Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

TNRC6A англ Trinucleotide repeat containing 6A білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому

TNRC6A

TNRC6A

TNRC6A (англ. Trinucleotide repeat containing 6A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 962 амінокислот, а молекулярна маса — 210 297.

TNRC6A
Ідентифікатори
Символи TNRC6A, CAGH26, GW1, GW182, TNRC6, trinucleotide repeat containing 6A, FAME6, trinucleotide repeat containing adaptor 6A
Зовнішні ІД OMIM: 610739 MGI: 2385292 HomoloGene: 41399 GeneCards: TNRC6A
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
27327
233833
Ensembl
ENSG00000090905
ENSG00000288130
ENSMUSG00000052707
UniProt
Q8NDV7
Q3UHK8
RefSeq (мРНК)
NM_014494
NM_001330520
NM_001351850
NM_144925
RefSeq (білок)
NP_001317449
NP_055309
NP_001338779
NP_659174
Локус (UCSC) Хр. 16: 24.61 – 24.83 Mb Хр. 7: 122.72 – 122.79 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MRELEAKATKDVERNLSRDLVQEEEQLMEEKKKKKDDKKKKEAAQKKATE
QKIKVPEQIKPSVSQPQPANSNNGTSTATSTNNNAKRATANNQQPQQQQQ
QQQPQQQQPQQQPQPQPQQQQPQQQPQALPRYPREVPPRFRHQEHKQLLK
RGQHFPVIAANLGSAVKVLNSQSESSALTNQQPQNNGEVQNSKNQSDINH
STSGSHYENSQRGPVSSTSDSSTNCKNAVVSDLSEKEAWPSAPGSDPELA
SECMDADSASSSESERNITIMASGNTGGEKDGLRNSTGLGSQNKFVVGSS
SNNVGHGSSTGPWGFSHGAIISTCQVSVDAPESKSESSNNRMNAWGTVSS
SSNGGLNPSTLNSASNHGAWPVLENNGLALKGPVGSGSSGINIQCSTIGQ
MPNNQSINSKVSGGSTHGTWGSLQETCESEVSGTQKVSFSGQPQNITTEM
TGPNNTTNFMTSSLPNSGSVQNNELPSSNTGAWRVSTMNHPQMQAPSGMN
GTSLSHLSNGESKSGGSYGTTWGAYGSNYSGDKCSGPNGQANGDTVNATL
MQPGVNGPMGTNFQVNTNKGGGVWESGAANSQSTSWGSGNGANSGGSRRG
WGTPAQNTGTNLPSVEWNKLPSNQHSNDSANGNGKTFTNGWKSTEEEDQG
SATSQTNEQSSVWAKTGGTVESDGSTESTGRLEEKGTGESQSRDRRKIDQ
HTLLQSIVNRTDLDPRVLSNSGWGQTPIKQNTAWDTETSPRGERKTDNGT
EAWGSSATQTFNSGACIDKTSPNGNDTSSVSGWGDPKPALRWGDSKGSNC
QGGWEDDSAATGMVKSNQWGNCKEEKAAWNDSQKNKQGWGDGQKSSQGWS
VSASDNWGETSRNNHWGEANKKSSSGGSDSDRSVSGWNELGKTSSFTWGN
NINPNNSSGWDESSKPTPSQGWGDPPKSNQSLGWGDSSKPVSSPDWNKQQ
DIVGSWGIPPATGKPPGTGWLGGPIPAPAKEEEPTGWEEPSPESIRRKME
IDDGTSAWGDPSKYNYKNVNMWNKNVPNGNSRSDQQAQVHQLLTPASAIS
NKEASSGSGWGEPWGEPSTPATTVDNGTSAWGKPIDSGPSWGEPIAAASS
TSTWGSSSVGPQALSKSGPKSMQDGWCGDDMPLPGNRPTGWEEEEDVEIG
MWNSNSSQELNSSLNWPPYTKKMSSKGLSGKKRRRERGMMKGGNKQEEAW
INPFVKQFSNISFSRDSPEENVQSNKMDLSGGMLQDKRMEIDKHSLNIGD
YNRTVGKGPGSRPQISKESSMERNPYFDKDGIVADESQNMQFMSSQSMKL
PPSNSALPNQALGSIAGLGMQNLNSVRQNGNPSMFGVGNTAAQPRGMQQP
PAQPLSSSQPNLRAQVPPPLLSPQVPVSLLKYAPNNGGLNPLFGPQQVAM
LNQLSQLNQLSQISQLQRLLAQQQRAQSQRSVPSGNRPQQDQQGRPLSVQ
QQMMQQSRQLDPNLLVKQQTPPSQQQPLHQPAMKSFLDNVMPHTTPELQK
GPSPINAFSNFPIGLNSNLNVNMDMNSIKEPQSRLRKWTTVDSISVNTSL
DQNSSKHGAISSGFRLEESPFVPYDFMNSSTSPASPPGSIGDGWPRAKSP
NGSSSVNWPPEFRPGEPWKGYPNIDPETDPYVTPGSVINNLSINTVREVD
HLRDRNSGSSSSLNTTLPSTSAWSSIRASNYNVPLSSTAQSTSARNSDSK
LTWSPGSVTNTSLAHELWKVPLPPKNITAPSRPPPGLTGQKPPLSTWDNS
PLRIGGGWGNSDARYTPGSSWGESSSGRITNWLVLKNLTPQIDGSTLRTL
CMQHGPLITFHLNLPHGNALVRYSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTTILAEF
ASEEEISRFFAQSQSLTPSPGWQSLGSSQSRLGSLDCSHSFSSRTDLNHW
NGAGLSGTNCGDLHGTSLWGTPHYSTSLWGPPSSSDPRGISSPSPINAFL
SVDHLGGGGESM

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
  • Sen G.L., Blau H.M. (2005). Argonaute 2/RISC resides in sites of mammalian mRNA decay known as cytoplasmic bodies. Nat. Cell Biol. 7: 633—636. PMID 15908945 DOI:10.1038/ncb1265
  • Wakiyama M., Takimoto K., Ohara O., Yokoyama S. (2007). Let-7 microRNA-mediated mRNA deadenylation and translational repression in a mammalian cell-free system. Genes Dev. 21: 1857—1862. PMID 17671087 DOI:10.1101/gad.1566707
  • Jagannath A., Wood M.J.A. (2009). Localization of double-stranded small interfering RNA to cytoplasmic processing bodies is Ago2 dependent and results in up-regulation of GW182 and Argonaute-2. Mol. Biol. Cell. 20: 521—529. PMID 18946079 DOI:10.1091/mbc.E08-08-0796
  • Zipprich J.T., Bhattacharyya S., Mathys H., Filipowicz W. (2009). Importance of the C-terminal domain of the human GW182 protein TNRC6C for translational repression. RNA. 15: 781—793. PMID 19304925 DOI:10.1261/rna.1448009

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11969 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

TNRC6A angl Trinucleotide repeat containing 6A bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 16 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 962 aminokislot a molekulyarna masa 210 297 TNRC6AIdentifikatoriSimvoliTNRC6A CAGH26 GW1 GW182 TNRC6 trinucleotide repeat containing 6A FAME6 trinucleotide repeat containing adaptor 6AZovnishni ID OMIM 610739 MGI 2385292 HomoloGene 41399 GeneCards TNRC6AOntologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0001948 GO 0016582 protein binding nucleic acid binding RNA bindingKlitinna komponenta citoplazma gialoplazma kompleks Goldzhi vnutrishnoklitinna membranna organela P body nukleoplazmaBiologichnij proces GO 0035194 RNK interferenciya gene silencing by miRNA regulation of translation miRNA mediated gene silencing by inhibition of translation Wnt signaling pathway calcium modulating pathway Sajlensing geniv GO 1905616 regulation of gene silencing by miRNA regulation of megakaryocyte differentiation cellular response to starvation GO 1901313 positive regulation of gene expression negative regulation of gene expression positive regulation of nuclear transcribed mRNA poly A tail shorteningDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez27327 233833Ensembl ENSG00000090905 ENSG00000288130 ENSMUSG00000052707UniProt Q8NDV7 Q3UHK8RefSeq mRNK NM 014494 NM 001330520 NM 001351850NM 144925RefSeq bilok NP 001317449 NP 055309 NP 001338779NP 659174Lokus UCSC Hr 16 24 61 24 83 MbHr 7 122 72 122 79 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MRELEAKATKDVERNLSRDLVQEEEQLMEEKKKKKDDKKKKEAAQKKATE QKIKVPEQIKPSVSQPQPANSNNGTSTATSTNNNAKRATANNQQPQQQQQ QQQPQQQQPQQQPQPQPQQQQPQQQPQALPRYPREVPPRFRHQEHKQLLK RGQHFPVIAANLGSAVKVLNSQSESSALTNQQPQNNGEVQNSKNQSDINH STSGSHYENSQRGPVSSTSDSSTNCKNAVVSDLSEKEAWPSAPGSDPELA SECMDADSASSSESERNITIMASGNTGGEKDGLRNSTGLGSQNKFVVGSS SNNVGHGSSTGPWGFSHGAIISTCQVSVDAPESKSESSNNRMNAWGTVSS SSNGGLNPSTLNSASNHGAWPVLENNGLALKGPVGSGSSGINIQCSTIGQ MPNNQSINSKVSGGSTHGTWGSLQETCESEVSGTQKVSFSGQPQNITTEM TGPNNTTNFMTSSLPNSGSVQNNELPSSNTGAWRVSTMNHPQMQAPSGMN GTSLSHLSNGESKSGGSYGTTWGAYGSNYSGDKCSGPNGQANGDTVNATL MQPGVNGPMGTNFQVNTNKGGGVWESGAANSQSTSWGSGNGANSGGSRRG WGTPAQNTGTNLPSVEWNKLPSNQHSNDSANGNGKTFTNGWKSTEEEDQG SATSQTNEQSSVWAKTGGTVESDGSTESTGRLEEKGTGESQSRDRRKIDQ HTLLQSIVNRTDLDPRVLSNSGWGQTPIKQNTAWDTETSPRGERKTDNGT EAWGSSATQTFNSGACIDKTSPNGNDTSSVSGWGDPKPALRWGDSKGSNC QGGWEDDSAATGMVKSNQWGNCKEEKAAWNDSQKNKQGWGDGQKSSQGWS VSASDNWGETSRNNHWGEANKKSSSGGSDSDRSVSGWNELGKTSSFTWGN NINPNNSSGWDESSKPTPSQGWGDPPKSNQSLGWGDSSKPVSSPDWNKQQ DIVGSWGIPPATGKPPGTGWLGGPIPAPAKEEEPTGWEEPSPESIRRKME IDDGTSAWGDPSKYNYKNVNMWNKNVPNGNSRSDQQAQVHQLLTPASAIS NKEASSGSGWGEPWGEPSTPATTVDNGTSAWGKPIDSGPSWGEPIAAASS TSTWGSSSVGPQALSKSGPKSMQDGWCGDDMPLPGNRPTGWEEEEDVEIG MWNSNSSQELNSSLNWPPYTKKMSSKGLSGKKRRRERGMMKGGNKQEEAW INPFVKQFSNISFSRDSPEENVQSNKMDLSGGMLQDKRMEIDKHSLNIGD YNRTVGKGPGSRPQISKESSMERNPYFDKDGIVADESQNMQFMSSQSMKL PPSNSALPNQALGSIAGLGMQNLNSVRQNGNPSMFGVGNTAAQPRGMQQP PAQPLSSSQPNLRAQVPPPLLSPQVPVSLLKYAPNNGGLNPLFGPQQVAM LNQLSQLNQLSQISQLQRLLAQQQRAQSQRSVPSGNRPQQDQQGRPLSVQ QQMMQQSRQLDPNLLVKQQTPPSQQQPLHQPAMKSFLDNVMPHTTPELQK GPSPINAFSNFPIGLNSNLNVNMDMNSIKEPQSRLRKWTTVDSISVNTSL DQNSSKHGAISSGFRLEESPFVPYDFMNSSTSPASPPGSIGDGWPRAKSP NGSSSVNWPPEFRPGEPWKGYPNIDPETDPYVTPGSVINNLSINTVREVD HLRDRNSGSSSSLNTTLPSTSAWSSIRASNYNVPLSSTAQSTSARNSDSK LTWSPGSVTNTSLAHELWKVPLPPKNITAPSRPPPGLTGQKPPLSTWDNS PLRIGGGWGNSDARYTPGSSWGESSSGRITNWLVLKNLTPQIDGSTLRTL CMQHGPLITFHLNLPHGNALVRYSSKEEVVKAQKSLHMCVLGNTTILAEF ASEEEISRFFAQSQSLTPSPGWQSLGSSQSRLGSLDCSHSFSSRTDLNHW NGAGLSGTNCGDLHGTSLWGTPHYSTSLWGPPSSSDPRGISSPSPINAFL SVDHLGGGGESM A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak regulyaciya translyaciyi RNK zalezhne zaglushennya geniv alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z RNK Lokalizovanij u citoplazmi LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Nagase T Kikuno R Ishikawa K Hirosawa M Ohara O 2000 Prediction of the coding sequences of unidentified human genes XVII The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro DNA Res 7 143 150 PMID 10819331 DOI 10 1093 dnares 7 2 143 Sen G L Blau H M 2005 Argonaute 2 RISC resides in sites of mammalian mRNA decay known as cytoplasmic bodies Nat Cell Biol 7 633 636 PMID 15908945 DOI 10 1038 ncb1265 Wakiyama M Takimoto K Ohara O Yokoyama S 2007 Let 7 microRNA mediated mRNA deadenylation and translational repression in a mammalian cell free system Genes Dev 21 1857 1862 PMID 17671087 DOI 10 1101 gad 1566707 Jagannath A Wood M J A 2009 Localization of double stranded small interfering RNA to cytoplasmic processing bodies is Ago2 dependent and results in up regulation of GW182 and Argonaute 2 Mol Biol Cell 20 521 529 PMID 18946079 DOI 10 1091 mbc E08 08 0796 Zipprich J T Bhattacharyya S Mathys H Filipowicz W 2009 Importance of the C terminal domain of the human GW182 protein TNRC6C for translational repression RNA 15 781 793 PMID 19304925 DOI 10 1261 rna 1448009PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 11969 angl Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 24 veresnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 16 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ