TRDMT1 (англ. TRNA aspartic acid methyltransferase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 391 амінокислот, а молекулярна маса — 44 597.
TRDMT1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | TRDMT1, DMNT2, DNMT2, MHSAIIP, PUMET, RNMT1, tRNA aspartic acid methyltransferase 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 602478 MGI: 1274787 HomoloGene: 3249 GeneCards: TRDMT1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 10: 17.14 – 17.2 Mb | Хр. 2: 13.51 – 13.55 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MEPLRVLELY | SGVGGMHHAL | RESCIPAQVV | AAIDVNTVAN | EVYKYNFPHT | ||||
QLLAKTIEGI | TLEEFDRLSF | DMILMSPPCQ | PFTRIGRQGD | MTDSRTNSFL | ||||
HILDILPRLQ | KLPKYILLEN | VKGFEVSSTR | DLLIQTIENC | GFQYQEFLLS | ||||
PTSLGIPNSR | LRYFLIAKLQ | SEPLPFQAPG | QVLMEFPKIE | SVHPQKYAMD | ||||
VENKIQEKNV | EPNISFDGSI | QCSGKDAILF | KLETAEEIHR | KNQQDSDLSV | ||||
KMLKDFLEDD | TDVNQYLLPP | KSLLRYALLL | DIVQPTCRRS | VCFTKGYGSY | ||||
IEGTGSVLQT | AEDVQVENIY | KSLTNLSQEE | QITKLLILKL | RYFTPKEIAN | ||||
LLGFPPEFGF | PEKITVKQRY | RLLGNSLNVH | VVAKLIKILY | E |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг тРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.
Література
- Yoder J.A., Bestor T.H. (1998). A candidate mammalian DNA methyltransferase related to pmt1p of fission yeast. Hum. Mol. Genet. 7: 279—284. PMID 9425235 DOI:10.1093/hmg/7.2.279
- Van den Wyngaert I., Sprengel J., Kass S.U., Luyten W.H.M.L. (1998). Cloning and analysis of a novel human putative DNA methyltransferase. FEBS Lett. 426: 283—289. PMID 9599025 DOI:10.1016/S0014-5793(98)00362-7
- Okano M., Xie S., Li E. (1998). Dnmt2 is not required for de novo and maintenance methylation of viral DNA in embryonic stem cells. Nucleic Acids Res. 26: 2536—2540. PMID 9592134 DOI:10.1093/nar/26.11.2536
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Franchina M., Hooper J., Kay P.H. (2001). Five novel alternatively spliced transcripts of DNA (cytosine-5) methyltransferase 2 in human peripheral blood leukocytes. Int. J. Biochem. Cell Biol. 33: 1104—1115. PMID 11551826 DOI:10.1016/S1357-2725(01)00074-7
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 1 серпня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 28 липня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
TRDMT1 angl TRNA aspartic acid methyltransferase 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 10 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 391 aminokislot a molekulyarna masa 44 597 TRDMT1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1G55IdentifikatoriSimvoliTRDMT1 DMNT2 DNMT2 MHSAIIP PUMET RNMT1 tRNA aspartic acid methyltransferase 1Zovnishni ID OMIM 602478 MGI 1274787 HomoloGene 3249 GeneCards TRDMT1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0102674 GO 0102675 methyltransferase activity transferase activity tRNA methyltransferase activity RNA binding tRNA cytosine 5 methyltransferase activityKlitinna komponenta citoplazma klitinne yadro nukleoplazmaBiologichnij proces response to amphetamine Metilyuvannya tRNA methylation tRNA modification tRNA processingDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez1787 13434Ensembl ENSG00000107614 ENSMUSG00000026723UniProt O14717 O55055RefSeq mRNK NM 004412 NM 176081 NM 176083 NM 176084 NM 176085NM 176086 NM 001321006 NM 001321007 NM 001351219 NM 001351220 NM 001351221 NM 001351222 NM 001351223NM 010067RefSeq bilok NP 001307935 NP 001307936 NP 004403 NP 001338148 NP 001338149NP 001338150 NP 001338151 NP 001338152NP 034197Lokus UCSC Hr 10 17 14 17 2 MbHr 2 13 51 13 55 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MEPLRVLELYSGVGGMHHALRESCIPAQVVAAIDVNTVANEVYKYNFPHT QLLAKTIEGITLEEFDRLSFDMILMSPPCQPFTRIGRQGDMTDSRTNSFL HILDILPRLQKLPKYILLENVKGFEVSSTRDLLIQTIENCGFQYQEFLLS PTSLGIPNSRLRYFLIAKLQSEPLPFQAPGQVLMEFPKIESVHPQKYAMD VENKIQEKNVEPNISFDGSIQCSGKDAILFKLETAEEIHRKNQQDSDLSV KMLKDFLEDDTDVNQYLLPPKSLLRYALLLDIVQPTCRRSVCFTKGYGSY IEGTGSVLQTAEDVQVENIYKSLTNLSQEEQITKLLILKLRYFTPKEIAN LLGFPPEFGFPEKITVKQRYRLLGNSLNVHVVAKLIKILYE A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do transferaz metiltransferaz Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak procesing tRNK alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z RNK S adenozil L metioninom Lokalizovanij u yadri LiteraturaYoder J A Bestor T H 1998 A candidate mammalian DNA methyltransferase related to pmt1p of fission yeast Hum Mol Genet 7 279 284 PMID 9425235 DOI 10 1093 hmg 7 2 279 Van den Wyngaert I Sprengel J Kass S U Luyten W H M L 1998 Cloning and analysis of a novel human putative DNA methyltransferase FEBS Lett 426 283 289 PMID 9599025 DOI 10 1016 S0014 5793 98 00362 7 Okano M Xie S Li E 1998 Dnmt2 is not required for de novo and maintenance methylation of viral DNA in embryonic stem cells Nucleic Acids Res 26 2536 2540 PMID 9592134 DOI 10 1093 nar 26 11 2536 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Franchina M Hooper J Kay P H 2001 Five novel alternatively spliced transcripts of DNA cytosine 5 methyltransferase 2 in human peripheral blood leukocytes Int J Biochem Cell Biol 33 1104 1115 PMID 11551826 DOI 10 1016 S1357 2725 01 00074 7PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 1 serpnya 2016 Procitovano 8 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 28 lipnya 2017 Procitovano 8 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 10 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi