Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

SDCBP англ Syndecan binding protein білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плечі 8 ї х

SDCBP

SDCBP

SDCBP (англ. Syndecan binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 298 амінокислот, а молекулярна маса — 32 444.

SDCBP
image
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи SDCBP, MDA-9, ST1, SYCL, TACIP18, MDA9, syndecan binding protein
Зовнішні ІД OMIM: 602217 MGI: 1337026 HomoloGene: 4110 GeneCards: SDCBP
Шаблон експресії
image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6386
53378
Ensembl
ENSG00000137575
ENSMUSG00000028249
UniProt
O00560
O08992
RefSeq (мРНК)
NM_001098227
NM_016807
RefSeq (білок)
NP_001091697
NP_058087
Локус (UCSC) Хр. 8: 58.55 – 58.58 Mb Хр. 4: 6.37 – 6.41 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MSLYPSLEDLKVDKVIQAQTAFSANPANPAILSEASAPIPHDGNLYPRLY
PELSQYMGLSLNEEEIRANVAVVSGAPLQGQLVARPSSINYMVAPVTGND
VGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGIFVQLVQANSPASLV
GLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTIT
MHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEINGQNVIGLK
DSQIADILSTSGTVVTITIMPAFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTIPEV

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, клітинних контактах, ендоплазматичному ретикулумі. Також секретований назовні.

Література

  • Lin J.J., Jiang H., Fisher P.B. (1998). Melanoma differentiation associated gene-9, mda-9, is a human gamma interferon responsive gene. Gene. 207: 105—110. PMID 9511750 DOI:10.1016/S0378-1119(97)00562-3
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Fernandez-Larrea J., Merlos-Suarez A., Urena J.M., Baselga J., Arribas J. (1999). A role for a PDZ protein in the early secretory pathway for the targeting of proTGF-alpha to the cell surface. Mol. Cell. 3: 423—433. PMID 10230395 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80470-0
  • Grootjans J.J., Reekmans G., Ceulemans H., David G. (2000). Syntenin-syndecan binding requires syndecan-synteny and the co-operation of both PDZ domains of syntenin. J. Biol. Chem. 275: 19933—19941. PMID 10770943 DOI:10.1074/jbc.M002459200
  • Friand V., David G., Zimmermann P. (2015). Syntenin and syndecan in the biogenesis of exosomes. Biol. Cell. 107: 331—341. PMID 26032692 DOI:10.1111/boc.201500010
  • Philley J.V., Kannan A., Dasgupta S. (2016). MDA-9/syntenin control. J. Cell. Physiol. 231: 545—550. PMID 26291527 DOI:10.1002/jcp.25136

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

SDCBP angl Syndecan binding protein bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 8 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 298 aminokislot a molekulyarna masa 32 444 SDCBPNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSBSpisok kodiv PDB1N99 1NTE 1OBX 1OBY 1OBZ 1R6J 1V1T 1W9E 1W9O 1W9Q 1YBO 4Z33IdentifikatoriSimvoliSDCBP MDA 9 ST1 SYCL TACIP18 MDA9 syndecan binding proteinZovnishni ID OMIM 602217 MGI 1337026 HomoloGene 4110 GeneCards SDCBPOntologiya genaMolekulyarna funkciya protein N terminus binding GO 0005110 frizzled binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding identical protein binding cytoskeletal anchor activity interleukin 5 receptor binding phosphatidylinositol 4 5 bisphosphate binding lipid binding cadherin binding syndecan binding protein heterodimerization activityKlitinna komponenta citoplazma extracellular vesicle blood microparticle endoplasmic reticulum membrane membrana focal adhesion Melanosoma Adgezivni kontakti klitinna membrana mizhklitinni kontakti endoplazmatichnij retikulum membrane raft ekzosoma citoskelet klitinne yadro extracellular region mizhklitinnij prostir nukleoplazma gialoplazma interleukin 5 receptor Yaderna membrana azurophil granule lumen vnutrishnoklitinna membranna organelaBiologichnij proces positive regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway GO 0007243 intracellular signal transduction positive regulation of extracellular exosome assembly negative regulation of receptor internalization protein targeting to membrane ephrin receptor signaling pathway substrate dependent cell migration cell extension positive regulation of pathway restricted SMAD protein phosphorylation positive regulation of JNK cascade positive regulation of epithelial to mesenchymal transition regulation of mitotic cell cycle negative regulation of proteasomal ubiquitin dependent protein catabolic process positive regulation of exosomal secretion positive regulation of phosphorylation actin cytoskeleton organization chemical synaptic transmission positive regulation of cell population proliferation positive regulation of cell growth positive regulation of cell migration neutrophil degranulationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez6386 53378Ensembl ENSG00000137575 ENSMUSG00000028249UniProt O00560 O08992RefSeq mRNK NM 001007067 NM 001007068 NM 001007069 NM 001007070 NM 005625NM 001330537 NM 001348339 NM 001348340 NM 001348341NM 001098227 NM 016807RefSeq bilok NP 001007068 NP 001007069 NP 001007070 NP 001007071 NP 001317466NP 005616 NP 001335268 NP 001335269 NP 001335270NP 001091697 NP 058087Lokus UCSC Hr 8 58 55 58 58 MbHr 4 6 37 6 41 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishejPoslidovnist aminokislot1020304050MSLYPSLEDLKVDKVIQAQTAFSANPANPAILSEASAPIPHDGNLYPRLYPELSQYMGLSLNEEEIRANVAVVSGAPLQGQLVARPSSINYMVAPVTGNDVGIRRAEIKQGIREVILCKDQDGKIGLRLKSIDNGIFVQLVQANSPASLVGLRFGDQVLQINGENCAGWSSDKAHKVLKQAFGEKITMTIRDRPFERTITMHKDSTGHVGFIFKNGKITSIVKDSSAARNGLLTEHNICEINGQNVIGLKDSQIADILSTSGTVVTITIMPAFIFEHIIKRMAPSIMKSLMDHTIPEVA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak acetilyuvannya alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z lipidami Lokalizovanij u klitinnij membrani citoplazmi citoskeleti yadri membrani klitinnih kontaktah endoplazmatichnomu retikulumi Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaLin J J Jiang H Fisher P B 1998 Melanoma differentiation associated gene 9 mda 9 is a human gamma interferon responsive gene Gene 207 105 110 PMID 9511750 DOI 10 1016 S0378 1119 97 00562 3 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Fernandez Larrea J Merlos Suarez A Urena J M Baselga J Arribas J 1999 A role for a PDZ protein in the early secretory pathway for the targeting of proTGF alpha to the cell surface Mol Cell 3 423 433 PMID 10230395 DOI 10 1016 S1097 2765 00 80470 0 Grootjans J J Reekmans G Ceulemans H David G 2000 Syntenin syndecan binding requires syndecan synteny and the co operation of both PDZ domains of syntenin J Biol Chem 275 19933 19941 PMID 10770943 DOI 10 1074 jbc M002459200 Friand V David G Zimmermann P 2015 Syntenin and syndecan in the biogenesis of exosomes Biol Cell 107 331 341 PMID 26032692 DOI 10 1111 boc 201500010 Philley J V Kannan A Dasgupta S 2016 MDA 9 syntenin control J Cell Physiol 231 545 550 PMID 26291527 DOI 10 1002 jcp 25136PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 10 veresnya 2017 Procitovano 7 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 8 veresnya 2017 Procitovano 7 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 8Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ