Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

APOBEC3B англ Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3B білок який кодується однойменним геном розташова

APOBEC3B

APOBEC3B

APOBEC3B (англ. Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 382 амінокислот, а молекулярна маса — 45 924.

APOBEC3B
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи APOBEC3B, A3B, APOBEC1L, ARCD3, ARP4, DJ742C19.2, PHRBNL, bK150C2.2, apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3B
Зовнішні ІД OMIM: 607110 MGI: 1933111 HomoloGene: 105420 GeneCards: APOBEC3B
Шаблон експресії
image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
9582
80287
Ensembl
ENSG00000179750
ENSMUSG00000009585
UniProt
Q9UH17
Q99J72
RefSeq (мРНК)
NM_004900
NM_001270411
NM_001160415
NM_030255
NM_001347041
RefSeq (білок)
NP_001257340
NP_004891
NP_001153887
NP_001333970
NP_084531
Локус (UCSC) Хр. 22: 38.98 – 38.99 Mb Хр. 15: 79.78 – 79.8 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MNPQIRNPMERMYRDTFYDNFENEPILYGRSYTWLCYEVKIKRGRSNLLW
DTGVFRGQVYFKPQYHAEMCFLSWFCGNQLPAYKCFQITWFVSWTPCPDC
VAKLAEFLSEHPNVTLTISAARLYYYWERDYRRALCRLSQAGARVTIMDY
EEFAYCWENFVYNEGQQFMPWYKFDENYAFLHRTLKEILRYLMDPDTFTF
NFNNDPLVLRRRQTYLCYEVERLDNGTWVLMDQHMGFLCNEAKNLLCGFY
GRHAELRFLDLVPSLQLDPAQIYRVTWFISWSPCFSWGCAGEVRAFLQEN
THVRLRIFAARIYDYDPLYKEALQMLRDAGAQVSIMTYDEFEYCWDTFVY
RQGCPFQPWDGLEEHSQALSGRLRAILQNQGN

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, антивірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Rose K.M., Marin M., Kozak S.L., Kabat D. (2005). Regulated production and anti-HIV type 1 activities of cytidine deaminases APOBEC3B, 3F, and 3G. AIDS Res. Hum. Retroviruses. 21: 611—619. PMID 16060832 DOI:10.1089/aid.2005.21.611
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Wedekind J.E., Dance G.S.C., Sowden M.P., Smith H.C. (2003). Messenger RNA editing in mammals: new members of the APOBEC family seeking roles in the family business. Trends Genet. 19: 207—216. PMID 12683974 DOI:10.1016/S0168-9525(03)00054-4
  • Hakata Y., Landau N.R. (2006). Reversed functional organization of mouse and human APOBEC3 cytidine deaminase domains. J. Biol. Chem. 281: 36624—36631. PMID 17020885 DOI:10.1074/jbc.M604980200
  • Wichroski M.J., Robb G.B., Rana T.M. (2006). Human retroviral host restriction factors APOBEC3G and APOBEC3F localize to mRNA processing bodies. PLoS Pathog. 2: E41—E41. PMID 16699599 DOI:10.1371/journal.ppat.0020041
  • Chiu Y.L., Greene W.C. (2008). The APOBEC3 cytidine deaminases: an innate defensive network opposing exogenous retroviruses and endogenous retroelements. Annu. Rev. Immunol. 26: 317—353. PMID 18304004 DOI:10.1146/annurev.immunol.26.021607.090350

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17352 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 17 лютого 2017. Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

APOBEC3B angl Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3B bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 22 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 382 aminokislot a molekulyarna masa 45 924 APOBEC3BNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB5CQD 5CQH 5CQI 5CQK 2NBQIdentifikatoriSimvoliAPOBEC3B A3B APOBEC1L ARCD3 ARP4 DJ742C19 2 PHRBNL bK150C2 2 apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3BZovnishni ID OMIM 607110 MGI 1933111 HomoloGene 105420 GeneCards APOBEC3BOntologiya genaMolekulyarna funkciya hydrolase activity acting on carbon nitrogen but not peptide bonds in cyclic amidines zinc ion binding katalitichna aktivnist hydrolase activity zv yazuvannya z ionom metalu deoxycytidine deaminase activity RNA binding cytidine deaminase activityKlitinna komponenta klitinne yadro citoplazmaBiologichnij proces negative regulation of transposition vrodzhenij imunitet proces imunnoyi sistemi defense response to virus cytidine deamination cytidine to uridine editing DNA demethylationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez9582 80287Ensembl ENSG00000179750 ENSMUSG00000009585UniProt Q9UH17 Q99J72RefSeq mRNK NM 004900 NM 001270411NM 001160415 NM 030255 NM 001347041RefSeq bilok NP 001257340 NP 004891NP 001153887 NP 001333970 NP 084531Lokus UCSC Hr 22 38 98 38 99 MbHr 15 79 78 79 8 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MNPQIRNPMERMYRDTFYDNFENEPILYGRSYTWLCYEVKIKRGRSNLLW DTGVFRGQVYFKPQYHAEMCFLSWFCGNQLPAYKCFQITWFVSWTPCPDC VAKLAEFLSEHPNVTLTISAARLYYYWERDYRRALCRLSQAGARVTIMDY EEFAYCWENFVYNEGQQFMPWYKFDENYAFLHRTLKEILRYLMDPDTFTF NFNNDPLVLRRRQTYLCYEVERLDNGTWVLMDQHMGFLCNEAKNLLCGFY GRHAELRFLDLVPSLQLDPAQIYRVTWFISWSPCFSWGCAGEVRAFLQEN THVRLRIFAARIYDYDPLYKEALQMLRDAGAQVSIMTYDEFEYCWDTFVY RQGCPFQPWDGLEEHSQALSGRLRAILQNQGN A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do gidrolaz Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak imunitet vrodzhenij imunitet antivirusnij zahist Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku RNK Lokalizovanij u yadri LiteraturaRose K M Marin M Kozak S L Kabat D 2005 Regulated production and anti HIV type 1 activities of cytidine deaminases APOBEC3B 3F and 3G AIDS Res Hum Retroviruses 21 611 619 PMID 16060832 DOI 10 1089 aid 2005 21 611 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Wedekind J E Dance G S C Sowden M P Smith H C 2003 Messenger RNA editing in mammals new members of the APOBEC family seeking roles in the family business Trends Genet 19 207 216 PMID 12683974 DOI 10 1016 S0168 9525 03 00054 4 Hakata Y Landau N R 2006 Reversed functional organization of mouse and human APOBEC3 cytidine deaminase domains J Biol Chem 281 36624 36631 PMID 17020885 DOI 10 1074 jbc M604980200 Wichroski M J Robb G B Rana T M 2006 Human retroviral host restriction factors APOBEC3G and APOBEC3F localize to mRNA processing bodies PLoS Pathog 2 E41 E41 PMID 16699599 DOI 10 1371 journal ppat 0020041 Chiu Y L Greene W C 2008 The APOBEC3 cytidine deaminases an innate defensive network opposing exogenous retroviruses and endogenous retroelements Annu Rev Immunol 26 317 353 PMID 18304004 DOI 10 1146 annurev immunol 26 021607 090350PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 17352 angl Procitovano 22 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 17 lyutogo 2017 Procitovano 22 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 22 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ