IRF4 (англ. Interferon regulatory factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 451 амінокислот, а молекулярна маса — 51 772.
IRF4 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | IRF4, LSIRF, MUM1, NF-EM5, SHEP8, interferon regulatory factor 4 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 601900 MGI: 1096873 HomoloGene: 1842 GeneCards: IRF4 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
хронічний лімфолейкоз, skin carcinoma, progressive supranuclear palsy | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 6: 0.39 – 0.41 Mb | Хр. 13: 30.93 – 30.95 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MNLEGGGRGG | EFGMSAVSCG | NGKLRQWLID | QIDSGKYPGL | VWENEEKSIF | ||||
RIPWKHAGKQ | DYNREEDAAL | FKAWALFKGK | FREGIDKPDP | PTWKTRLRCA | ||||
LNKSNDFEEL | VERSQLDISD | PYKVYRIVPE | GAKKGAKQLT | LEDPQMSMSH | ||||
PYTMTTPYPS | LPAQQVHNYM | MPPLDRSWRD | YVPDQPHPEI | PYQCPMTFGP | ||||
RGHHWQGPAC | ENGCQVTGTF | YACAPPESQA | PGVPTEPSIR | SAEALAFSDC | ||||
RLHICLYYRE | ILVKELTTSS | PEGCRISHGH | TYDASNLDQV | LFPYPEDNGQ | ||||
RKNIEKLLSH | LERGVVLWMA | PDGLYAKRLC | QSRIYWDGPL | ALCNDRPNKL | ||||
ERDQTCKLFD | TQQFLSELQA | FAHHGRSLPR | FQVTLCFGEE | FPDPQRQRKL | ||||
ITAHVEPLLA | RQLYYFAQQN | SGHFLRGYDL | PEHISNPEDY | HRSIRHSSIQ | ||||
E |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Rao S., Matsumura A., Yoon J., Simon M.C. (1999). SPI-B activates transcription via a unique proline, serine, and threonine domain and exhibits DNA binding affinity differences from PU.1. J. Biol. Chem. 274: 11115—11124. PMID 10196196 DOI:10.1074/jbc.274.16.11115
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з IRF4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 15 червня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
IRF4 angl Interferon regulatory factor 4 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 6 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 451 aminokislot a molekulyarna masa 51 772 IRF4Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2DLLIdentifikatoriSimvoliIRF4 LSIRF MUM1 NF EM5 SHEP8 interferon regulatory factor 4Zovnishni ID OMIM 601900 MGI 1096873 HomoloGene 1842 GeneCards IRF4Pov yazani genetichni zahvoryuvannyahronichnij limfolejkoz skin carcinoma progressive supranuclear palsy Ontologiya genaMolekulyarna funkciya sequence specific DNA binding DNA binding GO 0001131 GO 0001151 GO 0001130 GO 0001204 DNA binding transcription factor activity GO 0001077 GO 0001212 GO 0001213 GO 0001211 GO 0001205 DNA binding transcription activator activity RNA polymerase II specific transcription factor binding GO 0000980 RNA polymerase II cis regulatory region sequence specific DNA binding protein lysine N methyltransferase activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specificKlitinna komponenta gialoplazma membrana nukleoplazma klitinne yadroBiologichnij proces GO 0009373 regulation of transcription DNA templated interferon gamma mediated signaling pathway regulation of T helper cell differentiation myeloid dendritic cell differentiation transcription DNA templated T helper 17 cell lineage commitment GO 0060469 GO 0009371 positive regulation of transcription DNA templated peptidyl lysine methylation negative regulation of toll like receptor signaling pathway type I interferon signaling pathway histone H3 acetylation histone H4 acetylation positive regulation of DNA binding T cell activation GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II defense response to protozoan Metilyuvannya bilkiv transcription by RNA polymerase II cytokine mediated signaling pathway positive regulation of cold induced thermogenesis proces imunnoyi sistemiDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez3662 16364Ensembl ENSG00000137265 ENSMUSG00000021356UniProt Q15306 Q64287RefSeq mRNK NM 001195286 NM 002460NM 013674 NM 001347508RefSeq bilok NP 001182215 NP 002451NP 001334437 NP 038702Lokus UCSC Hr 6 0 39 0 41 MbHr 13 30 93 30 95 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MNLEGGGRGGEFGMSAVSCGNGKLRQWLIDQIDSGKYPGLVWENEEKSIF RIPWKHAGKQDYNREEDAALFKAWALFKGKFREGIDKPDPPTWKTRLRCA LNKSNDFEELVERSQLDISDPYKVYRIVPEGAKKGAKQLTLEDPQMSMSH PYTMTTPYPSLPAQQVHNYMMPPLDRSWRDYVPDQPHPEIPYQCPMTFGP RGHHWQGPACENGCQVTGTFYACAPPESQAPGVPTEPSIRSAEALAFSDC RLHICLYYREILVKELTTSSPEGCRISHGHTYDASNLDQVLFPYPEDNGQ RKNIEKLLSHLERGVVLWMAPDGLYAKRLCQSRIYWDGPLALCNDRPNKL ERDQTCKLFDTQQFLSELQAFAHHGRSLPRFQVTLCFGEEFPDPQRQRKL ITAHVEPLLARQLYYFAQQNSGHFLRGYDLPEHISNPEDYHRSIRHSSIQ E A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do aktivatoriv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z DNK Lokalizovanij u yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Rao S Matsumura A Yoon J Simon M C 1999 SPI B activates transcription via a unique proline serine and threonine domain and exhibits DNA binding affinity differences from PU 1 J Biol Chem 274 11115 11124 PMID 10196196 DOI 10 1074 jbc 274 16 11115PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z IRF4 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 15 chervnya 2017 Procitovano 6 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 23 lipnya 2017 Procitovano 6 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 6 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi