Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

A1CF англ APOBEC1 complementation factor білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плечі

A1CF

A1CF

A1CF (англ. APOBEC1 complementation factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 594 амінокислот, а молекулярна маса — 65 202.

A1CF
image
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи A1CF, ACF, ACF64, ACF65, APOBEC1CF, ASP, APOBEC1 complementation factor
Зовнішні ІД OMIM: 618199 MGI: 1917115 HomoloGene: 16363 GeneCards: A1CF
Шаблон експресії
image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
29974
69865
Ensembl
ENSG00000148584
ENSMUSG00000052595
UniProt
Q9NQ94
Q5YD48
RefSeq (мРНК)
NM_001081074
NM_001365078
RefSeq (білок)
NP_001074543
NP_001352007
Локус (UCSC) Хр. 10: 50.8 – 50.89 Mb Хр. 19: 31.85 – 31.93 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MESNHKSGDGLSGTQKEAALRALVQRTGYSLVQENGQRKYGGPPPGWDAA
PPERGCEIFIGKLPRDLFEDELIPLCEKIGKIYEMRMMMDFNGNNRGYAF
VTFSNKVEAKNAIKQLNNYEIRNGRLLGVCASVDNCRLFVGGIPKTKKRE
EILSEMKKVTEGVVDVIVYPSAADKTKNRGFAFVEYESHRAAAMARRKLL
PGRIQLWGHGIAVDWAEPEVEVDEDTMSSVKILYVRNLMLSTSEEMIEKE
FNNIKPGAVERVKKIRDYAFVHFSNREDAVEAMKALNGKVLDGSPIEVTL
AKPVDKDSYVRYTRGTGGRGTMLQGEYTYSLGQVYDPTTTYLGAPVFYAP
QTYAAIPSLHFPATKGHLSNRAIIRAPSVREIYMNVPVGAAGVRGLGGRG
YLAYTGLGRGYQVKGDKREDKLYDILPGMELTPMNPVTLKPQGIKLAPQI
LEEICQKNNWGQPVYQLHSAIGQDQRQLFLYKITIPALASQNPAIHPFTP
PKLSAFVDEAKTYAAEYTLQTLGIPTDGGDGTMATAAAAATAFPGYAVPN
ATAPVSAAQLKQAVTLGQDLAAYTTYEVYPTFAVTARGDGYGTF

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендоплазматичному ретикулумі.

Цей білок бере участь у редагуванні РНК шляхом дезамінування цитидину разом з білком APOBEC1. Комплекс редагує вже зрілі мРНК в ядрі. Він розпізнає ділянку РНК у 30-40 нуклеотидів, яка утворює шпильку, причому цільовий цитозин міститься в «голівці» (неспареній ділянці) цієї шпильки. Білок ACF виконує адапторну функцію, забезпечуючи контакт дезамінази з РНК. Комплекс розпізнає послідовність UUUN(A/U)U, яка має міститися далі за сайтом редагування та перетинається з якірною послідовністю, до якої приєднується молекула ACF. Від ступеня збігу цієї ділянки різних РНК з послідовністю мРНК ApoB залежить ефективність редагування конкретного цитидину.

Література

  • Mehta A., Kinter M.T., Sherman N.E., Driscoll D.M. (2000). Molecular cloning of APOBEC-1 complementation factor, a novel RNA-binding protein involved in the editing of apolipoprotein B mRNA. Mol. Cell. Biol. 20: 1846—1854. PMID 10669759 DOI:10.1128/MCB.20.5.1846-1854.2000
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Henderson J.O., Blanc V., Davidson N.O. (2001). Isolation, characterization and developmental regulation of the human apobec-1 complementation factor (ACF) gene. Biochim. Biophys. Acta. 1522: 22—30. PMID 11718896 DOI:10.1016/S0167-4781(01)00295-0
  • Mehta A., Driscoll D.M. (2002). Identification of domains in apobec-1 complementation factor required for RNA binding and apolipoprotein-B mRNA editing. RNA. 8: 69—82. PMID 11871661 DOI:10.1017/S1355838202015649
  • Blanc V., Kennedy S., Davidson N.O. (2003). A novel nuclear localization signal in the auxiliary domain of apobec-1 complementation factor regulates nucleocytoplasmic import and shuttling. J. Biol. Chem. 278: 41198—41204. PMID 12896982 DOI:10.1074/jbc.M302951200

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 20 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також


image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

A1CF angl APOBEC1 complementation factor bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 10 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 594 aminokislot a molekulyarna masa 65 202 A1CFNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2CPDIdentifikatoriSimvoliA1CF ACF ACF64 ACF65 APOBEC1CF ASP APOBEC1 complementation factorZovnishni ID OMIM 618199 MGI 1917115 HomoloGene 16363 GeneCards A1CFOntologiya genaMolekulyarna funkciya nucleic acid binding double stranded RNA binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding single stranded RNA binding RNA binding mRNA bindingKlitinna komponenta citoplazma apolipoprotein B mRNA editing enzyme complex endoplazmatichnij retikulum klitinne yadro nukleoplazmaBiologichnij proces mRNA processing protein stabilization cytidine to uridine editing mRNA modification mRNA localization resulting in posttranscriptional regulation of gene expressionDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez29974 69865Ensembl ENSG00000148584 ENSMUSG00000052595UniProt Q9NQ94 Q5YD48RefSeq mRNK NM 001198818 NM 001198819 NM 001198820 NM 014576 NM 138932NM 138933 NM 001370130 NM 001370131NM 001081074 NM 001365078RefSeq bilok NP 001185747 NP 001185748 NP 001185749 NP 055391 NP 620310NP 620311 NP 001357059 NP 001357060NP 001074543 NP 001352007Lokus UCSC Hr 10 50 8 50 89 MbHr 19 31 85 31 93 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MESNHKSGDGLSGTQKEAALRALVQRTGYSLVQENGQRKYGGPPPGWDAA PPERGCEIFIGKLPRDLFEDELIPLCEKIGKIYEMRMMMDFNGNNRGYAF VTFSNKVEAKNAIKQLNNYEIRNGRLLGVCASVDNCRLFVGGIPKTKKRE EILSEMKKVTEGVVDVIVYPSAADKTKNRGFAFVEYESHRAAAMARRKLL PGRIQLWGHGIAVDWAEPEVEVDEDTMSSVKILYVRNLMLSTSEEMIEKE FNNIKPGAVERVKKIRDYAFVHFSNREDAVEAMKALNGKVLDGSPIEVTL AKPVDKDSYVRYTRGTGGRGTMLQGEYTYSLGQVYDPTTTYLGAPVFYAP QTYAAIPSLHFPATKGHLSNRAIIRAPSVREIYMNVPVGAAGVRGLGGRG YLAYTGLGRGYQVKGDKREDKLYDILPGMELTPMNPVTLKPQGIKLAPQI LEEICQKNNWGQPVYQLHSAIGQDQRQLFLYKITIPALASQNPAIHPFTP PKLSAFVDEAKTYAAEYTLQTLGIPTDGGDGTMATAAAAATAFPGYAVPN ATAPVSAAQLKQAVTLGQDLAAYTTYEVYPTFAVTARGDGYGTF A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak procesing mRNK alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z RNK Lokalizovanij u citoplazmi yadri endoplazmatichnomu retikulumi Cej bilok bere uchast u redaguvanni RNK shlyahom dezaminuvannya citidinu razom z bilkom APOBEC1 Kompleks redaguye vzhe zrili mRNK v yadri Vin rozpiznaye dilyanku RNK u 30 40 nukleotidiv yaka utvoryuye shpilku prichomu cilovij citozin mistitsya v golivci nesparenij dilyanci ciyeyi shpilki Bilok ACF vikonuye adaptornu funkciyu zabezpechuyuchi kontakt dezaminazi z RNK Kompleks rozpiznaye poslidovnist UUUN A U U yaka maye mistitisya dali za sajtom redaguvannya ta peretinayetsya z yakirnoyu poslidovnistyu do yakoyi priyednuyetsya molekula ACF Vid stupenya zbigu ciyeyi dilyanki riznih RNK z poslidovnistyu mRNK ApoB zalezhit efektivnist redaguvannya konkretnogo citidinu LiteraturaMehta A Kinter M T Sherman N E Driscoll D M 2000 Molecular cloning of APOBEC 1 complementation factor a novel RNA binding protein involved in the editing of apolipoprotein B mRNA Mol Cell Biol 20 1846 1854 PMID 10669759 DOI 10 1128 MCB 20 5 1846 1854 2000 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Henderson J O Blanc V Davidson N O 2001 Isolation characterization and developmental regulation of the human apobec 1 complementation factor ACF gene Biochim Biophys Acta 1522 22 30 PMID 11718896 DOI 10 1016 S0167 4781 01 00295 0 Mehta A Driscoll D M 2002 Identification of domains in apobec 1 complementation factor required for RNA binding and apolipoprotein B mRNA editing RNA 8 69 82 PMID 11871661 DOI 10 1017 S1355838202015649 Blanc V Kennedy S Davidson N O 2003 A novel nuclear localization signal in the auxiliary domain of apobec 1 complementation factor regulates nucleocytoplasmic import and shuttling J Biol Chem 278 41198 41204 PMID 12896982 DOI 10 1074 jbc M302951200PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 15 veresnya 2017 Procitovano 8 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 20 serpnya 2017 Procitovano 8 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 10 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ