ATG12 (англ. Autophagy related 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 140 амінокислот, а молекулярна маса — 15 113.
ATG12 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | ATG12, APG12, APG12L, FBR93, HAPG12, autophagy related 12 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 609608 MGI: 1914776 HomoloGene: 37953 GeneCards: ATG12 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 5: 115.83 – 115.84 Mb | Хр. 18: 46.86 – 46.87 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAEEPQSVLQ | LPTSIAAGGE | GLTDVSPETT | TPEPPSSAAV | SPGTEEPAGD | ||||
TKKKIDILLK | AVGDTPIMKT | KKWAVERTRT | IQGLIDFIKK | FLKLVASEQL | ||||
FIYVNQSFAP | SPDQEVGTLY | ECFGSDGKLV | LHYCKSQAWG |
Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, убіквітинування білків, автофагія, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.
Література
- Mizushima N., Sugita H., Yoshimori T., Ohsumi Y. (1998). A new protein conjugation system in human. The counterpart of the yeast Apg12p conjugation system essential for autophagy. J. Biol. Chem. 273: 33889—33892. PMID 9852036 DOI:10.1074/jbc.273.51.33889
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Tanida I., Tanida-Miyake E., Ueno T., Kominami E. (2001). The human homolog of Saccharomyces cerevisiae Apg7p is a Protein-activating enzyme for multiple substrates including human Apg12p, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3. J. Biol. Chem. 276: 1701—1706. PMID 11096062 DOI:10.1074/jbc.C000752200
- Tanida I., Nishitani T., Nemoto T., Ueno T., Kominami E. (2002). Mammalian Apg12p, but not the Apg12p.Apg5p conjugate, facilitates LC3 processing. Biochem. Biophys. Res. Commun. 296: 1164—1170. PMID 12207896 DOI:10.1016/S0006-291X(02)02057-0
- Tanida I., Tanida-Miyake E., Komatsu M., Ueno T., Kominami E. (2002). Human Apg3p/Aut1p homologue is an authentic E2 enzyme for multiple substrates, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3, and facilitates the conjugation of hApg12p to hApg5p. J. Biol. Chem. 277: 13739—13744. PMID 11825910 DOI:10.1074/jbc.M200385200
- Shao Y., Gao Z., Feldman T., Jiang X. (2007). Stimulation of ATG12-ATG5 conjugation by ribonucleic acid. Autophagy. 3: 10—16. PMID 16963840 DOI:10.4161/auto.3270
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:588 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
ATG12 angl Autophagy related 12 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 5 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 140 aminokislot a molekulyarna masa 15 113 ATG12Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB4GDK 4GDL 4NAWIdentifikatoriSimvoliATG12 APG12 APG12L FBR93 HAPG12 autophagy related 12Zovnishni ID OMIM 609608 MGI 1914776 HomoloGene 37953 GeneCards ATG12Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0001948 GO 0016582 protein binding Atg8 ligase activityKlitinna komponenta citoplazma gialoplazma phagophore assembly site membrane phagocytic vesicle membrane Atg12 Atg5 Atg16 complex membrana autophagosome GO 0009327 protein containing complexBiologichnij proces avtofagiya autophagy of nucleus C terminal protein lipidation autophagy of mitochondrion macroautophagy autophagosome assemblyDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez9140 67526Ensembl ENSG00000145782 ENSMUSG00000032905UniProt O94817 Q9CQY1RefSeq mRNK NM 001277783 NM 004707NM 026217RefSeq bilok NP 001264712 NP 004698NP 080493Lokus UCSC Hr 5 115 83 115 84 MbHr 18 46 86 46 87 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MAEEPQSVLQLPTSIAAGGEGLTDVSPETTTPEPPSSAAVSPGTEEPAGD TKKKIDILLKAVGDTPIMKTKKWAVERTRTIQGLIDFIKKFLKLVASEQL FIYVNQSFAPSPDQEVGTLYECFGSDGKLVLHYCKSQAWG A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak imunitet vrodzhenij imunitet ubikvitinuvannya bilkiv avtofagiya acetilyuvannya alternativnij splajsing Lokalizovanij u citoplazmi membrani LiteraturaMizushima N Sugita H Yoshimori T Ohsumi Y 1998 A new protein conjugation system in human The counterpart of the yeast Apg12p conjugation system essential for autophagy J Biol Chem 273 33889 33892 PMID 9852036 DOI 10 1074 jbc 273 51 33889 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Tanida I Tanida Miyake E Ueno T Kominami E 2001 The human homolog of Saccharomyces cerevisiae Apg7p is a Protein activating enzyme for multiple substrates including human Apg12p GATE 16 GABARAP and MAP LC3 J Biol Chem 276 1701 1706 PMID 11096062 DOI 10 1074 jbc C000752200 Tanida I Nishitani T Nemoto T Ueno T Kominami E 2002 Mammalian Apg12p but not the Apg12p Apg5p conjugate facilitates LC3 processing Biochem Biophys Res Commun 296 1164 1170 PMID 12207896 DOI 10 1016 S0006 291X 02 02057 0 Tanida I Tanida Miyake E Komatsu M Ueno T Kominami E 2002 Human Apg3p Aut1p homologue is an authentic E2 enzyme for multiple substrates GATE 16 GABARAP and MAP LC3 and facilitates the conjugation of hApg12p to hApg5p J Biol Chem 277 13739 13744 PMID 11825910 DOI 10 1074 jbc M200385200 Shao Y Gao Z Feldman T Jiang X 2007 Stimulation of ATG12 ATG5 conjugation by ribonucleic acid Autophagy 3 10 16 PMID 16963840 DOI 10 4161 auto 3270PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 588 angl Procitovano 5 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 27 veresnya 2017 Procitovano 5 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 5 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi