CXCR4 (англ. C-X-C motif chemokine receptor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 352 амінокислот, а молекулярна маса — 39 746.
CXCR4 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | CXCR4, CD184, D2S201E, FB22, HM89, HSY3RR, LAP-3, LAP3, LCR1, LESTR, NPY3R, NPYR, NPYRL, NPYY3R, WHIM, WHIMS, C-X-C motif chemokine receptor 4, WHIMS1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 162643 MGI: 109563 HomoloGene: 20739 GeneCards: CXCR4 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
WHIM syndrome | |||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
plerixafor, mavorixafor | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 2: 136.11 – 136.12 Mb | Хр. 1: 128.52 – 128.52 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MEGISIYTSD | NYTEEMGSGD | YDSMKEPCFR | EENANFNKIF | LPTIYSIIFL | ||||
TGIVGNGLVI | LVMGYQKKLR | SMTDKYRLHL | SVADLLFVIT | LPFWAVDAVA | ||||
NWYFGNFLCK | AVHVIYTVNL | YSSVLILAFI | SLDRYLAIVH | ATNSQRPRKL | ||||
LAEKVVYVGV | WIPALLLTIP | DFIFANVSEA | DDRYICDRFY | PNDLWVVVFQ | ||||
FQHIMVGLIL | PGIVILSCYC | IIISKLSHSK | GHQKRKALKT | TVILILAFFA | ||||
CWLPYYIGIS | IDSFILLEII | KQGCEFENTV | HKWISITEAL | AFFHCCLNPI | ||||
LYAFLGAKFK | TSAQHALTSV | SRGSSLKILS | KGKRGGHSSV | STESESSSFH | ||||
SS |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, , фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, лізосомі, ендосомах.
Література
- Herzog H., Hort Y.J., Shine J., Selbie L.A. (1993). Molecular cloning, characterization, and localization of the human homolog to the reported bovine NPY Y3 receptor: lack of NPY binding and activation. DNA Cell Biol. 12: 465—471. PMID 8329116 DOI:10.1089/dna.1993.12.465
- Nomura H., Nielsen B.W., Matsushima K. (1993). Molecular cloning of cDNAs encoding a LD78 receptor and putative leukocyte chemotactic peptide receptors. Int. Immunol. 5: 1239—1249. PMID 7505609 DOI:10.1093/intimm/5.10.1239
- Feng Y., Broder C.C., Kennedy P.E., Berger E.A. (1996). HIV-1 entry cofactor: functional cDNA cloning of a seven-transmembrane, G protein-coupled receptor. Science. 272: 872—877. PMID 8629022 DOI:10.1126/science.272.5263.872
- Frodl R., Gierschik P., Moepps B. (1998). Genomic organization and expression of the CXCR4 gene in mouse and man: absence of a splice variant corresponding to mouse CXCR4-B in human tissues. J. Recept. Signal Transduct. 18: 321—344. PMID 9879064 DOI:10.3109/10799899809047750
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Brelot A., Heveker N., Montes M., Alizon M. (2000). Identification of residues of CXCR4 critical for human immunodeficiency virus coreceptor and chemokine receptor activities. J. Biol. Chem. 275: 23736—23744. PMID 10825158 DOI:10.1074/jbc.M000776200
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з CXCR4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Сполуки, які фізично взаємодіють з CXCR4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2561 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
CXCR4 angl C X C motif chemokine receptor 4 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 2 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 352 aminokislot a molekulyarna masa 39 746 CXCR4Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB4RWS 2K03 2K04 2K05 3ODU 3OE0 3OE6 3OE8 3OE9 2N55IdentifikatoriSimvoliCXCR4 CD184 D2S201E FB22 HM89 HSY3RR LAP 3 LAP3 LCR1 LESTR NPY3R NPYR NPYRL NPYY3R WHIM WHIMS C X C motif chemokine receptor 4 WHIMS1Zovnishni ID OMIM 162643 MGI 109563 HomoloGene 20739 GeneCards CXCR4Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaWHIM syndrome Reaguye na spolukuplerixafor mavorixafor Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0019974 cytokine binding coreceptor activity virus receptor activity signal transducer activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding chemokine receptor activity myosin light chain binding actin binding ubiquitin protein ligase binding G protein coupled receptor activity C X C chemokine receptor activity ubiquitin binding C C chemokine binding C C chemokine receptor activity chemokine binding C X C motif chemokine 12 receptor activityKlitinna komponenta citoplazma integral component of membrane endosoma membrana cell surface mizhklitinni kontakti cell leading edge ekzosoma GO 0016023 cytoplasmic vesicle early endosome late endosome lizosoma klitinna membrana external side of plasma membrane GO 0009327 protein containing complex klitinne yadroBiologichnij proces myelin maintenance positive regulation of oligodendrocyte differentiation response to hypoxia positive regulation of cytosolic calcium ion concentration chemokine mediated signaling pathway response to virus dendritic cell chemotaxis cellular response to cytokine stimulus hemotaksis inflammatory response calcium mediated signaling GO 0072468 signalna transdukciya GO 0097285 apoptoz GO 0022415 viral process fusion of virus membrane with host plasma membrane regulation of chemotaxis G protein coupled receptor signaling pathway axon guidance GO 0046730 GO 0046737 GO 0046738 GO 0046736 imunna vidpovid brain development Nejrogenez CXCL12 activated CXCR4 signaling pathway cell chemotaxis positive regulation of cold induced thermogenesis regulation of cell adhesion neuron migration epithelial cell development neuron recognition response to activity cell migration telencephalon cell migration positive regulation of cell migration positive regulation of vascular wound healing regulation of programmed cell death response to morphine endothelial cell differentiation positive regulation of neurogenesis regulation of viral process positive regulation of chemotaxis detection of temperature stimulus involved in sensory perception of pain detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of pain regulation of calcium ion transport cardiac muscle contraction endothelial tube morphogenesis positive regulation of dendrite extension positive regulation of mesenchymal stem cell migration response to ultrasoundDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez7852 12767Ensembl ENSG00000121966 ENSMUSG00000045382UniProt P61073 P70658RefSeq mRNK NM 003467 NM 001008540 NM 001348056 NM 001348059 NM 001348060NM 009911 NM 001356509RefSeq bilok NP 001008540 NP 003458 NP 001334985 NP 001334988 NP 001334989NP 034041 NP 001343438Lokus UCSC Hr 2 136 11 136 12 MbHr 1 128 52 128 52 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MEGISIYTSDNYTEEMGSGDYDSMKEPCFREENANFNKIFLPTIYSIIFL TGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVITLPFWAVDAVA NWYFGNFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYLAIVHATNSQRPRKL LAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSEADDRYICDRFYPNDLWVVVFQ FQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTVILILAFFA CWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPI LYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRGGHSSVSTESESSSFH SS A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do receptoriv klitini hazyayina dlya vhodu virusu receptoriv g bilokspryazhenih receptoriv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak vzayemodiya hazyayin virus alternativnij splajsing Lokalizovanij u klitinnij membrani membrani klitinnih kontaktah lizosomi endosomah LiteraturaHerzog H Hort Y J Shine J Selbie L A 1993 Molecular cloning characterization and localization of the human homolog to the reported bovine NPY Y3 receptor lack of NPY binding and activation DNA Cell Biol 12 465 471 PMID 8329116 DOI 10 1089 dna 1993 12 465 Nomura H Nielsen B W Matsushima K 1993 Molecular cloning of cDNAs encoding a LD78 receptor and putative leukocyte chemotactic peptide receptors Int Immunol 5 1239 1249 PMID 7505609 DOI 10 1093 intimm 5 10 1239 Feng Y Broder C C Kennedy P E Berger E A 1996 HIV 1 entry cofactor functional cDNA cloning of a seven transmembrane G protein coupled receptor Science 272 872 877 PMID 8629022 DOI 10 1126 science 272 5263 872 Frodl R Gierschik P Moepps B 1998 Genomic organization and expression of the CXCR4 gene in mouse and man absence of a splice variant corresponding to mouse CXCR4 B in human tissues J Recept Signal Transduct 18 321 344 PMID 9879064 DOI 10 3109 10799899809047750 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Brelot A Heveker N Montes M Alizon M 2000 Identification of residues of CXCR4 critical for human immunodeficiency virus coreceptor and chemokine receptor activities J Biol Chem 275 23736 23744 PMID 10825158 DOI 10 1074 jbc M000776200PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z CXCR4 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Spoluki yaki fizichno vzayemodiyut z CXCR4 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 2561 angl Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 8 veresnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 2 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi