RBBP8 (англ. RB binding protein 8, endonuclease) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 897 амінокислот, а молекулярна маса — 101 942.
RBBP8 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | RBBP8, COM1, CTIP, JWDS, RIM, SAE2, SCKL2, retinoblastoma binding protein 8, RB binding protein 8, endonuclease | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 604124 MGI: 2442995 HomoloGene: 28546 GeneCards: RBBP8 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
Seckel syndrome 2, Jawad syndrome | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 18: 22.8 – 23.03 Mb | Хр. 18: 11.77 – 11.88 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MNISGSSCGS | PNSADTSSDF | KDLWTKLKEC | HDREVQGLQV | KVTKLKQERI | ||||
LDAQRLEEFF | TKNQQLREQQ | KVLHETIKVL | EDRLRAGLCD | RCAVTEEHMR | ||||
KKQQEFENIR | QQNLKLITEL | MNERNTLQEE | NKKLSEQLQQ | KIENDQQHQA | ||||
AELECEEDVI | PDSPITAFSF | SGVNRLRRKE | NPHVRYIEQT | HTKLEHSVCA | ||||
NEMRKVSKSS | THPQHNPNEN | EILVADTYDQ | SQSPMAKAHG | TSSYTPDKSS | ||||
FNLATVVAET | LGLGVQEESE | TQGPMSPLGD | ELYHCLEGNH | KKQPFEESTR | ||||
NTEDSLRFSD | STSKTPPQEE | LPTRVSSPVF | GATSSIKSGL | DLNTSLSPSL | ||||
LQPGKKKHLK | TLPFSNTCIS | RLEKTRSKSE | DSALFTHHSL | GSEVNKIIIQ | ||||
SSNKQILINK | NISESLGEQN | RTEYGKDSNT | DKHLEPLKSL | GGRTSKRKKT | ||||
EEESEHEVSC | PQASFDKENA | FPFPMDNQFS | MNGDCVMDKP | LDLSDRFSAI | ||||
QRQEKSQGSE | TSKNKFRQVT | LYEALKTIPK | GFSSSRKASD | GNCTLPKDSP | ||||
GEPCSQECII | LQPLNKCSPD | NKPSLQIKEE | NAVFKIPLRP | RESLETENVL | ||||
DDIKSAGSHE | PIKIQTRSDH | GGCELASVLQ | LNPCRTGKIK | SLQNNQDVSF | ||||
ENIQWSIDPG | ADLSQYKMDV | TVIDTKDGSQ | SKLGGETVDM | DCTLVSETVL | ||||
LKMKKQEQKG | EKSSNEERKM | NDSLEDMFDR | TTHEEYESCL | ADSFSQAADE | ||||
EEELSTATKK | LHTHGDKQDK | VKQKAFVEPY | FKGDERETSL | QNFPHIEVVR | ||||
KKEERRKLLG | HTCKECEIYY | ADMPAEEREK | KLASCSRHRF | RYIPPNTPEN | ||||
FWEVGFPSTQ | TCMERGYIKE | DLDPCPRPKR | RQPYNAIFSP | KGKEQKT |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, мітоз, мейоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.
Література
- Fusco C., Reymond A., Zervos A.S. (1998). Molecular cloning and characterization of a novel retinoblastoma-binding protein. Genomics. 51: 351—358. PMID 9721205 DOI:10.1006/geno.1998.5368
- Schaeper U., Subramanian T., Lim L., Boyd J.M., Chinnadurai G. (1998). Interaction between a cellular protein that binds to the C-terminal region of adenovirus E1A (CtBP) and a novel cellular protein is disrupted by E1A through a conserved PLDLS motif. J. Biol. Chem. 273: 8549—8552. PMID 9535825 DOI:10.1074/jbc.273.15.8549
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Yu X., Baer R. (2000). Nuclear localization and cell cycle-specific expression of CtIP, a protein that associates with the BRCA1 tumor suppressor. J. Biol. Chem. 275: 18541—18549. PMID 10764811 DOI:10.1074/jbc.M909494199
- Yu X., Chen J. (2004). DNA damage-induced cell cycle checkpoint control requires CtIP, a phosphorylation-dependent binding partner of BRCA1 C-terminal domains. Mol. Cell. Biol. 24: 9478—9486. PMID 15485915 DOI:10.1128/MCB.24.21.9478-9486.2004
- Yu X., Fu S., Lai M., Baer R., Chen J. (2006). BRCA1 ubiquitinates its phosphorylation-dependent binding partner CtIP. Genes Dev. 20: 1721—1726. PMID 16818604 DOI:10.1101/gad.1431006
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з RBBP8 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9891 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
- UniProt, Q99708 (англ.) . Архів оригіналу за 21 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
RBBP8 angl RB binding protein 8 endonuclease bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 18 yi hromosomi 4 Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 897 aminokislot a molekulyarna masa 101 942 5 RBBP8Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2L4Z 4D2HIdentifikatoriSimvoliRBBP8 COM1 CTIP JWDS RIM SAE2 SCKL2 retinoblastoma binding protein 8 RB binding protein 8 endonucleaseZovnishni ID OMIM 604124 MGI 2442995 HomoloGene 28546 GeneCards RBBP8Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaSeckel syndrome 2 Jawad syndrome 1 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya nuclease activity hydrolase activity endonuclease activity GO 0001106 transcription corepressor activity damaged DNA binding DNA binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding single stranded DNA endodeoxyribonuclease activity identical protein binding Y form DNA binding double strand single strand DNA junction binding double stranded DNA binding single stranded DNA binding flap structured DNA bindingKlitinna komponenta transcription repressor complex hromosoma klitinne yadro nukleoplazma vnutrishnoklitinna membranna organela site of double strand breakBiologichnij proces klitinnij cikl GO 0100026 Reparaciya DNK nucleotide excision repair podil klitini nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis response to estradiol GO 0007126 mejoz GO 0044324 GO 0003256 GO 1901213 GO 0046019 GO 0046020 GO 1900094 GO 0061216 GO 0060994 GO 1902064 GO 0003258 GO 0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II cellular response to DNA damage stimulus blastocyst hatching DNA double strand break processing replikaciya DNK DNA double strand break processing involved in repair via single strand annealing GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II double strand break repair via homologous recombination negative regulation of G0 to G1 transition negative regulation of nucleic acid templated transcription G1 S transition of mitotic cell cycle regulation of signal transduction by p53 class mediatorDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez5932 225182Ensembl ENSG00000101773 ENSMUSG00000041238UniProt Q99708 Q80YR6RefSeq mRNK NM 002894 NM 203291 NM 203292NM 001081223 NM 001252495 NM 175458RefSeq bilok NP 002885 NP 976036 NP 976037 NP 002885 1 NP 976036 1NP 001074692 NP 001239424Lokus UCSC Hr 18 22 8 23 03 MbHr 18 11 77 11 88 MbPubMed search 2 3 VikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MNISGSSCGSPNSADTSSDFKDLWTKLKECHDREVQGLQVKVTKLKQERI LDAQRLEEFFTKNQQLREQQKVLHETIKVLEDRLRAGLCDRCAVTEEHMR KKQQEFENIRQQNLKLITELMNERNTLQEENKKLSEQLQQKIENDQQHQA AELECEEDVIPDSPITAFSFSGVNRLRRKENPHVRYIEQTHTKLEHSVCA NEMRKVSKSSTHPQHNPNENEILVADTYDQSQSPMAKAHGTSSYTPDKSS FNLATVVAETLGLGVQEESETQGPMSPLGDELYHCLEGNHKKQPFEESTR NTEDSLRFSDSTSKTPPQEELPTRVSSPVFGATSSIKSGLDLNTSLSPSL LQPGKKKHLKTLPFSNTCISRLEKTRSKSEDSALFTHHSLGSEVNKIIIQ SSNKQILINKNISESLGEQNRTEYGKDSNTDKHLEPLKSLGGRTSKRKKT EEESEHEVSCPQASFDKENAFPFPMDNQFSMNGDCVMDKPLDLSDRFSAI QRQEKSQGSETSKNKFRQVTLYEALKTIPKGFSSSRKASDGNCTLPKDSP GEPCSQECIILQPLNKCSPDNKPSLQIKEENAVFKIPLRPRESLETENVL DDIKSAGSHEPIKIQTRSDHGGCELASVLQLNPCRTGKIKSLQNNQDVSF ENIQWSIDPGADLSQYKMDVTVIDTKDGSQSKLGGETVDMDCTLVSETVL LKMKKQEQKGEKSSNEERKMNDSLEDMFDRTTHEEYESCLADSFSQAADE EEELSTATKKLHTHGDKQDKVKQKAFVEPYFKGDERETSLQNFPHIEVVR KKEERRKLLGHTCKECEIYYADMPAEEREKKLASCSRHRFRYIPPNTPEN FWEVGFPSTQTCMERGYIKEDLDPCPRPKRRQPYNAIFSPKGKEQKT A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do gidrolaz nukleaz endonukleaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak klitinnij cikl podil klitini poshkodzhennya DNK reparaciya DNK mitoz mejoz acetilyuvannya alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z DNK Lokalizovanij u yadri hromosomah Literaturared Fusco C Reymond A Zervos A S 1998 Molecular cloning and characterization of a novel retinoblastoma binding protein Genomics 51 351 358 PMID 9721205 DOI 10 1006 geno 1998 5368 Schaeper U Subramanian T Lim L Boyd J M Chinnadurai G 1998 Interaction between a cellular protein that binds to the C terminal region of adenovirus E1A CtBP and a novel cellular protein is disrupted by E1A through a conserved PLDLS motif J Biol Chem 273 8549 8552 PMID 9535825 DOI 10 1074 jbc 273 15 8549 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Yu X Baer R 2000 Nuclear localization and cell cycle specific expression of CtIP a protein that associates with the BRCA1 tumor suppressor J Biol Chem 275 18541 18549 PMID 10764811 DOI 10 1074 jbc M909494199 Yu X Chen J 2004 DNA damage induced cell cycle checkpoint control requires CtIP a phosphorylation dependent binding partner of BRCA1 C terminal domains Mol Cell Biol 24 9478 9486 PMID 15485915 DOI 10 1128 MCB 24 21 9478 9486 2004 Yu X Fu S Lai M Baer R Chen J 2006 BRCA1 ubiquitinates its phosphorylation dependent binding partner CtIP Genes Dev 20 1721 1726 PMID 16818604 DOI 10 1101 gad 1431006Primitkired Zahvoryuvannya genetichno pov yazani z RBBP8 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 9891 angl Arhiv originalu za 15 veresnya 2015 Procitovano 12 veresnya 2017 UniProt Q99708 angl Arhiv originalu za 21 lipnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhred Hromosoma 18 nbsp Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Otrimano z https uk wikipedia org w index php title RBBP8 amp oldid 35712582