KRIT1 (англ. KRIT1, ankyrin repeat containing) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 736 амінокислот, а молекулярна маса — 84 348.
KRIT1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | KRIT1, ankyrin repeat containing, CAM, CCM1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 604214 MGI: 1930618 HomoloGene: 12746 GeneCards: KRIT1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | н/д | Хр. 5: 3.85 – 3.9 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MGNPENIEDA | YVAVIRPKNT | ASLNSREYRA | KSYEILLHEV | PIEGQKKKRK | ||||
KVLLETKLQG | NSEITQGILD | YVVETTKPIS | PANQGIRGKR | VVLMKKFPLD | ||||
GEKMGREASL | FIVPSVVKDN | TKYTYTPGCP | IFYCLQDIMR | VCSESSTHFA | ||||
TLTARMLIAL | DKWLDERHAQ | SHFIPALFRP | SPLERIKTNV | INPAYATESG | ||||
QTENSLHMGY | SALEIKSKML | ALEKADTCIY | NPLFGSDLQY | TNRVDKVVIN | ||||
PYFGLGAPDY | SKIQIPKQEK | WQRSMSSVTE | DKERQWVDDF | PLHRSACEGD | ||||
SELLSRLLSE | RFSVNQLDSD | HWAPIHYACW | YGKVEATRIL | LEKGKCNPNL | ||||
LNGQLSSPLH | FAAGGGHAEI | VQILLNHPET | DRHITDQQGR | SPLNICEENK | ||||
QNNWEEAAKL | LKEAINKPYE | KVRIYRMDGS | YRSVELKHGN | NTTVQQIMEG | ||||
MRLSQETQQY | FTIWICSENL | SLQLKPYHKP | LQHVRDWPEI | LAELTNLDPQ | ||||
RETPQLFLRR | DVRLPLEVEK | QIEDPLAILI | LFDEARYNLL | KGFYTAPDAK | ||||
LITLASLLLQ | IVYGNYESKK | HKQGFLNEEN | LKSIVPVTKL | KSKAPHWTNR | ||||
ILHEYKNLST | SEGVSKEMHH | LQRMFLQNCW | EIPTYGAAFF | TGQIFTKASP | ||||
SNHKVIPVYV | GVNIKGLHLL | NMETKALLIS | LKYGCFMWQL | GDTDTCFQIH | ||||
SMENKMSFIV | HTKQAGLVVK | LLMKLNGQLM | PTERNS |
Задіяний у таких біологічних процесах, як ангіогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах.
Література
- Serebriiskii I., Estojak J., Sonoda G., Testa J.R., Golemis E.A. (1997). Association of Krev-1/rap1a with Krit1, a novel ankyrin repeat-containing protein encoded by a gene mapping to 7q21-22. Oncogene. 15: 1043—1049. PMID 9285558 DOI:10.1038/sj.onc.1201268
- Zhang J., Clatterbuck R.E., Rigamonti D., Dietz H.C. (2000). Cloning of the murine Krit1 cDNA reveals novel mammalian 5' coding exons. Genomics. 70: 392—395. PMID 11161791 DOI:10.1006/geno.2000.6410
- Kehrer-Sawatzki H., Wilda M., Braun V.M., Richter H.-P., Hameister H. (2002). Mutation and expression analysis of the KRIT1 gene associated with cerebral cavernous malformations (CCM1). Acta Neuropathol. 104: 231—240. PMID 12172908 DOI:10.1007/s00401-002-0552-6
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Eerola I., McIntyre B., Vikkula M. (2001). Identification of eight novel 5`-exons in cerebral capillary malformation gene-1 (CCM1) encoding KRIT1. Biochim. Biophys. Acta. 1517: 464—467. PMID 11342228 DOI:10.1016/S0167-4781(00)00303-1
- Zhang J., Clatterbuck R.E., Rigamonti D., Chang D.D., Dietz H.C. (2001). Interaction between krit1 and icap1alpha infers perturbation of integrin beta1-mediated angiogenesis in the pathogenesis of cerebral cavernous malformation. Hum. Mol. Genet. 10: 2953—2960. PMID 11741838 DOI:10.1093/hmg/10.25.2953
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 7 квітня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
KRIT1 angl KRIT1 ankyrin repeat containing bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 7 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 736 aminokislot a molekulyarna masa 84 348 KRIT1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv C9JD81 PDBe C9JD81 RCSB Spisok kodiv PDB3U7D 4DX8 4DXA 4HDO 4HDQ 4JIF 4TKN 5D68IdentifikatoriSimvoliKRIT1 ankyrin repeat containing CAM CCM1Zovnishni ID OMIM 604214 MGI 1930618 HomoloGene 12746 GeneCards KRIT1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya microtubule binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding phosphatidylinositol 4 5 bisphosphate binding GO 0032403 protein containing complex binding GO 0005083 GTPase regulator activityKlitinna komponenta citoskelet membrana mikrotrubochka klitinna membrana citoplazma cell cell junction mizhklitinni kontakti mizhklitinnij prostirBiologichnij proces regulation of establishment of cell polarity negative regulation of angiogenesis small GTPase mediated signal transduction Angiogenez negative regulation of endothelial cell proliferation negative regulation of endothelial cell apoptotic process negative regulation of endothelial cell migration positive regulation of protein binding cell redox homeostasis GO 0048552 regulation of catalytic activityDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez889 79264Ensembl ENSG00000001631 ENSMUSG00000000600UniProt O00522 Q6S5J6RefSeq mRNK NM 001013406 NM 004912 NM 194454 NM 194455 NM 194456NM 001170552 NM 030675RefSeq bilok NP 001013424 NP 004903 NP 919436 NP 919437 NP 919438NP 001337598 NP 001337599 NP 001337600 NP 001337601 NP 001337602 NP 001337603 NP 001337604 NP 001337605 NP 001337606 NP 001337607 NP 001337608 NP 001337609 NP 001337610 NP 001337611 NP 001337612 NP 001337613 NP 001337614 NP 001337615 NP 001337616 NP 001337617 NP 001337618 NP 001337619 NP 001337620 NP 001337621 NP 001337622 NP 001337623 NP 001337624 NP 001337625 NP 001337626NP 001164023 NP 109600Lokus UCSC n dHr 5 3 85 3 9 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MGNPENIEDAYVAVIRPKNTASLNSREYRAKSYEILLHEVPIEGQKKKRK KVLLETKLQGNSEITQGILDYVVETTKPISPANQGIRGKRVVLMKKFPLD GEKMGREASLFIVPSVVKDNTKYTYTPGCPIFYCLQDIMRVCSESSTHFA TLTARMLIALDKWLDERHAQSHFIPALFRPSPLERIKTNVINPAYATESG QTENSLHMGYSALEIKSKMLALEKADTCIYNPLFGSDLQYTNRVDKVVIN PYFGLGAPDYSKIQIPKQEKWQRSMSSVTEDKERQWVDDFPLHRSACEGD SELLSRLLSERFSVNQLDSDHWAPIHYACWYGKVEATRILLEKGKCNPNL LNGQLSSPLHFAAGGGHAEIVQILLNHPETDRHITDQQGRSPLNICEENK QNNWEEAAKLLKEAINKPYEKVRIYRMDGSYRSVELKHGNNTTVQQIMEG MRLSQETQQYFTIWICSENLSLQLKPYHKPLQHVRDWPEILAELTNLDPQ RETPQLFLRRDVRLPLEVEKQIEDPLAILILFDEARYNLLKGFYTAPDAK LITLASLLLQIVYGNYESKKHKQGFLNEENLKSIVPVTKLKSKAPHWTNR ILHEYKNLSTSEGVSKEMHHLQRMFLQNCWEIPTYGAAFFTGQIFTKASP SNHKVIPVYVGVNIKGLHLLNMETKALLISLKYGCFMWQLGDTDTCFQIH SMENKMSFIVHTKQAGLVVKLLMKLNGQLMPTERNS A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak angiogenez alternativnij splajsing Lokalizovanij u klitinnij membrani citoplazmi citoskeleti membrani klitinnih kontaktah LiteraturaSerebriiskii I Estojak J Sonoda G Testa J R Golemis E A 1997 Association of Krev 1 rap1a with Krit1 a novel ankyrin repeat containing protein encoded by a gene mapping to 7q21 22 Oncogene 15 1043 1049 PMID 9285558 DOI 10 1038 sj onc 1201268 Zhang J Clatterbuck R E Rigamonti D Dietz H C 2000 Cloning of the murine Krit1 cDNA reveals novel mammalian 5 coding exons Genomics 70 392 395 PMID 11161791 DOI 10 1006 geno 2000 6410 Kehrer Sawatzki H Wilda M Braun V M Richter H P Hameister H 2002 Mutation and expression analysis of the KRIT1 gene associated with cerebral cavernous malformations CCM1 Acta Neuropathol 104 231 240 PMID 12172908 DOI 10 1007 s00401 002 0552 6 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Eerola I McIntyre B Vikkula M 2001 Identification of eight novel 5 exons in cerebral capillary malformation gene 1 CCM1 encoding KRIT1 Biochim Biophys Acta 1517 464 467 PMID 11342228 DOI 10 1016 S0167 4781 00 00303 1 Zhang J Clatterbuck R E Rigamonti D Chang D D Dietz H C 2001 Interaction between krit1 and icap1alpha infers perturbation of integrin beta1 mediated angiogenesis in the pathogenesis of cerebral cavernous malformation Hum Mol Genet 10 2953 2960 PMID 11741838 DOI 10 1093 hmg 10 25 2953PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 7 kvitnya 2016 Procitovano 7 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 22 veresnya 2017 Procitovano 7 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 7 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi