Рибосомний білок S3 (англ. Ribosomal protein S3) – білок, який кодується геном RPS3, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 243 амінокислот, а молекулярна маса — 26 688.
Рибосомний білок S3 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | RPS3, S3, ribosomal protein S3 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 600454 MGI: 1350917 HomoloGene: 779 GeneCards: RPS3 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 11: 75.4 – 75.42 Mb | Хр. 7: 99.13 – 99.13 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAVQISKKRK | FVADGIFKAE | LNEFLTRELA | EDGYSGVEVR | VTPTRTEIII | ||||
LATRTQNVLG | EKGRRIRELT | AVVQKRFGFP | EGSVELYAEK | VATRGLCAIA | ||||
QAESLRYKLL | GGLAVRRACY | GVLRFIMESG | AKGCEVVVSG | KLRGQRAKSM | ||||
KFVDGLMIHS | GDPVNYYVDT | AVRHVLLRQG | VLGIKVKIML | PWDPTGKIGP | ||||
KKPLPDHVSI | VEPKDEILPT | TPISEQKGGK | PEPPAMPQPV | PTA |
Цей білок за функціями належить до ліаз, рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, мітоз. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, мітохондрії, внутрішній мембрані мітохондрії.
Література
- Zhang X.T., Tan Y.M., Tan Y.H. (1990). Isolation of a cDNA encoding human 40S ribosomal protein s3. Nucleic Acids Res. 18: 6689—6689. PMID 2129557 DOI:10.1093/nar/18.22.6689
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Tycowski K.T., Shu M.D., Steitz J.A. (1993). A small nucleolar RNA is processed from an intron of the human gene encoding ribosomal protein S3. Genes Dev. 7: 1176—1190. PMID 8319909 DOI:10.1101/gad.7.7a.1176
- Hegde V., Wang M., Deutsch W.A. (2004). Human ribosomal protein S3 interacts with DNA base excision repair proteins hAPE/Ref-1 and hOGG1. Biochemistry. 43: 14211—14217. PMID 15518571 DOI:10.1021/bi049234b
- Hegde V., Wang M., Deutsch W.A. (2004). Characterization of human ribosomal protein S3 binding to 7,8-dihydro-8-oxoguanine and abasic sites by surface plasmon resonance. DNA Repair. 3: 121—126. PMID 14706345 DOI:10.1016/j.dnarep.2003.10.004
- Jang C.Y., Lee J.Y., Kim J. (2004). RpS3, a DNA repair endonuclease and ribosomal protein, is involved in apoptosis. FEBS Lett. 560: 81—85. PMID 14988002 DOI:10.1016/S0014-5793(04)00074-2
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10420 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
- UniProt, P23396 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
Ribosomnij bilok S3 angl Ribosomal protein S3 bilok yakij koduyetsya genom RPS3 roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 11 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 243 aminokislot a molekulyarna masa 26 688 Ribosomnij bilok S3Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1WH9 4UG0 4V6X 5A2Q 5AJ0 3J7P 4UJE 4D5L 3J7R 4UJD 4V5Z 5FLX 4D61 4UJCIdentifikatoriSimvoliRPS3 S3 ribosomal protein S3Zovnishni ID OMIM 600454 MGI 1350917 HomoloGene 779 GeneCards RPS3Ontologiya genaMolekulyarna funkciya tubulin binding DNA N glycosylase activity small ribosomal subunit rRNA binding iron sulfur cluster binding transcription factor binding oxidized purine DNA binding Hsp70 protein binding lyase activity enzyme binding mRNA binding structural constituent of ribosome damaged DNA binding ubiquitin like protein conjugating enzyme binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding DNA apurinic or apyrimidinic site endonuclease activity oxidized pyrimidine DNA binding endodeoxyribonuclease activity protein kinase binding supercoiled DNA binding DNA binding Hsp90 protein binding microtubule binding protein kinase A binding RNA binding kinase binding RNA polymerase II transcription regulatory region sequence specific DNA binding GO 0032403 protein containing complex binding class I DNA apurinic or apyrimidinic site endonuclease activity class III IV DNA apurinic or apyrimidinic site endonuclease activity oxidized purine nucleobase lesion DNA N glycosylase activityKlitinna komponenta citoplazma gialoplazma Polisoma membrana focal adhesion ruffle membrane mitohondriya citoskelet klitinne yadro ribosoma yaderce ekzosoma klitinna membrana vereteno podilu mitohondrialnij matriks small ribosomal subunit mitotic spindle mitohondrialna vnutrishnya membrana cytosolic small ribosomal subunit nukleoplazma GO 0005578 Pozaklitinna matricya endoplazmatichnij retikulum NF kappaB complex GO 0097483 GO 0097481 postsinaptichne ushilnennya Ribonukleoproteyini sinapsBiologichnij proces chromosome segregation positive regulation of endodeoxyribonuclease activity cellular response to DNA damage stimulus positive regulation of microtubule polymerization klitinnij cikl GO 0097285 apoptoz negative regulation of translation GO 0009373 regulation of transcription DNA templated viral transcription response to TNF agonist positive regulation of apoptotic signaling pathway GO 0001306 response to oxidative stress transcription DNA templated SRP dependent cotranslational protein targeting to membrane positive regulation of cysteine type endopeptidase activity involved in execution phase of apoptosis positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage positive regulation of DNA N glycosylase activity positive regulation of JUN kinase activity nuclear transcribed mRNA catabolic process nonsense mediated decay negative regulation of DNA repair GO 1900404 positive regulation of DNA repair positive regulation of NIK NF kappaB signaling podil klitini spindle assembly negative regulation of protein ubiquitination GO 1901313 positive regulation of gene expression translational initiation regulation of translation cellular response to hydrogen peroxide Biosintez bilkiv positive regulation of base excision repair GO 0100026 Reparaciya DNK regulation of apoptotic process rRNA processing cytoplasmic translation positive regulation of protein containing complex assembly positive regulation of interleukin 2 production positive regulation of activated T cell proliferation positive regulation of T cell receptor signaling pathway positive regulation of NF kappaB transcription factor activity cellular response to tumor necrosis factorDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez6188 27050Ensembl ENSG00000149273 ENSMUSG00000030744UniProt P23396 P62908RefSeq mRNK NM 001260507 NM 001005 NM 001256802 NM 001260506NM 012052RefSeq bilok NP 000996 NP 001243731 NP 001247435 NP 001247436NP 036182Lokus UCSC Hr 11 75 4 75 42 MbHr 7 99 13 99 13 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MAVQISKKRKFVADGIFKAELNEFLTRELAEDGYSGVEVRVTPTRTEIII LATRTQNVLGEKGRRIRELTAVVQKRFGFPEGSVELYAEKVATRGLCAIA QAESLRYKLLGGLAVRRACYGVLRFIMESGAKGCEVVVSGKLRGQRAKSM KFVDGLMIHSGDPVNYYVDTAVRHVLLRQGVLGIKVKIMLPWDPTGKIGP KKPLPDHVSIVEPKDEILPTTPISEQKGGKPEPPAMPQPVPTA A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Cej bilok za funkciyami nalezhit do liaz ribonukleoproteyiniv ribosomnih bilkiv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak apoptoz regulyaciya translyaciyi transkripciya regulyaciya transkripciyi klitinnij cikl podil klitini poshkodzhennya DNK reparaciya DNK mitoz Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z DNK RNK Lokalizovanij u citoplazmi citoskeleti yadri membrani mitohondriyi vnutrishnij membrani mitohondriyi LiteraturaZhang X T Tan Y M Tan Y H 1990 Isolation of a cDNA encoding human 40S ribosomal protein s3 Nucleic Acids Res 18 6689 6689 PMID 2129557 DOI 10 1093 nar 18 22 6689 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Tycowski K T Shu M D Steitz J A 1993 A small nucleolar RNA is processed from an intron of the human gene encoding ribosomal protein S3 Genes Dev 7 1176 1190 PMID 8319909 DOI 10 1101 gad 7 7a 1176 Hegde V Wang M Deutsch W A 2004 Human ribosomal protein S3 interacts with DNA base excision repair proteins hAPE Ref 1 and hOGG1 Biochemistry 43 14211 14217 PMID 15518571 DOI 10 1021 bi049234b Hegde V Wang M Deutsch W A 2004 Characterization of human ribosomal protein S3 binding to 7 8 dihydro 8 oxoguanine and abasic sites by surface plasmon resonance DNA Repair 3 121 126 PMID 14706345 DOI 10 1016 j dnarep 2003 10 004 Jang C Y Lee J Y Kim J 2004 RpS3 a DNA repair endonuclease and ribosomal protein is involved in apoptosis FEBS Lett 560 81 85 PMID 14988002 DOI 10 1016 S0014 5793 04 00074 2PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 10420 angl Procitovano 6 lyutogo 2017 UniProt P23396 angl Procitovano 6 lyutogo 2017 Div takozhHromosoma 11 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi