGGRVLALLE | ENSTPQLAGI | LARVLNGEAP | PSLGPSSVAS | PEDVQALMYL | ||||
RGQLEPQWKM | LQCHPHLVA |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, , фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Tong J.J., Liu J., Bertos N.R., Yang X.-J. (2002). Identification of HDAC10, a novel class II human histone deacetylase containing a leucine-rich domain. Nucleic Acids Res. 30: 1114—1123. PMID 11861901 DOI:10.1093/nar/30.5.1114
- Guardiola A.R., Yao T.-P. (2002). Molecular cloning and characterization of a novel histone deacetylase HDAC10. J. Biol. Chem. 277: 3350—3356. PMID 11726666 DOI:10.1074/jbc.M109861200
- Kao H.-Y., Lee C.-H., Komarov A., Han C.C., Evans R.M. (2002). Isolation and characterization of mammalian HDAC10, a novel histone deacetylase. J. Biol. Chem. 277: 187—193. PMID 11677242 DOI:10.1074/jbc.M108931200
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
Примітки
- Сполуки, які фізично взаємодіють з Histone deacetylase 10 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 15 червня 2018. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
HDAC10 angl Histone deacetylase 10 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 22 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 669 aminokislot a molekulyarna masa 71 445 HDAC10IdentifikatoriSimvoliHDAC10 HD10 histone deacetylase 10Zovnishni ID OMIM 608544 MGI 2158340 HomoloGene 23749 GeneCards HDAC10Reaguye na spolukubufexamac pracinostat quisinostat zolinza Ontologiya genaMolekulyarna funkciya NAD dependent histone deacetylase activity H3 K14 specific protein deacetylase activity histone deacetylase binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding enzyme binding hydrolase activity histone deacetylase activity zinc ion binding deacetylase activity acetylputrescine deacetylase activity acetylspermidine deacetylase activity zv yazuvannya z ionom metaluKlitinna komponenta citoplazma histone deacetylase complex nukleoplazma klitinne yadroBiologichnij proces histone H3 deacetylation GO 0009373 regulation of transcription DNA templated GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II transcription DNA templated protein deacetylation oligodendrocyte development GO 0045996 negative regulation of transcription DNA templated histone deacetylation GO 0031497 GO 0006336 GO 0034724 GO 0001301 GO 0007580 GO 0034652 GO 0010847 chromatin organization macroautophagy positive regulation of mismatch repair peptidyl lysine deacetylation Gomologichna rekombinaciya polyamine deacetylation spermidine deacetylation GO 0100026 Reparaciya DNK DNA recombination avtofagiya cellular response to DNA damage stimulusDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez83933 170787Ensembl ENSG00000100429 ENSMUSG00000062906UniProt Q969S8 Q08AP5 Q6P3E7RefSeq mRNK NM 032019 NM 001159286NM 199198RefSeq bilok NP 001152758 NP 114408NP 954668Lokus UCSC Hr 22 50 25 50 25 MbHr 15 89 01 89 01 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MGTALVYHEDMTATRLLWDDPECEIERPERLTAALDRLRQRGLEQRCLRL SAREASEEELGLVHSPEYVSLVRETQVLGKEELQALSGQFDAIYFHPSTF HCARLAAGAGLQLVDAVLTGAVQNGLALVRPPGHHGQRAAANGFCVFNNV AIAAAHAKQKHGLHRILVVDWDVHHGQGIQYLFEDDPSVLYFSWHRYEHG RFWPFLRESDADAVGRGQGLGFTVNLPWNQVGMGNADYVAAFLHLLLPLA FEFDPELVLVSAGFDSAIGDPEGQMQATPECFAHLTQLLQVLAGGRVCAV LEGGYHLESLAESVCMTVQTLLGDPAPPLSGPMAPCQSALESIQSARAAQ APHWKSLQQQDVTAVPMSPSSHSPEGRPPPLLPGGPVCKAAASAPSSLLD QPCLCPAPSVRTAVALTTPDITLVLPPDVIQQEASALREETEAWARPHES LAREEALTALGKLLYLLDGMLDGQVNSGIAATPASAAAATLDVAVRRGLS HGAQRLLCVALGQLDRPPDLAHDGRSLWLNIRGKEAAALSMFHVSTPLPV MTGGFLSCILGLVLPLAYGFQPDLVLVALGPGHGLQGPHAALLAAMLRGL AGGRVLALLEENSTPQLAGILARVLNGEAPPSLGPSSVASPEDVQALMYL RGQLEPQWKMLQCHPHLVA A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do represoriv gidrolaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi alternativnij splajsing Lokalizovanij u citoplazmi yadri LiteraturaTong J J Liu J Bertos N R Yang X J 2002 Identification of HDAC10 a novel class II human histone deacetylase containing a leucine rich domain Nucleic Acids Res 30 1114 1123 PMID 11861901 DOI 10 1093 nar 30 5 1114 Guardiola A R Yao T P 2002 Molecular cloning and characterization of a novel histone deacetylase HDAC10 J Biol Chem 277 3350 3356 PMID 11726666 DOI 10 1074 jbc M109861200 Kao H Y Lee C H Komarov A Han C C Evans R M 2002 Isolation and characterization of mammalian HDAC10 a novel histone deacetylase J Biol Chem 277 187 193 PMID 11677242 DOI 10 1074 jbc M108931200 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Hillman R T Green R E Brenner S E 2004 An unappreciated role for RNA surveillance Genome Biol 5 R8 1 R8 16 PMID 14759258 DOI 10 1186 gb 2004 5 2 r8PrimitkiSpoluki yaki fizichno vzayemodiyut z Histone deacetylase 10 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 17 zhovtnya 2015 Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 15 chervnya 2018 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 22 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi