TNC (англ. Tenascin C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 201 амінокислот, а молекулярна маса — 240 853.
TNC | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | TNC, 150-225, DFNA56, GMEM, GP, HXB, JI, TN, TN-C, Tenascin C | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 187380 MGI: 101922 HomoloGene: 55636 GeneCards: TNC | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
рак простати, autosomal dominant nonsyndromic deafness 56 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 9: 115.02 – 115.12 Mb | Хр. 4: 63.88 – 63.97 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MGAMTQLLAG | VFLAFLALAT | EGGVLKKVIR | HKRQSGVNAT | LPEENQPVVF | ||||
NHVYNIKLPV | GSQCSVDLES | ASGEKDLAPP | SEPSESFQEH | TVDGENQIVF | ||||
THRINIPRRA | CGCAAAPDVK | ELLSRLEELE | NLVSSLREQC | TAGAGCCLQP | ||||
ATGRLDTRPF | CSGRGNFSTE | GCGCVCEPGW | KGPNCSEPEC | PGNCHLRGRC | ||||
IDGQCICDDG | FTGEDCSQLA | CPSDCNDQGK | CVNGVCICFE | GYAGADCSRE | ||||
ICPVPCSEEH | GTCVDGLCVC | HDGFAGDDCN | KPLCLNNCYN | RGRCVENECV | ||||
CDEGFTGEDC | SELICPNDCF | DRGRCINGTC | YCEEGFTGED | CGKPTCPHAC | ||||
HTQGRCEEGQ | CVCDEGFAGV | DCSEKRCPAD | CHNRGRCVDG | RCECDDGFTG | ||||
ADCGELKCPN | GCSGHGRCVN | GQCVCDEGYT | GEDCSQLRCP | NDCHSRGRCV | ||||
EGKCVCEQGF | KGYDCSDMSC | PNDCHQHGRC | VNGMCVCDDG | YTGEDCRDRQ | ||||
CPRDCSNRGL | CVDGQCVCED | GFTGPDCAEL | SCPNDCHGQG | RCVNGQCVCH | ||||
EGFMGKDCKE | QRCPSDCHGQ | GRCVDGQCIC | HEGFTGLDCG | QHSCPSDCNN | ||||
LGQCVSGRCI | CNEGYSGEDC | SEVSPPKDLV | VTEVTEETVN | LAWDNEMRVT | ||||
EYLVVYTPTH | EGGLEMQFRV | PGDQTSTIIQ | ELEPGVEYFI | RVFAILENKK | ||||
SIPVSARVAT | YLPAPEGLKF | KSIKETSVEV | EWDPLDIAFE | TWEIIFRNMN | ||||
KEDEGEITKS | LRRPETSYRQ | TGLAPGQEYE | ISLHIVKNNT | RGPGLKRVTT | ||||
TRLDAPSQIE | VKDVTDTTAL | ITWFKPLAEI | DGIELTYGIK | DVPGDRTTID | ||||
LTEDENQYSI | GNLKPDTEYE | VSLISRRGDM | SSNPAKETFT | TGLDAPRNLR | ||||
RVSQTDNSIT | LEWRNGKAAI | DSYRIKYAPI | SGGDHAEVDV | PKSQQATTKT | ||||
TLTGLRPGTE | YGIGVSAVKE | DKESNPATIN | AATELDTPKD | LQVSETAETS | ||||
LTLLWKTPLA | KFDRYRLNYS | LPTGQWVGVQ | LPRNTTSYVL | RGLEPGQEYN | ||||
VLLTAEKGRH | KSKPARVKAS | TEQAPELENL | TVTEVGWDGL | RLNWTAADQA | ||||
YEHFIIQVQE | ANKVEAARNL | TVPGSLRAVD | IPGLKAATPY | TVSIYGVIQG | ||||
YRTPVLSAEA | STGETPNLGE | VVVAEVGWDA | LKLNWTAPEG | AYEYFFIQVQ | ||||
EADTVEAAQN | LTVPGGLRST | DLPGLKAATH | YTITIRGVTQ | DFSTTPLSVE | ||||
VLTEEVPDMG | NLTVTEVSWD | ALRLNWTTPD | GTYDQFTIQV | QEADQVEEAH | ||||
NLTVPGSLRS | MEIPGLRAGT | PYTVTLHGEV | RGHSTRPLAV | EVVTEDLPQL | ||||
GDLAVSEVGW | DGLRLNWTAA | DNAYEHFVIQ | VQEVNKVEAA | QNLTLPGSLR | ||||
AVDIPGLEAA | TPYRVSIYGV | IRGYRTPVLS | AEASTAKEPE | IGNLNVSDIT | ||||
PESFNLSWMA | TDGIFETFTI | EIIDSNRLLE | TVEYNISGAE | RTAHISGLPP | ||||
STDFIVYLSG | LAPSIRTKTI | SATATTEALP | LLENLTISDI | NPYGFTVSWM | ||||
ASENAFDSFL | VTVVDSGKLL | DPQEFTLSGT | QRKLELRGLI | TGIGYEVMVS | ||||
GFTQGHQTKP | LRAEIVTEAE | PEVDNLLVSD | ATPDGFRLSW | TADEGVFDNF | ||||
VLKIRDTKKQ | SEPLEITLLA | PERTRDITGL | REATEYEIEL | YGISKGRRSQ | ||||
TVSAIATTAM | GSPKEVIFSD | ITENSATVSW | RAPTAQVESF | RITYVPITGG | ||||
TPSMVTVDGT | KTQTRLVKLI | PGVEYLVSII | AMKGFEESEP | VSGSFTTALD | ||||
GPSGLVTANI | TDSEALARWQ | PAIATVDSYV | ISYTGEKVPE | ITRTVSGNTV | ||||
EYALTDLEPA | TEYTLRIFAE | KGPQKSSTIT | AKFTTDLDSP | RDLTATEVQS | ||||
ETALLTWRPP | RASVTGYLLV | YESVDGTVKE | VIVGPDTTSY | SLADLSPSTH | ||||
YTAKIQALNG | PLRSNMIQTI | FTTIGLLYPF | PKDCSQAMLN | GDTTSGLYTI | ||||
YLNGDKAEAL | EVFCDMTSDG | GGWIVFLRRK | NGRENFYQNW | KAYAAGFGDR | ||||
REEFWLGLDN | LNKITAQGQY | ELRVDLRDHG | ETAFAVYDKF | SVGDAKTRYK | ||||
LKVEGYSGTA | GDSMAYHNGR | SFSTFDKDTD | SAITNCALSY | KGAFWYRNCH | ||||
RVNLMGRYGD | NNHSQGVNWF | HWKGHEHSIQ | FAEMKLRPSN | FRNLEGRRKR | ||||
A |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- Glumoff V., Savontaus M., Vehanen J., Vuorio E. (1994). Analysis of aggrecan and tenascin gene expression in mouse skeletal tissues by northern and in situ hybridization using species specific cDNA probes. Biochim. Biophys. Acta. 1219: 613—622. PMID 7524681 DOI:10.1016/0167-4781(94)90220-8
- Gulcher J.R., Nies D.E., Marton L.S., Stefansson K. (1989). An alternatively spliced region of the human hexabrachion contains a repeat of potential N-glycosylation sites. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 1588—1592. PMID 2466295 DOI:10.1073/pnas.86.5.1588
- Burg M.A., Tillet E., Timpl R., Stallcup W.B. (1996). Binding of the NG2 proteoglycan to type VI collagen and other extracellular matrix molecules. J. Biol. Chem. 271: 26110—26116. PMID 8824254 DOI:10.1074/jbc.271.42.26110
- Picariello G., Ferranti P., Mamone G., Roepstorff P., Addeo F. (2008). Identification of N-linked glycoproteins in human milk by hydrophilic interaction liquid chromatography and mass spectrometry. Proteomics. 8: 3833—3847. PMID 18780401 DOI:10.1002/pmic.200701057
- Leahy D.J., Hendrickson W.A., Aukhil I., Erickson H.P. (1992). Structure of a fibronectin type III domain from tenascin phased by MAD analysis of the selenomethionyl protein. Science. 258: 987—991. PMID 1279805 DOI:10.1126/science.1279805
- Nies D.E., Hemesath T.J., Kim J.H., Gulcher J.R., Stefansson K. (1991). The complete cDNA sequence of human hexabrachion (Tenascin). A multidomain protein containing unique epidermal growth factor repeats. J. Biol. Chem. 266: 2818—2823. PMID 1704365
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з TNC переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
TNC angl Tenascin C bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 9 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 2 201 aminokislot a molekulyarna masa 240 853 TNCNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1TEN 2RB8 2RBLIdentifikatoriSimvoliTNC 150 225 DFNA56 GMEM GP HXB JI TN TN C Tenascin CZovnishni ID OMIM 187380 MGI 101922 HomoloGene 55636 GeneCards TNCPov yazani genetichni zahvoryuvannyarak prostati autosomal dominant nonsyndromic deafness 56 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya syndecan binding extracellular matrix structural constituent GO 0001948 GO 0016582 protein bindingKlitinna komponenta interstitial matrix membrana focal adhesion GO 0005578 Pozaklitinna matricya bazalna membrana mizhklitinnij prostir endoplasmic reticulum lumen extracellular region collagen containing extracellular matrix perisynaptic extracellular matrixBiologichnij proces cellular response to retinoic acid negative regulation of cell adhesion bud outgrowth involved in lung branching mesenchymal epithelial cell signaling involved in prostate gland development response to fibroblast growth factor response to mechanical stimulus extracellular matrix organization Zagoyennya ran cellular response to vitamin D odontogenesis of dentin containing tooth GO 1901313 positive regulation of gene expression adgeziya klitin prostate gland epithelium morphogenesis cellular response to prostaglandin D stimulus regulation of cell population proliferation neuromuscular junction development response to wounding peripheral nervous system axon regeneration osteoblast differentiation positive regulation of cell population proliferation response to ethanol neuron projection development posttranslyacijna modifikaciyaDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez3371 21923Ensembl ENSG00000041982 ENSMUSG00000028364UniProt P24821 Q80YX1RefSeq mRNK NM 002160NM 011607 NM 001369211 NM 001369212 NM 001369213 NM 001369214RefSeq bilok NP 002151NP 035737 NP 001356140 NP 001356141 NP 001356142 NP 001356143Lokus UCSC Hr 9 115 02 115 12 MbHr 4 63 88 63 97 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MGAMTQLLAGVFLAFLALATEGGVLKKVIRHKRQSGVNATLPEENQPVVF NHVYNIKLPVGSQCSVDLESASGEKDLAPPSEPSESFQEHTVDGENQIVF THRINIPRRACGCAAAPDVKELLSRLEELENLVSSLREQCTAGAGCCLQP ATGRLDTRPFCSGRGNFSTEGCGCVCEPGWKGPNCSEPECPGNCHLRGRC IDGQCICDDGFTGEDCSQLACPSDCNDQGKCVNGVCICFEGYAGADCSRE ICPVPCSEEHGTCVDGLCVCHDGFAGDDCNKPLCLNNCYNRGRCVENECV CDEGFTGEDCSELICPNDCFDRGRCINGTCYCEEGFTGEDCGKPTCPHAC HTQGRCEEGQCVCDEGFAGVDCSEKRCPADCHNRGRCVDGRCECDDGFTG ADCGELKCPNGCSGHGRCVNGQCVCDEGYTGEDCSQLRCPNDCHSRGRCV EGKCVCEQGFKGYDCSDMSCPNDCHQHGRCVNGMCVCDDGYTGEDCRDRQ CPRDCSNRGLCVDGQCVCEDGFTGPDCAELSCPNDCHGQGRCVNGQCVCH EGFMGKDCKEQRCPSDCHGQGRCVDGQCICHEGFTGLDCGQHSCPSDCNN LGQCVSGRCICNEGYSGEDCSEVSPPKDLVVTEVTEETVNLAWDNEMRVT EYLVVYTPTHEGGLEMQFRVPGDQTSTIIQELEPGVEYFIRVFAILENKK SIPVSARVATYLPAPEGLKFKSIKETSVEVEWDPLDIAFETWEIIFRNMN KEDEGEITKSLRRPETSYRQTGLAPGQEYEISLHIVKNNTRGPGLKRVTT TRLDAPSQIEVKDVTDTTALITWFKPLAEIDGIELTYGIKDVPGDRTTID LTEDENQYSIGNLKPDTEYEVSLISRRGDMSSNPAKETFTTGLDAPRNLR RVSQTDNSITLEWRNGKAAIDSYRIKYAPISGGDHAEVDVPKSQQATTKT TLTGLRPGTEYGIGVSAVKEDKESNPATINAATELDTPKDLQVSETAETS LTLLWKTPLAKFDRYRLNYSLPTGQWVGVQLPRNTTSYVLRGLEPGQEYN VLLTAEKGRHKSKPARVKASTEQAPELENLTVTEVGWDGLRLNWTAADQA YEHFIIQVQEANKVEAARNLTVPGSLRAVDIPGLKAATPYTVSIYGVIQG YRTPVLSAEASTGETPNLGEVVVAEVGWDALKLNWTAPEGAYEYFFIQVQ EADTVEAAQNLTVPGGLRSTDLPGLKAATHYTITIRGVTQDFSTTPLSVE VLTEEVPDMGNLTVTEVSWDALRLNWTTPDGTYDQFTIQVQEADQVEEAH NLTVPGSLRSMEIPGLRAGTPYTVTLHGEVRGHSTRPLAVEVVTEDLPQL GDLAVSEVGWDGLRLNWTAADNAYEHFVIQVQEVNKVEAAQNLTLPGSLR AVDIPGLEAATPYRVSIYGVIRGYRTPVLSAEASTAKEPEIGNLNVSDIT PESFNLSWMATDGIFETFTIEIIDSNRLLETVEYNISGAERTAHISGLPP STDFIVYLSGLAPSIRTKTISATATTEALPLLENLTISDINPYGFTVSWM ASENAFDSFLVTVVDSGKLLDPQEFTLSGTQRKLELRGLITGIGYEVMVS GFTQGHQTKPLRAEIVTEAEPEVDNLLVSDATPDGFRLSWTADEGVFDNF VLKIRDTKKQSEPLEITLLAPERTRDITGLREATEYEIELYGISKGRRSQ TVSAIATTAMGSPKEVIFSDITENSATVSWRAPTAQVESFRITYVPITGG TPSMVTVDGTKTQTRLVKLIPGVEYLVSIIAMKGFEESEPVSGSFTTALD GPSGLVTANITDSEALARWQPAIATVDSYVISYTGEKVPEITRTVSGNTV EYALTDLEPATEYTLRIFAEKGPQKSSTITAKFTTDLDSPRDLTATEVQS ETALLTWRPPRASVTGYLLVYESVDGTVKEVIVGPDTTSYSLADLSPSTH YTAKIQALNGPLRSNMIQTIFTTIGLLYPFPKDCSQAMLNGDTTSGLYTI YLNGDKAEALEVFCDMTSDGGGWIVFLRRKNGRENFYQNWKAYAAGFGDR REEFWLGLDNLNKITAQGQYELRVDLRDHGETAFAVYDKFSVGDAKTRYK LKVEGYSGTAGDSMAYHNGRSFSTFDKDTDSAITNCALSYKGAFWYRNCH RVNLMGRYGDNNHSQGVNWFHWKGHEHSIQFAEMKLRPSNFRNLEGRRKR A A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak klitinna adgeziya alternativnij splajsing Lokalizovanij u pozaklitinnomu matriksi Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaGlumoff V Savontaus M Vehanen J Vuorio E 1994 Analysis of aggrecan and tenascin gene expression in mouse skeletal tissues by northern and in situ hybridization using species specific cDNA probes Biochim Biophys Acta 1219 613 622 PMID 7524681 DOI 10 1016 0167 4781 94 90220 8 Gulcher J R Nies D E Marton L S Stefansson K 1989 An alternatively spliced region of the human hexabrachion contains a repeat of potential N glycosylation sites Proc Natl Acad Sci U S A 86 1588 1592 PMID 2466295 DOI 10 1073 pnas 86 5 1588 Burg M A Tillet E Timpl R Stallcup W B 1996 Binding of the NG2 proteoglycan to type VI collagen and other extracellular matrix molecules J Biol Chem 271 26110 26116 PMID 8824254 DOI 10 1074 jbc 271 42 26110 Picariello G Ferranti P Mamone G Roepstorff P Addeo F 2008 Identification of N linked glycoproteins in human milk by hydrophilic interaction liquid chromatography and mass spectrometry Proteomics 8 3833 3847 PMID 18780401 DOI 10 1002 pmic 200701057 Leahy D J Hendrickson W A Aukhil I Erickson H P 1992 Structure of a fibronectin type III domain from tenascin phased by MAD analysis of the selenomethionyl protein Science 258 987 991 PMID 1279805 DOI 10 1126 science 1279805 Nies D E Hemesath T J Kim J H Gulcher J R Stefansson K 1991 The complete cDNA sequence of human hexabrachion Tenascin A multidomain protein containing unique epidermal growth factor repeats J Biol Chem 266 2818 2823 PMID 1704365PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z TNC pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 15 bereznya 2016 Procitovano 7 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 26 veresnya 2017 Procitovano 7 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 9 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi