SYP (англ. Synaptophysin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі X-хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 313 амінокислот, а молекулярна маса — 33 845.
SYP | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SYP, MRX96, MRXsynaptophysin, XLID96 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 313475 MGI: 98467 HomoloGene: 2391 GeneCards: SYP | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
non-syndromic X-linked intellectual disability | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. X: 49.19 – 49.2 Mb | Хр. X: 7.5 – 7.52 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MLLLADMDVV | NQLVAGGQFR | VVKEPLGFVK | VLQWVFAIFA | FATCGSYSGE | ||||
LQLSVDCANK | TESDLSIEVE | FEYPFRLHQV | YFDAPTCRGG | TTKVFLVGDY | ||||
SSSAEFFVTV | AVFAFLYSMG | ALATYIFLQN | KYRENNKGPM | LDFLATAVFA | ||||
FMWLVSSSAW | AKGLSDVKMA | TDPENIIKEM | PVCRQTGNTC | KELRDPVTSG | ||||
LNTSVVFGFL | NLVLWVGNLW | FVFKETGWAA | PFLRAPPGAP | EKQPAPGDAY | ||||
GDAGYGQGPG | GYGPQDSYGP | QGGYQPDYGQ | PAGSGGSGYG | PQGDYGQQGY | ||||
GPQGAPTSFS | NQM |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах, [en].
Література
- Suedhof T.C., Lottspeich F., Greengard P., Mehl E., Jahn R. (1987). The cDNA and derived amino acid sequences for rat and human synaptophysin. Nucleic Acids Res. 15: 9607—9607. PMID 3120152 DOI:10.1093/nar/15.22.9607
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з SYP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 20 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 20 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
SYP angl Synaptophysin bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi X hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 313 aminokislot a molekulyarna masa 33 845 SYPIdentifikatoriSimvoliSYP MRX96 MRXsynaptophysin XLID96Zovnishni ID OMIM 313475 MGI 98467 HomoloGene 2391 GeneCards SYPPov yazani genetichni zahvoryuvannyanon syndromic X linked intellectual disability Ontologiya genaMolekulyarna funkciya SH2 domain binding protein self association cholesterol binding identical protein binding syntaxin 1 bindingKlitinna komponenta integral component of membrane membrana Sinaptichni bulbashki sinaps excitatory synapse synaptic vesicle membrane presynaptic active zone mizhklitinni kontakti terminal bouton integral component of synaptic vesicle membrane neuron projection neuron projection terminus presynaptic membrane GO 0016023 cytoplasmic vesicle neuromuscular junction Schaffer collateral CA1 synapse perinuclear region of cytoplasmBiologichnij proces cellular response to organic substance regulation of long term neuronal synaptic plasticity endocitoz regulation of opioid receptor signaling pathway regulation of short term neuronal synaptic plasticity synaptic vesicle membrane organization regulation of neuronal synaptic plasticity synaptic vesicle maturation synaptic vesicle endocytosis regulation of synaptic vesicle exocytosisDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez6855 20977Ensembl ENSG00000102003 ENSMUSG00000031144UniProt P08247 Q62277RefSeq mRNK NM 003179NM 009305RefSeq bilok NP 003170NP 033331Lokus UCSC Hr X 49 19 49 2 MbHr X 7 5 7 52 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MLLLADMDVVNQLVAGGQFRVVKEPLGFVKVLQWVFAIFAFATCGSYSGE LQLSVDCANKTESDLSIEVEFEYPFRLHQVYFDAPTCRGGTTKVFLVGDY SSSAEFFVTVAVFAFLYSMGALATYIFLQNKYRENNKGPMLDFLATAVFA FMWLVSSSAWAKGLSDVKMATDPENIIKEMPVCRQTGNTCKELRDPVTSG LNTSVVFGFLNLVLWVGNLWFVFKETGWAAPFLRAPPGAPEKQPAPGDAY GDAGYGQGPGGYGPQDSYGPQGGYQPDYGQPAGSGGSGYGPQGDYGQQGY GPQGAPTSFSNQM A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionom kalciyu Lokalizovanij u membrani klitinnih kontaktah citoplazmatichnih vezikulah sinapsah en LiteraturaSuedhof T C Lottspeich F Greengard P Mehl E Jahn R 1987 The cDNA and derived amino acid sequences for rat and human synaptophysin Nucleic Acids Res 15 9607 9607 PMID 3120152 DOI 10 1093 nar 15 22 9607 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z SYP pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 20 travnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 20 serpnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma X Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi