TRIM21 (англ. Tripartite motif containing 21) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 475 амінокислот, а молекулярна маса — 54 170.
TRIM21 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | TRIM21, RNF81, RO52, Ro/SSA, SSA, SSA1, tripartite motif containing 21, Tripartite motif-containing protein 21 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 109092 MGI: 106657 HomoloGene: 2365 GeneCards: TRIM21 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 11: 4.38 – 4.39 Mb | Хр. 7: 102.21 – 102.21 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MASAARLTMM | WEEVTCPICL | DPFVEPVSIE | CGHSFCQECI | SQVGKGGGSV | ||||
CPVCRQRFLL | KNLRPNRQLA | NMVNNLKEIS | QEAREGTQGE | RCAVHGERLH | ||||
LFCEKDGKAL | CWVCAQSRKH | RDHAMVPLEE | AAQEYQEKLQ | VALGELRRKQ | ||||
ELAEKLEVEI | AIKRADWKKT | VETQKSRIHA | EFVQQKNFLV | EEEQRQLQEL | ||||
EKDEREQLRI | LGEKEAKLAQ | QSQALQELIS | ELDRRCHSSA | LELLQEVIIV | ||||
LERSESWNLK | DLDITSPELR | SVCHVPGLKK | MLRTCAVHIT | LDPDTANPWL | ||||
ILSEDRRQVR | LGDTQQSIPG | NEERFDSYPM | VLGAQHFHSG | KHYWEVDVTG | ||||
KEAWDLGVCR | DSVRRKGHFL | LSSKSGFWTI | WLWNKQKYEA | GTYPQTPLHL | ||||
QVPPCQVGIF | LDYEAGMVSF | YNITDHGSLI | YSFSECAFTG | PLRPFFSPGF | ||||
NDGGKNTAPL | TLCPLNIGSQ | GSTDY |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, цитоплазматичних везикулах.
Література
- Itoh K., Itoh Y., Frank M.B. (1991). Protein heterogeneity in the human Ro/SSA ribonucleoproteins. The 52- and 60-kD Ro/SSA autoantigens are encoded by separate genes. J. Clin. Invest. 87: 177—186. PMID 1985094 DOI:10.1172/JCI114968
- Chan E.K., Hamel J.C., Buyon J.P., Tan E.M. (1991). Molecular definition and sequence motifs of the 52-kD component of human SS-A/Ro autoantigen. J. Clin. Invest. 87: 68—76. PMID 1985112 DOI:10.1172/JCI115003
- Tsugu H., Horowitz R., Gibson N., Frank M.B. (1994). The location of a disease-associated polymorphism and genomic structure of the human 52-kDa Ro/SSA locus (SSA1). Genomics. 24: 541—548. PMID 7713506 DOI:10.1006/geno.1994.1664
- Keech C.L., Gordon T.P., McCluskey J. (1996). Structural differences between the human and mouse 52-kD Ro autoantigens associated with poorly conserved autoantibody activity across species. Clin. Exp. Immunol. 104: 255—263. PMID 8625517 DOI:10.1046/j.1365-2249.1996.16726.x
- Bepler G., O'Briant K.C., Kim Y.-C., Schreiber G., Pitterle D.M. (1999). A 1.4-Mb high-resolution physical map and contig of chromosome segment 11p15.5 and genes in the LOH11A metastasis suppressor region. Genomics. 55: 164—175. PMID 9933563 DOI:10.1006/geno.1998.5659
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
TRIM21 angl Tripartite motif containing 21 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 11 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 475 aminokislot a molekulyarna masa 54 170 TRIM21Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2IWGIdentifikatoriSimvoliTRIM21 RNF81 RO52 Ro SSA SSA SSA1 tripartite motif containing 21 Tripartite motif containing protein 21Zovnishni ID OMIM 109092 MGI 106657 HomoloGene 2365 GeneCards TRIM21Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding zinc ion binding zv yazuvannya z ionom metalu GO 0001948 GO 0016582 protein binding RNA binding identical protein binding GO 0050372 ubiquitin protein transferase activity transferase activityKlitinna komponenta citoplazma gialoplazma SCF ubiquitin ligase complex P body vnutrishnoklitinnij autophagosome GO 0016023 cytoplasmic vesicle klitinne yadro nukleoplazma RibonukleoproteyiniBiologichnij proces negative regulation of protein deubiquitination response to interferon gamma positive regulation of autophagy interferon gamma mediated signaling pathway protein trimerization positive regulation of viral entry into host cell positive regulation of DNA binding transcription factor activity protein monoubiquitination regulation of type I interferon production positive regulation of cell cycle protein destabilization Ubikvitin zalezhnij proteoliz klitinnij cikl negative regulation of NF kappaB transcription factor activity protein autoubiquitination vrodzhenij imunitet protein polyubiquitination negative regulation of viral transcriptionDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez6737 20821Ensembl ENSG00000132109 ENSMUSG00000030966UniProt P19474 Q62191RefSeq mRNK NM 003141NM 001082552 NM 009277RefSeq bilok NP 003132n dLokus UCSC Hr 11 4 38 4 39 MbHr 7 102 21 102 21 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MASAARLTMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQECISQVGKGGGSV CPVCRQRFLLKNLRPNRQLANMVNNLKEISQEAREGTQGERCAVHGERLH LFCEKDGKALCWVCAQSRKHRDHAMVPLEEAAQEYQEKLQVALGELRRKQ ELAEKLEVEIAIKRADWKKTVETQKSRIHAEFVQQKNFLVEEEQRQLQEL EKDEREQLRILGEKEAKLAQQSQALQELISELDRRCHSSALELLQEVIIV LERSESWNLKDLDITSPELRSVCHVPGLKKMLRTCAVHITLDPDTANPWL ILSEDRRQVRLGDTQQSIPGNEERFDSYPMVLGAQHFHSGKHYWEVDVTG KEAWDLGVCRDSVRRKGHFLLSSKSGFWTIWLWNKQKYEAGTYPQTPLHL QVPPCQVGIFLDYEAGMVSFYNITDHGSLIYSFSECAFTGPLRPFFSPGF NDGGKNTAPLTLCPLNIGSQGSTDY A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do transferaz ribonukleoproteyiniv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak klitinnij cikl ubikvitinuvannya bilkiv alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku DNK RNK Lokalizovanij u citoplazmi yadri citoplazmatichnih vezikulah LiteraturaItoh K Itoh Y Frank M B 1991 Protein heterogeneity in the human Ro SSA ribonucleoproteins The 52 and 60 kD Ro SSA autoantigens are encoded by separate genes J Clin Invest 87 177 186 PMID 1985094 DOI 10 1172 JCI114968 Chan E K Hamel J C Buyon J P Tan E M 1991 Molecular definition and sequence motifs of the 52 kD component of human SS A Ro autoantigen J Clin Invest 87 68 76 PMID 1985112 DOI 10 1172 JCI115003 Tsugu H Horowitz R Gibson N Frank M B 1994 The location of a disease associated polymorphism and genomic structure of the human 52 kDa Ro SSA locus SSA1 Genomics 24 541 548 PMID 7713506 DOI 10 1006 geno 1994 1664 Keech C L Gordon T P McCluskey J 1996 Structural differences between the human and mouse 52 kD Ro autoantigens associated with poorly conserved autoantibody activity across species Clin Exp Immunol 104 255 263 PMID 8625517 DOI 10 1046 j 1365 2249 1996 16726 x Bepler G O Briant K C Kim Y C Schreiber G Pitterle D M 1999 A 1 4 Mb high resolution physical map and contig of chromosome segment 11p15 5 and genes in the LOH11A metastasis suppressor region Genomics 55 164 175 PMID 9933563 DOI 10 1006 geno 1998 5659 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 26 veresnya 2017 Procitovano 8 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 8 serpnya 2017 Procitovano 8 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 11 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi