TUBA1A (англ. Tubulin alpha 1a) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 451 амінокислот, а молекулярна маса — 50 136.
TUBA1A | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | TUBA1A, B-ALPHA-1, LIS3, TUBA3, tubulin alpha 1a | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 602529 MGI: 98869 HomoloGene: 68498 GeneCards: TUBA1A | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
lissencephaly due to TUBA1A mutation | |||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
velban, ixabepilone, plinabulin, vinblastine sulfate, patupilone, vincristine sulfate, dolastatin 10 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 12: 49.18 – 49.19 Mb | Хр. 15: 98.85 – 98.85 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MRECISIHVG | QAGVQIGNAC | WELYCLEHGI | QPDGQMPSDK | TIGGGDDSFN | ||||
TFFSETGAGK | HVPRAVFVDL | EPTVIDEVRT | GTYRQLFHPE | QLITGKEDAA | ||||
NNYARGHYTI | GKEIIDLVLD | RIRKLADQCT | GLQGFLVFHS | FGGGTGSGFT | ||||
SLLMERLSVD | YGKKSKLEFS | IYPAPQVSTA | VVEPYNSILT | THTTLEHSDC | ||||
AFMVDNEAIY | DICRRNLDIE | RPTYTNLNRL | IGQIVSSITA | SLRFDGALNV | ||||
DLTEFQTNLV | PYPRIHFPLA | TYAPVISAEK | AYHEQLSVAE | ITNACFEPAN | ||||
QMVKCDPRHG | KYMACCLLYR | GDVVPKDVNA | AIATIKTKRT | IQFVDWCPTG | ||||
FKVGINYQPP | TVVPGGDLAK | VQRAVCMLSN | TTAIAEAWAR | LDHKFDLMYA | ||||
KRAFVHWYVG | EGMEEGEFSE | AREDMAALEK | DYEEVGVDSV | EGEGEEEGEE | ||||
Y |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.
Література
- Hall J.L., Cowan N.J. (1985). Structural features and restricted expression of a human alpha-tubulin gene. Nucleic Acids Res. 13: 207—223. PMID 3839072 DOI:10.1093/nar/13.1.207
- Crabtree D.V., Ojima I., Geng X., Adler A.J. (2001). Tubulins in the primate retina: evidence that xanthophylls may be endogenous ligands for the paclitaxel-binding site. Bioorg. Med. Chem. 9: 1967—1976. PMID 11504633 DOI:10.1016/S0968-0896(01)00103-1
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Cowan N.J., Dobner P., Fuchs E.V., Cleveland D.W. (1983). Expression of human alpha-tubulin genes: interspecies conservation of 3' untranslated regions. Mol. Cell. Biol. 3: 1738—1745. PMID 6646120 DOI:10.1128/MCB.3.10.1738
- Valenstein M.L., Roll-Mecak A. (2016). Graded control of microtubule severing by tubulin glutamylation. Cell. 164: 911—921. PMID 26875866 DOI:10.1016/j.cell.2016.01.019
- Nirschl J.J., Magiera M.M., Lazarus J.E., Janke C., Holzbaur E.L. (2016). Alpha-tubulin tyrosination and CLIP-170 phosphorylation regulate the initiation of dynein-driven transport in neurons. Cell Rep. 14: 2637—2652. PMID 26972003 DOI:10.1016/j.celrep.2016.02.046
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з TUBA1A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Сполуки, які фізично взаємодіють з Tubulin alpha 1a переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
TUBA1A angl Tubulin alpha 1a bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 12 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 451 aminokislot a molekulyarna masa 50 136 TUBA1ANayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB3HKC 4X20 3HKE 3N2G 4X1Y 3N2K 4X1I 4X1K 3HKB 3HKD 5JCOIdentifikatoriSimvoliTUBA1A B ALPHA 1 LIS3 TUBA3 tubulin alpha 1aZovnishni ID OMIM 602529 MGI 98869 HomoloGene 68498 GeneCards TUBA1APov yazani genetichni zahvoryuvannyalissencephaly due to TUBA1A mutation Reaguye na spolukuvelban ixabepilone plinabulin vinblastine sulfate patupilone vincristine sulfate dolastatin 10 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya nucleotide binding protein domain specific binding GTP binding structural molecule activity structural constituent of cytoskeleton GO 0001948 GO 0016582 protein binding GO 0006184 GTPase activityKlitinna komponenta citoplazma recycling endosome gialoplazma myelin sheath cytoplasmic microtubule cytoplasmic ribonucleoprotein granule mikrotrubochka ekzosoma citoskelet klitinne yadro microtubule cytoskeleton membrane raft neuromuscular junctionBiologichnij proces cytoskeleton dependent intracellular transport podil klitini G2 M transition of mitotic cell cycle microtubule based process cytoskeleton organization ciliary basal body plasma membrane docking regulation of G2 M transition of mitotic cell cycle microtubule cytoskeleton organization GO 0007067 mitoz GO 1904739 regulation of synapse organizationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez7846 22142Ensembl ENSG00000167552 ENSMUSG00000072235UniProt Q71U36 P68369RefSeq mRNK NM 006009 NM 001270399 NM 001270400NM 011653RefSeq bilok NP 001257328 NP 001257329 NP 006000NP 035783Lokus UCSC Hr 12 49 18 49 19 MbHr 15 98 85 98 85 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFN TFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAA NNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFT SLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDC AFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLIGQIVSSITASLRFDGALNV DLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPAN QMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRTIQFVDWCPTG FKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYA KRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEE Y A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak acetilyuvannya alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z nukleotidami GTF Lokalizovanij u citoplazmi citoskeleti LiteraturaHall J L Cowan N J 1985 Structural features and restricted expression of a human alpha tubulin gene Nucleic Acids Res 13 207 223 PMID 3839072 DOI 10 1093 nar 13 1 207 Crabtree D V Ojima I Geng X Adler A J 2001 Tubulins in the primate retina evidence that xanthophylls may be endogenous ligands for the paclitaxel binding site Bioorg Med Chem 9 1967 1976 PMID 11504633 DOI 10 1016 S0968 0896 01 00103 1 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Cowan N J Dobner P Fuchs E V Cleveland D W 1983 Expression of human alpha tubulin genes interspecies conservation of 3 untranslated regions Mol Cell Biol 3 1738 1745 PMID 6646120 DOI 10 1128 MCB 3 10 1738 Valenstein M L Roll Mecak A 2016 Graded control of microtubule severing by tubulin glutamylation Cell 164 911 921 PMID 26875866 DOI 10 1016 j cell 2016 01 019 Nirschl J J Magiera M M Lazarus J E Janke C Holzbaur E L 2016 Alpha tubulin tyrosination and CLIP 170 phosphorylation regulate the initiation of dynein driven transport in neurons Cell Rep 14 2637 2652 PMID 26972003 DOI 10 1016 j celrep 2016 02 046PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z TUBA1A pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Spoluki yaki fizichno vzayemodiyut z Tubulin alpha 1a pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 28 travnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 5 veresnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 12 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi