GABBR1 (англ. Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 961 амінокислот, а молекулярна маса — 108 320.
GABBR1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | GABBR1, GABABR1, GABBR1-3, GB1, GPRC3A, dJ271M21.1.1, dJ271M21.1.2, gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 603540 MGI: 1860139 HomoloGene: 1132 GeneCards: GABBR1 | ||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
arbaclofen placarbil, Гамма-оксимасляна кислота, arbaclofen, sgs-742 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 6: 29.56 – 29.63 Mb | Хр. 17: 37.36 – 37.39 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MLLLLLLAPL | FLRPPGAGGA | QTPNATSEGC | QIIHPPWEGG | IRYRGLTRDQ | ||||
VKAINFLPVD | YEIEYVCRGE | REVVGPKVRK | CLANGSWTDM | DTPSRCVRIC | ||||
SKSYLTLENG | KVFLTGGDLP | ALDGARVDFR | CDPDFHLVGS | SRSICSQGQW | ||||
STPKPHCQVN | RTPHSERRAV | YIGALFPMSG | GWPGGQACQP | AVEMALEDVN | ||||
SRRDILPDYE | LKLIHHDSKC | DPGQATKYLY | ELLYNDPIKI | ILMPGCSSVS | ||||
TLVAEAARMW | NLIVLSYGSS | SPALSNRQRF | PTFFRTHPSA | TLHNPTRVKL | ||||
FEKWGWKKIA | TIQQTTEVFT | STLDDLEERV | KEAGIEITFR | QSFFSDPAVP | ||||
VKNLKRQDAR | IIVGLFYETE | ARKVFCEVYK | ERLFGKKYVW | FLIGWYADNW | ||||
FKIYDPSINC | TVDEMTEAVE | GHITTEIVML | NPANTRSISN | MTSQEFVEKL | ||||
TKRLKRHPEE | TGGFQEAPLA | YDAIWALALA | LNKTSGGGGR | SGVRLEDFNY | ||||
NNQTITDQIY | RAMNSSSFEG | VSGHVVFDAS | GSRMAWTLIE | QLQGGSYKKI | ||||
GYYDSTKDDL | SWSKTDKWIG | GSPPADQTLV | IKTFRFLSQK | LFISVSVLSS | ||||
LGIVLAVVCL | SFNIYNSHVR | YIQNSQPNLN | NLTAVGCSLA | LAAVFPLGLD | ||||
GYHIGRNQFP | FVCQARLWLL | GLGFSLGYGS | MFTKIWWVHT | VFTKKEEKKE | ||||
WRKTLEPWKL | YATVGLLVGM | DVLTLAIWQI | VDPLHRTIET | FAKEEPKEDI | ||||
DVSILPQLEH | CSSRKMNTWL | GIFYGYKGLL | LLLGIFLAYE | TKSVSTEKIN | ||||
DHRAVGMAIY | NVAVLCLITA | PVTMILSSQQ | DAAFAFASLA | IVFSSYITLV | ||||
VLFVPKMRRL | ITRGEWQSEA | QDTMKTGSST | NNNEEEKSRL | LEKENRELEK | ||||
IIAEKEERVS | ELRHQLQSRQ | QLRSRRHPPT | PPEPSGGLPR | GPPEPPDRLS | ||||
CDGSRVHLLY | K |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, , фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах. Також секретований назовні.
Література
- Makoff A. (1999). Molecular cloning of human GABABR1 and its tissue distribution. Brain Res. Mol. Brain Res. 64: 137—140. PMID 9889352 DOI:10.1016/S0169-328X(98)00316-7
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
- Nomura R., Suzuki Y., Kakizuka A., Jingami H. (2008). Direct detection of the interaction between recombinant soluble extracellular regions in the heterodimeric metabotropic gamma-aminobutyric acid receptor. J. Biol. Chem. 283: 4665—4673. PMID 18165688 DOI:10.1074/jbc.M705202200
- Geng Y., Bush M., Mosyak L., Wang F., Fan Q.R. (2013). Structural mechanism of ligand activation in human GABA(B) receptor. Nature. 504: 254—259. PMID 24305054 DOI:10.1038/nature12725
Примітки
- Сполуки, які фізично взаємодіють з Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4070 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 2 жовтня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
GABBR1 angl Gamma aminobutyric acid type B receptor subunit 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 6 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 961 aminokislot a molekulyarna masa 108 320 GABBR1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB4MQE 4MQF 4MR7 4MR9 4MRM 4MS1 4MS3 4MS4 4PASIdentifikatoriSimvoliGABBR1 GABABR1 GABBR1 3 GB1 GPRC3A dJ271M21 1 1 dJ271M21 1 2 gamma aminobutyric acid type B receptor subunit 1Zovnishni ID OMIM 603540 MGI 1860139 HomoloGene 1132 GeneCards GABBR1Reaguye na spolukuarbaclofen placarbil Gamma oksimaslyana kislota arbaclofen sgs 742 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya G protein coupled receptor activity signal transducer activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding G protein coupled GABA receptor activity G protein coupled neurotransmitter receptor activity involved in regulation of postsynaptic membrane potentialKlitinna komponenta citoplazma integral component of membrane G protein coupled receptor dimeric complex postsynaptic membrane cell projection membrana klitinna membrana sinaps integral component of plasma membrane extracellular region mizhklitinni kontakti dendrit nejrobiologiya G protein coupled receptor heterodimeric complex presynaptic membrane presynapse Schaffer collateral CA1 synapse GABA ergic synapseBiologichnij proces gamma aminobutyric acid signaling pathway adenylate cyclase inhibiting G protein coupled receptor signaling pathway GO 0072468 signalna transdukciya negative regulation of adenylate cyclase activity G protein coupled receptor signaling pathway regulation of postsynaptic membrane potential neuron glial cell signalingDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez2550 54393Ensembl ENSG00000237112 ENSG00000206511 ENSG00000206466 ENSG00000232632 ENSG00000232569ENSG00000237051 ENSG00000204681 ENSMUSG00000024462UniProt Q9UBS5 Q9WV18RefSeq mRNK NM 001470 NM 021903 NM 021904 NM 021905 NM 001319053NM 019439RefSeq bilok NP 001305982 NP 001461 NP 068703 NP 068704NP 062312Lokus UCSC Hr 6 29 56 29 63 MbHr 17 37 36 37 39 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MLLLLLLAPLFLRPPGAGGAQTPNATSEGCQIIHPPWEGGIRYRGLTRDQ VKAINFLPVDYEIEYVCRGEREVVGPKVRKCLANGSWTDMDTPSRCVRIC SKSYLTLENGKVFLTGGDLPALDGARVDFRCDPDFHLVGSSRSICSQGQW STPKPHCQVNRTPHSERRAVYIGALFPMSGGWPGGQACQPAVEMALEDVN SRRDILPDYELKLIHHDSKCDPGQATKYLYELLYNDPIKIILMPGCSSVS TLVAEAARMWNLIVLSYGSSSPALSNRQRFPTFFRTHPSATLHNPTRVKL FEKWGWKKIATIQQTTEVFTSTLDDLEERVKEAGIEITFRQSFFSDPAVP VKNLKRQDARIIVGLFYETEARKVFCEVYKERLFGKKYVWFLIGWYADNW FKIYDPSINCTVDEMTEAVEGHITTEIVMLNPANTRSISNMTSQEFVEKL TKRLKRHPEETGGFQEAPLAYDAIWALALALNKTSGGGGRSGVRLEDFNY NNQTITDQIYRAMNSSSFEGVSGHVVFDASGSRMAWTLIEQLQGGSYKKI GYYDSTKDDLSWSKTDKWIGGSPPADQTLVIKTFRFLSQKLFISVSVLSS LGIVLAVVCLSFNIYNSHVRYIQNSQPNLNNLTAVGCSLALAAVFPLGLD GYHIGRNQFPFVCQARLWLLGLGFSLGYGSMFTKIWWVHTVFTKKEEKKE WRKTLEPWKLYATVGLLVGMDVLTLAIWQIVDPLHRTIETFAKEEPKEDI DVSILPQLEHCSSRKMNTWLGIFYGYKGLLLLLGIFLAYETKSVSTEKIN DHRAVGMAIYNVAVLCLITAPVTMILSSQQDAAFAFASLAIVFSSYITLV VLFVPKMRRLITRGEWQSEAQDTMKTGSSTNNNEEEKSRLLEKENRELEK IIAEKEERVSELRHQLQSRQQLRSRRHPPTPPEPSGGLPRGPPEPPDRLS CDGSRVHLLYK A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do receptoriv g bilokspryazhenih receptoriv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak alternativnij splajsing Lokalizovanij u klitinnij membrani membrani klitinnih kontaktah klitinnih vidrostkah sinapsah Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaMakoff A 1999 Molecular cloning of human GABABR1 and its tissue distribution Brain Res Mol Brain Res 64 137 140 PMID 9889352 DOI 10 1016 S0169 328X 98 00316 7 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Hillman R T Green R E Brenner S E 2004 An unappreciated role for RNA surveillance Genome Biol 5 R8 1 R8 16 PMID 14759258 DOI 10 1186 gb 2004 5 2 r8 Nomura R Suzuki Y Kakizuka A Jingami H 2008 Direct detection of the interaction between recombinant soluble extracellular regions in the heterodimeric metabotropic gamma aminobutyric acid receptor J Biol Chem 283 4665 4673 PMID 18165688 DOI 10 1074 jbc M705202200 Geng Y Bush M Mosyak L Wang F Fan Q R 2013 Structural mechanism of ligand activation in human GABA B receptor Nature 504 254 259 PMID 24305054 DOI 10 1038 nature12725PrimitkiSpoluki yaki fizichno vzayemodiyut z Gamma aminobutyric acid type B receptor subunit 1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 4070 angl Procitovano 6 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 2 zhovtnya 2017 Procitovano 6 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 6 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi