DNMT3A (англ. DNA methyltransferase 3 alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 912 амінокислот, а молекулярна маса — 101 858.
DNMT3A | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | DNMT3A, DNMT3A2, M.HsaIIIA, TBRS, DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3 alpha, DNA methyltransferase 3 alpha, HESJAS | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 602769 MGI: 1261827 HomoloGene: 7294 GeneCards: DNMT3A | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
Хвороба Крона, Tatton-Brown–Rahman syndrome, мієлодиспластичний синдром, гострий мієлоїдний лейкоз | |||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
decitabine | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 2: 25.23 – 25.34 Mb | Хр. 12: 3.86 – 3.96 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MPAMPSSGPG | DTSSSAAERE | EDRKDGEEQE | EPRGKEERQE | PSTTARKVGR | ||||
PGRKRKHPPV | ESGDTPKDPA | VISKSPSMAQ | DSGASELLPN | GDLEKRSEPQ | ||||
PEEGSPAGGQ | KGGAPAEGEG | AAETLPEASR | AVENGCCTPK | EGRGAPAEAG | ||||
KEQKETNIES | MKMEGSRGRL | RGGLGWESSL | RQRPMPRLTF | QAGDPYYISK | ||||
RKRDEWLARW | KREAEKKAKV | IAGMNAVEEN | QGPGESQKVE | EASPPAVQQP | ||||
TDPASPTVAT | TPEPVGSDAG | DKNATKAGDD | EPEYEDGRGF | GIGELVWGKL | ||||
RGFSWWPGRI | VSWWMTGRSR | AAEGTRWVMW | FGDGKFSVVC | VEKLMPLSSF | ||||
CSAFHQATYN | KQPMYRKAIY | EVLQVASSRA | GKLFPVCHDS | DESDTAKAVE | ||||
VQNKPMIEWA | LGGFQPSGPK | GLEPPEEEKN | PYKEVYTDMW | VEPEAAAYAP | ||||
PPPAKKPRKS | TAEKPKVKEI | IDERTRERLV | YEVRQKCRNI | EDICISCGSL | ||||
NVTLEHPLFV | GGMCQNCKNC | FLECAYQYDD | DGYQSYCTIC | CGGREVLMCG | ||||
NNNCCRCFCV | ECVDLLVGPG | AAQAAIKEDP | WNCYMCGHKG | TYGLLRRRED | ||||
WPSRLQMFFA | NNHDQEFDPP | KVYPPVPAEK | RKPIRVLSLF | DGIATGLLVL | ||||
KDLGIQVDRY | IASEVCEDSI | TVGMVRHQGK | IMYVGDVRSV | TQKHIQEWGP | ||||
FDLVIGGSPC | NDLSIVNPAR | KGLYEGTGRL | FFEFYRLLHD | ARPKEGDDRP | ||||
FFWLFENVVA | MGVSDKRDIS | RFLESNPVMI | DAKEVSAAHR | ARYFWGNLPG | ||||
MNRPLASTVN | DKLELQECLE | HGRIAKFSKV | RTITTRSNSI | KQGKDQHFPV | ||||
FMNEKEDILW | CTEMERVFGF | PVHYTDVSNM | SRLARQRLLG | RSWSVPVIRH | ||||
LFAPLKEYFA | CV |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, , метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, . Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Chen T., Ueda Y., Xie S., Li E. (2002). A novel Dnmt3a isoform produced from an alternative promoter localizes to euchromatin and its expression correlates with active de novo methylation. J. Biol. Chem. 277: 38746—38754. PMID 12138111 DOI:10.1074/jbc.M205312200
- Kim G.-D., Ni J., Kelesoglu N., Roberts R.J., Pradhan S. (2002). Co-operation and communication between the human maintenance and de novo DNA (cytosine-5) methyltransferases. EMBO J. 21: 4183—4195. PMID 12145218 DOI:10.1093/emboj/cdf401
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Kokura K., Sun L., Bedford M.T., Fang J. (2010). Methyl-H3K9-binding protein MPP8 mediates E-cadherin gene silencing and promotes tumour cell motility and invasion. EMBO J. 29: 3673—3687. PMID 20871592 DOI:10.1038/emboj.2010.239
- Jia D., Jurkowska R.Z., Zhang X., Jeltsch A., Cheng X. (2007). Structure of Dnmt3a bound to Dnmt3L suggests a model for de novo DNA methylation. Nature. 449: 248—251. PMID 17713477 DOI:10.1038/nature06146
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з DNMT3A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Сполуки, які фізично взаємодіють з DNA methyltransferase 3 alpha переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2978 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 7 травня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
DNMT3A angl DNA methyltransferase 3 alpha bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 2 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 912 aminokislot a molekulyarna masa 101 858 DNMT3ANayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB4U7T 4QBR 4U7P 4QBS 3A1B 3LLR 4QBQ 3SVM 3A1A 2QRVIdentifikatoriSimvoliDNMT3A DNMT3A2 M HsaIIIA TBRS DNA cytosine 5 methyltransferase 3 alpha DNA methyltransferase 3 alpha HESJASZovnishni ID OMIM 602769 MGI 1261827 HomoloGene 7294 GeneCards DNMT3APov yazani genetichni zahvoryuvannyaHvoroba Krona Tatton Brown Rahman syndrome miyelodisplastichnij sindrom gostrij miyeloyidnij lejkoz Reaguye na spolukudecitabine Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0102674 GO 0102675 methyltransferase activity transferase activity DNA binding DNA methyltransferase activity chromatin binding zv yazuvannya z ionom metalu GO 0001948 GO 0016582 protein binding identical protein binding DNA cytosine 5 methyltransferase activity GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specific GO 0000980 RNA polymerase II cis regulatory region sequence specific DNA binding GO 0001106 transcription corepressor activity transcription factor bindingKlitinna komponenta citoplazma GO 0035327 Euhromatin nuclear matrix nukleoplazma GO 0035328 Geterohromatin XY body centromera klitinne yadroBiologichnij proces response to ionizing radiation regulation of gene expression by genetic imprinting C 5 methylation of cytosine response to estradiol positive regulation of cell death cellular response to ethanol GO 0010260 starinnya lyudini GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II DNA methylation involved in gamete generation response to vitamin A Metilyuvannya DNK Metilyuvannya negative regulation of gene expression epigenetic response to nutrient levels response to lead ion DNA methylation dependent heterochromatin assembly Spermatogenez neuron differentiation GO 0007067 mitoz cellular response to amino acid stimulus regulyaciya ekspresiyi geniv DNA methylation involved in embryo development response to ethanol response to toxic substance cellular response to hypoxia hepatocyte apoptotic process response to cocaine DNA methylation on cytosine GO 0031497 GO 0006336 GO 0034724 GO 0001301 GO 0007580 GO 0034652 GO 0010847 chromatin organizationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez1788 13435Ensembl ENSG00000119772 ENSMUSG00000020661UniProt Q9Y6K1 O88508RefSeq mRNK NM 022552 NM 153759 NM 175629 NM 175630 NM 001320892NM 001320893 NM 001375819NM 001271753 NM 007872 NM 153743RefSeq bilok NP 001307821 NP 001307822 NP 072046 NP 715640 NP 783328NP 783329 NP 001362748NP 001258682 NP 031898 NP 714965Lokus UCSC Hr 2 25 23 25 34 MbHr 12 3 86 3 96 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MPAMPSSGPGDTSSSAAEREEDRKDGEEQEEPRGKEERQEPSTTARKVGR PGRKRKHPPVESGDTPKDPAVISKSPSMAQDSGASELLPNGDLEKRSEPQ PEEGSPAGGQKGGAPAEGEGAAETLPEASRAVENGCCTPKEGRGAPAEAG KEQKETNIESMKMEGSRGRLRGGLGWESSLRQRPMPRLTFQAGDPYYISK RKRDEWLARWKREAEKKAKVIAGMNAVEENQGPGESQKVEEASPPAVQQP TDPASPTVATTPEPVGSDAGDKNATKAGDDEPEYEDGRGFGIGELVWGKL RGFSWWPGRIVSWWMTGRSRAAEGTRWVMWFGDGKFSVVCVEKLMPLSSF CSAFHQATYNKQPMYRKAIYEVLQVASSRAGKLFPVCHDSDESDTAKAVE VQNKPMIEWALGGFQPSGPKGLEPPEEEKNPYKEVYTDMWVEPEAAAYAP PPPAKKPRKSTAEKPKVKEIIDERTRERLVYEVRQKCRNIEDICISCGSL NVTLEHPLFVGGMCQNCKNCFLECAYQYDDDGYQSYCTICCGGREVLMCG NNNCCRCFCVECVDLLVGPGAAQAAIKEDPWNCYMCGHKGTYGLLRRRED WPSRLQMFFANNHDQEFDPPKVYPPVPAEKRKPIRVLSLFDGIATGLLVL KDLGIQVDRYIASEVCEDSITVGMVRHQGKIMYVGDVRSVTQKHIQEWGP FDLVIGGSPCNDLSIVNPARKGLYEGTGRLFFEFYRLLHDARPKEGDDRP FFWLFENVVAMGVSDKRDISRFLESNPVMIDAKEVSAAHRARYFWGNLPG MNRPLASTVNDKLELQECLEHGRIAKFSKVRTITTRSNSIKQGKDQHFPV FMNEKEDILWCTEMERVFGFPVHYTDVSNMSRLARQRLLGRSWSVPVIRH LFAPLKEYFACV A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do transferaz represoriv metiltransferaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak polimorfizm alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku DNK Lokalizovanij u citoplazmi yadri LiteraturaChen T Ueda Y Xie S Li E 2002 A novel Dnmt3a isoform produced from an alternative promoter localizes to euchromatin and its expression correlates with active de novo methylation J Biol Chem 277 38746 38754 PMID 12138111 DOI 10 1074 jbc M205312200 Kim G D Ni J Kelesoglu N Roberts R J Pradhan S 2002 Co operation and communication between the human maintenance and de novo DNA cytosine 5 methyltransferases EMBO J 21 4183 4195 PMID 12145218 DOI 10 1093 emboj cdf401 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Kokura K Sun L Bedford M T Fang J 2010 Methyl H3K9 binding protein MPP8 mediates E cadherin gene silencing and promotes tumour cell motility and invasion EMBO J 29 3673 3687 PMID 20871592 DOI 10 1038 emboj 2010 239 Jia D Jurkowska R Z Zhang X Jeltsch A Cheng X 2007 Structure of Dnmt3a bound to Dnmt3L suggests a model for de novo DNA methylation Nature 449 248 251 PMID 17713477 DOI 10 1038 nature06146PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z DNMT3A pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Spoluki yaki fizichno vzayemodiyut z DNA methyltransferase 3 alpha pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 2978 angl Procitovano 28 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 7 travnya 2017 Procitovano 28 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 2 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi