EXOSC10 (англ. Exosome component 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 885 амінокислот, а молекулярна маса — 100 831.
EXOSC10 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | EXOSC10, PM-Scl, PM/Scl-100, PMSCL, PMSCL2, RRP6, Rrp6p, p2, p3, p4, exosome component 10 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 605960 MGI: 1355322 HomoloGene: 31105 GeneCards: EXOSC10 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 1: 11.07 – 11.1 Mb | Хр. 4: 148.64 – 148.67 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAPPSTREPR | VLSATSATKS | DGEMVLPGFP | DADSFVKFAL | GSVVAVTKAS | ||||
GGLPQFGDEY | DFYRSFPGFQ | AFCETQGDRL | LQCMSRVMQY | HGCRSNIKDR | ||||
SKVTELEDKF | DLLVDANDVI | LERVGILLDE | ASGVNKNQQP | VLPAGLQVPK | ||||
TVVSSWNRKA | AEYGKKAKSE | TFRLLHAKNI | IRPQLKFREK | IDNSNTPFLP | ||||
KIFIKPNAQK | PLPQALSKER | RERPQDRPED | LDVPPALADF | IHQQRTQQVE | ||||
QDMFAHPYQY | ELNHFTPADA | VLQKPQPQLY | RPIEETPCHF | ISSLDELVEL | ||||
NEKLLNCQEF | AVDLEHHSYR | SFLGLTCLMQ | ISTRTEDFII | DTLELRSDMY | ||||
ILNESLTDPA | IVKVFHGADS | DIEWLQKDFG | LYVVNMFDTH | QAARLLNLGR | ||||
HSLDHLLKLY | CNVDSNKQYQ | LADWRIRPLP | EEMLSYARDD | THYLLYIYDK | ||||
MRLEMWERGN | GQPVQLQVVW | QRSRDICLKK | FIKPIFTDES | YLELYRKQKK | ||||
HLNTQQLTAF | QLLFAWRDKT | ARREDESYGY | VLPNHMMLKI | AEELPKEPQG | ||||
IIACCNPVPP | LVRQQINEMH | LLIQQAREMP | LLKSEVAAGV | KKSGPLPSAE | ||||
RLENVLFGPH | DCSHAPPDGY | PIIPTSGSVP | VQKQASLFPD | EKEDNLLGTT | ||||
CLIATAVITL | FNEPSAEDSK | KGPLTVAQKK | AQNIMESFEN | PFRMFLPSLG | ||||
HRAPVSQAAK | FDPSTKIYEI | SNRWKLAQVQ | VQKDSKEAVK | KKAAEQTAAR | ||||
EQAKEACKAA | AEQAISVRQQ | VVLENAAKKR | ERATSDPRTT | EQKQEKKRLK | ||||
ISKKPKDPEP | PEKEFTPYDY | SQSDFKAFAG | NSKSKVSSQF | DPNKQTPSGK | ||||
KCIAAKKIKQ | SVGNKSMSFP | TGKSDRGFRY | NWPQR |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як процесинг рРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, екзосомі.
Література
- Bluethner M., Bautz F.A. (1992). Cloning and characterization of the cDNA coding for a polymyositis-scleroderma overlap syndrome-related nucleolar 100-kD protein. J. Exp. Med. 176: 973—980. PMID 1383382 DOI:10.1084/jem.176.4.973
- Ge Q., Frank M.B., O'Brien C., Targoff I.N. (1992). Cloning of a complementary DNA coding for the 100-kD antigenic protein of the PM-Scl autoantigen. J. Clin. Invest. 90: 559—570. PMID 1644924 DOI:10.1172/JCI115895
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Lejeune F., Li X., Maquat L.E. (2003). Nonsense-mediated mRNA decay in mammalian cells involves decapping, deadenylating, and exonucleolytic activities. Mol. Cell. 12: 675—687. PMID 14527413 DOI:10.1016/S1097-2765(03)00349-6
- Lehner B., Sanderson C.M. (2004). A protein interaction framework for human mRNA degradation. Genome Res. 14: 1315—1323. PMID 15231747 DOI:10.1101/gr.2122004
- West S., Gromak N., Norbury C.J., Proudfoot N.J. (2006). Adenylation and exosome-mediated degradation of cotranscriptionally cleaved pre-messenger RNA in human cells. Mol. Cell. 21: 437—443. PMID 16455498 DOI:10.1016/j.molcel.2005.12.008
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9138 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
EXOSC10 angl Exosome component 10 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 1 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 885 aminokislot a molekulyarna masa 100 831 EXOSC10Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2CPR 3SAF 3SAG 3SAHIdentifikatoriSimvoliEXOSC10 PM Scl PM Scl 100 PMSCL PMSCL2 RRP6 Rrp6p p2 p3 p4 exosome component 10Zovnishni ID OMIM 605960 MGI 1355322 HomoloGene 31105 GeneCards EXOSC10Ontologiya genaMolekulyarna funkciya nucleotide binding exoribonuclease activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding katalitichna aktivnist 3 5 exonuclease activity nucleic acid binding nuclease activity exonuclease activity hydrolase activity RNA binding 3 5 exoribonuclease activity telomerase RNA binding single stranded RNA bindingKlitinna komponenta citoplazma Ekzosoma membrana nuclear exosome RNase complex vnutrishnoklitinnij yaderce klitinne yadro nukleoplazma gialoplazmaBiologichnij proces GO 0033168 GO 0036404 GO 1902360 RNA processing nuclear polyadenylation dependent rRNA catabolic process nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis CUT catabolic process nuclear transcribed mRNA catabolic process GO 0071049 GO 0071048 GO 0071033 nuclear mRNA surveillance cell metabolism maturation of 5 8S rRNA histone mRNA catabolic process dosage compensation by inactivation of X chromosome nucleobase containing compound metabolic process rRNA processing RNA phosphodiester bond hydrolysis exonucleolytic nuclear transcribed mRNA catabolic process nonsense mediated decay negative regulation of telomere maintenance via telomerase regulation of telomerase RNA localization to Cajal body exonucleolytic trimming to generate mature 3 end of 5 8S rRNA from tricistronic rRNA transcript SSU rRNA 5 8S rRNA LSU rRNA nuclear polyadenylation dependent snoRNA catabolic process nuclear polyadenylation dependent snRNA catabolic process nuclear polyadenylation dependent tRNA catabolic process nuclear polyadenylation dependent CUT catabolic process nuclear polyadenylation dependent antisense transcript catabolic process polyadenylation dependent snoRNA 3 end processingDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez5394 50912Ensembl ENSG00000171824 ENSMUSG00000017264UniProt Q01780 P56960RefSeq mRNK NM 001001998 NM 002685NM 016699 NM 001355489 NM 001355490RefSeq bilok NP 001001998 NP 002676NP 057908 NP 001342418 NP 001342419Lokus UCSC Hr 1 11 07 11 1 MbHr 4 148 64 148 67 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MAPPSTREPRVLSATSATKSDGEMVLPGFPDADSFVKFALGSVVAVTKAS GGLPQFGDEYDFYRSFPGFQAFCETQGDRLLQCMSRVMQYHGCRSNIKDR SKVTELEDKFDLLVDANDVILERVGILLDEASGVNKNQQPVLPAGLQVPK TVVSSWNRKAAEYGKKAKSETFRLLHAKNIIRPQLKFREKIDNSNTPFLP KIFIKPNAQKPLPQALSKERRERPQDRPEDLDVPPALADFIHQQRTQQVE QDMFAHPYQYELNHFTPADAVLQKPQPQLYRPIEETPCHFISSLDELVEL NEKLLNCQEFAVDLEHHSYRSFLGLTCLMQISTRTEDFIIDTLELRSDMY ILNESLTDPAIVKVFHGADSDIEWLQKDFGLYVVNMFDTHQAARLLNLGR HSLDHLLKLYCNVDSNKQYQLADWRIRPLPEEMLSYARDDTHYLLYIYDK MRLEMWERGNGQPVQLQVVWQRSRDICLKKFIKPIFTDESYLELYRKQKK HLNTQQLTAFQLLFAWRDKTARREDESYGYVLPNHMMLKIAEELPKEPQG IIACCNPVPPLVRQQINEMHLLIQQAREMPLLKSEVAAGVKKSGPLPSAE RLENVLFGPHDCSHAPPDGYPIIPTSGSVPVQKQASLFPDEKEDNLLGTT CLIATAVITLFNEPSAEDSKKGPLTVAQKKAQNIMESFENPFRMFLPSLG HRAPVSQAAKFDPSTKIYEISNRWKLAQVQVQKDSKEAVKKKAAEQTAAR EQAKEACKAAAEQAISVRQQVVLENAAKKRERATSDPRTTEQKQEKKRLK ISKKPKDPEPPEKEFTPYDYSQSDFKAFAGNSKSKVSSQFDPNKQTPSGK KCIAAKKIKQSVGNKSMSFPTGKSDRGFRYNWPQR A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do gidrolaz ekzonukleaz nukleaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak procesing rRNK Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z RNK Lokalizovanij u citoplazmi yadri ekzosomi LiteraturaBluethner M Bautz F A 1992 Cloning and characterization of the cDNA coding for a polymyositis scleroderma overlap syndrome related nucleolar 100 kD protein J Exp Med 176 973 980 PMID 1383382 DOI 10 1084 jem 176 4 973 Ge Q Frank M B O Brien C Targoff I N 1992 Cloning of a complementary DNA coding for the 100 kD antigenic protein of the PM Scl autoantigen J Clin Invest 90 559 570 PMID 1644924 DOI 10 1172 JCI115895 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Lejeune F Li X Maquat L E 2003 Nonsense mediated mRNA decay in mammalian cells involves decapping deadenylating and exonucleolytic activities Mol Cell 12 675 687 PMID 14527413 DOI 10 1016 S1097 2765 03 00349 6 Lehner B Sanderson C M 2004 A protein interaction framework for human mRNA degradation Genome Res 14 1315 1323 PMID 15231747 DOI 10 1101 gr 2122004 West S Gromak N Norbury C J Proudfoot N J 2006 Adenylation and exosome mediated degradation of cotranscriptionally cleaved pre messenger RNA in human cells Mol Cell 21 437 443 PMID 16455498 DOI 10 1016 j molcel 2005 12 008PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 9138 angl Procitovano 25 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 8 serpnya 2017 Procitovano 25 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 1 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi