FYB1 (англ. FYN binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 783 амінокислот, а молекулярна маса — 85 387.
FYB1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | FYB1, ADAP, PRO0823, SLAP-130, SLAP130, FYB, FYN binding protein, THC3, FYN binding protein 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 602731 MGI: 1346327 HomoloGene: 22664 GeneCards: FYB1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 5: 39.11 – 39.27 Mb | Хр. 15: 6.55 – 6.69 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAKYNTGGNP | TEDVSVNSRP | FRVTGPNSSS | GIQARKNLFN | NQGNASPPAG | ||||
PSNVPKFGSP | KPPVAVKPSS | EEKPDKEPKP | PFLKPTGAGQ | RFGTPASLTT | ||||
RDPEAKVGFL | KPVGPKPINL | PKEDSKPTFP | WPPGNKPSLH | SVNQDHDLKP | ||||
LGPKSGPTPP | TSENEQKQAF | PKLTGVKGKF | MSASQDLEPK | PLFPKPAFGQ | ||||
KPPLSTENSH | EDESPMKNVS | SSKGSPAPLG | VRSKSGPLKP | AREDSENKDH | ||||
AGEISSLPFP | GVVLKPAASR | GGPGLSKNGE | EKKEDRKIDA | AKNTFQSKIN | ||||
QEELASGTPP | ARFPKAPSKL | TVGGPWGQSQ | EKEKGDKNSA | TPKQKPLPPL | ||||
FTLGPPPPKP | NRPPNVDLTK | FHKTSSGNST | SKGQTSYSTT | SLPPPPPSHP | ||||
ASQPPLPASH | PSQPPVPSLP | PRNIKPPFDL | KSPVNEDNQD | GVTHSDGAGN | ||||
LDEEQDSEGE | TYEDIEASKE | REKKREKEEK | KRLELEKKEQ | KEKEKKEQEI | ||||
KKKFKLTGPI | QVIHLAKACC | DVKGGKNELS | FKQGEQIEII | RITDNPEGKW | ||||
LGRTARGSYG | YIKTTAVEID | YDSLKLKKDS | LGAPSRPIED | DQEVYDDVAE | ||||
QDDISSHSQS | GSGGIFPPPP | DDDIYDGIEE | EDADDGFPAP | PKQLDMGDEV | ||||
YDDVDTSDFP | VSSAEMSQGT | NVGKAKTEEK | DLKKLKKQEK | EEKDFRKKFK | ||||
YDGEIRVLYS | TKVTTSITSK | KWGTRDLQVK | PGESLEVIQT | TDDTKVLCRN | ||||
EEGKYGYVLR | SYLADNDGEI | YDDIADGCIY | DND |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, клітинних контактах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Marie-Cardine A., Verhagen A.M., Eckerskorn C., Schraven B. (1998). SKAP-HOM, a novel adaptor protein homologous to the FYN-associated protein SKAP55. FEBS Lett. 435: 55—60. PMID 9755858 DOI:10.1016/S0014-5793(98)01040-0
- Duke-Cohan J.S., Kang H., Liu H., Rudd C.E. (2006). Regulation and function of SKAP-55 non-canonical motif binding to the SH3c domain of adhesion and degranulation-promoting adaptor protein. J. Biol. Chem. 281: 13743—13750. PMID 16461356 DOI:10.1074/jbc.M508774200
- Voss M., Lettau M., Janssen O. (2009). Identification of SH3 domain interaction partners of human FasL (CD178) by phage display screening. BMC Immunol. 10: 53—53. PMID 19807924 DOI:10.1186/1471-2172-10-53
- Hamamy H., Makrythanasis P., Al-Allawi N., Muhsin A.A., Antonarakis S.E. (2014). Recessive thrombocytopenia likely due to a homozygous pathogenic variant in the FYB gene: case report. BMC Med. Genet. 15: 135—135. PMID 25516138 DOI:10.1186/s12881-014-0135-0
- Heuer K., Kofler M., Langdon G., Thiemke K., Freund C. (2004). Structure of a helically extended SH3 domain of the T cell adapter protein ADAP. Structure. 12: 603—610. PMID 15062083 DOI:10.1016/j.str.2004.02.021
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 31 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до . |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
FYB1 angl FYN binding protein 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 5 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 783 aminokislot a molekulyarna masa 85 387 FYB1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1RI9 2GTJ 2GTOIdentifikatoriSimvoliFYB1 ADAP PRO0823 SLAP 130 SLAP130 FYB FYN binding protein THC3 FYN binding protein 1Zovnishni ID OMIM 602731 MGI 1346327 HomoloGene 22664 GeneCards FYB1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya signaling receptor binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding lipid binding GO 0032403 protein containing complex bindingKlitinna komponenta citoplazma gialoplazma klitinne yadro actin cytoskeleton klitinna membrana mizhklitinni kontaktiBiologichnij proces protein phosphorylation GO 0007243 intracellular signal transduction protein localization to plasma membrane T cell receptor signaling pathway GO 0046730 GO 0046737 GO 0046738 GO 0046736 imunna vidpovid GO 0072468 signalna transdukciya NLS bearing protein import into nucleus GO 0022610 zhittyediyalnist integrin mediated signaling pathwayDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez2533 23880Ensembl ENSG00000082074 ENSMUSG00000022148UniProt O15117 O35601RefSeq mRNK NM 001243093 NM 001465 NM 199335 NM 001349333 NM 018594NM 001278269 NM 011815RefSeq bilok NP 001230022 NP 001456 NP 955367 NP 001336262 NP 061064NP 001265198 NP 035945Lokus UCSC Hr 5 39 11 39 27 MbHr 15 6 55 6 69 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MAKYNTGGNPTEDVSVNSRPFRVTGPNSSSGIQARKNLFNNQGNASPPAG PSNVPKFGSPKPPVAVKPSSEEKPDKEPKPPFLKPTGAGQRFGTPASLTT RDPEAKVGFLKPVGPKPINLPKEDSKPTFPWPPGNKPSLHSVNQDHDLKP LGPKSGPTPPTSENEQKQAFPKLTGVKGKFMSASQDLEPKPLFPKPAFGQ KPPLSTENSHEDESPMKNVSSSKGSPAPLGVRSKSGPLKPAREDSENKDH AGEISSLPFPGVVLKPAASRGGPGLSKNGEEKKEDRKIDAAKNTFQSKIN QEELASGTPPARFPKAPSKLTVGGPWGQSQEKEKGDKNSATPKQKPLPPL FTLGPPPPKPNRPPNVDLTKFHKTSSGNSTSKGQTSYSTTSLPPPPPSHP ASQPPLPASHPSQPPVPSLPPRNIKPPFDLKSPVNEDNQDGVTHSDGAGN LDEEQDSEGETYEDIEASKEREKKREKEEKKRLELEKKEQKEKEKKEQEI KKKFKLTGPIQVIHLAKACCDVKGGKNELSFKQGEQIEIIRITDNPEGKW LGRTARGSYGYIKTTAVEIDYDSLKLKKDSLGAPSRPIEDDQEVYDDVAE QDDISSHSQSGSGGIFPPPPDDDIYDGIEEEDADDGFPAPPKQLDMGDEV YDDVDTSDFPVSSAEMSQGTNVGKAKTEEKDLKKLKKQEKEEKDFRKKFK YDGEIRVLYSTKVTTSITSKKWGTRDLQVKPGESLEVIQTTDDTKVLCRN EEGKYGYVLRSYLADNDGEIYDDIADGCIYDND A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak polimorfizm acetilyuvannya alternativnij splajsing Lokalizovanij u citoplazmi yadri klitinnih kontaktah LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Marie Cardine A Verhagen A M Eckerskorn C Schraven B 1998 SKAP HOM a novel adaptor protein homologous to the FYN associated protein SKAP55 FEBS Lett 435 55 60 PMID 9755858 DOI 10 1016 S0014 5793 98 01040 0 Duke Cohan J S Kang H Liu H Rudd C E 2006 Regulation and function of SKAP 55 non canonical motif binding to the SH3c domain of adhesion and degranulation promoting adaptor protein J Biol Chem 281 13743 13750 PMID 16461356 DOI 10 1074 jbc M508774200 Voss M Lettau M Janssen O 2009 Identification of SH3 domain interaction partners of human FasL CD178 by phage display screening BMC Immunol 10 53 53 PMID 19807924 DOI 10 1186 1471 2172 10 53 Hamamy H Makrythanasis P Al Allawi N Muhsin A A Antonarakis S E 2014 Recessive thrombocytopenia likely due to a homozygous pathogenic variant in the FYB gene case report BMC Med Genet 15 135 135 PMID 25516138 DOI 10 1186 s12881 014 0135 0 Heuer K Kofler M Langdon G Thiemke K Freund C 2004 Structure of a helically extended SH3 domain of the T cell adapter protein ADAP Structure 12 603 610 PMID 15062083 DOI 10 1016 j str 2004 02 021PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 15 bereznya 2016 Procitovano 31 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 7 serpnya 2017 Procitovano 31 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 5 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Na cyu stattyu ne posilayutsya inshi statti Vikipediyi Bud laska rozstavte posilannya vidpovidno do prijnyatih rekomendacij