EFCAB6 (англ. EF-hand calcium binding domain 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 501 амінокислот, а молекулярна маса — 172 930.
EFCAB6 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | EFCAB6, DJBP, HSCBCIP1, dJ185D5.1, EF-hand calcium binding domain 6 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | MGI: 1924877 HomoloGene: 11259 GeneCards: EFCAB6 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 22: 43.53 – 43.81 Mb | Хр. 15: 83.75 – 83.95 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MCKMAIIPDW | LRSHPHTRKF | THSRPHSSPC | RVYSRNGSPN | KFRSSSTTAV | ||||
ANPTLSSLDV | KRILFQKITD | RGDELQKAFQ | LLDTGQNLTV | SKSELRRIIT | ||||
DFLMPLTREQ | FQDVLAQIPL | STSGTVPYLA | FLSRFGGIDL | YINGIKRGGG | ||||
NEMNCCRTLR | ELEIQVGEKV | FKNIKTVMKA | FELIDVNKTG | LVRPQELRRV | ||||
LETFCMKLRD | EEYEKFSKHY | NIHKDTAVDY | NVFLKNLSIN | NDLNLRYCMG | ||||
NQEVSLENQQ | AKNSKKERLL | GSASSEDIWR | NYSLDEIERN | FCLQLSKSYE | ||||
KVEKALSAGD | PCKGGYVSFN | YLKIVLDTFV | YQIPRRIFIQ | LMKRFGLKAT | ||||
TKINWKQFLT | SFHEPQGLQV | SSKGPLTKRN | SINSRNESHK | ENIITKLFRH | ||||
TEDHSASLKK | ALLIINTKPD | GPITREEFRY | ILNCMAVKLS | DSEFKELMQM | ||||
LDPGDTGVVN | TSMFIDLIEE | NCRMRKTSPC | TDAKTPFLLA | WDSVEEIVHD | ||||
TITRNLQAFY | NMLRSYDLGD | TGRIGRNNFK | KIMHVFCPFL | TNAHFIKLCS | ||||
KIQDIGSGRI | LYKKLLACIG | IDGPPTVSPV | LVPKDQLLSE | HLQKDEQQQP | ||||
DLSERTKLTE | DKTTLTKKMT | TEEVIEKFKK | CIQQQDPAFK | KRFLDFSKEP | ||||
NGKINVHDFK | KVLEDTGMPM | DDDQYALLTT | KIGFEKEGMS | YLDFAAGFED | ||||
PPMRGPETTP | PQPPTPSKSY | VNSHFITAEE | CLKLFPRRLK | ESFRDPYSAF | ||||
FKTDADRDGI | INMHDLHRLL | LHLLLNLKDD | EFERFLGLLG | LRLSVTLNFR | ||||
EFQNLCEKRP | WRTDEAPQRL | IRPKQKVADS | ELACEQAHQY | LVTKAKNRWS | ||||
DLSKNFLETD | NEGNGILRRR | DIKNALYGFD | IPLTPREFEK | LWARYDTEGK | ||||
GHITYQEFLQ | KLGINYSPAV | HRPCAEDYFN | FMGHFTKPQQ | LQEEMKELQQ | ||||
STEKAVAARD | KLMDRHQDIS | KAFTKTDQSK | TNYISICKMQ | EVLEECGCSL | ||||
TEGELTHLLN | SWGVSRHDNA | INYLDFLRAV | ENSKSTGAQP | KEKEESMPIN | ||||
FATLNPQEAV | RKIQEVVESS | QLALSTAFSA | LDKEDTGFVK | ATEFGQVLKD | ||||
FCYKLTDNQY | HYFLRKLRIH | LTPYINWKYF | LQNFSCFLEE | TADEWAEKMP | ||||
KGPPPTSPKA | TADRDILARL | HKAVTSHYHA | ITQEFENFDT | MKTNTISREE | ||||
FRAICNRRVQ | ILTDEQFDRL | WNEMPVNAKG | RLKYPDFLSR | FSSETAATPM | ||||
ATGDSAVAQR | GSSVPDVSEG | TRSALSLPTQ | ELRPGSKSQS | HPCTPASTTV | ||||
IPGTPPLQNC | DPIESRLRKR | IQGCWRQLLK | ECKEKDVARQ | GDINASDFLA | ||||
LVEKFNLDIS | KEECQQLIIK | YDLKSNGKFA | YCDFIQSCVL | LLKAKESSLM | ||||
HRMKIQNAHK | MKEAGAETPS | FYSALLRIQP | KIVHCWRPMR | RTFKSYDEAG | ||||
TGLLSVADFR | TVLRQYSINL | SEEEFFHILE | YYDKTLSSKI | SYNDFLRAFL | ||||
Q |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hirosawa M., Nagase T., Murahashi Y., Kikuno R., Ohara O. (2001). Identification of novel transcribed sequences on human chromosome 22 by expressed sequence tag mapping. DNA Res. 8: 1—9. PMID 11258795 DOI:10.1093/dnares/8.1.1
- Niki T., Takahashi-Niki K., Taira T., Iguchi-Ariga S.M.M., Ariga H. (2003). DJBP: a novel DJ-1-binding protein, negatively regulates the androgen receptor by recruiting histone deacetylase complex, and DJ-1 antagonizes this inhibition by abrogation of this complex. Mol. Cancer Res. 1: 247—261. PMID 12612053
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24204 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 14 квітня 2018. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
EFCAB6 angl EF hand calcium binding domain 6 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 22 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 501 aminokislot a molekulyarna masa 172 930 EFCAB6Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1WLZ 5D67IdentifikatoriSimvoliEFCAB6 DJBP HSCBCIP1 dJ185D5 1 EF hand calcium binding domain 6Zovnishni ID MGI 1924877 HomoloGene 11259 GeneCards EFCAB6Ontologiya genaMolekulyarna funkciya zv yazuvannya z ionom metalu calcium ion bindingKlitinna komponenta klitinne yadro nukleoplazmaBiologichnij proces GO 0009373 regulation of transcription DNA templated transcription DNA templatedDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez64800 77627Ensembl ENSG00000186976 ENSMUSG00000022441UniProt Q5THR3 Q6P1E8RefSeq mRNK NM 022785 NM 198856NM 001161628 NM 001161629 NM 029946RefSeq bilok NP 073622 NP 942153NP 001155100 NP 001155101 NP 084222Lokus UCSC Hr 22 43 53 43 81 MbHr 15 83 75 83 95 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MCKMAIIPDWLRSHPHTRKFTHSRPHSSPCRVYSRNGSPNKFRSSSTTAV ANPTLSSLDVKRILFQKITDRGDELQKAFQLLDTGQNLTVSKSELRRIIT DFLMPLTREQFQDVLAQIPLSTSGTVPYLAFLSRFGGIDLYINGIKRGGG NEMNCCRTLRELEIQVGEKVFKNIKTVMKAFELIDVNKTGLVRPQELRRV LETFCMKLRDEEYEKFSKHYNIHKDTAVDYNVFLKNLSINNDLNLRYCMG NQEVSLENQQAKNSKKERLLGSASSEDIWRNYSLDEIERNFCLQLSKSYE KVEKALSAGDPCKGGYVSFNYLKIVLDTFVYQIPRRIFIQLMKRFGLKAT TKINWKQFLTSFHEPQGLQVSSKGPLTKRNSINSRNESHKENIITKLFRH TEDHSASLKKALLIINTKPDGPITREEFRYILNCMAVKLSDSEFKELMQM LDPGDTGVVNTSMFIDLIEENCRMRKTSPCTDAKTPFLLAWDSVEEIVHD TITRNLQAFYNMLRSYDLGDTGRIGRNNFKKIMHVFCPFLTNAHFIKLCS KIQDIGSGRILYKKLLACIGIDGPPTVSPVLVPKDQLLSEHLQKDEQQQP DLSERTKLTEDKTTLTKKMTTEEVIEKFKKCIQQQDPAFKKRFLDFSKEP NGKINVHDFKKVLEDTGMPMDDDQYALLTTKIGFEKEGMSYLDFAAGFED PPMRGPETTPPQPPTPSKSYVNSHFITAEECLKLFPRRLKESFRDPYSAF FKTDADRDGIINMHDLHRLLLHLLLNLKDDEFERFLGLLGLRLSVTLNFR EFQNLCEKRPWRTDEAPQRLIRPKQKVADSELACEQAHQYLVTKAKNRWS DLSKNFLETDNEGNGILRRRDIKNALYGFDIPLTPREFEKLWARYDTEGK GHITYQEFLQKLGINYSPAVHRPCAEDYFNFMGHFTKPQQLQEEMKELQQ STEKAVAARDKLMDRHQDISKAFTKTDQSKTNYISICKMQEVLEECGCSL TEGELTHLLNSWGVSRHDNAINYLDFLRAVENSKSTGAQPKEKEESMPIN FATLNPQEAVRKIQEVVESSQLALSTAFSALDKEDTGFVKATEFGQVLKD FCYKLTDNQYHYFLRKLRIHLTPYINWKYFLQNFSCFLEETADEWAEKMP KGPPPTSPKATADRDILARLHKAVTSHYHAITQEFENFDTMKTNTISREE FRAICNRRVQILTDEQFDRLWNEMPVNAKGRLKYPDFLSRFSSETAATPM ATGDSAVAQRGSSVPDVSEGTRSALSLPTQELRPGSKSQSHPCTPASTTV IPGTPPLQNCDPIESRLRKRIQGCWRQLLKECKEKDVARQGDINASDFLA LVEKFNLDISKEECQQLIIKYDLKSNGKFAYCDFIQSCVLLLKAKESSLM HRMKIQNAHKMKEAGAETPSFYSALLRIQPKIVHCWRPMRRTFKSYDEAG TGLLSVADFRTVLRQYSINLSEEEFFHILEYYDKTLSSKISYNDFLRAFL Q A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do represoriv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom kalciyu Lokalizovanij u yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Hirosawa M Nagase T Murahashi Y Kikuno R Ohara O 2001 Identification of novel transcribed sequences on human chromosome 22 by expressed sequence tag mapping DNA Res 8 1 9 PMID 11258795 DOI 10 1093 dnares 8 1 1 Niki T Takahashi Niki K Taira T Iguchi Ariga S M M Ariga H 2003 DJBP a novel DJ 1 binding protein negatively regulates the androgen receptor by recruiting histone deacetylase complex and DJ 1 antagonizes this inhibition by abrogation of this complex Mol Cancer Res 1 247 261 PMID 12612053PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 24204 angl Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 14 kvitnya 2018 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 22 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi