SUV39H1 (англ. Suppressor of variegation 3-9 homolog 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 412 амінокислот, а молекулярна маса — 47 907.
SUV39H1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SUV39H1, H3-K9-HMTase 1, KMT1A, MG44, SUV39H, suppressor of variegation 3-9 homolog 1, SUV39H1 histone lysine methyltransferase | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 300254 MGI: 1099440 HomoloGene: 2388 GeneCards: SUV39H1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. X: 48.7 – 48.71 Mb | Хр. X: 7.93 – 7.94 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAENLKGCSV | CCKSSWNQLQ | DLCRLAKLSC | PALGISKRNL | YDFEVEYLCD | ||||
YKKIREQEYY | LVKWRGYPDS | ESTWEPRQNL | KCVRILKQFH | KDLERELLRR | ||||
HHRSKTPRHL | DPSLANYLVQ | KAKQRRALRR | WEQELNAKRS | HLGRITVENE | ||||
VDLDGPPRAF | VYINEYRVGE | GITLNQVAVG | CECQDCLWAP | TGGCCPGASL | ||||
HKFAYNDQGQ | VRLRAGLPIY | ECNSRCRCGY | DCPNRVVQKG | IRYDLCIFRT | ||||
DDGRGWGVRT | LEKIRKNSFV | MEYVGEIITS | EEAERRGQIY | DRQGATYLFD | ||||
LDYVEDVYTV | DAAYYGNISH | FVNHSCDPNL | QVYNVFIDNL | DERLPRIAFF | ||||
ATRTIRAGEE | LTFDYNMQVD | PVDMESTRMD | SNFGLAGLPG | SPKKRVRIEC | ||||
KCGTESCRKY | LF |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, , метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, біологічні ритми, процесинг рРНК, диференціація клітин, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Firestein R., Cui X., Huie P., Cleary M.L. (2000). Set domain-dependent regulation of transcriptional silencing and growth control by SUV39H1, a mammalian ortholog of Drosophila Su(var)3-9. Mol. Cell. Biol. 20: 4900—4909. PMID 10848615 DOI:10.1128/MCB.20.13.4900-4909.2000
- Lachner M., O'Carroll D., Rea S., Mechtler K., Jenuwein T. (2001). Methylation of histone H3 lysine 9 creates a binding site for HP1 proteins. Nature. 410: 116—120. PMID 11242053 DOI:10.1038/35065132
- Chakraborty S., Sinha K.K., Senyuk V., Nucifora G. (2003). SUV39H1 interacts with AML1 and abrogates AML1 transactivity. AML1 is methylated in vivo. Oncogene. 22: 5229—5237. PMID 12917624 DOI:10.1038/sj.onc.1206600
- Macaluso M., Cinti C., Russo G., Russo A., Giordano A. (2003). pRb2/p130-E2F4/5-HDAC1-SUV39H1-p300 and pRb2/p130-E2F4/5-HDAC1-SUV39H1-DNMT1 multimolecular complexes mediate the transcription of estrogen receptor-alpha in breast cancer. Oncogene. 22: 3511—3517. PMID 12789259 DOI:10.1038/sj.onc.1206578
- Vassen L., Fiolka K., Moeroey T. (2006). Gfi1b alters histone methylation at target gene promoters and sites of gamma-satellite containing heterochromatin. EMBO J. 25: 2409—2419. PMID 16688220 DOI:10.1038/sj.emboj.7601124
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11479 (англ.) . Процитовано 13 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 13 вересня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
SUV39H1 angl Suppressor of variegation 3 9 homolog 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na X hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 412 aminokislot a molekulyarna masa 47 907 SUV39H1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB3MTSIdentifikatoriSimvoliSUV39H1 H3 K9 HMTase 1 KMT1A MG44 SUV39H suppressor of variegation 3 9 homolog 1 SUV39H1 histone lysine methyltransferaseZovnishni ID OMIM 300254 MGI 1099440 HomoloGene 2388 GeneCards SUV39H1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0102674 GO 0102675 methyltransferase activity transferase activity histone methyltransferase activity histone methyltransferase activity H3 K9 specific S adenosylmethionine dependent methyltransferase activity protein N terminus binding zinc ion binding chromatin binding GO 0000975 transcription cis regulatory region binding zv yazuvannya z ionom metalu GO 0001948 GO 0016582 protein binding histone lysine N methyltransferase activityKlitinna komponenta Yaderna plastinka nukleoplazma hromosoma GO 0035328 Geterohromatin condensed nuclear chromosome rDNA heterochromatin chromatin silencing complex centromera klitinne yadroBiologichnij proces diferenciaciya klitin GO 0009373 regulation of transcription DNA templated histone H3 K9 dimethylation ritmichnij proces negative regulation of circadian rhythm GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II transcription DNA templated histone H3 K9 trimethylation cellular response to DNA damage stimulus Metilyuvannya rDNA heterochromatin assembly rRNA processing histone lysine methylation klitinnij cikl GO 0022415 viral process GO 0045996 negative regulation of transcription DNA templated cellular response to hypoxia GO 0031497 GO 0006336 GO 0034724 GO 0001301 GO 0007580 GO 0034652 GO 0010847 chromatin organizationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez6839 20937Ensembl ENSG00000101945 ENSMUSG00000039231UniProt O43463 O54864RefSeq mRNK NM 003173 NM 001282166NM 001290716 NM 011514 NM 001358237RefSeq bilok NP 001269095 NP 003164NP 001277645 NP 035644 NP 001345166Lokus UCSC Hr X 48 7 48 71 MbHr X 7 93 7 94 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MAENLKGCSVCCKSSWNQLQDLCRLAKLSCPALGISKRNLYDFEVEYLCD YKKIREQEYYLVKWRGYPDSESTWEPRQNLKCVRILKQFHKDLERELLRR HHRSKTPRHLDPSLANYLVQKAKQRRALRRWEQELNAKRSHLGRITVENE VDLDGPPRAFVYINEYRVGEGITLNQVAVGCECQDCLWAPTGGCCPGASL HKFAYNDQGQVRLRAGLPIYECNSRCRCGYDCPNRVVQKGIRYDLCIFRT DDGRGWGVRTLEKIRKNSFVMEYVGEIITSEEAERRGQIYDRQGATYLFD LDYVEDVYTVDAAYYGNISHFVNHSCDPNLQVYNVFIDNLDERLPRIAFF ATRTIRAGEELTFDYNMQVDPVDMESTRMDSNFGLAGLPGSPKKRVRIEC KCGTESCRKYLF A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do transferaz represoriv metiltransferaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak vzayemodiya hazyayin virus transkripciya regulyaciya transkripciyi klitinnij cikl biologichni ritmi procesing rRNK diferenciaciya klitin acetilyuvannya alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku S adenozil L metioninom Lokalizovanij u yadri hromosomah centromerah LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Firestein R Cui X Huie P Cleary M L 2000 Set domain dependent regulation of transcriptional silencing and growth control by SUV39H1 a mammalian ortholog of Drosophila Su var 3 9 Mol Cell Biol 20 4900 4909 PMID 10848615 DOI 10 1128 MCB 20 13 4900 4909 2000 Lachner M O Carroll D Rea S Mechtler K Jenuwein T 2001 Methylation of histone H3 lysine 9 creates a binding site for HP1 proteins Nature 410 116 120 PMID 11242053 DOI 10 1038 35065132 Chakraborty S Sinha K K Senyuk V Nucifora G 2003 SUV39H1 interacts with AML1 and abrogates AML1 transactivity AML1 is methylated in vivo Oncogene 22 5229 5237 PMID 12917624 DOI 10 1038 sj onc 1206600 Macaluso M Cinti C Russo G Russo A Giordano A 2003 pRb2 p130 E2F4 5 HDAC1 SUV39H1 p300 and pRb2 p130 E2F4 5 HDAC1 SUV39H1 DNMT1 multimolecular complexes mediate the transcription of estrogen receptor alpha in breast cancer Oncogene 22 3511 3517 PMID 12789259 DOI 10 1038 sj onc 1206578 Vassen L Fiolka K Moeroey T 2006 Gfi1b alters histone methylation at target gene promoters and sites of gamma satellite containing heterochromatin EMBO J 25 2409 2419 PMID 16688220 DOI 10 1038 sj emboj 7601124PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 11479 angl Procitovano 13 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 13 veresnya 2017 Procitovano 13 veresnya 2017 Div takozhHromosoma X Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi