TIA1

TIA1 (англ. TIA1 cytotoxic granule associated RNA binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 386 амінокислот, а молекулярна маса — 42 963.

TIA1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2MJN, 3BS9
Ідентифікатори
Символи	TIA1, TIA-1, WDM, TIA1 cytotoxic granule-associated RNA binding protein, TIA1 cytotoxic granule associated RNA binding protein
Зовнішні ІД	OMIM: 603518 MGI: 107914 HomoloGene: 20692 GeneCards: TIA1
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • poly(A) binding • RNA binding • mRNA 3'-UTR AU-rich region binding Клітинна компонента • цитоплазма • cytoplasmic stress granule • nuclear stress granule • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • negative regulation of translation • positive regulation of epithelial cell apoptotic process • regulation of mRNA splicing, via spliceosome • protein localization to cytoplasmic stress granule • GO:0097285 апоптоз • fibroblast growth factor receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7072	21841
Ensembl	ENSG00000116001	ENSMUSG00000071337
UniProt	P31483	P52912
RefSeq (мРНК)	NM_022037 NM_022173	NM_001164078 NM_001164079 NM_011585
RefSeq (білок)	NP_071320 NP_071505 NP_001338437 NP_001338438 NP_001338439 NP_001338440 NP_001338441 NP_001338443 NP_001338444 NP_001338445 NP_001338446 NP_001338447 NP_001338448 NP_001338449 NP_001338450 NP_001338451 NP_001338452 NP_001338453 NP_001338454 NP_001338442	NP_001157550 NP_001157551 NP_035715
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 6: 86.38 – 86.41 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEDEMPKTLY		VGNLSRDVTE		ALILQLFSQI		GPCKNCKMIM		DTAGNDPYCF
VEFHEHRHAA		AALAAMNGRK		IMGKEVKVNW		ATTPSSQKKD		TSSSTVVSTQ
RSQDHFHVFV		GDLSPEITTE		DIKAAFAPFG		RISDARVVKD		MATGKSKGYG
FVSFFNKWDA		ENAIQQMGGQ		WLGGRQIRTN		WATRKPPAPK		STYESNTKQL
SYDEVVNQSS		PSNCTVYCGG		VTSGLTEQLM		RQTFSPFGQI		MEIRVFPDKG
YSFVRFNSHE		SAAHAIVSVN		GTTIEGHVVK		CYWGKETLDM		INPVQQQNQI
GYPQPYGQWG		QWYGNAQQIG		QYMPNGWQVP		AYGMYGQAWN		QQGFNQTQSS
APWMGPNYGV		QPPQGQNGSM		LPNQPSGYRV		AGYETQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Tian Q., Streuli M., Saito H., Schlossman S.F., Anderson P. (1991). A polyadenylate binding protein localized to the granules of cytolytic lymphocytes induces DNA fragmentation in target cells. Cell. 67: 629—639. PMID 1934064 DOI:10.1016/0092-8674(91)90536-8
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kumar A.O., Swenson M.C., Benning M.M., Kielkopf C.L. (2008). Structure of the central RNA recognition motif of human TIA-1 at 1.95A resolution. Biochem. Biophys. Res. Commun. 367: 813—819. PMID 18201561 DOI:10.1016/j.bbrc.2008.01.027

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11802 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
4. (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 2