PRPF31 (англ. Pre-mRNA processing factor 31) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 499 амінокислот, а молекулярна маса — 55 456.
PRPF31 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | PRPF31, pre-mRNA processing factor 31, NY-BR-99, PRP31, RP11, SNRNP61 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 606419 MGI: 1916238 HomoloGene: 5980 GeneCards: PRPF31 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
retinitis pigmentosa 11 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 19: 54.12 – 54.13 Mb | Хр. 7: 3.63 – 3.65 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSLADELLAD | LEEAAEEEEG | GSYGEEEEEP | AIEDVQEETQ | LDLSGDSVKT | ||||
IAKLWDSKMF | AEIMMKIEEY | ISKQAKASEV | MGPVEAAPEY | RVIVDANNLT | ||||
VEIENELNII | HKFIRDKYSK | RFPELESLVP | NALDYIRTVK | ELGNSLDKCK | ||||
NNENLQQILT | NATIMVVSVT | ASTTQGQQLS | EEELERLEEA | CDMALELNAS | ||||
KHRIYEYVES | RMSFIAPNLS | IIIGASTAAK | IMGVAGGLTN | LSKMPACNIM | ||||
LLGAQRKTLS | GFSSTSVLPH | TGYIYHSDIV | QSLPPDLRRK | AARLVAAKCT | ||||
LAARVDSFHE | STEGKVGYEL | KDEIERKFDK | WQEPPPVKQV | KPLPAPLDGQ | ||||
RKKRGGRRYR | KMKERLGLTE | IRKQANRMSF | GEIEEDAYQE | DLGFSLGHLG | ||||
KSGSGRVRQT | QVNEATKARI | SKTLQRTLQK | QSVVYGGKST | IRDRSSGTAS | ||||
SVAFTPLQGL | EIVNPQAAEK | KVAEANQKYF | SSMAEFLKVK | GEKSGLMST |
Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Makarova O.V., Makarov E.M., Liu S., Vornlocher H.-P., Luehrmann R. (2002). Protein 61K, encoded by a gene (PRPF31) linked to autosomal dominant retinitis pigmentosa, is required for U4/U6.U5 tri-snRNP formation and pre-mRNA splicing. EMBO J. 21: 1148—1157. PMID 11867543 DOI:10.1093/emboj/21.5.1148
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Liu S., Rauhut R., Vornlocher H.-P., Luehrmann R. (2006). The network of protein-protein interactions within the human U4/U6.U5 tri-snRNP. RNA. 12: 1418—1430. PMID 16723661 DOI:10.1261/rna.55406
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з PRPF31 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 9 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
PRPF31 angl Pre mRNA processing factor 31 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 19 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 499 aminokislot a molekulyarna masa 55 456 PRPF31Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2OZB 3SIU 3SIV 3JCR s3JCRIdentifikatoriSimvoliPRPF31 pre mRNA processing factor 31 NY BR 99 PRP31 RP11 SNRNP61Zovnishni ID OMIM 606419 MGI 1916238 HomoloGene 5980 GeneCards PRPF31Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaretinitis pigmentosa 11 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya snRNP binding U4 snRNA binding U4atac snRNA binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding ribonucleoprotein complex binding RNA bindingKlitinna komponenta Tilce Kahalya nuclear speck U4 U6 x U5 tri snRNP complex U4atac snRNP nukleoplazma MLL1 complex U2 type spliceosomal complex precatalytic spliceosome spliceosomal complex U4 snRNP klitinne yadro U2 type precatalytic spliceosomeBiologichnij proces mRNA splicing via spliceosome spliceosomal tri snRNP complex assembly mRNA processing snoRNA localization ribonucleoprotein complex localization Splajsing RNKDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez26121 68988Ensembl ENSG00000275885 ENSG00000105618 ENSMUSG00000008373UniProt Q8WWY3 Q8CCF0RefSeq mRNK NM 015629NM 001159714 NM 027328RefSeq bilok NP 056444 NP 056444 3NP 001153186 NP 081604Lokus UCSC Hr 19 54 12 54 13 MbHr 7 3 63 3 65 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MSLADELLADLEEAAEEEEGGSYGEEEEEPAIEDVQEETQLDLSGDSVKT IAKLWDSKMFAEIMMKIEEYISKQAKASEVMGPVEAAPEYRVIVDANNLT VEIENELNIIHKFIRDKYSKRFPELESLVPNALDYIRTVKELGNSLDKCK NNENLQQILTNATIMVVSVTASTTQGQQLSEEELERLEEACDMALELNAS KHRIYEYVESRMSFIAPNLSIIIGASTAAKIMGVAGGLTNLSKMPACNIM LLGAQRKTLSGFSSTSVLPHTGYIYHSDIVQSLPPDLRRKAARLVAAKCT LAARVDSFHESTEGKVGYELKDEIERKFDKWQEPPPVKQVKPLPAPLDGQ RKKRGGRRYRKMKERLGLTEIRKQANRMSFGEIEEDAYQEDLGFSLGHLG KSGSGRVRQTQVNEATKARISKTLQRTLQKQSVVYGGKSTIRDRSSGTAS SVAFTPLQGLEIVNPQAAEKKVAEANQKYFSSMAEFLKVKGEKSGLMST A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do ribonukleoproteyiniv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak procesing mRNK splajsing mRNK acetilyuvannya alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z RNK Lokalizovanij u yadri LiteraturaMakarova O V Makarov E M Liu S Vornlocher H P Luehrmann R 2002 Protein 61K encoded by a gene PRPF31 linked to autosomal dominant retinitis pigmentosa is required for U4 U6 U5 tri snRNP formation and pre mRNA splicing EMBO J 21 1148 1157 PMID 11867543 DOI 10 1093 emboj 21 5 1148 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Liu S Rauhut R Vornlocher H P Luehrmann R 2006 The network of protein protein interactions within the human U4 U6 U5 tri snRNP RNA 12 1418 1430 PMID 16723661 DOI 10 1261 rna 55406PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z PRPF31 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 5 veresnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 9 veresnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 19 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi