APOBEC3D (англ. Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 386 амінокислот, а молекулярна маса — 46 598.
APOBEC3D | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | APOBEC3D, A3D, APOBEC3DE, APOBEC3E, ARP6, apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3D, A3DE | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 609900 HomoloGene: 122788 GeneCards: APOBEC3D | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 22: 39.02 – 39.03 Mb | н/д | |||||||||||||||
PubMed search | н/д | ||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MNPQIRNPME | RMYRDTFYDN | FENEPILYGR | SYTWLCYEVK | IKRGRSNLLW | ||||
DTGVFRGPVL | PKRQSNHRQE | VYFRFENHAE | MCFLSWFCGN | RLPANRRFQI | ||||
TWFVSWNPCL | PCVVKVTKFL | AEHPNVTLTI | SAARLYYYRD | RDWRWVLLRL | ||||
HKAGARVKIM | DYEDFAYCWE | NFVCNEGQPF | MPWYKFDDNY | ASLHRTLKEI | ||||
LRNPMEAMYP | HIFYFHFKNL | LKACGRNESW | LCFTMEVTKH | HSAVFRKRGV | ||||
FRNQVDPETH | CHAERCFLSW | FCDDILSPNT | NYEVTWYTSW | SPCPECAGEV | ||||
AEFLARHSNV | NLTIFTARLC | YFWDTDYQEG | LCSLSQEGAS | VKIMGYKDFV | ||||
SCWKNFVYSD | DEPFKPWKGL | QTNFRLLKRR | LREILQ |
Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, антивірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- Wedekind J.E., Dance G.S.C., Sowden M.P., Smith H.C. (2003). Messenger RNA editing in mammals: new members of the APOBEC family seeking roles in the family business. Trends Genet. 19: 207—216. PMID 12683974 DOI:10.1016/S0168-9525(03)00054-4
- Chiu Y.L., Greene W.C. (2008). The APOBEC3 cytidine deaminases: an innate defensive network opposing exogenous retroviruses and endogenous retroelements. Annu. Rev. Immunol. 26: 317—353. PMID 18304004 DOI:10.1146/annurev.immunol.26.021607.090350
- Stenglein M.D., Burns M.B., Li M., Lengyel J., Harris R.S. (2010). APOBEC3 proteins mediate the clearance of foreign DNA from human cells. Nat. Struct. Mol. Biol. 17: 222—229. PMID 20062055 DOI:10.1038/nsmb.1744
- Arias J.F., Koyama T., Kinomoto M., Tokunaga K. (2012). Retroelements versus APOBEC3 family members: No great escape from the magnificent seven. Front. Microbiol. 3: 275—275. PMID 22912627 DOI:10.3389/fmicb.2012.00275
- Phalora P.K., Sherer N.M., Wolinsky S.M., Swanson C.M., Malim M.H. (2012). HIV-1 replication and APOBEC3 antiviral activity are not regulated by P bodies. J. Virol. 86: 11712—11724. PMID 22915799 DOI:10.1128/JVI.00595-12
- Refsland E.W., Hultquist J.F., Harris R.S. (2012). Endogenous origins of HIV-1 G-to-A hypermutation and restriction in the nonpermissive T cell line CEM2n. PLoS Pathog. 8: E1002800—E1002800. PMID 22807680 DOI:10.1371/journal.ppat.1002800
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17354 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 2 травня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
APOBEC3D angl Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3D bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 22 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 386 aminokislot a molekulyarna masa 46 598 APOBEC3DIdentifikatoriSimvoliAPOBEC3D A3D APOBEC3DE APOBEC3E ARP6 apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3D A3DEZovnishni ID OMIM 609900 HomoloGene 122788 GeneCards APOBEC3DOntologiya genaMolekulyarna funkciya hydrolase activity acting on carbon nitrogen but not peptide bonds in cyclic amidines zinc ion binding katalitichna aktivnist hydrolase activity zv yazuvannya z ionom metalu RNA binding cytidine deaminase activityKlitinna komponenta citoplazma P body klitinne yadroBiologichnij proces negative regulation of transposition vrodzhenij imunitet defense response to virus DNA cytosine deamination negative regulation of single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate proces imunnoyi sistemi cytidine deamination cytidine to uridine editing DNA demethylationDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez140564 n dEnsembl ENSG00000243811 n dUniProt B2CML4 n dRefSeq mRNK NM 152426 NM 001363781n dRefSeq bilok NP 689639 NP 001350710n dLokus UCSC Hr 22 39 02 39 03 Mbn dPubMed search n dVikidaniDiv Red dlya lyudej Poslidovnist aminokislot1020304050 MNPQIRNPMERMYRDTFYDNFENEPILYGRSYTWLCYEVKIKRGRSNLLW DTGVFRGPVLPKRQSNHRQEVYFRFENHAEMCFLSWFCGNRLPANRRFQI TWFVSWNPCLPCVVKVTKFLAEHPNVTLTISAARLYYYRDRDWRWVLLRL HKAGARVKIMDYEDFAYCWENFVCNEGQPFMPWYKFDDNYASLHRTLKEI LRNPMEAMYPHIFYFHFKNLLKACGRNESWLCFTMEVTKHHSAVFRKRGV FRNQVDPETHCHAERCFLSWFCDDILSPNTNYEVTWYTSWSPCPECAGEV AEFLARHSNVNLTIFTARLCYFWDTDYQEGLCSLSQEGASVKIMGYKDFV SCWKNFVYSDDEPFKPWKGLQTNFRLLKRRLREILQ A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do gidrolaz Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak imunitet vrodzhenij imunitet antivirusnij zahist Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku Lokalizovanij u citoplazmi LiteraturaWedekind J E Dance G S C Sowden M P Smith H C 2003 Messenger RNA editing in mammals new members of the APOBEC family seeking roles in the family business Trends Genet 19 207 216 PMID 12683974 DOI 10 1016 S0168 9525 03 00054 4 Chiu Y L Greene W C 2008 The APOBEC3 cytidine deaminases an innate defensive network opposing exogenous retroviruses and endogenous retroelements Annu Rev Immunol 26 317 353 PMID 18304004 DOI 10 1146 annurev immunol 26 021607 090350 Stenglein M D Burns M B Li M Lengyel J Harris R S 2010 APOBEC3 proteins mediate the clearance of foreign DNA from human cells Nat Struct Mol Biol 17 222 229 PMID 20062055 DOI 10 1038 nsmb 1744 Arias J F Koyama T Kinomoto M Tokunaga K 2012 Retroelements versus APOBEC3 family members No great escape from the magnificent seven Front Microbiol 3 275 275 PMID 22912627 DOI 10 3389 fmicb 2012 00275 Phalora P K Sherer N M Wolinsky S M Swanson C M Malim M H 2012 HIV 1 replication and APOBEC3 antiviral activity are not regulated by P bodies J Virol 86 11712 11724 PMID 22915799 DOI 10 1128 JVI 00595 12 Refsland E W Hultquist J F Harris R S 2012 Endogenous origins of HIV 1 G to A hypermutation and restriction in the nonpermissive T cell line CEM2n PLoS Pathog 8 E1002800 E1002800 PMID 22807680 DOI 10 1371 journal ppat 1002800PrimitkiHuman PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 17354 angl Procitovano 22 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 2 travnya 2017 Procitovano 22 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 22 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi