EXOSC2 (англ. Exosome component 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 293 амінокислот, а молекулярна маса — 32 789.
EXOSC2 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | EXOSC2, RRP4, Rrp4p, hRrp4p, p7, Exosome component 2, SHRF | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 602238 MGI: 2385133 HomoloGene: 6095 GeneCards: EXOSC2 | ||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
Viroporin 3a | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 9: 130.69 – 130.71 Mb | Хр. 2: 31.56 – 31.57 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAMEMRLPVA | RKPLSERLGR | DTKKHLVVPG | DTITTDTGFM | RGHGTYMGEE | ||||
KLIASVAGSV | ERVNKLICVK | ALKTRYIGEV | GDIVVGRITE | VQQKRWKVET | ||||
NSRLDSVLLL | SSMNLPGGEL | RRRSAEDELA | MRGFLQEGDL | ISAEVQAVFS | ||||
DGAVSLHTRS | LKYGKLGQGV | LVQVSPSLVK | RQKTHFHDLP | CGASVILGNN | ||||
GFIWIYPTPE | HKEEEAGGFI | ANLEPVSLAD | REVISRLRNC | IISLVTQRMM | ||||
LYDTSILYCY | EASLPHQIKD | ILKPEIMEEI | VMETRQRLLE | QEG |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесінг рРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, екзосомі.
Література
- Mitchell P., Petfalski E., Shevchenko A., Mann M., Tollervey D. (1997). The exosome: a conserved eukaryotic RNA processing complex containing multiple 3'-->5' exoribonucleases. Cell. 91: 457—466. PMID 9390555 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80432-8
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Mitchell P., Petfalski E., Tollervey D. (1996). The 3' end of yeast 5.8S rRNA is generated by an exonuclease processing mechanism. Genes Dev. 10: 502—513. PMID 8600032 DOI:10.1101/gad.10.4.502
- Lykke-Andersen J., Wagner E. (2005). Recruitment and activation of mRNA decay enzymes by two ARE-mediated decay activation domains in the proteins TTP and BRF-1. Genes Dev. 19: 351—361. PMID 15687258 DOI:10.1101/gad.1282305
- van Dijk E.L., Schilders G., Pruijn G.J. (2007). Human cell growth requires a functional cytoplasmic exosome, which is involved in various mRNA decay pathways. RNA. 13: 1027—1035. PMID 17545563 DOI:10.1261/rna.575107
- Liu Q., Greimann J.C., Lima C.D. (2006). Reconstitution, activities, and structure of the eukaryotic RNA exosome. Cell. 127: 1223—1237. PMID 17174896 DOI:10.1016/j.cell.2006.10.037
Примітки
- Сполуки, які фізично взаємодіють з Exosome component 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17097 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
EXOSC2 angl Exosome component 2 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 9 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 293 aminokislot a molekulyarna masa 32 789 EXOSC2Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2NN6IdentifikatoriSimvoliEXOSC2 RRP4 Rrp4p hRrp4p p7 Exosome component 2 SHRFZovnishni ID OMIM 602238 MGI 2385133 HomoloGene 6095 GeneCards EXOSC2Reaguye na spolukuViroporin 3a Ontologiya genaMolekulyarna funkciya 3 5 exoribonuclease activity exoribonuclease activity 7S RNA binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding RNA bindingKlitinna komponenta citoplazma gialoplazma Ekzosoma nuclear exosome RNase complex cytoplasmic exosome RNase complex klitinne yadro nukleoplazma yaderceBiologichnij proces nuclear polyadenylation dependent tRNA catabolic process nuclear polyadenylation dependent rRNA catabolic process regulation of mRNA stability exonucleolytic trimming to generate mature 3 end of 5 8S rRNA from tricistronic rRNA transcript SSU rRNA 5 8S rRNA LSU rRNA nuclear transcribed mRNA catabolic process exonucleolytic 3 5 CUT catabolic process positive regulation of cell growth exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA rRNA processing U4 snRNA 3 end processing polyadenylation dependent snoRNA 3 end processingDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez23404 227715Ensembl ENSG00000130713 ENSMUSG00000039356UniProt Q13868 Q8VBV3RefSeq mRNK NM 001282708 NM 001282709 NM 014285NM 144886RefSeq bilok NP 001269637 NP 001269638 NP 055100NP 659135Lokus UCSC Hr 9 130 69 130 71 MbHr 2 31 56 31 57 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MAMEMRLPVARKPLSERLGRDTKKHLVVPGDTITTDTGFMRGHGTYMGEE KLIASVAGSVERVNKLICVKALKTRYIGEVGDIVVGRITEVQQKRWKVET NSRLDSVLLLSSMNLPGGELRRRSAEDELAMRGFLQEGDLISAEVQAVFS DGAVSLHTRSLKYGKLGQGVLVQVSPSLVKRQKTHFHDLPCGASVILGNN GFIWIYPTPEHKEEEAGGFIANLEPVSLADREVISRLRNCIISLVTQRMM LYDTSILYCYEASLPHQIKDILKPEIMEEIVMETRQRLLEQEG A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak procesing rRNK alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z RNK Lokalizovanij u citoplazmi yadri ekzosomi LiteraturaMitchell P Petfalski E Shevchenko A Mann M Tollervey D 1997 The exosome a conserved eukaryotic RNA processing complex containing multiple 3 gt 5 exoribonucleases Cell 91 457 466 PMID 9390555 DOI 10 1016 S0092 8674 00 80432 8 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Mitchell P Petfalski E Tollervey D 1996 The 3 end of yeast 5 8S rRNA is generated by an exonuclease processing mechanism Genes Dev 10 502 513 PMID 8600032 DOI 10 1101 gad 10 4 502 Lykke Andersen J Wagner E 2005 Recruitment and activation of mRNA decay enzymes by two ARE mediated decay activation domains in the proteins TTP and BRF 1 Genes Dev 19 351 361 PMID 15687258 DOI 10 1101 gad 1282305 van Dijk E L Schilders G Pruijn G J 2007 Human cell growth requires a functional cytoplasmic exosome which is involved in various mRNA decay pathways RNA 13 1027 1035 PMID 17545563 DOI 10 1261 rna 575107 Liu Q Greimann J C Lima C D 2006 Reconstitution activities and structure of the eukaryotic RNA exosome Cell 127 1223 1237 PMID 17174896 DOI 10 1016 j cell 2006 10 037PrimitkiSpoluki yaki fizichno vzayemodiyut z Exosome component 2 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 17097 angl Procitovano 8 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 24 serpnya 2017 Procitovano 8 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 9 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi