SHROOM3 (англ. Shroom family member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 996 амінокислот, а молекулярна маса — 216 857.
SHROOM3 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SHROOM3, APXL3, SHRM, ShrmL, MSTP013, shroom family member 3 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 604570 MGI: 1351655 HomoloGene: 9263 GeneCards: SHROOM3 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
захворювання нирок | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 4: 76.44 – 76.78 Mb | Хр. 5: 92.83 – 93.11 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MMRTTEDFHK | PSATLNSNTA | TKGRYIYLEA | FLEGGAPWGF | TLKGGLEHGE | ||||
PLIISKVEEG | GKADTLSSKL | QAGDEVVHIN | EVTLSSSRKE | AVSLVKGSYK | ||||
TLRLVVRRDV | CTDPGHADTG | ASNFVSPEHL | TSGPQHRKAA | WSGGVKLRLK | ||||
HRRSEPAGRP | HSWHTTKSGE | KQPDASMMQI | SQGMIGPPWH | QSYHSSSSTS | ||||
DLSNYDHAYL | RRSPDQCSSQ | GSMESLEPSG | AYPPCHLSPA | KSTGSIDQLS | ||||
HFHNKRDSAY | SSFSTSSSIL | EYPHPGISGR | ERSGSMDNTS | ARGGLLEGMR | ||||
QADIRYVKTV | YDTRRGVSAE | YEVNSSALLL | QGREARASAN | GQGYDKWSNI | ||||
PRGKGVPPPS | WSQQCPSSLE | TATDNLPPKV | GAPLPPARSD | SYAAFRHRER | ||||
PSSWSSLDQK | RLCRPQANSL | GSLKSPFIEE | QLHTVLEKSP | ENSPPVKPKH | ||||
NYTQKAQPGQ | PLLPTSIYPV | PSLEPHFAQV | PQPSVSSNGM | LYPALAKESG | ||||
YIAPQGACNK | MATIDENGNQ | NGSGRPGFAF | CQPLEHDLLS | PVEKKPEATA | ||||
KYVPSKVHFC | SVPENEEDAS | LKRHLTPPQG | NSPHSNERKS | THSNKPSSHP | ||||
HSLKCPQAQA | WQAGEDKRSS | RLSEPWEGDF | QEDHNANLWR | RLEREGLGQS | ||||
LSGNFGKTKS | AFSSLQNIPE | SLRRHSSLEL | GRGTQEGYPG | GRPTCAVNTK | ||||
AEDPGRKAAP | DLGSHLDRQV | SYPRPEGRTG | ASASFNSTDP | SPEEPPAPSH | ||||
PHTSSLGRRG | PGPGSASALQ | GFQYGKPHCS | VLEKVSKFEQ | REQGSQRPSV | ||||
GGSGFGHNYR | PHRTVSTSST | SGNDFEETKA | HIRFSESAEP | LGNGEQHFKN | ||||
GELKLEEASR | QPCGQQLSGG | ASDSGRGPQR | PDARLLRSQS | TFQLSSEPER | ||||
EPEWRDRPGS | PESPLLDAPF | SRAYRNSIKD | AQSRVLGATS | FRRRDLELGA | ||||
PVASRSWRPR | PSSAHVGLRS | PEASASASPH | TPRERHSVTP | AEGDLARPVP | ||||
PAARRGARRR | LTPEQKKRSY | SEPEKMNEVG | IVEEAEPAPL | GPQRNGMRFP | ||||
ESSVADRRRL | FERDGKACST | LSLSGPELKQ | FQQSALADYI | QRKTGKRPTS | ||||
AAGCSLQEPG | PLRERAQSAY | LQPGPAALEG | SGLASASSLS | SLREPSLQPR | ||||
REATLLPATV | AETQQAPRDR | SSSFAGGRRL | GERRRGDLLS | GANGGTRGTQ | ||||
RGDETPREPS | SWGARAGKSM | SAEDLLERSD | VLAGPVHVRS | RSSPATADKR | ||||
QDVLLGQDSG | FGLVKDPCYL | AGPGSRSLSC | SERGQEEMLP | LFHHLTPRWG | ||||
GSGCKAIGDS | SVPSECPGTL | DHQRQASRTP | CPRPPLAGTQ | GLVTDTRAAP | ||||
LTPIGTPLPS | AIPSGYCSQD | GQTGRQPLPP | YTPAMMHRSN | GHTLTQPPGP | ||||
RGCEGDGPEH | GVEEGTRKRV | SLPQWPPPSR | AKWAHAARED | SLPEESSAPD | ||||
FANLKHYQKQ | QSLPSLCSTS | DPDTPLGAPS | TPGRISLRIS | ESVLRDSPPP | ||||
HEDYEDEVFV | RDPHPKATSS | PTFEPLPPPP | PPPPSQETPV | YSMDDFPPPP | ||||
PHTVCEAQLD | SEDPEGPRPS | FNKLSKVTIA | RERHMPGAAH | VVGSQTLASR | ||||
LQTSIKGSEA | ESTPPSFMSV | HAQLAGSLGG | QPAPIQTQSL | SHDPVSGTQG | ||||
LEKKVSPDPQ | KSSEDIRTEA | LAKEIVHQDK | SLADILDPDS | RLKTTMDLME | ||||
GLFPRDVNLL | KENSVKRKAI | QRTVSSSGCE | GKRNEDKEAV | SMLVNCPAYY | ||||
SVSAPKAELL | NKIKEMPAEV | NEEEEQADVN | EKKAELIGSL | THKLETLQEA | ||||
KGSLLTDIKL | NNALGEEVEA | LISELCKPNE | FDKYRMFIGD | LDKVVNLLLS | ||||
LSGRLARVEN | VLSGLGEDAS | NEERSSLYEK | RKILAGQHED | ARELKENLDR | ||||
RERVVLGILA | NYLSEEQLQD | YQHFVKMKST | LLIEQRKLDD | KIKLGQEQVK | ||||
CLLESLPSDF | IPKAGALALP | PNLTSEPIPA | GGCTFSGIFP | TLTSPL |
Кодований геном білок за функціями належить до , фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пдтримання форми клітини, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах.
Література
- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з SHROOM3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30422 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 26 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
SHROOM3 angl Shroom family member 3 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 4 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 996 aminokislot a molekulyarna masa 216 857 SHROOM3IdentifikatoriSimvoliSHROOM3 APXL3 SHRM ShrmL MSTP013 shroom family member 3Zovnishni ID OMIM 604570 MGI 1351655 HomoloGene 9263 GeneCards SHROOM3Pov yazani genetichni zahvoryuvannyazahvoryuvannya nirok Ontologiya genaMolekulyarna funkciya actin filament binding actin bindingKlitinna komponenta apical plasma membrane mizhklitinni kontakti Adgezivni kontakti citoplazma apical junction complex mikrotrubochka citoskelet cortical actin cytoskeletonBiologichnij proces cellular pigment accumulation multicellular organism development apical protein localization regulation of cell shape neural tube closure epithelial cell development pattern specification process GO 0000767 cell morphogenesis actin filament organization actin cytoskeleton organizationDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez57619 27428Ensembl ENSG00000138771 ENSMUSG00000029381UniProt Q8TF72 Q9QXN0RefSeq mRNK NM 020859NM 001077595 NM 001077596 NM 015756RefSeq bilok NP 065910NP 001071063 NP 001071064 NP 056571Lokus UCSC Hr 4 76 44 76 78 MbHr 5 92 83 93 11 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MMRTTEDFHKPSATLNSNTATKGRYIYLEAFLEGGAPWGFTLKGGLEHGE PLIISKVEEGGKADTLSSKLQAGDEVVHINEVTLSSSRKEAVSLVKGSYK TLRLVVRRDVCTDPGHADTGASNFVSPEHLTSGPQHRKAAWSGGVKLRLK HRRSEPAGRPHSWHTTKSGEKQPDASMMQISQGMIGPPWHQSYHSSSSTS DLSNYDHAYLRRSPDQCSSQGSMESLEPSGAYPPCHLSPAKSTGSIDQLS HFHNKRDSAYSSFSTSSSILEYPHPGISGRERSGSMDNTSARGGLLEGMR QADIRYVKTVYDTRRGVSAEYEVNSSALLLQGREARASANGQGYDKWSNI PRGKGVPPPSWSQQCPSSLETATDNLPPKVGAPLPPARSDSYAAFRHRER PSSWSSLDQKRLCRPQANSLGSLKSPFIEEQLHTVLEKSPENSPPVKPKH NYTQKAQPGQPLLPTSIYPVPSLEPHFAQVPQPSVSSNGMLYPALAKESG YIAPQGACNKMATIDENGNQNGSGRPGFAFCQPLEHDLLSPVEKKPEATA KYVPSKVHFCSVPENEEDASLKRHLTPPQGNSPHSNERKSTHSNKPSSHP HSLKCPQAQAWQAGEDKRSSRLSEPWEGDFQEDHNANLWRRLEREGLGQS LSGNFGKTKSAFSSLQNIPESLRRHSSLELGRGTQEGYPGGRPTCAVNTK AEDPGRKAAPDLGSHLDRQVSYPRPEGRTGASASFNSTDPSPEEPPAPSH PHTSSLGRRGPGPGSASALQGFQYGKPHCSVLEKVSKFEQREQGSQRPSV GGSGFGHNYRPHRTVSTSSTSGNDFEETKAHIRFSESAEPLGNGEQHFKN GELKLEEASRQPCGQQLSGGASDSGRGPQRPDARLLRSQSTFQLSSEPER EPEWRDRPGSPESPLLDAPFSRAYRNSIKDAQSRVLGATSFRRRDLELGA PVASRSWRPRPSSAHVGLRSPEASASASPHTPRERHSVTPAEGDLARPVP PAARRGARRRLTPEQKKRSYSEPEKMNEVGIVEEAEPAPLGPQRNGMRFP ESSVADRRRLFERDGKACSTLSLSGPELKQFQQSALADYIQRKTGKRPTS AAGCSLQEPGPLRERAQSAYLQPGPAALEGSGLASASSLSSLREPSLQPR REATLLPATVAETQQAPRDRSSSFAGGRRLGERRRGDLLSGANGGTRGTQ RGDETPREPSSWGARAGKSMSAEDLLERSDVLAGPVHVRSRSSPATADKR QDVLLGQDSGFGLVKDPCYLAGPGSRSLSCSERGQEEMLPLFHHLTPRWG GSGCKAIGDSSVPSECPGTLDHQRQASRTPCPRPPLAGTQGLVTDTRAAP LTPIGTPLPSAIPSGYCSQDGQTGRQPLPPYTPAMMHRSNGHTLTQPPGP RGCEGDGPEHGVEEGTRKRVSLPQWPPPSRAKWAHAAREDSLPEESSAPD FANLKHYQKQQSLPSLCSTSDPDTPLGAPSTPGRISLRISESVLRDSPPP HEDYEDEVFVRDPHPKATSSPTFEPLPPPPPPPPSQETPVYSMDDFPPPP PHTVCEAQLDSEDPEGPRPSFNKLSKVTIARERHMPGAAHVVGSQTLASR LQTSIKGSEAESTPPSFMSVHAQLAGSLGGQPAPIQTQSLSHDPVSGTQG LEKKVSPDPQKSSEDIRTEALAKEIVHQDKSLADILDPDSRLKTTMDLME GLFPRDVNLLKENSVKRKAIQRTVSSSGCEGKRNEDKEAVSMLVNCPAYY SVSAPKAELLNKIKEMPAEVNEEEEQADVNEKKAELIGSLTHKLETLQEA KGSLLTDIKLNNALGEEVEALISELCKPNEFDKYRMFIGDLDKVVNLLLS LSGRLARVENVLSGLGEDASNEERSSLYEKRKILAGQHEDARELKENLDR RERVVLGILANYLSEEQLQDYQHFVKMKSTLLIEQRKLDDKIKLGQEQVK CLLESLPSDFIPKAGALALPPNLTSEPIPAGGCTFSGIFPTLTSPL A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak pdtrimannya formi klitini polimorfizm alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z molekuloyu aktinu Lokalizovanij u citoplazmi citoskeleti klitinnih kontaktah LiteraturaNagase T Kikuno R Ishikawa K Hirosawa M Ohara O 2000 Prediction of the coding sequences of unidentified human genes XVII The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro DNA Res 7 143 150 PMID 10819331 DOI 10 1093 dnares 7 2 143 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z SHROOM3 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 30422 angl Procitovano 30 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 26 serpnya 2017 Procitovano 30 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 4 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi