ATP2C1 (англ. ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 919 амінокислот, а молекулярна маса — 100 577.
ATP2C1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | ATP2C1, ATP2C1A, BCPM, HHD, PMR1, SPCA1, hSPCA1, ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 604384 MGI: 1889008 HomoloGene: 56672 GeneCards: ATP2C1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 3: 130.85 – 131.02 Mb | Хр. 9: 105.28 – 105.4 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MKVARFQKIP | NGENETMIPV | LTSKKASELP | VSEVASILQA | DLQNGLNKCE | ||||
VSHRRAFHGW | NEFDISEDEP | LWKKYISQFK | NPLIMLLLAS | AVISVLMHQF | ||||
DDAVSITVAI | LIVVTVAFVQ | EYRSEKSLEE | LSKLVPPECH | CVREGKLEHT | ||||
LARDLVPGDT | VCLSVGDRVP | ADLRLFEAVD | LSIDESSLTG | ETTPCSKVTA | ||||
PQPAATNGDL | ASRSNIAFMG | TLVRCGKAKG | VVIGTGENSE | FGEVFKMMQA | ||||
EEAPKTPLQK | SMDLLGKQLS | FYSFGIIGII | MLVGWLLGKD | ILEMFTISVS | ||||
LAVAAIPEGL | PIVVTVTLAL | GVMRMVKKRA | IVKKLPIVET | LGCCNVICSD | ||||
KTGTLTKNEM | TVTHIFTSDG | LHAEVTGVGY | NQFGEVIVDG | DVVHGFYNPA | ||||
VSRIVEAGCV | CNDAVIRNNT | LMGKPTEGAL | IALAMKMGLD | GLQQDYIRKA | ||||
EYPFSSEQKW | MAVKCVHRTQ | QDRPEICFMK | GAYEQVIKYC | TTYQSKGQTL | ||||
TLTQQQRDVY | QQEKARMGSA | GLRVLALASG | PELGQLTFLG | LVGIIDPPRT | ||||
GVKEAVTTLI | ASGVSIKMIT | GDSQETAVAI | ASRLGLYSKT | SQSVSGEEID | ||||
AMDVQQLSQI | VPKVAVFYRA | SPRHKMKIIK | SLQKNGSVVA | MTGDGVNDAV | ||||
ALKAADIGVA | MGQTGTDVCK | EAADMILVDD | DFQTIMSAIE | EGKGIYNNIK | ||||
NFVRFQLSTS | IAALTLISLA | TLMNFPNPLN | AMQILWINII | MDGPPAQSLG | ||||
VEPVDKDVIR | KPPRNWKDSI | LTKNLILKIL | VSSIIIVCGT | LFVFWRELRD | ||||
NVITPRDTTM | TFTCFVFFDM | FNALSSRSQT | KSVFEIGLCS | NRMFCYAVLG | ||||
SIMGQLLVIY | FPPLQKVFQT | ESLSILDLLF | LLGLTSSVCI | VAEIIKKVER | ||||
SREKIQKHVS | STSSSFLEV |
Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у мембрані, апараті гольджі.
Література
- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Yokota K., Yasukawa K., Shimizu H. (2002). Analysis of ATP2C1 gene mutation in 10 unrelated Japanese families with Hailey-Hailey disease. J. Invest. Dermatol. 118: 550—551. PMID 11874499 DOI:10.1046/j.0022-202x.2001.01686.x
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
ATP2C1 angl ATPase secretory pathway Ca2 transporting 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 3 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 919 aminokislot a molekulyarna masa 100 577 ATP2C1IdentifikatoriSimvoliATP2C1 ATP2C1A BCPM HHD PMR1 SPCA1 hSPCA1 ATPase secretory pathway Ca2 transporting 1Zovnishni ID OMIM 604384 MGI 1889008 HomoloGene 56672 GeneCards ATP2C1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya nucleotide binding calcium ion binding manganese ion binding P type calcium transporter activity signal transducer activity zv yazuvannya z ionom metalu ABC type manganese transporter activity hydrolase activity ATP bindingKlitinna komponenta integral component of membrane kompleks Goldzhi membrana Golgi membrane trans Golgi networkBiologichnij proces calcium dependent cell cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules actin cytoskeleton reorganization cellular calcium ion homeostasis Golgi calcium ion homeostasis ion transport ion transmembrane transport epidermis development positive regulation of I kappaB kinase NF kappaB signaling cellular manganese ion homeostasis manganese ion transport Golgi calcium ion transport calcium ion transport manganese ion transmembrane transport GO 0072468 signalna transdukciya calcium ion transmembrane transport GO 0015915 transportDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez27032 235574Ensembl ENSG00000017260 ENSMUSG00000032570UniProt P98194 Q80XR2RefSeq mRNK NM 001001485 NM 001001486 NM 001001487 NM 001199179 NM 001199180NM 001199181 NM 001199182 NM 001199183 NM 001199184 NM 001199185 NM 014382 NM 001378511 NM 001378512 NM 001378513 NM 001378514 NM 001378687NM 001253831 NM 001253834 NM 001253836 NM 175025 NM 001359822NM 001359823RefSeq bilok NP 001001485 NP 001001486 NP 001001487 NP 001186108 NP 001186109NP 001186110 NP 001186111 NP 001186112 NP 001186113 NP 001186114 NP 055197 NP 001365440 NP 001365441 NP 001365442 NP 001365443 NP 001365616NP 001240760 NP 001240763 NP 001240765 NP 778190 NP 001346751NP 001346752Lokus UCSC Hr 3 130 85 131 02 MbHr 9 105 28 105 4 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MKVARFQKIPNGENETMIPVLTSKKASELPVSEVASILQADLQNGLNKCE VSHRRAFHGWNEFDISEDEPLWKKYISQFKNPLIMLLLASAVISVLMHQF DDAVSITVAILIVVTVAFVQEYRSEKSLEELSKLVPPECHCVREGKLEHT LARDLVPGDTVCLSVGDRVPADLRLFEAVDLSIDESSLTGETTPCSKVTA PQPAATNGDLASRSNIAFMGTLVRCGKAKGVVIGTGENSEFGEVFKMMQA EEAPKTPLQKSMDLLGKQLSFYSFGIIGIIMLVGWLLGKDILEMFTISVS LAVAAIPEGLPIVVTVTLALGVMRMVKKRAIVKKLPIVETLGCCNVICSD KTGTLTKNEMTVTHIFTSDGLHAEVTGVGYNQFGEVIVDGDVVHGFYNPA VSRIVEAGCVCNDAVIRNNTLMGKPTEGALIALAMKMGLDGLQQDYIRKA EYPFSSEQKWMAVKCVHRTQQDRPEICFMKGAYEQVIKYCTTYQSKGQTL TLTQQQRDVYQQEKARMGSAGLRVLALASGPELGQLTFLGLVGIIDPPRT GVKEAVTTLIASGVSIKMITGDSQETAVAIASRLGLYSKTSQSVSGEEID AMDVQQLSQIVPKVAVFYRASPRHKMKIIKSLQKNGSVVAMTGDGVNDAV ALKAADIGVAMGQTGTDVCKEAADMILVDDDFQTIMSAIEEGKGIYNNIK NFVRFQLSTSIAALTLISLATLMNFPNPLNAMQILWINIIMDGPPAQSLG VEPVDKDVIRKPPRNWKDSILTKNLILKILVSSIIIVCGTLFVFWRELRD NVITPRDTTMTFTCFVFFDMFNALSSRSQTKSVFEIGLCSNRMFCYAVLG SIMGQLLVIYFPPLQKVFQTESLSILDLLFLLGLTSSVCIVAEIIKKVER SREKIQKHVSSTSSSFLEV A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do gidrolaz Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transport ioniv transport transport kalciyu polimorfizm alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ATF nukleotidami ionami metaliv ionom kalciyu ionom magniyu Lokalizovanij u membrani aparati goldzhi LiteraturaNagase T Kikuno R Ishikawa K Hirosawa M Ohara O 2000 Prediction of the coding sequences of unidentified human genes XVI The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro DNA Res 7 65 73 PMID 10718198 DOI 10 1093 dnares 7 1 65 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Yokota K Yasukawa K Shimizu H 2002 Analysis of ATP2C1 gene mutation in 10 unrelated Japanese families with Hailey Hailey disease J Invest Dermatol 118 550 551 PMID 11874499 DOI 10 1046 j 0022 202x 2001 01686 xPrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 15 veresnya 2015 Procitovano 30 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 22 serpnya 2017 Procitovano 30 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 3 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi