EXOSC3 (англ. Exosome component 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 275 амінокислот, а молекулярна маса — 29 572.
EXOSC3 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | EXOSC3, PCH1B, RRP40, Rrp40p, bA3J10.7, hRrp-40, p10, CGI-102, Exosome component 3 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 606489 MGI: 1913612 HomoloGene: 6867 GeneCards: EXOSC3 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
pontocerebellar hypoplasia type 1B, pontocerebellar hypoplasia type 1 | |||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
Viroporin 3a | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 9: 37.76 – 37.83 Mb | Хр. 4: 45.32 – 45.34 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAEPASVAAE | SLAGSRARAA | RTVLGQVVLP | GEELLLPEQE | DAEGPGGAVE | ||||
RPLSLNARAC | SRVRVVCGPG | LRRCGDRLLV | TKCGRLRHKE | PGSGSGGGVY | ||||
WVDSQQKRYV | PVKGDHVIGI | VTAKSGDIFK | VDVGGSEPAS | LSYLSFEGAT | ||||
KRNRPNVQVG | DLIYGQFVVA | NKDMEPEMVC | IDSCGRANGM | GVIGQDGLLF | ||||
KVTLGLIRKL | LAPDCEIIQE | VGKLYPLEIV | FGMNGRIWVK | AKTIQQTLIL | ||||
ANILEACEHM | TSDQRKQIFS | RLAES |
Задіяний у таких біологічних процесах, як процесінг рРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, екзосомі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
- van Dijk E.L., Schilders G., Pruijn G.J. (2007). Human cell growth requires a functional cytoplasmic exosome, which is involved in various mRNA decay pathways. RNA. 13: 1027—1035. PMID 17545563 DOI:10.1261/rna.575107
- Chen G., Guo X., Lv F., Xu Y., Gao G. (2008). p72 DEAD box RNA helicase is required for optimal function of the zinc-finger antiviral protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105: 4352—4357. PMID 18334637 DOI:10.1073/pnas.0712276105
- Liu Q., Greimann J.C., Lima C.D. (2006). Reconstitution, activities, and structure of the eukaryotic RNA exosome. Cell. 127: 1223—1237. PMID 17174896 DOI:10.1016/j.cell.2006.10.037
- Liu Q., Greimann J.C., Lima C.D. (2007). Cell. 131: 188—189.
{{}}
: Пропущений або порожній|title=
()
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з EXOSC3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Сполуки, які фізично взаємодіють з Exosome component 3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 6 червня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 5 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
EXOSC3 angl Exosome component 3 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 9 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 275 aminokislot a molekulyarna masa 29 572 EXOSC3Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2NN6IdentifikatoriSimvoliEXOSC3 PCH1B RRP40 Rrp40p bA3J10 7 hRrp 40 p10 CGI 102 Exosome component 3Zovnishni ID OMIM 606489 MGI 1913612 HomoloGene 6867 GeneCards EXOSC3Pov yazani genetichni zahvoryuvannyapontocerebellar hypoplasia type 1B pontocerebellar hypoplasia type 1 Reaguye na spolukuViroporin 3a Ontologiya genaMolekulyarna funkciya 3 5 exoribonuclease activity exoribonuclease activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding RNA bindingKlitinna komponenta gialoplazma nuclear exosome RNase complex cytoplasmic exosome RNase complex klitinne yadro citoplazma Ekzosoma yaderce nukleoplazmaBiologichnij proces nuclear polyadenylation dependent tRNA catabolic process exonucleolytic trimming to generate mature 3 end of 5 8S rRNA from tricistronic rRNA transcript SSU rRNA 5 8S rRNA LSU rRNA regulation of mRNA stability polyadenylation dependent snoRNA 3 end processing DNA deamination CUT catabolic process nuclear polyadenylation dependent rRNA catabolic process positive regulation of isotype switching Peremikannya klasu imunoglobuliniv nuclear transcribed mRNA catabolic process exonucleolytic 3 5 U4 snRNA 3 end processing rRNA processing exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNADzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez51010 66362Ensembl ENSG00000107371 ENSMUSG00000028322UniProt Q9NQT5 Q7TQK4RefSeq mRNK NM 016042 NM 001002269NM 025513 NM 001362788RefSeq bilok NP 001002269 NP 057126NP 079789 NP 001349717Lokus UCSC Hr 9 37 76 37 83 MbHr 4 45 32 45 34 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MAEPASVAAESLAGSRARAARTVLGQVVLPGEELLLPEQEDAEGPGGAVE RPLSLNARACSRVRVVCGPGLRRCGDRLLVTKCGRLRHKEPGSGSGGGVY WVDSQQKRYVPVKGDHVIGIVTAKSGDIFKVDVGGSEPASLSYLSFEGAT KRNRPNVQVGDLIYGQFVVANKDMEPEMVCIDSCGRANGMGVIGQDGLLF KVTLGLIRKLLAPDCEIIQEVGKLYPLEIVFGMNGRIWVKAKTIQQTLIL ANILEACEHMTSDQRKQIFSRLAES A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak procesing rRNK acetilyuvannya alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z RNK Lokalizovanij u citoplazmi yadri ekzosomi LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Lai C H Chou C Y Ch ang L Y Liu C S Lin W C 2000 Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics Genome Res 10 703 713 PMID 10810093 DOI 10 1101 gr 10 5 703 van Dijk E L Schilders G Pruijn G J 2007 Human cell growth requires a functional cytoplasmic exosome which is involved in various mRNA decay pathways RNA 13 1027 1035 PMID 17545563 DOI 10 1261 rna 575107 Chen G Guo X Lv F Xu Y Gao G 2008 p72 DEAD box RNA helicase is required for optimal function of the zinc finger antiviral protein Proc Natl Acad Sci U S A 105 4352 4357 PMID 18334637 DOI 10 1073 pnas 0712276105 Liu Q Greimann J C Lima C D 2006 Reconstitution activities and structure of the eukaryotic RNA exosome Cell 127 1223 1237 PMID 17174896 DOI 10 1016 j cell 2006 10 037 Liu Q Greimann J C Lima C D 2007 Cell 131 188 189 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite journal title Shablon Cite journal cite journal a Propushenij abo porozhnij title dovidka PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z EXOSC3 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Spoluki yaki fizichno vzayemodiyut z Exosome component 3 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 6 chervnya 2017 Procitovano 8 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 5 zhovtnya 2017 Procitovano 8 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 9 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi