SREBF2 (англ. Sterol regulatory element binding transcription factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 141 амінокислот, а молекулярна маса — 123 688.
SREBF2 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SREBF2, SREBP-2, SREBP2, bHLHd2, sterol regulatory element binding transcription factor 2 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 600481 MGI: 107585 HomoloGene: 20966 GeneCards: SREBF2 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 22: 41.83 – 41.91 Mb | Хр. 15: 82.03 – 82.09 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MDDSGELGGL | ETMETLTELG | DELTLGDIDE | MLQFVSNQVG | EFPDLFSEQL | ||||
CSSFPGSGGS | GSSSGSSGSS | SSSSNGRGSS | SGAVDPSVQR | SFTQVTLPSF | ||||
SPSAASPQAP | TLQVKVSPTS | VPTTPRATPI | LQPRPQPQPQ | PQTQLQQQTV | ||||
MITPTFSTTP | QTRIIQQPLI | YQNAATSFQV | LQPQVQSLVT | SSQVQPVTIQ | ||||
QQVQTVQAQR | VLTQTANGTL | QTLAPATVQT | VAAPQVQQVP | VLVQPQIIKT | ||||
DSLVLTTLKT | DGSPVMAAVQ | NPALTALTTP | IQTAALQVPT | LVGSSGTILT | ||||
TMPVMMGQEK | VPIKQVPGGV | KQLEPPKEGE | RRTTHNIIEK | RYRSSINDKI | ||||
IELKDLVMGT | DAKMHKSGVL | RKAIDYIKYL | QQVNHKLRQE | NMVLKLANQK | ||||
NKLLKGIDLG | SLVDNEVDLK | IEDFNQNVLL | MSPPASDSGS | QAGFSPYSID | ||||
SEPGSPLLDD | AKVKDEPDSP | PVALGMVDRS | RILLCVLTFL | CLSFNPLTSL | ||||
LQWGGAHDSD | QHPHSGSGRS | VLSFESGSGG | WFDWMMPTLL | LWLVNGVIVL | ||||
SVFVKLLVHG | EPVIRPHSRS | SVTFWRHRKQ | ADLDLARGDF | AAAAGNLQTC | ||||
LAVLGRALPT | SRLDLACSLS | WNVIRYSLQK | LRLVRWLLKK | VFQCRRATPA | ||||
TEAGFEDEAK | TSARDAALAY | HRLHQLHITG | KLPAGSACSD | VHMALCAVNL | ||||
AECAEEKIPP | STLVEIHLTA | AMGLKTRCGG | KLGFLASYFL | SRAQSLCGPE | ||||
HSAVPDSLRW | LCHPLGQKFF | MERSWSVKSA | AKESLYCAQR | NPADPIAQVH | ||||
QAFCKNLLER | AIESLVKPQA | KKKAGDQEEE | SCEFSSALEY | LKLLHSFVDS | ||||
VGVMSPPLSR | SSVLKSALGP | DIICRWWTSA | ITVAISWLQG | DDAAVRSHFT | ||||
KVERIPKALE | VTESPLVKAI | FHACRAMHAS | LPGKADGQQS | SFCHCERASG | ||||
HLWSSLNVSG | ATSDPALNHV | VQLLTCDLLL | SLRTALWQKQ | ASASQAVGET | ||||
YHASGAELAG | FQRDLGSLRR | LAHSFRPAYR | KVFLHEATVR | LMAGASPTRT | ||||
HQLLEHSLRR | RTTQSTKHGE | VDAWPGQRER | ATAILLACRH | LPLSFLSSPG | ||||
QRAVLLAEAA | RTLEKVGDRR | SCNDCQQMIV | KLGGGTAIAA | S |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, метаболізм ліпідів, метаболізм холестеролу, метаболізм стероїдів, метаболізм стеролів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hua X., Sakai J., Brown M.S., Goldstein J.L. (1996). Regulated cleavage of sterol regulatory element binding proteins requires sequences on both sides of the endoplasmic reticulum membrane. J. Biol. Chem. 271: 10379—10384. PMID 8626610 DOI:10.1074/jbc.271.17.10379
- Pai J.-T., Brown M.S., Goldstein J.L. (1996). Purification and cDNA cloning of a second apoptosis-related cysteine protease that cleaves and activates sterol regulatory element binding proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 5437—5442. PMID 8643593 DOI:10.1073/pnas.93.11.5437
- Duncan E.A., Dave U.P., Sakai J., Goldstein J.L., Brown M.S. (1998). Second-site cleavage in sterol regulatory element-binding protein occurs at transmembrane junction as determined by cysteine panning. J. Biol. Chem. 273: 17801—17809. PMID 9651382 DOI:10.1074/jbc.273.28.17801
- Ye J., Dave U.P., Grishin N.V., Goldstein J.L., Brown M.S. (2000). Asparagine-proline sequence within membrane-spanning segment of SREBP triggers intramembrane cleavage by site-2 protease. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 5123—5128. PMID 10805775 DOI:10.1073/pnas.97.10.5123
- Irisawa M., Inoue J., Ozawa N., Mori K., Sato R. (2009). The sterol-sensing endoplasmic reticulum (ER) membrane protein TRC8 hampers ER to Golgi transport of sterol regulatory element-binding protein-2 (SREBP-2)/SREBP cleavage-activated protein and reduces SREBP-2 cleavage. J. Biol. Chem. 284: 28995—29004. PMID 19706601 DOI:10.1074/jbc.M109.041376
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 6 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
SREBF2 angl Sterol regulatory element binding transcription factor 2 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 22 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 141 aminokislot a molekulyarna masa 123 688 SREBF2Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1UKLIdentifikatoriSimvoliSREBF2 SREBP 2 SREBP2 bHLHd2 sterol regulatory element binding transcription factor 2Zovnishni ID OMIM 600481 MGI 107585 HomoloGene 20966 GeneCards SREBF2Ontologiya genaMolekulyarna funkciya C 8 sterol isomerase activity DNA binding protein dimerization activity GO 0001131 GO 0001151 GO 0001130 GO 0001204 DNA binding transcription factor activity GO 0000980 RNA polymerase II cis regulatory region sequence specific DNA binding GO 0001078 GO 0001214 GO 0001206 DNA binding transcription repressor activity RNA polymerase II specific E box binding protein C terminus binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specificKlitinna komponenta citoplazma integral component of membrane gialoplazma SREBP SCAP Insig complex kompleks Goldzhi endoplasmic reticulum membrane membrana Golgi membrane endoplazmatichnij retikulum ER to Golgi transport vesicle membrane GO 0016023 cytoplasmic vesicle klitinne yadro nukleoplazma mitohondriya vnutrishnoklitinna membranna organelaBiologichnij proces steroid metabolic process GO 0009373 regulation of transcription DNA templated positive regulation of protein targeting to mitochondrion lipid metabolism positive regulation of cholesterol storage cellular response to laminar fluid shear stress cellular response to starvation cholesterol metabolic process GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II transcription DNA templated regulation of autophagy of mitochondrion negative regulation of cholesterol efflux GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II regulation of cholesterol biosynthetic process cellular response to low density lipoprotein particle stimulusDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez6721 20788Ensembl ENSG00000198911 ENSMUSG00000022463UniProt Q12772 Q3U1N2RefSeq mRNK NM 004599NM 033218RefSeq bilok NP 004590NP 150087Lokus UCSC Hr 22 41 83 41 91 MbHr 15 82 03 82 09 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MDDSGELGGLETMETLTELGDELTLGDIDEMLQFVSNQVGEFPDLFSEQL CSSFPGSGGSGSSSGSSGSSSSSSNGRGSSSGAVDPSVQRSFTQVTLPSF SPSAASPQAPTLQVKVSPTSVPTTPRATPILQPRPQPQPQPQTQLQQQTV MITPTFSTTPQTRIIQQPLIYQNAATSFQVLQPQVQSLVTSSQVQPVTIQ QQVQTVQAQRVLTQTANGTLQTLAPATVQTVAAPQVQQVPVLVQPQIIKT DSLVLTTLKTDGSPVMAAVQNPALTALTTPIQTAALQVPTLVGSSGTILT TMPVMMGQEKVPIKQVPGGVKQLEPPKEGERRTTHNIIEKRYRSSINDKI IELKDLVMGTDAKMHKSGVLRKAIDYIKYLQQVNHKLRQENMVLKLANQK NKLLKGIDLGSLVDNEVDLKIEDFNQNVLLMSPPASDSGSQAGFSPYSID SEPGSPLLDDAKVKDEPDSPPVALGMVDRSRILLCVLTFLCLSFNPLTSL LQWGGAHDSDQHPHSGSGRSVLSFESGSGGWFDWMMPTLLLWLVNGVIVL SVFVKLLVHGEPVIRPHSRSSVTFWRHRKQADLDLARGDFAAAAGNLQTC LAVLGRALPTSRLDLACSLSWNVIRYSLQKLRLVRWLLKKVFQCRRATPA TEAGFEDEAKTSARDAALAYHRLHQLHITGKLPAGSACSDVHMALCAVNL AECAEEKIPPSTLVEIHLTAAMGLKTRCGGKLGFLASYFLSRAQSLCGPE HSAVPDSLRWLCHPLGQKFFMERSWSVKSAAKESLYCAQRNPADPIAQVH QAFCKNLLERAIESLVKPQAKKKAGDQEEESCEFSSALEYLKLLHSFVDS VGVMSPPLSRSSVLKSALGPDIICRWWTSAITVAISWLQGDDAAVRSHFT KVERIPKALEVTESPLVKAIFHACRAMHASLPGKADGQQSSFCHCERASG HLWSSLNVSGATSDPALNHVVQLLTCDLLLSLRTALWQKQASASQAVGET YHASGAELAGFQRDLGSLRRLAHSFRPAYRKVFLHEATVRLMAGASPTRT HQLLEHSLRRRTTQSTKHGEVDAWPGQRERATAILLACRHLPLSFLSSPG QRAVLLAEAARTLEKVGDRRSCNDCQQMIVKLGGGTAIAAS A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do aktivatoriv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi metabolizm lipidiv metabolizm holesterolu metabolizm steroyidiv metabolizm steroliv alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z DNK Lokalizovanij u yadri membrani endoplazmatichnomu retikulumi citoplazmatichnih vezikulah aparati goldzhi LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Hua X Sakai J Brown M S Goldstein J L 1996 Regulated cleavage of sterol regulatory element binding proteins requires sequences on both sides of the endoplasmic reticulum membrane J Biol Chem 271 10379 10384 PMID 8626610 DOI 10 1074 jbc 271 17 10379 Pai J T Brown M S Goldstein J L 1996 Purification and cDNA cloning of a second apoptosis related cysteine protease that cleaves and activates sterol regulatory element binding proteins Proc Natl Acad Sci U S A 93 5437 5442 PMID 8643593 DOI 10 1073 pnas 93 11 5437 Duncan E A Dave U P Sakai J Goldstein J L Brown M S 1998 Second site cleavage in sterol regulatory element binding protein occurs at transmembrane junction as determined by cysteine panning J Biol Chem 273 17801 17809 PMID 9651382 DOI 10 1074 jbc 273 28 17801 Ye J Dave U P Grishin N V Goldstein J L Brown M S 2000 Asparagine proline sequence within membrane spanning segment of SREBP triggers intramembrane cleavage by site 2 protease Proc Natl Acad Sci U S A 97 5123 5128 PMID 10805775 DOI 10 1073 pnas 97 10 5123 Irisawa M Inoue J Ozawa N Mori K Sato R 2009 The sterol sensing endoplasmic reticulum ER membrane protein TRC8 hampers ER to Golgi transport of sterol regulatory element binding protein 2 SREBP 2 SREBP cleavage activated protein and reduces SREBP 2 cleavage J Biol Chem 284 28995 29004 PMID 19706601 DOI 10 1074 jbc M109 041376PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 22 bereznya 2016 Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 6 veresnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 22 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi